Messenger RNA

Matriisiribonukleiinihappo ( mRNA , synonyymi - lähetti-RNA, mRNA ) - RNA , joka sisältää tietoa proteiinien primäärirakenteesta (aminohapposekvenssistä) [1] . mRNA syntetisoituu DNA :sta transkription aikana , minkä jälkeen sitä puolestaan ​​käytetään translaation aikana templaattina proteiinisynteesiin. Siten mRNA:lla on tärkeä rooli geenien "ilmentymisessä" ( ekspressiossa ) .

Tyypillinen kypsä mRNA on pituudeltaan useista sadaista useisiin tuhansiin nukleotideihin . Pisimmät mRNA:t on havaittu (+)ss-RNA- viruksissa , kuten pikornaviruksissa  - tulee kuitenkin muistaa, että näissä viruksissa mRNA muodostaa niiden koko genomin .

DNA:ta verrataan usein suunnitelmiin – ja samalla ohjeisiin – proteiinien valmistamiseksi. Tätä suunnittelu-tuotanto-analogiaa kehitettäessä voidaan sanoa, että jos DNA on "täydellinen sarja proteiinien valmistukseen tarkoitettuja suunnitelmia-ohjeita, jotka on säilytetty tehtaan johtajan kassakaapissa", niin mRNA on "väliaikainen työkopio suunnitelma-ohjeista yksiosainen, julkaistu Assembly Shopissa". On huomattava, että DNA ei sisällä yksityiskohtaista kuvaa aikuisesta organismista, vaan se on enemmän kuin "resepti" sen valmistukseen, jota sovelletaan vallitsevista olosuhteista riippuen geenin ilmentymisen aikana - osa täydestä ohjesarjasta on käytetty, ja osa ei ole.

Löytöhistoria

1900-luvun puoliväliin mennessä oli kertynyt tieteellistä tietoa, jonka perusteella oli mahdollista päätellä, että proteiinien rakennetta koodaavat DNA-osat - geenit [2] . Varsinaista koodausmekanismia ei kuitenkaan ole vahvistettu.

J. Brachetin (1944) ja T. Kasperssonin (1947) työ osoitti, että solut, jotka syntetisoivat aktiivisesti proteiinia, sisältävät suuren määrän RNA:ta sytoplasmassa . Myöhemmin kävi ilmi, että tämä koskee pääasiassa ribosomaalista RNA :ta , ei mRNA:ta, jonka määrä on solussa suhteellisen pieni. Tämä havainto kuitenkin yhdisti DNA:n, RNA:n ja proteiinin, ja sillä oli todennäköisesti rooli ehdotuksessa RNA:n mahdollisesta roolista välittäjänä, joka pystyy siirtämään tietoa ytimessä olevasta DNA: sta proteiinin biosynteesilaitteistoon sytoplasmassa [3] .

Samaan aikaan löydettiin ribosomeja  - ribonukleoproteiinihiukkasia , jotka syntetisoivat proteiineja. On ehdotettu, että geenit transkriptoidaan RNA-ribosomeihin, jotka toimivat templaatteina proteiinisynteesiin [4] . Kuitenkin vuosina 1956-1958 A. Belozersky ja A. Spirin suorittivat vertailevan analyysin useiden mikro-organismien DNA:n ja RNA:n nukleotidikoostumuksesta, ja osoittivat, että DNA:n koostumuksen suurilla vaihteluilla RNA:ssa oli erilaisia lajit olivat melko samanlaisia ​​[5] . Tämä osoitti, että suurin osa solujen RNA:sta (rRNA) ei heijasta tietyn organismin DNA:n nukleotidikoostumusta eikä se voi toimia templaattina proteiinisynteesiä varten. Samaan aikaan kirjoittajat pystyivät havaitsemaan heikon positiivisen korrelaation DNA:n ja RNA:n koostumuksen välillä, ja lajien välillä oli suuria eroja. Tämä antoi heille mahdollisuuden ehdottaa, että rRNA:n lisäksi solussa on toinen pieni osa RNA:ta, joka voi välittää geenin ilmentymistä.

Riippumatta, E. Volkin ja L. Astrachan tulivat samanlaisiin johtopäätöksiin: he havaitsivat, että kun bakteerisolut infektoidaan T2- bakteriofagilla , ne siirtyvät täysin virusproteiinien synteesiin. Vaikka suurin osa isäntäsolun RNA:sta pysyy muuttumattomana, infektion jälkeen syntetisoituu pieni määrä lyhytikäistä RNA:ta, joka on nukleotidikoostumukseltaan samanlainen kuin faagi-DNA [6] [7] .

Vuonna 1961 useat tutkijaryhmät osoittivat suoraan lyhytikäisen RNA-lähettimen olemassaolon, joka on rakenteeltaan samanlainen kuin DNA:n geenit ja joka toimii mallina proteiinisynteesille sitoutumalla ribosomeihin [8] [9] .

"Life Cycle"

mRNA-molekyylin elinkaari alkaa sen "lukemisesta" DNA-templaatista (transkriptio) ja päättyy sen hajoamiseen yksittäisiksi nukleotideiksi. mRNA-molekyyli voi läpikäydä erilaisia ​​modifikaatioita elinkaarensa aikana ennen proteiinisynteesiä (translaatiota). Eukaryoottiset mRNA-molekyylit vaativat usein monimutkaista prosessointia ja kuljetusta ytimestä, mRNA-synteesipaikasta, ribosomeihin, joissa translaatio tapahtuu, kun taas prokaryoottiset mRNA-molekyylit eivät vaadi tätä ja RNA-synteesi liittyy proteiinisynteesiin [10] .

Transkriptio

Transkriptio on prosessi, jossa geneettistä tietoa kopioidaan DNA:sta RNA:han, erityisesti mRNA:han. Transkription suorittaa RNA-polymeraasientsyymi , joka komplementaarisuuden periaatteen mukaisesti rakentaa kopion DNA-segmentistä, joka perustuu yhteen kaksoiskierteen ketjuista. Tämä prosessi on järjestetty samalla tavalla sekä eukaryooteissa että prokaryooteissa. Suurin ero pro- ja eukaryoottien välillä on, että eukaryooteissa RNA-polymeraasi liittyy mRNA:ta prosessoiviin entsyymeihin transkription aikana, joten mRNA:n prosessointi ja transkriptio voivat tapahtua niissä samanaikaisesti. Lyhytikäisiä raakoja tai osittain prosessoituja transkriptiotuotteita kutsutaan pre-mRNA:iksi ; täydellisen prosessoinnin jälkeen - kypsä mRNA .

Eukaryoottinen mRNA:n kypsyminen

Vaikka prokaryoottien ( bakteerien ja arkkien ) mRNA on harvinaisia ​​poikkeuksia lukuun ottamatta välittömästi valmis translaatioon eikä vaadi erityistä prosessointia, eukaryoottiset pre-mRNA:t ovat kuitenkin laajojen modifikaatioiden kohteena. Joten samanaikaisesti transkription kanssa erityinen modifioitu nukleotidi ( cap ) lisätään RNA-molekyylin 5'-päähän, tietyt RNA-osat poistetaan ( splicing ) ja adeniininukleotidit lisätään 3'-päähän (niin. -kutsutaan polyadeniiniksi tai poly (A) - , tail) [11] . Tyypillisesti näitä transkription jälkeisiä muutoksia eukaryoottisessa mRNA:ssa kutsutaan mRNA:n käsittelyksi.

Korkki on ensimmäinen vaihe mRNA:n prosessoinnissa. Se tapahtuu, kun syntetisoitu transkripti saavuttaa 25–30 nukleotidin pituuden [12] . Välittömästi sen jälkeen, kun korkki on kiinnitetty transkriptin 5'-päähän, siihen sitoutuu cap-sitoutumiskompleksi CBC ( cap sitova kompleksi ) ,  joka pysyy sitoutuneena mRNA:han, kunnes käsittely on valmis ja on tärkeä kaikissa myöhemmissä vaiheissa [13] . ] . Silmukoinnin aikana ei-proteiinia koodaavat sekvenssit, joita kutsutaan introneiksi , poistetaan pre-mRNA:sta . Polyadenylaatio on välttämätön useimpien mRNA:iden kuljettamiseksi sytoplasmaan ja suojaa mRNA-molekyylejä nopealta hajoamiselta (lisää niiden puoliintumisaikaa). mRNA-molekyylit, joista puuttuu poly(A)-kohta (esimerkiksi virusmolekyylit), tuhoutuvat nopeasti eukaryoottisolujen sytoplasmassa ribonukleaasien vaikutuksesta .

Kun kaikki prosessoinnin vaiheet on saatu päätökseen, mRNA tarkistetaan ennenaikaisten lopetuskodonien puuttumisen varalta , minkä jälkeen siitä tulee täysimittainen templaatti translaatiota varten [14] . Sytoplasmassa korkin tunnistavat aloitustekijät , proteiinit, jotka vastaavat kiinnittymisestä ribosomin mRNA:han, polyadeniinihäntä sitoutuu erityiseen poly(A)-sitoutuvaan proteiiniin PABP1.

Liitos

Silmukointi on prosessi, jossa ei-proteiinia koodaavia alueita, joita kutsutaan introneiksi , poistetaan pre-mRNA:sta ; jäljelle jääneet sekvenssit kantavat tietoa proteiinin rakenteesta ja niitä kutsutaan eksoneiksi . Joskus pre-mRNA-silmukointituotteet voidaan silmukoida useilla tavoilla, jolloin yksi geeni voi koodata useita proteiineja. Tätä prosessia kutsutaan vaihtoehtoiseksi liittämiseksi . Silmukoinnin suorittaa yleensä RNA-proteiinikompleksi, jota kutsutaan silmukointiosomiksi , mutta jotkin mRNA-molekyylit voivat myös katalysoida silmukointia ilman proteiinien osallistumista (katso ribotsyymit ) [15] .

Kuljetus

Toinen ero eukaryoottien ja prokaryoottien välillä on mRNA-kuljetus. Koska eukaryoottinen transkriptio ja translaatio ovat spatiaalisesti erotettuja, eukaryoottiset mRNA :t on siirrettävä ytimestä sytoplasmaan [16] . Kypsät mRNA:t tunnistetaan modifikaatioiden läsnäolosta ja poistuvat ytimestä tumahuokosten kautta ; sytoplasmassa mRNA muodostaa nukleoproteiinikomplekseja - informosomeja  , joissa se kuljetetaan ribosomeihin . Monet mRNA:t sisältävät signaaleja, jotka määrittävät niiden lokalisoinnin [17] . Neuroneissa mRNA on kuljetettava neuronien kehosta dendriitteihin , joissa translaatio tapahtuu vasteena ulkoisille ärsykkeille [18] .

mRNA-vienti suoritetaan kuljetustekijöiden kompleksin Mex67-Mtr2 (hiivassa) tai TAP-p15:n (monisoluisissa organismeissa) mukana [19] . Tämä kompleksi ei kuitenkaan sido mRNA:ta suoraan, vaan adapteriproteiinin Yra1 ( hiivassa ) tai ALY/REF (monisoluisissa organismeissa) kautta, joka on yksi TREX-proteiinikompleksin alayksiköistä. TREX puolestaan ​​värvätään kompleksiin mRNA:n kanssa johtuen ALY/REF:n suorasta vuorovaikutuksesta capa sitovan kompleksin CBC80 -alayksikön kanssa [20] . Tämä mekanismi varmistaa kuljetuskompleksin kiinnittymisen lähelle mRNA:n 5'-päätä ja vastaavan kuljetussuunnan 5'-pään sytoplasmaan päin.

Metylointi

Eukaryoottiset mRNA:t käyvät läpi transkription jälkeisen metylaation . Yleisin modifikaatio on adenosiinitähteiden metylaatio N 6 -asemassa N 6 -metyyliadenosiinin (m 6 A) muodostumisella. Tätä prosessia katalysoivat N6 - adenosiinimetyylitransferaasientsyymit, jotka tunnistavat adenosiinitähteet konsensussekvensseistä GAC (70 % tapauksista) ja AAC (30 % tapauksista). Vastaavat demetylaasit katalysoivat käänteistä demetylaatioprosessia. Kun otetaan huomioon mRNA:n metylaatioprosessin palautuvuus ja dynaamisuus sekä lisääntynyt m6A:n pitoisuus pitkissä eksoneissa ja lopetuskodonien ympärillä , oletetaan, että mRNA:n metylaatiolla on säätelytoiminto [21] .

Lähetys

Koska prokaryoottista mRNA:ta ei tarvitse käsitellä ja kuljettaa, ribosomin translaatio voi alkaa välittömästi transkription jälkeen. Siksi voidaan sanoa, että translaatio prokaryooteissa sijoittuu samaan paikkaan transkription kanssa ja tapahtuu samanaikaisesti transkription kanssa .

Eukaryoottinen mRNA on prosessoitava ja toimitettava ytimestä sytoplasmaan, ja vasta sitten ribosomi voi kääntää sen. Translaatio voi tapahtua sekä ribosomeissa , jotka sijaitsevat sytoplasmassa vapaassa muodossa, että ribosomeissa, jotka liittyvät endoplasmisen retikulumin seinämiin . Siten eukaryooteissa translaatio ei ole suoraan kytketty transkriptioon.

Käännösasetus

Koska transkriptio yhdistetään translaatioon prokaryooteissa, prokaryoottisolu voi reagoida nopeasti ympäristön muutoksiin syntetisoimalla uusia proteiineja, eli säätely tapahtuu pääasiassa transkription tasolla . Eukaryooteissa vaste ulkoisiin ärsykkeisiin kestää kauemmin mRNA:n käsittelyn ja kuljetuksen tarpeesta johtuen. Siksi niiden proteiinisynteesi on intensiivisesti säädelty transkription jälkeisellä tasolla. Jokaista kypsää mRNA:ta ei transloida, koska solussa on mekanismeja proteiinin ilmentymisen säätelemiseksi transkription jälkeisellä tasolla, esimerkiksi RNA-interferenssi .

Jotkut mRNA:t sisältävät itse asiassa kaksi tandem - terminaattorikodonia (stop-kodonia) – usein nämä ovat erityyppisiä kodoneja koodaavan sekvenssin lopussa [22] .

Kypsä mRNA-rakenne

Kypsä mRNA koostuu useista alueista, jotka eroavat toiminnaltaan: "5'-cap", 5'-transloitumaton alue, koodaava (transloitunut) alue, 3'-transloitumaton alue ja 3'-polyadeniini "häntä".

5'-Cap

5'-cap ( englannin sanasta  cap  - cap) on modifioitu guanosiininukleotidi , joka lisätään kypsymättömän mRNA:n 5'- ( etu )päähän. Tämä modifikaatio on erittäin tärkeä mRNA:n tunnistamiselle translaation aloituksen aikana sekä suojaukselle 5'-nukleaaseja, entsyymejä vastaan, jotka tuhoavat nukleiinihappoketjuja, joissa on suojaamaton 5'-pää.

Alueiden koodaus

Koodaavat alueet koostuvat kodoneista  , jotka ovat kolmen välittömästi toisiaan seuraavan nukleotidin sekvenssejä, joista jokainen vastaa geneettisessä koodissa tiettyä aminohappoa tai proteiinisynteesin alkua ja loppua. Koodaavat alueet alkavat aloituskodonilla ja päättyvät yhteen kolmesta lopetuskodonista. Kodonisekvenssin lukeminen ja sen syntetisoituneen proteiinimolekyylin aminohapposekvenssin perusteella kokoaminen suoritetaan ribosomien avulla kuljetus-RNA : iden osallistuessa translaatioprosessiin . Koodaavien proteiinien lisäksi osa koodaavista alueista voi toimia kontrollisekvensseinä. Esimerkiksi RNA:n sekundaarinen rakenne määrää joissakin tapauksissa translaation tuloksen.

Monokistroninen ja polykistroninen mRNA

MRNA:ta kutsutaan monokistroniseksi, jos se sisältää vain yhden proteiinin (yhden cistronin ) translaatioon tarvittavan tiedon . Monikistroninen mRNA koodaa useita proteiineja. Geenit (cistronit) sellaisessa mRNA:ssa erotetaan geenien välisillä, ei-koodaavilla sekvensseillä. Monikistroniset mRNA:t ovat ominaisia ​​prokaryooteille ja viruksille ; eukaryooteissa suurin osa mRNA:sta on monokistronista [23] [24] [25] .

Kääntämättömät alueet

Transloitumattomat alueet  ovat RNA:n alueita, jotka sijaitsevat ennen aloituskodonia ja lopetuskodonia, jotka eivät koodaa proteiinia. Niitä kutsutaan vastaavasti 5'-transloitumattomaksi alueeksi ja 3'-transloitumattomaksi alueeksi. Nämä alueet transkriptoidaan osana samaa transkriptiä kuin koodaava alue. Translatoimattomilla alueilla on useita toimintoja mRNA:n elinkierrossa, mukaan lukien mRNA:n stabiilisuuden säätely, mRNA:n lokalisaatio ja translaatiotehokkuus. mRNA:n stabiilisuutta voidaan kontrolloida 5'- ja/tai 3'-alueella, mikä johtuu erilaisesta herkkyydestä RNA:n hajoamisesta vastaaville entsyymeille - RNaasit ja säätelyproteiinit, jotka nopeuttavat tai hidastavat hajoamista [26] .

3'-polyadeniinihäntä

Pitkä (usein useita satoja nukleotideja) adeniiniemästen sekvenssi, joka on läsnä eukaryoottisen mRNA:n 3'-hännässä, syntetisoidaan polyadenylaattipolymeraasientsyymin toimesta. Korkeammissa eukaryooteissa poly(A)-häntä lisätään transkriptoituun RNA:han, joka sisältää spesifisen sekvenssin, AAUAAA. Tämän sekvenssin tärkeys näkyy esimerkissä ihmisen 2 - globiinigeenin mutaatiosta , joka muuttaa AAUAAA:n AAUAAG:ksi, mikä johtaa riittämättömään globiiniin kehossa [27] .

Toissijainen rakenne

Primäärirakenteen (nukleotidisekvenssin) lisäksi mRNA:lla on sekundaarirakenne. Toisin kuin DNA:n, jonka sekundaarirakenne perustuu molekyylien välisiin vuorovaikutuksiin (DNA:n kaksoiskierre muodostuu kahdesta lineaarisesta molekyylistä, jotka on liitetty toisiinsa koko pituudelta vetysidoksilla), mRNA:n sekundaarirakenne perustuu molekyylinsisäisiin vuorovaikutuksiin (lineaarinen molekyyli "laskoksia" ja vetysidoksia esiintyy saman molekyylin eri alueiden välillä).

Varsi, silmukka ja pseudoknot ovat esimerkkejä toissijaisesta rakenteesta. [28]

Toissijaiset rakenteet mRNA:ssa säätelevät translaatiota. Esimerkiksi epätavallisten aminohappojen , selenometioniinin ja pyrrolysiinin , liittäminen proteiineihin riippuu kantasilmukasta, joka sijaitsee 3'-transloitumattomalla alueella. Pseudoknotit muuttavat ohjelmallisesti geenien lukukehystä . Toissijainen rakenne myös hidastaa tiettyjen mRNA:iden hajoamista [29] [30]

Viruksen mRNA: issa monimutkaiset sekundaarirakenteet ( IRES ) ohjaavat translaatiota cap-tunnistus- ja translaation aloitustekijöistä riippumatta (katso " Käännöksen aloitus ").

Tuhoa

Eri mRNA:illa on erilainen elinikä (stabiilisuus). Bakteerisoluissa mRNA-molekyyli voi esiintyä muutamasta sekunnista yli tuntiin ja nisäkässoluissa useista minuuteista useisiin päiviin. Mitä suurempi mRNA:n stabiilius on, sitä enemmän proteiinia voidaan syntetisoida tietystä molekyylistä. Solun mRNA:n rajoitettu elinikä mahdollistaa nopeat muutokset proteiinisynteesissä vasteena muuttuviin solutarpeisiin. Jonkin ajan kuluttua mRNA hajoaa sen nukleotidisekvenssin, erityisesti molekyylin 3'-pään polyadeniinialueen pituuden, perusteella sen muodostaviksi nukleotideiksi RNaasien osallistuessa . Tähän mennessä tunnetaan monia mRNA:n hajoamismekanismeja, joista osa kuvataan alla.

mRNA:n hajoaminen prokaryooteissa

Prokaryooteissa mRNA:n stabiilisuus on paljon pienempi kuin eukaryooteissa. mRNA:n hajoaminen prokaryoottisoluissa tapahtuu ribonukleaasien yhdistelmän vaikutuksesta, mukaan lukien endonukleaasit, 3'-eksonukleaasit ja 5'-eksonukleaasit. Joissakin tapauksissa pienet RNA-molekyylit, joiden pituus vaihtelee kymmenistä satoihin nukleotideihin, voivat stimuloida mRNA:n hajoamista pariutumalla komplementaarisesti vastaaviin mRNA:n sekvensseihin ja edistämällä ribonukleaaseja [31] [32] . Vuonna 2008 osoitettiin, että bakteereissa on jotain korkkia, trifosfaattia 5'-päässä [33] . Kahden fosfaatin poistaminen jättää monofosfaatin 5'-päähän, mikä aiheuttaa mRNA:n pilkkomisen RNaasi E -endonukleaasin toimesta .

Eukaryooteissa

Tyypillisesti hajoaminen alkaa poistamalla kansi 5'-päästä, polyadeniinihäntä 3'-päästä, ja sitten nukleaasit hajottavat samanaikaisesti mRNA:ta 5' -> 3' ja 3' -> 5' -suunnissa. mRNA, jossa proteiinisynteesin loppuun saattamisen signaali, stop-kodoni, sijaitsee koodaavan sekvenssin keskellä transkriptiovirheen seurauksena, on erityisen nopean hajoamismuodon, NMD :n alainen .

Määritysmenetelmät

Äskettäin on kehitetty erittäin herkkiä menetelmiä, joiden avulla on mahdollista analysoida "transkriptomi" näytteistä, joiden koko on 50-100 solua [34] [35] [36] .

Katso myös

Kirjallisuus

  1. ↑ Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Solun molekyylibiologia. - 5. - Garland Science, 2008. - 1392 s. — ISBN 0815341059 .
  2. ↑ Ichas M. Biologinen koodi. - Moskova: Mir, 1971.
  3. ↑ Crick FH Geneettinen koodi - eilen, tänään ja huomenna  // Cold Spring Harb. Symp. määrä. Biol .. - 1966. - T. 31 . - S. 1-9 . — PMID 5237190 .
  4. ↑ Spirin A.S. Luku II. Viesti-RNA ja geneettinen koodi // Molekyylibiologia. Ribosomin rakenne ja proteiinien biosynteesi. - Moskova: Higher School, 1986. - S. 9-11.
  5. ↑ Belozersky AN, Spirin AS Deoksiribonukleiini- ja ribonukleiinihappojen koostumusten välinen korrelaatio   // Luonto . - 1958. - Voi. 182 , iss. 4628 . - s. 111-112 . — PMID 13566202 .
  6. ↑ Volkin E., Astrachan L. Leimatun ribonukleiinihapon solunsisäinen jakautuminen Escherichia colin faagiinfektion jälkeen // Virology. - 1956. - Osa 2 , no. 4 . - S. 433-437 . — PMID 13352773 .
  7. ↑ Volkin E., Astrachan L. Fosforin sisällyttäminen Escherichia colin ribonukleiinihappoon bakteriofagi T2:lla infektion jälkeen // Virology. - 1956. - Osa 2 , no. 2 . - S. 149-161 . — PMID 13312220 .
  8. ↑ Brenner S., Jacob F., Meselson M. Epästabiili välituote, joka kuljettaa tietoa geeneistä ribosomeihin proteiinisynteesiä varten   // Nature . - 1961. - Voi. 190 . - s. 576-581 . — PMID 20446365 .
  9. ↑ Gros F., Hiatt H., Gilbert W., Kurland CG, Risebrough RW, Watson JD Epästabiili ribonukleiinihappo, joka paljastui Escherichia colin pulssileimauksella   // Nature . - 1961. - Voi. 190 . - s. 581-585 . — PMID 13708983 .
  10. ↑ Alberts, Bruce; Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts ja Peter Walters. Solun molekyylibiologia; Neljäs painos  (englanniksi) . — New York ja Lontoo: Garland Science, 2002.
  11. ↑ Moore MJ, Proudfoot NJ Esi-mRNA-käsittely ulottuu takaisin transkriptioon ja eteenpäin translaatioon  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2009. - Voi. 20 . - s. 688-700 . — PMID 19239889 .
  12. ↑ Rasmussen EB, Lis JT. In vivo -transkription tauko ja korkin muodostuminen kolmessa Drosophilan lämpösokkigeenissä  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 1993. - Voi. 90 . - P. 7923-7927 . — PMID 8367444 .
  13. ↑ Topisirovic I., Svitkin YV, Sonenberg N., Shatkin AJ Cap and cap-binding proteins in the control of gene-  explension //  Wiley Interdiscip Rev RNA : Journal. - 2011. - Vol. 2 , ei. 2 . - s. 277-298 . - doi : 10.1002/wrna.52 . — PMID 21957010 .
  14. ↑ Maquat LE Nonsense-välitteinen mRNA-hajoaminen: silmukointi, translaatio ja mRNP-dynamiikka   // Nat . Rev. Mol. Cell biol.  : päiväkirja. - 2004. - Voi. 5 , ei. 2 . - s. 89-99 . - doi : 10.1038/nrm1310 . — PMID 15040442 .
  15. ↑ Johnston W., Unrau P., Lawrence M., Glasner M., Bartel D. RNA-katalysoitu RNA-polymerointi: tarkka ja yleinen RNA-temploitu alukepidennys  //  Science : Journal. - 2001. - Voi. 292 , nro. 5520 . - s. 1319-1325 . — PMID 11358999 . Arkistoitu alkuperäisestä 27. helmikuuta 2012.
  16. ↑ Paquin N., Chartrand P. mRNA:n translaation paikallinen säätely: uusia näkemyksiä alkuunsa   // Trends Cell Biol : päiväkirja. - 2008. - Voi. 18 . - s. 105-111 .
  17. ↑ Ainger, Kevin; Avossa, Daniela; Diana, Amy S. & Barry, Christopher (1997), Transport and Localization Elements in Myelin Basic Protein mRNA , The Journal of Cell Biology osa 138 (5): 1077–1087, PMID 9281585 , doi : 10.1083/jc.717. , < http://www.jcb.org/cgi/content/full/138/5/1077 > Arkistoitu 28. marraskuuta 2007 Wayback Machinessa 
  18. ↑ Job, C. & Eberwine, J. (1912), mRNA:n lokalisointi ja translaatio dendriiteissä ja aksoneissa , Nat Rev Neurosci T. 2001 (12): 889–98, PMID 11733796 , doi : 10.1038/6910.40 : 35 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11733796 > Arkistoitu 3. lokakuuta 2016 Wayback Machinessa 
  19. ↑ Köhler A., ​​​​Hurt E. RNA:n vienti ytimestä sytoplasmaan   // Nat . Rev. Mol. Cell biol.  : päiväkirja. - 2007. - Voi. 8 , ei. 10 . - s. 761-773 . - doi : 10.1038/nrm2255 . — PMID 17786152 .
  20. ↑ Cheng H., Dufu K., Lee CS, Hsu JL, Dias A., Reed R. Ihmisen mRNA:n vientikoneisto värvätty mRNA:n 5'-päähän  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2006. - Voi. 127 , nro. 7 . - s. 1389-1400 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.10.044 . — PMID 17190602 .
  21. ↑ Wang X., Lu Z., Gomez A., Hon GC, Yue Y., Han D., Fu Y., Parisien M., Dai Q., ​​​​Jia G., Ren B., Pan T., Hän C . {{{title}}}  (eng.)  // Luonto. - 2014. - Vol. 505 , iss. 7481 . - s. 117-120 . - doi : 10.1038/luonto12730 . — PMID 24284625 .
  22. ↑ Ayala F. D. Moderni genetiikka. 1987.
  23. ↑ Poyry, T., Kaminski, A., Jackson R. Mikä määrittää sen, jatkavatko nisäkäsribosomit skannausta lyhyen ylävirran avoimen lukukehyksen kääntämisen jälkeen  // Genes and Development  : Journal  . - 2004. - Voi. 18 . - s. 62-75 .
  24. ↑ Kozak, M. (1983), Prokaryooteissa, eukaryooteissa ja organelleissa tapahtuvan proteiinisynteesin aloituksen vertailu , Microbiological Reviews , osa 47 (1): 1-45, PMID 6343825 , < http://www.pubmedcentral.nih. gov/picrender.fcgi?artid=281560&blobtype=pdf > . Haettu 12. elokuuta 2006.  
  25. ↑ Niehrs C, Pollet N (1999), Synexpression groups in eukaryotes , Nature T. 402 (6761): 483-7, PMID 10591207 , DOI 10.1038/ 990025 
  26. ↑ Kozak, M. Prokaryoottien, eukaryoottien ja organellejen proteiinisynteesin aloituksen vertailu  //  Microbiology and Molecular Biology Reviews : päiväkirja. — American Society for Microbiology, 1983. - Voi. 47 , nro. 1 . - s. 1-45 . — PMID 15680349 .
  27. ↑ Shaw, G. ja Kamen, R. Konservoitunut AU-sekvenssi GM-CSF-mRNA:n transloimattomalta 3'-alueelta välittää selektiivistä mRNA:n hajoamista  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1986. - Voi. 46 , nro. 5 . - s. 659-667 . — PMID 15680349 .
  28. ↑ Nukleiinihapporakenteen muodostumisprosessien tietokoneanalyysi // Matemaattinen mallintaminen. - M. , 2013. - T. 25, nro 4. - S. 126–134.
  29. ↑ Shabalina SA, Ogurtsov AY, Spiridonov NA (2006), Geneettisen koodin luoma mRNA:n sekundaarirakenteen jaksollinen malli , Nucleic Acids Res. T. 34 (8): 2428–37, PMID 16682450 , DOI 10.1093/nar/gkl287 
  30. ↑ Katz L, Burge CB (2003), Laaja valikoima paikallista RNA:n sekundaarirakennetta bakteerigeenien koodaavilla alueilla , Genome Res. T. 13 (9): 2042–51, PMID 12952875 , DOI 10.1101/gr.1257503 
  31. ↑ Vogel J., Wagner EG Pienten ei-koodaavien RNA:iden kohdetunnistus bakteereissa   // Curr . Opin. mikrobiol. : päiväkirja. - 2007. - Kesäkuu ( osa 10 , nro 3 ). - s. 262-270 . - doi : 10.1016/j.mib.2007.06.001 . — PMID 17574901 .
  32. ↑ Viegas SC, Arraiano CM Säätöjen säätely: Kuinka ribonukleaasit sanelevat säännöt pienten ei-koodaavien RNA:iden hallinnassa  // RNA  Biol : päiväkirja. - 2008. - Voi. 5 , ei. 4 . - s. 230-243 . — PMID 18981732 .
  33. ↑ Deana, Atilio; Celesnik, Helena & Belasco, Joel G. (2008), Bakteerientsyymi RppH laukaisee lähetti-RNA:n hajoamisen 5'-pyrofosfaatin poistamisella , Nature T. 451 (7176): 355–8, PMID 18202662 , doi : < 5 07046/10 . ://www.nature.com/nature/journal/v451/n7176/abs/nature06475.html > Arkistoitu 21. tammikuuta 2008 Wayback Machinessa 
  34. ↑ Bhargava, V., Ko, P., Willems, E., Mercola, M., & Subramaniam, S. (2013) Quantitative Transcriptomics using Designed Primer-based Amplification Arkistoitu 27. lokakuuta 2013 Wayback Machinessa . Tieteelliset raportit, 3, artikkelinumero: 1740 doi:10.1038/srep01740
  35. ↑ Tilgner, H., Raha, D., Habegger, L., Mohiuddin, M., Gerstein, M., & Snyder, M. (2013). Ihmisen mRNA-isoformien tarkka tunnistaminen ja analyysi syvän pitkän lukusekvenssin avulla. G3: Geenit| Genomit| Genetics, 3(3), 387-397. doi: 10.1534/g3.112.004812
  36. ↑ Drewe, P., Stegle, O., Hartmann, L., et ai. & Ratsch, G. (2013). Differentiaalisen RNA-käsittelyn tarkka havaitseminen. Nucleic acids research, 41(10), 5189-5198 doi: 10.1093/nar/gkt211

Linkit

  Siirry Wikidata-kohteeseen  Sanakirjat ja tietosanakirjat
Bibliografisissa luetteloissa
 RNA:n tyypit
Proteiinin biosynteesi
RNA:n käsittely
Geeniekspression säätely
cis-säätelyelementtejä
Parasiittiset elementit
muu
 Nukleiinihappotyypit _
Typpipitoiset emäkset
Nukleosidit
Nukleotidit
RNA
DNA
Analogit
Vektorityypit _