Diftamidi

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 1. helmikuuta 2021 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 2 muokkausta .
diftamidi
Kenraali
Systemaattinen
nimi		 (2S)-2-amino-3-[2-[(3S)-4-amino-4-okso-3- (trimetyyliatsaniumyyli)butyyli] -1H-imidatsol-5-yyli]propanoaatti
Perinteiset nimet 2-(3-karboksamido-3(trimetyyliammonio)propyyli)histidiini
Chem. kaava C13H23N5O3 _ _ _ _ _ _ _
Fyysiset ominaisuudet
Osavaltio värittömiä kiteitä
Moolimassa 297,353 g/ mol
Luokitus
Reg. CAS-numero 75645-22-6
PubChem 70789228
Hymyilee   C[N+](C)(C)C(CCC1=NC=C(N1)CC(C(=O)[O-])N)C(=O)N
InChI   InChI = 1S/C13H23N5O3/c1-18(2.3)10(12(15)19)4-5-11-16-7-8(17-11)6-9(14)13(20)21/ h7, 9-10H,4-6,14H2,1-3H3,(H3-,15,16,17,19,20,21)/p+1/t9-,10-/m0/s1FOOBQHKMWYGHCE-UWVGGRQHSA-O
CHEBI 15949
ChemSpider 4573817
Turvallisuus
Lyhyt hahmo. vaara (H) H201 , H202 , H235+H410
varotoimenpiteitä. (P) P201
GHS-piktogrammit CGS-järjestelmän kuvake "Kaasupullo".CGS-järjestelmän piktogrammi "Räjähtävä pommi".
NFPA 704 NFPA 704 nelivärinen timantti 0 0 0
Tiedot perustuvat standardiolosuhteisiin (25 °C, 100 kPa), ellei toisin mainita.

Diftamidi on histidiinistä johdettu ei-koodaava aminohappo , jota löytyy yksinomaan eukaryoottien elongaatiotekijästä eEF- 2 ja joistakin arkeista . Se syntetisoituu translaation jälkeisen modifikaation aikana ja on kohde mono -ADP-ribosylaatiolle ribosomaalisen proteiinisynteesin säätelyprosessissa .

Diftamidi löydettiin kurkkumätätoksiinin vaikutusmekanismin tutkimuksessa, minkä vuoksi se sai nimensä. Ainakin viidellä ADP:tä ribosyloivalla toksiinilla (hinkuyskä-, kolera- ja kurkkumätätoksiinit, E. coli LT-toksiini ja Pseudomonas-eksotoksiini A) tiedetään olevan yhteinen NAD-sitoutumiskohta, joista kolme (kurkkumätä, kolera, eksotoksiini A) on diftamidi -riippuvainen [1] , [2] .

Biosynteesi

Vaikka diftamidi on ollut tiedossa yli kaksi vuosikymmentä, sen biosynteesin alkuvaiheiden yksityiskohdat ovat edelleen epäselviä.

Diftamidibiosynteesin ensimmäinen vaihe on 3-karboksi-3-aminopropyylitähteen siirto eEF-2-proteiiniketjun histidiinitähteeseen [3] . Jäännöksen luovuttaja on S-adenosyylimetioniini (SAM), ja histidiinin imidatsolifragmentin nukleofiilinen hyökkäys sulfoniumkeskuksen aktivoimaan SAM-hiileen tapahtuu. Toisin kuin useimmat näistä SAM:iin liittyvistä reaktioista, jotka etenevät nukleofiilisina hyökkäyksinä metyyliryhmän hiileen ja johtavat sen siirtymiseen nukleofiiliseen substraattiin, diftamidin biosynteesin aikana ei siirry metyyliryhmää vaan 3-karboksi-3:a. -aminopropyylitähde per hiiliatomi histidiinin imidatsolirenkaan asemassa 2 2-(3-karboksi-3-aminopropyyli)-L-histidiinin muodostamiseksi.

Seuraavassa vaiheessa 2-(3-karboksi-3-aminopropyyli)-L-histidiinitähteen 3-aminopropyylifragmentin aminoryhmä läpikäy perusteellisen metylaation, jolloin muodostuu difniinitähde (2-[3-karboksi- 3-(trimetyyliammonio)propyyli]-L-histidiini), tätä reaktiota katalysoi diftiinisyntaasientsyymi (EC 2.1.1.98), S-adenosyylimetioniini toimii metyyliryhmän luovuttajana [4] .

Viimeisessä vaiheessa diftiinin karboksyyliryhmä muuttuu vuorovaikutuksessa diftiini-ammoniakiligaasin (EC 6.3.1.14) katalysoiman ammoniakin kanssa amidiryhmäksi, jolloin muodostuu diftamidia [5]

Muistiinpanot

  1. ↑ Tietoja EC 2.4.2.36 - NAD+-diftamidi ADP-ribosyylitransferaasista // BRENDA . Haettu 4. heinäkuuta 2013. Arkistoitu alkuperäisestä 10. heinäkuuta 2013.
  2. ↑ Supotnitsky , M.V. Bakteerimyrkyt. Niiden luonne, toimintamekanismit, hybridi- ja modifioitujen toksiinien rakentamismahdollisuudet (pääsemätön linkki) . Biologiset aineet . Haettu 4. heinäkuuta 2013. Arkistoitu alkuperäisestä 18. heinäkuuta 2013. 
  3. ↑ nisäkkäillä - asemassa 715, hiivassa - 699, Pyrococcus horikoshiissa  - 600
  4. ↑ EY 2.1.1.98 // IUBMB-entsyyminimikkeistö . Haettu 14. toukokuuta 2013. Arkistoitu alkuperäisestä 23. toukokuuta 2013.
  5. ↑ EY 6.3.1.14 // IUBMB-entsyyminimikkeistö . Haettu 14. toukokuuta 2013. Arkistoitu alkuperäisestä 20. lokakuuta 2012.