Koronavirukset

Koronavirukset

SARS-CoV-2 :n 3D-malli
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:PisuviricotaLuokka:PisoniviricetesTilaus:NidoviralesAlajärjestys:CornidovirineaePerhe:Koronavirukset
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Coronaviridae
Alaperheet
Baltimore Group
IV: (+)ssRNA-virukset

Koronavirukset [2] ( lat.  Coronaviridae ) ovat RNA :ta sisältävien virusten perhe , johon kuuluu 45 lajia toukokuussa 2020, yhdistettynä kahteen alaheimoon [3] [4] . Ne vaikuttavat nisäkkäisiin (mukaan lukien ihmiset), lintuihin ja sammakkoeläimiin. Nimi liittyy viruksen rakenteeseen, jonka piikkimäiset prosessit muistuttavat aurinkokoronaa [2] . Tunnetaan 7 koronavirusta, jotka tartuttavat ihmisiä [5] [6] [7] :

Etymologia

Nimi "koronavirus" tulee latinan sanasta corona , joka tarkoittaa "seppelettä", joka puolestaan ​​on lainattu muusta kreikasta. κορώνη korṓnē, "seppele, seppele" [8] [9] . Nimen keksivät Juna Almeida ja David Tyrrell, jotka olivat ensimmäiset, jotka löysivät ja tutkivat ihmisen koronaviruksia [10] . Epävirallinen virologiryhmä Nature -lehdessä käytti sanaa painetussa muodossa vuonna 1968 viittaamaan uuteen virusperheeseen [11] . Nimi viittaa virionien (viruksen tarttuva muoto) tyypilliseen esiintymiseen elektronimikroskopiassa. Niiden pinnalla on suuria kohoavia ulkonemia, jotka luovat auringon koronaa tai haloa muistuttavan kuvan [11] [10] . Tämän morfologian luovat viruspiikkipeplomeerit, jotka ovat viruksen pinnalla olevia proteiineja [12] .

Kansainvälinen virusnimikkeistökomitea (nimettiin myöhemmin Kansainväliseksi virustaksonomiaksi) hyväksyi tieteellisen nimen Coronavirus suvuksi vuonna 1971 [13] . Kun uusien lajien määrä lisääntyi, suku jakautui neljään sukuun, jotka ovat Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Deltacoronavirus ja Gammacoronavirus vuonna 2009 [14] . Yleisnimeä koronavirus käytetään viittaamaan mihin tahansa Orthocoronavirinae -alaheimon jäseneen [15] . Vuodesta 2020 lähtien 45 lajia on virallisesti tunnustettu [16] .

Epidemiologia

Koronavirukset aiheuttavat sairauksia nisäkkäissä ( ihmiset , lepakot , kissat , koirat , siat , naudat ) ja linnut . Esimerkkejä ( sioilla__linnuillaAvCoV( koronaviruksetLintujen  : TGEV  – porcine transmissible gastroenteritis coronavirus ja sen patotyyppi PRCV  – sian hengitysteiden koronavirus), koirilla, joilla on koiran koronaviruksia ( CCoV-1 ja CCoV-2 /PanCCoV) ), kissoilla, joilla on kissan koronavirus ( FECV  — enteritis coronavirus cats, FIPV  — kissan infectious peritonitis coronavirus), hiirillä hiiren koronavirus ( MCoV , aiheuttaa virushepatiittia hiirillä, rotilla RtCoV  — rotan koronavirus, PCoV  — petrel puffinosis koronavirus) jne., eri lepakalajeissa on monia koronaviruksia [ 3] [17] .

Koronavirustartunnan lähteitä voivat olla sairas ihminen, eläimet. Mahdolliset välitysmekanismit: ilmassa, ilmassa, uloste-oraalinen, kontakti. Ilmaantuvuus lisääntyy talvella ja alkukeväällä. Sairaalapotilaiden ARVI -rakenteessa koronavirusinfektio on keskimäärin 12%. Koronavirusten laajalle levinneestä esiintyvyydestä todistavat spesifiset vasta-aineet, jotka on havaittu 80 prosentilla ihmisistä [18] [19] .

Ihmisen koronaviruksen eristi ensimmäisen kerran vuonna 1965 ARVI -potilaista D. Tyrrel nenänielusta, jolla oli akuutti nuha , myöhemmin vuonna 1975 E. Kaul ja S. Clark eristivät koronaviruksen ulosteesta lapsuuden enterokoliitissa . Myöhemmin koronavirukset eivät juuri herättäneet tutkijoiden huomiota, kunnes Kiinassa havaittiin SARS-epidemia eli vakava akuutti hengitystieoireyhtymä (SARS, SARS) vuosina 2002-2003 . Taudin aiheutti SARS-CoV-virus. Tämän seurauksena tauti levisi muihin maihin, yhteensä 8273 ihmistä sairastui, 775 kuoli (kuolleisuus 9,6 %).

MERS-CoV-virus on Lähi-idän hengitystieoireyhtymän (MERS) aiheuttaja, jonka ensimmäiset tapaukset raportoitiin vuonna 2012 [20] . Vuonna 2015 Etelä-Koreassa puhkesi Lähi-idän hengitystieoireyhtymä , jonka aikana 183 ihmistä sairastui ja 33 kuoli.

Joulukuussa 2019 Kiinassa alkoi keuhkokuumeepidemia , jonka aiheutti äskettäin löydetty SARS-CoV-2- virus . Pian se levisi muihin maihin.

Rakenne ja elinkaari

Genomia edustaa yksijuosteinen (+)RNA. Nukleokapsidia ympäröi proteiinikalvo ja lipopitoinen ulkokuori, josta ulottuvat nuppimaiset piikit, jotka muistuttavat kruunua, josta perhe sai nimensä.

SARS-CoV-2 käyttää kruunussa olevaa S-proteiinia kiinnittymään reseptoriinsa  , angiotensiiniä konvertoivaan entsyymiin 2 (ACE2) sekä seriiniproteaasiin TMPRSS2 [21] , samoin kuin SARS-CoV (SARS) -virus. [22] . Solu ympäröi viruksen kalvollaan, ja tuloksena oleva kalvovesikkeli on solun sytoplasmassa. Edellä mainitut kaksi solureseptoriproteiinia muuntavat viruksen S-proteiinin siten, että virus ja solukalvot fuusioituvat [23] .

Päästyään soluun virus muodostaa solunsisäisten kalvojen avulla kalvorakkuloita, joihin kiinnittyy erityisiä proteiinikomplekseja. Nämä kompleksit syntetisoivat kopion viruksen genomisesta RNA:sta ja lyhyitä mRNA:ita virusproteiinien synteesiä varten [24] .

Viruksen RNA:lla on 5'-metyloitu alku ja 3'- polyadenyloitu pääte. Tämä antaa viruksen käynnistää proteiiniensa kokoamisen RNA: ssaan solun ribosomien toimesta , mikä ei pysty määrittämään, onko kyseessä viruksen RNA vai itse solun proteiinien RNA.

Koronavirusten RNA on noin 26-30 tuhatta emäsparia , mikä tarkoittaa, että koronaviruksilla on kaikista tunnetuista viruksista suurin segmentoimaton RNA, eli ne ovat rakenteeltaan monimutkaisimpia tunnetuista viruksista. Viruksen genomi koostuu yli 20 000 nukleotidista ja se koodaa kahta replikoituvaa polyproteiinia pp1a ja pp1ab [25] [26] , joista muodostuu kopio viruksen RNA:sta seuraavassa replikaatio/translaatiovaiheessa, sekä 8 erillistä mRNA -templaattia virusproteiineja, joita syntyy loputtomasti. M-, S-, HE- ja E-proteiinien muodostuminen, jotka tulevat viruksen kalvolipidivaippaan, tapahtuu vastaavissa mRNA : issa solun endoplasmisessa retikulumissa ; N-proteiini, joka ympäröi viruksen genomista RNA:ta, syntetisoituu solun sytoplasmassa kelluvassa mRNA:ssa [24] .

Saatuaan viruksen genomisen RNA:n ja sen välttämättömät proteiinit, tämä N-proteiiniin kääritty RNA lähestyy endoplasmisessa retikulumissa olevia proteiineja ja on vuorovaikutuksessa niiden kanssa. Tämän seurauksena endoplasmisen retikulumin kalvo ja siinä olevat virusproteiinit peittävät tämän RNA:n muodostaen virionin [24] . Virionit vapautuvat sitten infektoituneesta solusta eksosytoosin kautta . Virionien vapautumisen jälkeen solu kuolee.

Taksonomia

Koronavirusten perheeseen ( lat.  Coronaviridae ) kuuluu 2 alaryhmää ja noin 46 lajia [27] :

Vuonna 2018 eristetty Letovirinae -alaheimo sisältää vain yhden hyväksytyn lajin, alasuvun ja suvun (kaksi muuta lajia on kuitenkin tunnistettu, joita ei ole vielä virallisesti hyväksytty):

Alaheimo Orthocoronavirinae


Katso myös

Muistiinpanot

  1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  2. ↑ 1 2 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Oppikirja lääketieteen opiskelijoille / toim. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Medical Information Agency, 2003. - S. 121. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
  3. ↑ 1 2 Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Koronavirusten (Nidovirales: Coronaviridae) tutkimushistoria ja nykyaikainen luokittelu  // Infektio ja immuniteetti . - 2020. - T. 10 , nro 2 . - S. 221-246 . - doi : 10.15789/2220-7619-H0I-1412 . Arkistoitu alkuperäisestä 25.6.2020.
  4. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla . (Käytetty: 19. heinäkuuta 2019)
  5. ↑ M. Yu. Shchelkanov, LV Kolobukhina, OA Burgasova, IS Kruzhkova, VV Maleev. COVID-19: etiologia, kliininen kuva, hoito  // Russian Journal of Infection and Immunity. - 2020-05-06. - T. 10 , no. 3 . — S. 421–445 . — ISSN 2220-7619 2313-7398, 2220-7619 . - doi : 10.15789/2220-7619-CEC-1473 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. huhtikuuta 2022.
  6. ↑ Supotnitsky M. V. Uusi koronavirus SARS-CoV-2 koronavirusinfektioiden maailmanlaajuisen epidemiologian näkökulmasta  // Bulletin of the RCB Protection Troops. - 2020. - Vol. 4 , no. 1 . - S. 32-65 .
  7. ↑ Ensimmäisten koronavirusten salainen historia Arkistoitu 22. huhtikuuta 2020 Wayback Machineen // Forbes.
  8. ↑ Merriam-Websterin määritelmä koronavirukselle . Merriam Webster. Haettu 24. maaliskuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 23. maaliskuuta 2020.
  9. ↑ Merriam-Websterin Coronan määritelmä . Merriam Webster. Haettu 24. maaliskuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 24. maaliskuuta 2020.
  10. ↑ 1 2 Tyrrell, David Arthur John. Kylmät sodat: Taistelu kylmää  vastaan ]  / David Arthur John Tyrrell, Michael Fielder. - Oxford University Press, 2002. - S. 96. - "Katsoimme tarkemmin uusien virusten ulkonäköä ja huomasimme, että niitä ympäröi eräänlainen kehä. Sanakirjaan turvautuminen tuotti latinankielisen vastineen corona, ja niin syntyi nimi coronavirus." - ISBN 978-0-19-263285-2 . Arkistoitu 18. marraskuuta 2020 Wayback Machinessa
  11. ↑ 1 2 Almeida JD, Berry DM, Cunningham CH, Hamre D, Hofstad MS, Mallucci L, McIntosh K, Tyrrell DA (marraskuu 1968). Virologia: Koronavirukset. luonto . 220 (5168): 650. Bibcode : 1968Natur.220..650. . DOI : 10.1038/220650b0 . [T]tässä on myös tyypillinen "hapsu" 200 A pituisille ulokkeille, jotka ovat pyöristettyjä tai terälehden muotoisia... Tämä aurinkokoronaa muistuttava ulkonäkö on yhteinen hiiren hepatiittivirukselle ja useille ihmisestä hiljattain toipuville viruksille, nimittäin kannalle. B814, 229E ja monet muut.
  12. ↑ Sturman LS, Holmes KV (1983-01-01). Lauffer MA, Maramorosch K, toim. "Koronavirusten molekyylibiologia" . Virustutkimuksen edistysaskel . 28 :35-112. DOI : 10.1016/s0065-3527(08)60721-6 . ISBN  9780120398287 . PMC  7131312 . PMID  6362367 . [N]äillä viruksilla oli tyypillinen suurten, erottuvien, terälehden muotoisten peplomeerien tai piikien reuna, jotka muistuttivat kruunua, kuten uskonnollisessa taiteessa corona spinarum ; tästä syystä nimi koronavirukset.
  13. ↑ Lalchhandama, Kholhring (2020). "Koronavirusten kronikat: keuhkoputkentulehdus, hepatiitti ja flunssa". Tieteen visio _ ]. 20 (1):43-53. DOI : 10.33493/scivis.20.01.04 .
  14. ↑ Carstens EB (2010). "Ratifiointiäänestys taksonomisista ehdotuksista Kansainväliselle virustaksonomiakomitealle (2009)" . Virologian arkisto . 155 (1): 133-46. DOI : 10.1007/s00705-009-0547-x . PMC  7086975 . PMID  19960211 .
  15. ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (maaliskuu 2019). Lepakkokoronavirukset Kiinassa . Virukset . 11 (3): 210. doi : 10.3390/ v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .  
  16. ↑ Kansainvälinen virustaksonomiakomitea (ICTV  ) . talk.ictvonline.org . Haettu 14. syyskuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 20. maaliskuuta 2020.
  17. ↑ Gilmutdinov R. Ya., Galiullin A. K., Spiridonov G. N. Luonnonvaraisten lintujen koronavirusinfektiot  // Eläinlääkäri. - 2020. - Numero. 6 . - S. 57-67 . - doi : 10.33632/1998-698X.2020-6-57-67 .
  18. ↑ Pulmonologia: kansallinen ohje . - M  .: GEOTAR-Media, 2009.
  19. ↑ Shirobokov V.P. Lääketieteellinen mikrobiologia, virologia ja immunologia . - Vinnitsa: Uusi kirja, 2015. - S. 504-505.
  20. ↑ Korotyaev A.I. , Babichev S.A. Lääketieteellinen mikrobiologia, immunologia ja virologia . - Pietari: SpecLit, 2008.
  21. ↑ Stasevich, 2020 , s. 11-12.
  22. ↑ Xintian Xu, Ping Chen, Jingfang Wang, Jiannan Feng, Hui Zhou. Uuden koronaviruksen evoluutio meneillään olevasta Wuhanin epidemiasta ja sen piikkiproteiinin mallinnus ihmiseen tarttuvan riskin suhteen  //  SCIENCE CHINA Life Sciences. - 2020. - Vol. 63 . — s. 457–460 . - doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . Arkistoitu alkuperäisestä 28. kesäkuuta 2021.
  23. ↑ Stasevich, 2020 , s. 10-12.
  24. ↑ 1 2 3 Stasevich, 2020 , s. 12.
  25. ↑ Koronavirukset: Molecular and Cellular Biology  (englanniksi) / V. Thiel (toimittaja). – 1. painos. – Caister Academic Press, 2007. - ISBN 978-1-904455-16-5 .
  26. ↑ Perhe - Coronaviridae // Virustaksonomia: Kansainvälisen virustaksonomian komitean yhdeksäs raportti  / Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz (Toim.). - Elsevier Inc., 2012. - P.  806-828 . — ISBN 978-0-12-384684-6 . - doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00068-9 .
  27. ↑ Virus Metadata Repository: versio 1.5.2020; MSL35  // Kansainvälinen virustaksonomiakomitea (ICTV). - 2020 - 1. toukokuuta.

Kirjallisuus

Linkit

  Siirry Wikidata-kohteeseen  Sanakirjat ja tietosanakirjat
Taksonomia
Bibliografisissa luetteloissa