Bat SARSin kaltainen koronavirus RsSHC014

Bat SARSin kaltainen koronavirus RsSHC014
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:PisuviricotaLuokka:PisoniviricetesTilaus:NidoviralesAlajärjestys:CornidovirineaePerhe:KoronaviruksetAlaperhe:KoronaviruksetSuku:betakoronavirusAlasuku:SarbekovirusNäytä:Vaikea akuuttiin hengitystieoireyhtymään liittyvä koronavirusEristää:Bat SARSin kaltainen koronavirus RsSHC014
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Bat SARSin kaltainen koronavirus RsSHC014
Synonyymit
  • Bat SL-CoV RsSHC014

Bat SARSin kaltainen koronavirus RsSHC014  on SARS:n kaltaisen koronaviruksen  isolaatti , joka tartuttaa hevosenkenkälepakoita (Rhinolophidae). Löytyy Kiinasta, kuvattu vuonna 2013 [2] .

Virustunnistus

Huhtikuussa 2011-syyskuussa 2012 kerättiin 117 peräaukon vanupuikkoa ja ulostenäytettä lepakoista Rhinolophus sinicus -lepakoiden pesäkkeestä Kunmingin piirikunnassa ( Yunnanin maakunta Lounais- Kiinassa ) [2] . 27 näytteestä 117 (23 %) sisälsi seitsemän erilaista SARS-kaltaisen koronaviruksen isolaattia , joista kaksi oli aiemmin tuntematonta, nimeltään RsSHC014 ja Rs3367 [2] .

Kuvaus

RsSHC014-virus sisältää 29 787 emäsparia (pois lukien poly(A) häntä ) [2] . RsSHC014-genomin yleinen nukleotidisekvenssi-identtisyys ihmisen koronaviruksen SARS-CoV :n (kanta Tor2) kanssa on 95 %, mikä on korkeampi kuin aiemmin havaittiin kaikilla muilla SL-CoV-lepakoilla sekä Kiinassa (88-92 %) että Euroopassa ( 76 %) [2] . Fylogeneettinen analyysi on osoittanut, että RsSHC014 on rekombinaatiolinjojen jälkeläinen, joka lopulta johtaa ihmisen koronavirusten SARS-CoV ja SL-CoV Rs672 syntymiseen [2] .

Läheisistä yhtäläisyyksistä huolimatta lepakoiden koronavirus RsSHC014 ei kuitenkaan pysty tartuttamaan ihmisiä [3] . Oletettavasti sivetit ovat saaneet sen lepakoiden tartunnan , jossa virus mutatoitui useita vuosia (erityisesti sen ORF8-proteiini) ennen kuin muuttui SARS-CoV:ksi [3] .

Kimeerinen koronavirus RsSHC014:stä ja SARS-CoV:sta

Vuonna 2015 tutkijat Pohjois-Carolinan yliopistosta (USA) ja Wuhan Institute of Virologysta (Kiina) ilmoittivat luoneensa käänteisgenetiikkaa käyttäen kimeerisen koronaviruksen , joka koostuu SARS-CoV-viruksesta , mutta jossa oli peplometrit (piikkejä kuoressa). ) RsSHC014-viruksesta [4] . Työ osoitti tämän kimeerisen viruksen luotettavan replikaation sekä in vitro että in vivo [4] . In vitro -tutkimuksissa käytettiin kimeeristä virusta, joka oli luotu villistä SARS-CoV-kannasta (Urbani), ja in vivo -tutkimuksissa kimeerinen virus sisälsi hiireen mukautetun SARS-CoV MA15 -viruskannan (tämä kimeerinen virus sai nimekseen SHC014-MA15). [4] .

Pseudotyyppikokeet suoritettiin Wuhan Institute of Virologyn johtavassa erityispatogeenien ja bioturvallisuuden laboratoriossa, kaikki muut kokeet Pohjois-Carolinan yliopiston epidemiologian osaston laboratoriossa [4] . Kaikki tutkimukset suoritettiin bioturvallisuustason 3 ( BSL-3 ) laboratorioissa [4]

In vitro virus voi infektoida ihmisen hengitysteiden epiteeliä (HAE-solulinja), ihmisen keuhkosyöpäsoluja ( Calu-3 2B4 -solulinja ) ja kohdunkaulan syöpäsoluja ( HeLa -solulinja ) sekä hengitysteiden epiteelin. grivetin munuainen ( Vero E6 -solulinja). ) [4]

In vivo virus pystyi aiheuttamaan keuhkokuumeen hiirillä. SHC014-MA15-infektio johti merkittävään painon laskuun (10 %), mutta ei kuolleisuutta hiirillä [4] . SHC014-MA15:llä infektoiduilla hiirillä havaittiin hengitysteiden antigeenin värjäytymisen vähenemistä, eikä antigeenivärjäytymisen parenkymaalista tai yleistä histologista puutetta havaittu, mikä viittaa keuhkokudoksen erilaiseen infektioon tämän kimeerisen koronaviruksen aiheuttaman infektion kanssa [4] . Herkemmillä vanhoilla (12 kuukauden ikäisillä) hiirillä SHC014-MA15-infektio aiheutti jatkuvaa painonpudotusta, mutta sen kuolleisuus oli vähäistä [4] . Nuorilla hiirillä havaitut histologian ja antigeenien värjäytymismallit säilyivät myös vanhemmilla eläimillä [4] .

Tutkijat havaitsivat myös, että SARS :n immunoterapeuttiset ja profylaktiset hoidot (käyttämällä monoklonaalisia vasta-aineita tai saatavilla olevia rokotteita ) eivät pystyneet neutraloimaan tai suojaamaan kimeerisen koronaviruksen aiheuttamaa infektiota vastaan ​​[4] . Vuonna 2018 kuitenkin löydettiin rokote (dNSP16/ExoN), joka voisi neutraloida kimeerisen koronaviruksen SHC014-MA15 [5] .

Kritiikki

Marraskuussa 2015 Nature -lehdessä julkaistiin artikkeli, jossa ilmaistiin huoli tästä kokeesta, joka tuo vain vähän hyötyä virusten ymmärtämisessä, mutta aiheuttaa suuren riskin, jos laboratoriosta murtautuu kimeerinen koronavirus, joka pystyy tarttumaan ihmisiin [6] . Artikkelissa todettiin, että jos RsSHC014-lepakkovirus aiheuttaa vain potentiaalisen vaaran, niin uusi keinotekoisesti luotu kimeerinen koronavirus on jo todellinen uhka ihmisille [6] . Kuitenkin vuonna 2016 Columbia Universityn mikrobiologian ja immunologian professori Vincent Racaniello arvioidessaan uusinta tutkimusta mahdollisesti pandeemisista viruksista, mukaan lukien SHC014-MA15, totesi [7] : "Kokeiden kriitikot keinotekoisesti tehostaa virukset mainitsevat usein apokalyptisiä skenaarioita, joihin liittyy muunnettujen virusten vapautumista ja myöhempiä katastrofaalisia vaikutuksia ihmisiin. Tällaiset lausunnot ovat kuitenkin yksityisiä mielipiteitä, joiden tarkoituksena on vain pelotella yleisöä ja työntää meidät tarpeettomaan sääntelyyn. Virologit ovat manipuloineet viruksia vuosia […], eikä yksikään muunnettu virus ole aiheuttanut epidemiaa ihmisissä.”

Vuonna 2018 julkaistiin artikkeli [8] , jossa kritisoitiin käytäntöä arvioida koronavirusten (ja erityisesti kimeerisen koronaviruksen SHC014-MA15) in vivo patogeenisyyttä ihmisille puhtailla laboratoriohiirten kannoilla. Erityisesti ihmisille vaarallisen SARS-CoV- viruksen in vivo -tutkimusta varten oli välttämätöntä kehittää uusi SARS-CoV-kanta MA15, joka on tappava hiirten MA15 geneettiselle linjalle. Muiden SARS-kaltaisten koronavirusten patogeenisyyden tutkimukset MA15-hiirillä voivat kuitenkin johtaa näiden virusten vaaran aliarvioimiseen, koska nämä virukset voivat olla turvallisia vain tälle geneettiselle linjalle [8] . Lisäksi puhtailla hiirillä tehdyt patogeenisuustutkimukset vaikeuttavat sellaisten liitännäissairauksien (diabetes, krooninen keuhkosairaus, sydän- ja munuaissairaus) lisääntymistä ja tutkimista, jotka liittyvät ihmisillä havaittuun kuolemaan johtaviin hengitystiesairauksiin [8] .

Salaliittoteoria, joka yhdistää kimeerisen viruksen COVID-19-pandemiaan

Vuoden 2019 lopussa Wuhanissa puhkesi äkillinen uuden koronaviruksen SARS-CoV-2 -epidemia , joka johti COVID-19-pandemiaan vuoteen 2020 mennessä , mikä synnytti salaliittoteorioita, joiden mukaan virus on keinotekoinen ja liittyy SHC014-MA15:een.

Maaliskuussa 2020 Ohion yliopiston , Pennsylvanian yliopiston ja North Carolinan yliopiston tutkijoiden artikkeli [9] julkaistiin tieteellisessä lehdessä Emerging Microbes & Infections , joka kumoaa salaliittoteorian kimeerisen koronaviruksen identiteetistä. SHC014-MA15 ja koronavirus SARS-CoV-2, sillä kiinalaisten tutkijoiden [10] [11] artikkeleiden mukaan SHC014-MA15-koronavirus eroaa yli 6000 nukleotidilla (noin 20 %) SARS-CoV-viruksesta. 2 koronavirus. Näissä artikkeleissa SARS-CoV-2-koronaviruksen geneettistä koodia kuitenkin verrattiin lepakon koronaviruksen RsSHC014 geneettiseen koodiin, eikä kimeeriseen koronavirukseen SHC014-MA15, jonka koko geneettistä koodia ei ole julkaistu missään. . Maaliskuussa 2020 Nature Medicine -lehdessä julkaistiin artikkeli [12] , jossa analysoitiin SARS-CoV-2-koronaviruksen geneettistä koodia ja joka osoittaa, että tämä virus "ei ole laboratoriorakenne tai tarkoituksellisesti kontrolloitu virus .” On myös osoitettu [13] , että SARS-CoV-2:ta fylogeneettisesti lähimpänä ei ole Bat SL-CoV RsSHC014, vaan Bat SL-CoV ZC45 ja Bat SL-CoV ZXC21.

Muistiinpanot

  1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  2. ↑ 1 2 3 4 5 6 Ge X., Li J., Yang X. et ai. (2013). ACE2-reseptoria käyttävän lepakon SARS:n kaltaisen koronaviruksen eristäminen ja karakterisointi. Nature 503 : 535-538. doi : 10.1038/luonto12711 .
  3. ↑ 1 2 Lau SK, Feng Y., Chen H., Luk HK, Yang WH, Li KS, Zhang YZ, Huang Y., Song ZZ, Chow WN, Fan RY, Ahmed SS, Yeung HC, Lam CS, Cai JP , Wong SS, Chan JF, Yuen KY, Zhang HL ja Woo PC vakava akuutti hengitystieoireyhtymä (SARS) Koronaviruksen ORF8-proteiini on hankittu SARS:iin liittyvästä koronaviruksesta Greater Horseshoe Lepakoilta rekombinaatiolla : [ eng. ] // Virologian lehti. - 2015. - T. 89, nro 20. - P. 10532–10547. - doi : 10.1128/JVI.01048-15 .
  4. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Menachery V., Yount B., Debbink K. et al. (2015). SARSin kaltainen kiertävien lepakkokoronavirusten rypäs osoittaa, että ihmisten ilmaantuminen on mahdollista. Nat Med 21 : 1508-1513. doi : 10.1038/nm.3985 .
  5. ↑ Menachery VD, Gralinski LE, Mitchell HD, Dinnon KH 3rd, Leist SR, Yount BL Jr, McAnarney ET, Graham RL, Waters KM ja Baric RS Combination Attenuation Offers Strategy for Live Attenuated Coronavirus Vaccines : [ eng. ] // Virologian lehti. - 2018. - T. 92, nro 17. - P. e00710-18. - doi : 10.1128/JVI.00710-18 .
  6. ↑ 12 Butler , Declan. Suunniteltu lepakkovirus herättää keskustelua riskialttiista tutkimuksesta: Laboratoriossa valmistettu SARS:iin liittyvä koronavirus voi tartuttaa ihmissoluja  (englanniksi)  // Nature  : Journal. - Luonto, 2015. - 12. marraskuuta. - doi : 10.1038/luonto.2015.18787 . Arkistoitu 14. maaliskuuta 2020.
  7. ↑ Racaniello V. Siirtyminen metagenomiikan ulkopuolelle löytääksesi seuraavan pandeemisen viruksen // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America. - 2016. - T. 113, nro 11. - P. 2812-2814. - doi : 10.1073/pnas.1601512113 .
  8. ↑ 1 2 3 Cockrell AS, Leist SR, Douglas MG ja Baric RS Muodostuvien ja ennalta syntyvien ihmisen koronavirusten patogeneesin mallintaminen hiirissä // Nisäkäsgenomi: Kansainvälisen nisäkäsgenomiyhdistyksen virallinen lehti. - 2018. - T. 29, nro 7-8. - s. 367-383. - doi : 10.1007/s00335-018-9760-9 .
  9. ↑ Shan-Lu Liu, Linda J. Saif, Susan R. Weiss & Lishan Su (2020). Ei uskottavia todisteita, jotka tukevat väitteitä SARS-CoV-2, Emerging Microbes & Infections 9(1): 505-507, https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 Arkistoitu 2 Maaliskuu 2020.
  10. ↑ Zhu N. et ai. Uusi koronavirus keuhkokuumepotilailta Kiinassa, 2019 // New England Journal of Medicine. - 2020. - T. 382, ​​​​nro 8. - P. 727-733. - doi : 10.1056/NEJMoa2001017 .
  11. ↑ Wu F., Zhao S., Yu B. et ai. Uusi koronavirus, joka liittyy ihmisen hengitystiesairauksiin Kiinassa // Luonto. - 2020. - nro 579. - s. 265-269. - doi : 10.1038/s41586-020-2008-3 .
  12. ↑ Andersen KG, Rambaut A., Lipkin WI et ai. SARS-CoV-2:n proksimaalinen alkuperä // Nat Med. - 2020. - doi : 10.1038/s41591-020-0820-9 .
  13. ↑ Chan JF et ai. Vuoden 2019 uuteen koronavirukseen liittyvä suvullinen keuhkokuumeryhmä, joka viittaa ihmisestä toiseen: tutkimus perheklusterista // Lancet. - 2020. - T. 395, nro 10223. - P. 514-523. - doi : 10.1016/S0140-6736(20)30154-9 .

Linkit