Kaksoispohjat
Parilliset emäkset - kahden typpipitoisen nukleotidiemäksen pari nukleiinihappojen komplementaarisissa ketjuissa (vastakkainen DNA tai identtinen RNA ), jotka on yhdistetty vetysidoksilla .
Kanonisessa Watson - Crick DNA -emäsparituksessa adeniini ( A) pariutuu tymiinin (T) kanssa ja guaniini (G) pariutuu sytosiinin (C) kanssa. RNA:ssa tymiini on korvattu urasiililla (U). Muita ei-Watson-Crick-pareja esiintyy myös, erityisesti RNA:ssa, ja ne johtuvat muuttuneesta vetysidoskuviosta: Hoogsten (imidatsoli) parilliset emäkset ovat tyypillinen esimerkki . AT (tai AU) pari on yhdistetty kahdella vetysidoksella ja GC pari kolmella [1] .
Parillisten emästen muodostumisen päärooli biologisissa järjestelmissä on kyky lukea ja kopioida nukleiinihappoihin koodattua tietoa. Translaatioprosessin aikana emäsparien muodostumisen vuoksi lähetti- RNA - molekyylien kodonit tunnistavat siirto-RNA:iden antikodonit .
Jotkut DNA:ta tai RNA:ta sitovat entsyymit voivat tunnistaa tiettyjä emäsparisekvenssejä: esimerkiksi transkriptiotekijät tunnistavat tällä tavalla spesifisiä geenien säätelyalueita.
Käyttö mittayksikkönä
Organismien yksittäisten geenien tai kokonaisten genomien koko (C-arvo) ilmaistaan usein emäspareina, koska nämä geenit ja genomit liittyvät yhteen kaksijuosteiseksi DNA:ksi. Emäsparien lukumäärä on yhtä suuri kuin nukleotidien lukumäärä yhdessä juosteesta (lukuun ottamatta telomeerien ei-koodaavia alueita , jotka ovat yksijuosteisia).
Jos mittayksikkönä käytetään termiä "paired base", nimi lyhennetään yleensä "bp" ( englanninkielisestä kantaparista ). Venäjänkielisessä kirjallisuudessa käytetään joskus myös lyhennettä b.n. - nukleotidipari. Lisäksi käytetään johdettuja yksiköitä [2] :
- kilobase tai jne. o. (tbp tai kb; englannin kilobase , kb tai kbp) - tuhat emäsparia;
- megabase tai miljoonaa p.o. (miljoonaa emäsparia tai Mb; englannin megabase , Mb tai Mbp) - miljoona emäsparia;
- gigabase tai miljardi p.o. (miljardi bp tai Gb; englantilainen gigabase , Gb tai Gbp) - miljardi emäsparia.
Yksi emäspari vastaa etäisyyttä kaksijuosteisessa DNA-molekyylissä, joka on 3,4 Å (0,34 nm ), joka on yksi kymmenesosa kierteen täydellisestä kierroksesta [3] . Yhden emäsparin molekyylipaino DNA:ssa on keskimäärin 643 daltonia .
Katso myös
Muistiinpanot
- ↑ Kantor Ch., Schimmel P. Biofysikaalinen kemia / Per. englannista. toim. A. A. Bogdanov, Yu. S. Lazurkina, M. D. Frank-Kamenetsky. - M .: Mir, 1984. - T. 1. - S. 295. - 336 s.
- ↑ Tailed sammakkoeläingenomit olivat suuria alusta alkaen . Elements.ru . Käyttöpäivä: 1. tammikuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 5. helmikuuta 2016.
- ↑ Alberts B., Johnson A., Lewis J., Morgan D., Raff M., Roberts K., Walter P. Molecular Biology of the Cell . – 6. painos. — New York/Abingdon: Garland Science, Taylor & Francis Group, 2014. — s. 177. — ISBN 978-0-8153-4432-2 .
Kirjallisuus
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A., Levine M., Losick R. Molecular Biology of the Gene (neopr.) . – 5. — Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press, 2004. (Katso erityisesti luvut 6 ja 9)
- Olson, WK, Bansal, M., Burley, SK, Dickerson, RE, Gerstein, M., Harvey, SC, Heinemann, X.-JLU, Neidle, S., Shakked, Z., Sklenar, H., Suzuki, M., Tung, C.-S., Westhof, E., Wolberger, C. & Berman, HM Standardiviitekehys nukleiinihappoemäsparigeometrian kuvaukseen // Journal of Molecular Biology . - 2001. - Voi. 313. - s. 229-237.
- Myron F. Goodman. Vetysidosten uudelleentarkastelu: Geometrinen valinta DNA:n replikaation tarkkuuden päätekijänä // Proceedings of the National Academy of Sciences . - 1997. - Voi. 94. - P. 10493-10495.
Linkit
- Nukleiinihappoemäsparien geometrian nimikkeistö - Hampurin yliopisto - Biologian tiedekunta , Biokemian kohokohdat
 Sanakirjat ja tietosanakirjat |
|---|