Ortervirales
Ortervirales on luokka, joka sisältää kaikki hyväksytyt yksijuosteiset RNA -viruslajit, jotka replikoituvat DNA - välituotteen(ryhmä VI) ja kaikki hyväksytyt kaksijuosteiset DNA-viruslajit (paitsi Hepadnaviridae ), jotka replikoituvat RNA-välituotteen kautta (ryhmä VII) [2] [3] . Nimi tulee sanan retro kääntöpuolelta [4] .
Kaikilla käänteistranskriptioviruksilla on merkittäviä samankaltaisuuksia keskenään. Niiden käänteiskopioijaproteiineilla on yhteinen alkuperä. Lisäksi belpaoviruksilla, metaviruksilla, pseudoviruksilla ja retroviruksilla on muita yhteisiä piirteitä. Niiden polymeraasiproteiinit ovat rakenteeltaan samanlaisia ja sisältävät asparagiiniproteaasin ( retroviraalinen aspartyyliproteaasi ) ja integraasin , joka kuuluu DDE-rekombinaasien superperheeseen (katso rekombinaatiota aktivoiva geeni ). Niillä on myös samanlaiset kapsidi- ja nukleokapsidiproteiinit/domeenit [5] . Caulimoviruksilla on myös joitain piirteitä belpaovirusten, metavirusten, pseudovirusten ja retrovirusten kanssa, kuten homologinen aspartaattiproteaasi . Toisaalta Hepadnaviridae -suku näyttää olevan kauempaa sukua yllä oleville perheille [6] .
Taksonomia
Tämä tilaus sisältää viisi perhettä:
Viitteet
- ↑ Virusten taksonomia Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
- ↑ Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: Uusi virusjärjestys, joka yhdistää viisi käänteiskopioijavirusten perhettä // Journal of Virology. – 15.6.2018. - T. 92 , no. 12 . — S. e00515–18 . — ISSN 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
- ↑ Taksonomia . _ Kansainvälinen virustaksonomiakomitea (ICTV) . Käyttöönottopäivä: 23.5.2018.
- ↑ Jens H. Kuhn, Mart Krupovic et ai. : Luodaan uusi tilaus, Ortervirales, viidelle käänteiskopioivien virusten perheelle , ICTV Proposal (Taxoprop) 2017.013D, DOI:10.1340/RG.2.2.24914.04804
- ↑ Krupovic, M (2017). "Homologiset kapsidiproteiinit todistavat retrovirusten, caulimovirusten, pseudovirusten ja metavirusten yhteisestä sukujuuresta." Journal of Virology . 91 (12). DOI : 10.1128/JVI.00210-17 . PMID28356531 _ _
- ↑ Krupovic, M (4. huhtikuuta 2018). " Ortervirales : Uusi virusjärjestys, joka yhdistää viisi käänteiskopioijavirusperhettä". Journal of Virology . 92 (12). DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642 . _
Virusten luokitus Baltimoren mukaan |
---|
DNA | I: virukset |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae_
- Simuloviridae_
- Sphaerolipoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Luokittelematon | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Luokittelematon |
|
---|
|
---|
Luokittelematon |
- perhe : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae_
- Clavaviridae_
- Fuselloviridae_
- Globuloviridae_
- Guttaviridae_
- Halspiviridae_
- Ovaliviridae_
- Plasmaviridae_
- Polydnaviridae_
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae_
- Suku : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-virukset |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae_
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae_ | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxiviridae
- Nanoviridae_
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae_
- Genomoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae_ | |
---|
|
---|
Luokittelematon |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-virukset |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae_
- Benyviridae
- Hepeviridae_
- Matonaviridae_
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae_
- Betaflexiviridae_
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae_
- Tymoviridae_
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae_
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolukavirukset | Tolivirales_ |
- Carmotetraviridae_
- Luteoviridae_
- Tombusviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae_
- Duinviridae_
- Fiersviridae_
- Solspiviridae_
|
---|
Timlovirales_ |
- Blumeviridae_
- Steitzviridae_
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae_
- Arteriviridae_
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae_
- Mononiviridae_
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae_
- Tobaniviridae_
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae_
- Solinviviridae
- Caliciviridae_
- Flaviridae_
- Secoviridae_
- Dicistroviridae_
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae_
- Barnaviridae_
- Solemoviridae_
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Luokittelematon |
- Heimot : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FROM | |
---|