Kirkon separatismi - toisin kuin skisma , ei oman rinnakkaisen "kirkon" luominen, vaan muodollisesti hallitsevaan kirkkoon kuuluminen, täydellinen osallistumattomuus sen ulkoiseen elämään. Samaan aikaan vain tietoiset kristityt, jotka ovat päättäneet noudattaa enemmän tai vähemmän tiukkaa kristillistä elämäntapaa, liittämättä itseään viralliseen kirkkokuntaan, voivat olla "separatisteja" - eikä vain kastettuja, vaan itse asiassa ihmisiä, jotka ovat välinpitämättömiä kirkko eivätkä varsinaisesti kuulu siihen.
Vaikka jotkut tutkijat ymmärtävät kirkkoseparatismin minkä tahansa henkilön tai ihmisryhmän erottamisena virallisesta kirkosta ja luokittelevat siksi Novatianin , Donatuksen , Tertullianuksen ja muut varhaiskristillisyyden hahmot separatisteiksi, tätä termiä käytetään pääasiassa uskonpuhdistuksen aikakauden yhteydessä . Tämäntyyppisen separatismin perustajat ovat Jodocus van Lodenstein ("pehmeä" versio) ja Jean de Labadi (myöhemmin Labadin separatismi muuttui kuitenkin klassiseksi lahoksi). Kirkkoseparatismi oli varsin yleistä pietistisissä piireissä . Separatisteja olivat Gottfried Arnold (hänen toimintansa ensimmäisellä kaudella), Gerhard Terstegenin opettaja Wilhelm Hoffmann ja monet muut. jne. Separatistit välttelivät osallistumasta jumalallisiin jumalanpalveluksiin ja ehtoolliseen, järjestämästä rukous- ja saarnaamiskokouksia kodeissaan.