Pseudoviridae

Pseudoviridae
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:ParanaviraeTyyppi:ArtverviricotaLuokka:RevtraviricetesTilaus:OrterviralesPerhe:Pseudoviridae
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Pseudoviridae
Tytärtaksonit
  • hemivirus
  • Pseudovirus
  • Sirevirus

Pseudoviridae  on virusperhe [2] , johon kuuluu kolme sukua [3] .

Perheen virukset ovat itse asiassa Ty1-copia-perheen LTR-retrotransposoneja . Ne replikoituvat käyttämällä rakenteita, joita kutsutaan viruksen kaltaisiksi partikkeleiksi (VLP). VLP:t eivät ole tarttuvia kuten normaalit virionit, mutta silti ne muodostavat tärkeän osan pseudovirusten elinkaarta [4] .

Taksonomia

Pseudoviridae luokitellaan epävirallisesti RNA VI - käänteistranskriptiovirusten ryhmään ja infektoi sieniä ja selkärangattomia .

Pseudoviridae sisältää erittäin erilaisia ​​jäseniä, ja useimmat Pseudoviridae koodaavat Gag ja Pol samassa avoimessa lukukehyksessä .

Pseudoviridae kuuluu Ortervirales- lahkoon yhdessä Belpaoviridae- , Metaviridae- , Retroviridae- ja Caulimoviridae-heimojen kanssa [5] .

Perheeseen kuuluvat seuraavat suvut: [3]

Muita Pseudoviridae- lajeja, joita ei ole luokiteltu sukuun, ovat:

Genomi

Tämän virusperheen genomi on segmentoimaton, -RT, positiivinen yksijuosteinen RNA ja se on 4200-9700 nukleotidia pitkä . Genomi koodaa rakenneproteiineja ja ei-rakenneproteiineja , jotka koodaavat RNA-riippuvaista DNA- polymeraasia , replikaasia ja käänteistranskriptaasia käänteiskopiointivaiheessa replikaation aikana .

Virologia

Viruksen kapsidissa ei ole kuorta ja se näyttää karkeasti pallomaiselta. Kapsidi on pyöreä, ikosaedrisymmetrinen ja kolmiomittausluvut (T) = 3 ja 4. Se on myös isometrinen kvasiisometrinen ja sen halkaisija on 30-50 nm. LTR -retrotransposonit on huonosti karakterisoitu, eikä niiden lipidejä ole raportoitu.

Genomi integroituu isäntägenomiin, ja isäntäsolun entsyymit , kuten eukaryoottinen tuman RNA-polymeraasi II , transkriptoivat sen . Genomin replikaatio tapahtuu isännän sytoplasmassa tai ydin ja kokoonpano voivat tapahtua sytoplasmassa tai tumassa.

Muistiinpanot

  1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  2. ↑ Llorens, C (2. helmikuuta 2021). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Pseudoviridae ". Journal of General Virology . 102 (3). doi : 10.1099/ jgv.0.001563 . PMID 33528349 . 
  3. ↑ 1 2 ICTV Report Pseudoviridae .
  4. ↑ Heimo: Pseudoviridae | ICTV  (englanniksi) . www.ictv.global . Haettu: 19.8.2022.
  5. ↑ "Ortervirales: Uusi virusjärjestys, joka yhdistää viisi käänteiskopioijavirusten perhettä". Journal of Virology . 92 (12). Kesäkuu 2018. DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642  . _
  6. ↑ NCBI: Penicillium camemberti virus - GP1 (laji)

Linkit