Partitiokromatografia on kromatografinen menetelmä , jossa stationäärinen (stationaarinen) faasi sidotaan kemiallisesti kiinteän kantajan pintaan. Liikkuva faasi on neste (LLC - englanti nestekromatografia ), joka toimii liuottimena, tai kaasu (kaasukromatografia). Erottaminen johtuu erotettavien aineiden polariteettierosta . Archer Martin ja Richard Sing saivat Nobelin vuonna 1952 partitiokromatografian perusteiden kehittämisestä .
Erityinen partitiokromatografian tapaus on käänteisfaasikromatografia .