Ihmisen koronavirus NL63

Ihmisen koronavirus NL63
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:PisuviricotaLuokka:PisoniviricetesTilaus:NidoviralesAlajärjestys:CornidovirineaePerhe:KoronaviruksetAlaperhe:KoronaviruksetSuku:AlfakoronavirusAlasuku:SetracovirusNäytä:Ihmisen koronavirus NL63
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Ihmisen koronavirus NL63
Synonyymit
  • HCoV-NL63
Baltimore Group
IV: (+)ssRNA-virukset

Ihmisen koronavirus NL63 [2] ( eng.  Human coronavirus NL63 ) on eräänlainen koronavirusperheeseen kuuluva virus [ 3] , joka havaittiin vuoden 2004 lopulla seitsemän kuukauden ikäiseltä vauvalta, jolla oli keuhkoputkentulehdus Alankomaissa [4] . Virus on (+)yksijuosteinen RNA-virus, joka pääsee isäntäsoluun ACE2-reseptorin kautta [5] [6] . Virustartunta on vahvistettu maailmanlaajuisesti, ja siihen liittyy monia yleisiä oireita ja sairauksia. Liitännäisiä sairauksia ovat lievät tai kohtalaiset ylähengitystieinfektiot, vakavat alahengitystieinfektiot, lantio ja keuhkoputkentulehdus [4] .

Virusta esiintyy pääasiassa pienillä lapsilla, vanhuksilla ja immuunipuutteellisilla potilailla, joilla on akuutteja hengitystieinfektioita. Sillä on myös kausiluonteinen yhteys lauhkeassa ilmastossa. Amsterdamissa tehdyssä tutkimuksessa arvioitiin HCoV-NL63:n esiintymistä noin 4,7 prosentissa yleisistä hengitystiesairauksista [7] . Virus on peräisin tartunnan saaneista palmu-siiveistä ja lepakoista [8]

Oireet

Ensimmäiset ihmisen koronavirus NL63 -tartuntatapaukset havaittiin pienillä lapsilla, joilla oli vakavia alahengitystieinfektioita, jotka joutuivat sairaalahoitoon. Vaikka viruksen kliininen esitys voi olla vakava, sitä on havaittu myös lievissä hengitystieinfektiotapauksissa. HCoV-NL63:n yhteissairaus muiden hengitystieinfektioiden kanssa on vaikeuttanut viruksen erityisten oireiden tunnistamista. Kliinisistä oireista tehdyssä tutkimuksessa potilailla, joilla oli HCoV-NL63 ilman sekundaarista infektiota, havaittiin, että yleisimmät oireet olivat kuume, yskä, nuha, kurkkukipu, käheys, keuhkoputkentulehdus, bronkioliitti, keuhkokuume ja lantio. Varhaisessa tutkimuksessa, jossa tarkasteltiin lapsia, joilla on alahengitysteiden sairaus, havaittiin, että HCoV-NL63 on yleisempi avohoitopotilailla kuin sairaalapotilailla, mikä viittaa siihen, että se on tavallinen flunssavirus, joka on samanlainen kuin HCoV-229E ja HCoV-OC43, jotka tyypillisesti aiheuttavat vähemmän vakavia oireita [9] . Suuri lantion ilmaantuvuus on kuitenkin spesifistä HCoV-NL63-infektiolle.

Tartunnan lähde

HCoV-NL63:n uskotaan leviävän suoraan ihmisestä toiseen tiheästi asutuilla alueilla. Virus voi selviytyä jopa viikon kehon ulkopuolella vesiliuoksissa huoneenlämmössä ja kolme tuntia kuivilla pinnoilla [10] . Suurin osa ihmisistä saa koronavirustartunnan elämänsä aikana, mutta jotkut populaatiot ovat alttiimpia HCoV-NL63:lle. Tähän ryhmään kuuluvat alle 5-vuotiaat lapset, vanhukset ja heikentyneet immuunijärjestelmät. Viruksen esiintyvyys näyttää olevan kausiluonteinen, ja sitä esiintyy useimmiten talvikuukausina lauhkeassa ilmastossa. Äärimmäisemmässä ja trooppisessa ilmastossa viruksella ei ole etusijaa tiettyyn vuodenaikaan. Monet tutkimukset ovat raportoineet HCoV-NL63:n ilmaantumisesta samanaikaisesti toisen ihmisen koronaviruksen, influenssa A -viruksen, ihmisen orthopneumoviruksen (RSV), parainfluenssaviruksen ja ihmisen metapneumoviruksen (hMPV) kanssa [4] .

Voimansiirtomekanismi

HCoV-NL63:n tarttuminen on mahdollista poistamalla hengitysteistä pisaroita, jotka voivat kulkeutua ilmassa tai levitä lähikontaktin kautta. Virus pystyy selviytymään hengitysteissä jopa seitsemän päivää ja pysyy tarttuvana huoneenlämmössä [11] . Kun virus on päässyt isäntään, se sitoutuu solun reseptoreihin käyttämällä piikkiproteiineja, jotka ovat samanlaisia ​​kuin HIV-1 :ssä . Virus pystyy käyttämään angiotensiiniä konvertoivaa entsyymiä 2 ( ACE2 ) sisääntuloreseptorina kohdesolujen sitomiseen ja sisäänpääsyyn [11] . Viruksen spesifisen pääsyn isäntäsoluun määritystä ei ole saatu päätökseen. Siksi solujen sisäänpääsy tapahtuu joko suoralla solufuusiolla plasmakalvon kanssa tai endosytoosin kautta, jota seuraa kalvofuusio. HCoV-NL63-cDNA-kloonin puuttumisen vuoksi replikaatiosykliä koskevat tutkimukset ovat rajallisia. Koska se on positiivinen yksijuosteinen RNA-virus, replikaatioprosessit transkription ja translaation kautta voivat tapahtua infektoituneen solun sytoplasmassa.

Diagnostiikka

On vaikea erottaa toisistaan ​​HCoV-NL63-virusinfektion ja muiden yleisten ihmisen virusten aiheuttamia oireita, mikä tekee diagnoosista ja havaitsemisesta vaikeaa. Nenänielun vanupuikolla otettujen näytteiden käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktio on yleisimmin käytetty menetelmä viruksen havaitsemiseksi [4] . Virusviljelmää tai seerumin vasta-ainetestiä voidaan myös käyttää infektion vahvistamiseen.

Ennaltaehkäisy

Yhdysvaltain tautien valvonta- ja ehkäisykeskukset ( CDC ) suosittelevat useita toimenpiteitä HCoV-NL63-infektion estämiseksi, mukaan lukien: käsien pesu usein saippualla ja vedellä, lähikontaktin välttäminen sairaiden ihmisten kanssa ja silmien, suun tai nenän koskettaminen [12] .

Hoito ja ennuste

HCoV-NL63:n hoito riippuu siihen liittyvien oireiden vakavuudesta. Useimmat lievistä tai kohtalaisista infektioista häviävät itsestään. Oireet voidaan lievittää ottamalla kipu- tai kuumelääkkeitä, kuumaa suihkua tai ilmankostutinta. Viruslääkitys voi olla tarpeen tartunnan saaneille potilaille, jotka joutuvat teho-osastolle akuutin hengitystieinfektion vuoksi. Laskimonsisäinen immunoglobuliini on FDA :n hyväksymä HCoV-NL63-estäjä, jota käytetään myös primaarisen immuunipuutoksen, RSV:n ja Kawasakin taudin hoitoon [7] .

Tuore tutkimus

Uusimmat tiedot[ milloin? ] viittaavat HCoV-NL63-infektion ja Kawasakin taudin yhteyteen , joka on lapsuuden systeeminen vaskuliitti, joka voi johtaa sepelvaltimon aneurysmiin. Kawasakin tauti on kehittyneissä maissa yleisin lasten hankittujen sydänsairauksien syy [13] . HCoV-NL63:n patogeenisyyden lisäanalyysi näyttää perustellulta, osittain koska viimeaikaiset todisteet ovat osoittaneet, että tämä virus käyttää samaa solureseptoria kuin SARS-CoV (ACE2) [11] . HCoV-NL63:a on löydetty myös infektoituneiden yksilöiden suolistosta, ja se liittyy gastroenteriittiin [14] . Tämäntyyppinen infektio on suora seuraus viruksen tunkeutumisesta suolen limakalvoon. HCoV-NL63:n rooli gastroenteriitissä on epäselvä, koska se on tyypillistä samanaikaista infektiota muiden tässä tilassa olevien virusten kanssa. HCoV-NL63 on luultavasti alihavaittu johtuen sen roolista monissa lievissä tai keskivaikeissa hengitystieinfektioissa ja muiden sairauksien yhteydessä. Tutkijat ehdottivat, että tarvitaan kattavampia väestöpohjaisia ​​tutkimuksia tämän viruksen vaikutusten määrittämiseksi hengitysteiden ulkopuolisiin järjestelmiin.

Muistiinpanot

  1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  2. ↑ Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Koronavirusten (Nidovirales: Coronaviridae) tutkimushistoria ja nykyaikainen luokittelu  // Infektio ja immuniteetti  : lehti. - 2020. - T. 10 , nro 2 . - S. 221-246 . Arkistoitu alkuperäisestä 25.6.2020.
  3. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla . (Käytetty: 21. helmikuuta 2020)
  4. ↑ 1 2 3 4 Abdul-Rasool S., Fielding BC Understanding Human Coronavirus HCoV-NL63 // The Open Virology Journal. - 2010. - toukokuu ( osa 4 ). - S. 76-84 . - doi : 10.2174/1874357901004010076 . — PMID 20700397 .
  5. ↑ ACE2 angiotensiini I:tä konvertoiva entsyymi 2 - geeni . NCBI (28. helmikuuta 2020). - "Tämän geenin koodaama proteiini kuuluu dipeptidyylikarboksidipeptidaasien angiotensiiniä konvertoivaan entsyymiperheeseen ja sillä on huomattavaa homologiaa ihmisen angiotensiini 1:tä konvertoivan entsyymin kanssa. Tämä erittynyt proteiini katalysoi angiotensiini I:n pilkkoutumista angiotensiini 1-9:ksi ja angiotensiini II:n verisuonia laajentavaksi angiotensiini 1-7:ksi. Tämän geenin elin- ja soluspesifinen ilmentyminen viittaa siihen, että sillä voi olla roolia kardiovaskulaaristen ja munuaisten toiminnan sekä hedelmällisyyden säätelyssä. Lisäksi koodattu proteiini on toiminnallinen reseptori ihmisen koronaviruksen HCoV-NL63 piikkiglykoproteiinille ja ihmisen vakavan akuutin hengitystieoireyhtymän koronavirusten SARS-CoV ja SARS-CoV-2 (COVID-19-virus). Haettu 21. maaliskuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 24. joulukuuta 2014.
  6. ↑ Fehr AR, Perlman S. Koronavirukset: yleiskatsaus niiden replikaatioon ja patogeneesiin   // Methods in Molecular Biology : päiväkirja. - Springer, 2015. - Vol. 1282 . - s. 1-23 . — ISBN 978-1-4939-2438-7 . - doi : 10.1007/978-1-4939-2438-7_1 . — PMID 25720466 .
  7. ↑ 1 2 van der Hoek L., Pyrc K., Berkhout B. Ihmisen koronavirus NL63, uusi hengitystievirus  //  FEMS Microbiology Reviews. - 2006. - syyskuu ( osa 30 , nro 5 ). - s. 760-773 . - doi : 10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x . — PMID 16911043 .
  8. ↑ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang. Ihmisen koronavirukset: katsaus virus-isäntävuorovaikutuksiin  (englanniksi)  // Diseases : Journal. - 2016. - 25. heinäkuuta ( nide 4 , nro 3 ). - s. 26 . — ISSN 2079-9721 . - doi : 10.3390/taudit4030026 . — PMID 28933406 . . — Katso taulukko 1.
  9. ↑ van der Hoek L., Berkhout B. New Havenin koronavirukseen liittyviä kysymyksiä  // The  Journal of Infectious Diseases . - 2005. - Heinäkuu ( osa 192 , nro 2 ) . — s. 350–1; kirjoittajan vastaus 353-4 . - doi : 10.1086/430795 . — PMID 15962232 .
  10. ↑ Ihmisen koronavirus . Kanadan kansanterveysvirasto (19. elokuuta 2011). Haettu 22. heinäkuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 3. heinäkuuta 2017.
  11. ↑ 1 2 3 Hofmann H., Pyrc K., van der Hoek L., Geier M., Berkhout B., Pöhlmann S.  Ihmisen koronavirus NL63 käyttää vakavan akuutin hengitystieoireyhtymän koronavirusreseptoria soluun pääsyä varten  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States  : Journal. - 2005. - toukokuu ( osa 102 , nro 22 ). - P. 7988-7993 . - doi : 10.1073/pnas.0409465102 . - . — PMID 15897467 .
  12. ↑ Tietoja koronaviruksesta . Taudintorjuntakeskus . Haettu 22. heinäkuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 27. heinäkuuta 2015.
  13. ↑ Kawasakin tauti . Mayon klinikka . Haettu 22. heinäkuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 13. elokuuta 2015.
  14. ↑ Fielding BC Ihmisen koronavirus NL63: kliinisesti tärkeä virus? (englanniksi)  // Future Microbiology : päiväkirja. - 2011. - Helmikuu ( osa 6 , nro 2 ) - s. 153-159 . - doi : 10.2217/fmb.10.166 . — PMID 21366416 .
  Siirry Wikidata-kohteeseen  Taksonomia