Pribnov-laatikko

Pribnow-laatikko ( tunnetaan myös nimellä Pribnow- Schaller box ) on spesifinen nukleotidisekvenssi  , jota tarvitaan bakteerien promoottorialueelle , johon RNA-polymeraasi sitoutuu [1] [2] . Pribnow-box-nukleotidisekvenssiä pidetään konsensussekvenssinä, koska sitä esiintyy monissa organismeissa vain vähän vaihteluina. Tämä sekvenssi on nimetty David Pribnowin ja Heinz Schallerin mukaan [1] [2] . ТАТААТ

Pribnow-laatikkoa kutsutaan myös -10-sekvenssiksi, koska se sijaitsee noin 10 emäsparia ylävirtaan transkription aloituspisteestä .

Tämän sekvenssin toiminnot ovat samanlaisia ​​kuin eukaryooteissa ja arkeissa esiintyvä TATA-laatikko : RNA-polymeraasikohta tunnistaa ja sitoo sen transkription aloituksen aikana . Se on myös ensimmäinen kohta, jossa komplementaariset DNA - juosteet eroavat sallien RNA -synteesin alkaa DNA-templaatissa. Tätä helpottaa suuri määrä AT-pareja, koska sidokset adeniinin ja tymiinin välillä ovat heikommat kuin guaniinin ja sytosiinin välillä [3] .

Jokaisen nukleotidin löytämisen todennäköisyys

T A T A A T
82 % 89 % 52 % 59 % 49 % 89 % [4]

Muistiinpanot

  1. 1 2 Pribnow D. RNA-polymeraasin sitoutumiskohdan nukleotidisekvenssi varhaisessa T7-promoottorissa.  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America. - 1975. - Voi. 72, nro. 3 . - s. 784-788. — PMID 1093168 .
  2. 1 2 Schaller H. , Gray C. , Herrmann K. RNA-polymeraasin sitoutumiskohdan nukleotidisekvenssi bakteriofagin fd.:n DNA:sta.  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America. - 1975. - Voi. 72, nro. 2 . - s. 737-741. — PMID 1054851 .
  3. Yakovchuk P. , Protozanova E. , Frank-Kamenetskii MD Pohjien pinoaminen ja emäspariutuminen vaikuttavat DNA:n kaksoiskierteen lämpöstabiilisuuteen. (englanniksi)  // Nukleiinihappotutkimus. - 2006. - Voi. 34, nro. 2 . - s. 564-574. doi : 10.1093 / nar/gkj454 . PMID 16449200 .  
  4. Harley CB , Reynolds RP E. colin promoottorisekvenssien analyysi.  (englanniksi)  // Nukleiinihappotutkimus. - 1987. - Voi. 15, ei. 5 . - s. 2343-2361. — PMID 3550697 .