Haploryhmä H1 (mtDNA)

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 3. elokuuta 2019 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 8 muokkausta .
Haploryhmä H1
Tyyppi mtDNA
Esiintymisaika 8,4-14,8 tuhatta vuotta sitten [1]
Spawn Sijainti Iberia tai Etelä- Ranska
Aika BOP :iin 12.500 vuotta
Esi-isän ryhmä H
Alaryhmät H1a , H1 - a , H1bc , H1f , H1g , H1k , H1q , H1c , H1e , H1h , H1i , H1j , H1m , H1n , H1o , H1p , H1r , H1s , H1 , H1x , H1 _ _
Merkkimutaatiot 3010A [2]

Haploryhmä H1  on ihmisen mitokondrion DNA:n haploryhmä. Se on haploryhmän H jälkeläinen.

Alkuperä

Viimeisen jääkauden (viimeinen jäätikkö) aikana 20-13 tuhatta vuotta sitten suurin osa Pohjois- ja Keski-Euroopan paleoliittisista asutuksista kuoli, ja siksi haploryhmän H edustajat säilyivät suuremmassa määrin vain nykyajan pohjoisosassa. Espanja. Euroopan nykykansoista mtDNA:n haploryhmä H1 on yleisin Espanjan baskien (27,8 %), portugalilaisten (25,8 %) ja Andalusian asukkaiden (24,3 %) keskuudessa [3] . Molekyyligeneettiset tiedot viittaavat siihen, että ranskalais-kantabrialainen alue oli kehto suurimmalle osalle Euroopan väestöstä, ainakin naaraslinjassa (haploryhmän H kautta) [4] . Haploryhmän H1 leviäminen Ranskan ja Kantabrian alueelta koko Eurooppaan viimeisen jääkauden jälkeen liittyy Madeleinen laajenemiseen noin 13 tuhatta vuotta sitten [5] [6] .

Jakelu

Haploryhmä H1 muodostaa merkittävän osan Länsi-Euroopan mitokondrioiden DNA:sta, ja Euroopan huippujakauma osuu Espanjan baskeille (27,8 %), portugalilaisille (25,8 %), Andalusian asukkaille (24,3 %) ja Pasiego -etnografiselle ryhmälle. Kantabriassa (23,5 %). [3] . Pohjois-Afrikassa epätavallisen suuri osuus haploryhmästä H1 Libyan tuaregien joukossa (61 %). [3] . Myös mtDNA-haploryhmä H1 on yleinen muiden Iberian niemimaan, Pohjois-Afrikan ja Sardinian asukkaiden keskuudessa . Se on yli 10 % monilla muilla Euroopan alueilla (Ranska, Brittisaaret, Alpit, monet Itä-Euroopan alueet) ja vähintään 5 % muualla Euroopassa. [6]

mtDNA:n haploryhmän H1 alakladit

H1a

mtDNA:n haploryhmälle H1a on tunnusomaista lisämutaatiot 73G ja 16162G. Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploryhmä H1a on suomalaisten (5,1 %), slovakkien (3,4 %), Volgan alueen suomalais-ugrilaisten (2,4 %), ranskalaisten (1,9 %), virolaisten (1,8 %), itäslaavien (1,7 %) keskuudessa. ) ja turkkilaiset (1 %), eikä sitä tavata Lähi- ja Lähi-idän eikä Aasian kansojen keskuudessa. [7] Tutkiessaan Lähi-idän ja Kaukasuksen populaatioita Roostalu et al. (2007) löysi haploryhmän H1a vain karatšayista (5,5 %) ja turkkilaisista (0,6 %). [8] Haploryhmän H1a ikä on 4,5–9,9 tuhatta vuotta. [yksi]

H1b

mtDNA:n haploryhmälle H1b on tunnusomaista lisämutaatiot 3796G, 16189C ja 16356C. Samaan aikaan Mannis van Ovenin mukaan 16356C:n läsnäolo riittää jo määrittämään sen H1b:ksi (vaikka 3796G:tä ei olisi).

MtDNA:n haploryhmä H1b on yleisin Itä-Euroopassa (7 % koko haploryhmästä H), Keski-Euroopan pohjoisosassa (5 % haploryhmästä H) ja Luoteis-Siperiassa (5 % haploryhmästä H mansien keskuudessa ). [7] Haploryhmän H1b huippujakauma Itä-Euroopassa sijaitsee nykyajan Latvian ja Liettuan rajalla, Riian eteläpuolella [9] ja osuu samaan aikaan semigaleen balttilaisen heimon asutusalueen kanssa keskiajalla.

Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploryhmää H1b esiintyy virolaisten (5,3 %), itäslaavien (2,8 %), balkanin kansojen (1,8 %) ja slovakkien (1,7 %) keskuudessa, eikä sitä löydy Volgan alueen suomalais-ugrilaisista kansoista, turkkilaisista, Lähi- ja Lähi-idän sekä Aasian kansat. [7]

Huolimatta H1b-haploryhmän hallitsevuudesta Itä-Euroopan kansojen keskuudessa, sitä esiintyy myös lännessä ( espanjalaiset , baskit , ranskalaiset , saksalaiset ), mutta paljon pienemmässä osassa. Lähi-idän ja Kaukasuksen populaatioissa Roostalu et al. (2007) löysi haploryhmän H1b karatšailaisten (4,1 %), adygien (1,1 %), balkarien (1 %), osseetioiden (0,3 %) ja turkkilaisten (0,3 %) joukosta. [8] Haploryhmän H1b ikä on 7,2-14 tuhatta vuotta. [yksi]

Todennäköisesti haploryhmä H1b syntyi Etelä-Ranskasta tai Iberiasta pian jääkauden päättymisen jälkeen. H1b:tä kantavat naiset matkustivat itään nykyisestä Ranskasta, ohittivat Italian Alppien pohjoispuolella ja saapuivat nykyiseen Slovakiaan. Sieltä H1b levisi pohjoiseen.

Ehkä Keski-Euroopan pohjoisosassa H1b-haploryhmä liitettiin lopullisen paleoliittisen svider-kulttuuriin , joka oli yleinen 10.-9. vuosituhannella eKr. e. nykyaikaisen Puolan, Liettuan ja Länsi-Valko-Venäjän alueella. Svider-kulttuurin kantajat, jotka muuttivat koilliseen ja kaakkoon, 8. vuosituhannella eKr. e. voisi tuoda haploryhmän H1b Keski-Euroopan pohjoisosasta nykyisen Viron, Etelä-Suomen ja Keski-Venäjän alueelle ( Buvon mesoliittinen kulttuuri Volga-Oka-välin VIII-VI vuosituhannella eKr. ja Kundin mesoliittisen kulttuurin itäisellä Itämerellä VIII-VI vuosituhannella eKr. . e.).

Mitokondrioiden haploryhmässä H1b Unkarin kuninkaan Bela III :n Euphrosyne Mstislavnan pojan mitokondriosekvenssi on läheisimmin sukua henkilölle, joka kuuluu Karpaattien altaan KL-VI-ryhmään [10] .

H1f

Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploryhmä H1f on yleisin suomalaisilla (10,3 %), myös virolaisilla (1 %) ja itäslaaveilla (0,2 %), eikä sitä ole havaittu Volgan alueen slovakkien, ranskalaisten, turkkilaisten, suomalais-ugrilaisten kansojen keskuudessa. Ison-Britannian, Yhdysvaltojen, Lähi- ja Lähi-idän sekä Aasian kansojen. [7] Haploryhmän H1f ikä on noin 1000 vuotta. [yksi]


H1c

mtDNA:n haploryhmälle H1c on tunnusomaista lisämutaatio 477C. Lähi-idän ja Kaukasuksen populaatioita tutkiessaan Roostalu et al. (2007) löysi haploryhmän H1c vain kahdesta Adygista, mikä on noin 2,3 % tästä populaatiosta. [8] H1c-haploryhmän ikä on noin 9,4 tuhatta vuotta. [yksi]

H1d

mtDNA:n haploryhmälle H1d on tunnusomaista lisämutaatio 456T, mutta tämä alaluokka suljettiin pois Mannis van Oven -puun versiosta 3. Lähi-idän ja Kaukasuksen populaatioissa Roostalu et al. (2007) löysi haploryhmän H1d vain kahdesta Kuwaitista kotoisin olevasta arabista, mikä on noin 1,2 % tutkitusta väestöstä. [kahdeksan]

PaleoDNA tulokset

Nikitin et ai. (Unpub) Verteba -luolasta (Late Trypillia) Ternopilin alueella Ukrainasta löydettiin 2 näytettä mtDNA-haploryhmästä H1, jotka ovat päivätty 4300-3100 vuotta. eKr e. [9] Lacan et ai. (2011), tutkiessaan Treillesiä (Etelä-Ranska), 29 näytteestä tunnisti 3 mtDNA-haploryhmää H1, jotka ajoittuivat 3000 eKr. e. [yksitoista]

Nilsson et ai. Vuonna 2010 he tutkivat 1300-luvulla eläneen katolisen pyhimyksen Brigid of Swedenin väitettyjä jäänteitä . [12] Pyhien jäänteiden identiteettiä voidaan epäillä niiden radiohiilidatauksen vuoksi: on mahdollista, että jäänteet ovat peräisin 1200-luvulta, kun taas Saint Brigid eli 1300-luvulla. Jäännösten mtDNA-haplotyyppi (263G, 315.1C, 3010A, 16189C, 16519C) kuuluu H1b , f, g, k, q haploryhmään , jolle on tunnusomaista 16189C-mutaatio.

Geneetikkojen mukaan mitokondrioiden haploryhmä H1b tunnistettiin Unkarin kuninkaan Bela III:n Euphrosynen pojasta [13] .

Fylogeneettinen puu

Alla oleva fylogeneettinen puu perustuu Van Ovenin [2] julkaisuun ja myöhempään julkaistuun tutkimukseen.

Muistiinpanot

  1. 1 2 3 4 5 V.Zaporozhchenko (2011), Haplogroup Ages Arkistoitu 30. elokuuta 2011 Wayback Machinessa , "Human mtDNA", Tiedot on koonnut V. Zaporozhchenko Gentis Companylle, Build 4/201/01
  2. 12 van Oven, Mannis ; Manfred Kaiser. Päivitetty kattava fylogeneettinen puu globaalista ihmisen mitokondrion DNA-muuntelusta  // Human  Mutation : päiväkirja. - 2008. - 13. lokakuuta ( nide 30 , nro 2 ). -P.E386 - E394 . Arkistoitu alkuperäisestä 4. joulukuuta 2012.
  3. 1 2 3 Ottoni et al. 2010, mitokondriaalinen haploryhmä H1 Pohjois-Arrival Africa: An Early Holosene from Iberia Arkistoitu 13. elokuuta 2011 Wayback Machinessa
  4. mtDNA:n haploryhmän H molekyylidissektio vahvistaa, että ranskalais-kantabrialainen jäätikkö oli Euroopan geenipoolin tärkein lähde
  5. Pereira L., Richards M., Goios A., et ai. Korkean resoluution mtDNA-todisteet Euroopan myöhäisjääkauden uudelleensijoittamisesta iberialaisesta  pakopaikasta  // Genomitutkimus : päiväkirja. - 2005. - tammikuu ( osa 15 , nro 1 ) - s. 19-24 . - doi : 10.1101/gr.3182305 . — PMID 15632086 .
  6. 1 2 A. Achilli et ai., The Molecular Dissection of mtDNA Haplogroup H vahvistaa, että Ranskan ja Kantabrian jäätikköalue oli Euroopan geenivaraston tärkein lähde . AJHG, 2004 . Haettu 11. syyskuuta 2011. Arkistoitu alkuperäisestä 4. heinäkuuta 2008.
  7. 1 2 3 4 Eva-Liis Loogväli et al., Disuniting Uniformity: A Pied Cladistic Canvas of mtDNA Haplogroup H in Eurasia . Society for Molecular Biology and Evolution, 2004. . Haettu 11. syyskuuta 2011. Arkistoitu alkuperäisestä 19. elokuuta 2009.
  8. 1 2 3 4 U. Roostalu et ai., Länsi-Euraasiassa hallitsevan ihmisen mitokondriaalisen DNA-linjan haploryhmän H alkuperä ja laajeneminen: Lähi-idän ja Kaukasian näkökulma . Molecular Biology and Evolution, voi. 24, nro. 2 (2007), s. 436-448. . Haettu 12. syyskuuta 2011. Arkistoitu alkuperäisestä 23. syyskuuta 2011.
  9. 1 2 Haplogroup H1 Arkistoitu 10. toukokuuta 2012 Wayback Machinessa , Tiedot Gentis Companyn verkkosivustolta
  10. Bea Szeifert et ai. Muinaisten unkarilaisten geneettisten yhteyksien jäljittäminen Volgan ja Uralin alueen 6-1300-luvun populaatioihin Arkistoitu 12. helmikuuta 2022 Wayback Machinessa , 8. helmikuuta 2022
  11. Lacan et al., Muinainen DNA paljastaa miesten diffuusion neoliittisen Välimeren reitin kautta . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America, 2011. . Haettu 11. syyskuuta 2011. Arkistoitu alkuperäisestä 18. syyskuuta 2011.
  12. Nilsson et ai., Analyys of the Putative Remains of a European Patron Saint-St. Birgitt . PLoS ONE, 2010. . Haettu 11. syyskuuta 2011. Arkistoitu alkuperäisestä 11. kesäkuuta 2012.
  13. Judith Olasz . Unkarin kuninkaan Béla III:n ja muiden Székesfehérvárin kuninkaallisesta basilikasta peräisin olevien luurangojen DNA-profilointi Arkistoitu 29. syyskuuta 2018 Wayback Machinessa , 2018
  14. Tämän alaluokan nimi on Alvarez-Iglesiasin mukaan (Alvarez-Iglesias 2009)
  15. Tämä alaluokka on poistettu Van Oven -puun versiosta 3.

Linkit

Ihmisen mtDNA:n haploryhmäpuu

Mitokondrioiden Eeva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G K R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 ennen JT:tä P Iso-Britannia minä N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Vanhat IWX- klusterit