Allofykosyaniini ( kreikaksi : ἄλλος (allos) - "muu", φύκος (phycos) - "levä" ja κυανός ( kyanos ) - "sininen") on valoa keräävä proteiini , joka sisältää myös phycophyrinth - perheen phycophyrinth -proteiinia. ja fykoerytrosyaniini , ja se on klorofyllin apupigmentti . Kaikki fykobiliproteiinit ovat vesiliukoisia eivätkä siksi voi olla kalvoankkuroituja kuten karotenoidit , vaan muodostavat sen sijaan kalvoon ankkuroituja klustereita, joita kutsutaan fykobilisomeiksi . Allofykosyaniini absorboi ja emittoi punaista valoa (650 ja 660 nm, vastaavasti), ja se havaitaan helposti syanobakteereista ja punalevistä . Fykobiliinien kykyä lähettää valoa käytetään immunomäärityssarjoissa. Allofykosyaniinia käytetään usein virtaussytometriassa , solujen laskennassa ja lajittelussa sekä mikroskopiassa . Tätä varten siihen lisätään kemiallinen silloitus.
Allofykosyaniini voidaan eristää erilaisista puna- tai sinilevätyypeistä, joista jokainen syntetisoi oman, hieman erilaisen muotonsa tästä molekyylistä. Proteiini koostuu kahden tyyppisistä alayksiköistä (α ja β), joista jokaisessa on yksi fykosyanobiliinin kromoforiryhmä . Proteiinin yleinen kaava voidaan kuvata muodossa (αβ) 3 . Allofykosyaniinin molekyylipaino on 105 kDa.
| Absorptio maksimi | 652 nm |
| Lisäabsorptio maksimi | 625 nm |
| Säteily maksimi | 657,5 nm |
| Stokes vaihtaa | 5,5 nm |
| ekstinktiokerroin | 2,4 x 105 M −1 cm −1 |
| kvanttilähtö | 0,68 |
| Kirkkaus | 1,6 x 10 5 M −1 cm −1 |
Silloitettu allofykosyaniini
Kuten edellä mainittiin, jotta allofykosyaniinia voidaan käyttää immunomäärityksessä, se on silloitettava kemiallisesti sen alayksiköiden dissosioitumisen estämiseksi, mikä tapahtuu melko usein tavallisissa fysiologisissa puskureissa. [1] Perinteinen menetelmä tähän on sekoittaminen 1-etyyli-3,3-dimetyyliaminopropyyliin, joka on voimakas silloitusaine. Sitten sitä käsitellään kahdeksanmolaarisella urealiuoksella ja annetaan sitten renaturoitua, mutta jo fysiologisessa puskurissa. Tämän menettelyn avulla voit päästä eroon silloittamattomista alayksiköistä. [2] On olemassa vaihtoehtoisia menetelmiä, joiden avulla voit tallentaa trimeerin alkuperäisen rakenteen ja saada kirkkaamman lopputuotteen [3] .