Haploryhmä L3 (mtDNA)

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 15. maaliskuuta 2013 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 39 muokkausta .
Haploryhmä L3
Tyyppi mtDNA
Esiintymisaika 104 000–84 000 vuotta sitten [1]
Spawn Sijainti Itä-Afrikka [2]
Esi-isän ryhmä Mitokondrioiden Eeva
Alaryhmät L3a , L3b , L3c , L3d , L3e , L3f , L3h , L3i , L3j , L3k , L3x , M , N [3]
Merkkimutaatiot 769, 1018, 16311

Haploryhmä L3  - populaatiogenetiikassa - ihmisen mitokondrion DNA :n haploryhmä .

Alkuperä

Haploryhmän oletetaan syntyneen noin 105-85 tuhatta vuotta sitten. Haploryhmät M ja N ovat peräisin mitokondrioryhmästä L3 noin 65 tuhatta vuotta sitten (Macaulay et al., 2005) [4] . Kaikkien euraasian (M, N) ja afrikkalaisten L3-linjojen sulautumisikä on noin 71 tuhatta vuotta sitten. n. Makrohaploryhmä L3 ilmestyi Euraasiassa ja palasi Afrikkaan noin 70 tuhatta vuotta sitten [5] [6] . Alakladit L3h ja L3i ovat peräisin ~55,1 tuhatta vuotta sitten. n., alakladit L3h1 ja L3h2 juontavat juurensa ~ 47 tuhatta vuotta sitten. n., L3h2 - ~ 31 tuhatta vuotta sitten [7] . Mitokondrioiden haploryhmän L3 kantajat muuttivat Itä-Afrikasta Keski-Afrikkaan ~60-35 tuhatta vuotta sitten. L3-operaattorien lukumäärän kasvu Keski-Afrikassa n. 4-3 tuhatta litraa. n. vastaa Bantu -laajennusta . Noin 3-2 tuhatta litraa. n. eri L3-sukupolvien kantajat levisivät Itä- ja Etelä-Afrikkaan [8] .

Paleogenetiikka

Jakelu

Useimmiten tämä haploryhmä löytyy Itä-Afrikasta , toisin kuin muissa Afrikan osissa, missä 2/3 kaikesta mitokondrioiden DNA:sta on haploryhmiä L1 ja L2 [18] .

L3 on jaettu useisiin alaryhmiin, joista yhden oletetaan olevan M- ja N -makrohaploryhmän esi-isä , joista useimmat ei-afrikkalaiset kansat polveutuvat.

Yksi näistä suvuista, joka määritellään Ddel-alueen katoamisena np:ssä 10394, edustaa vain pientä prosenttiosuutta afrikkalaisesta mtDNA:sta, mutta näyttää olevan esi-isä lähes puolelle kaikesta eurooppalaisesta, aasialaisesta ja alkuperäisestä amerikkalaisesta mtDNA:sta." [ 19]

McMayerin ym. mukaan "L3 liittyy enemmän euraasialaisiin haploryhmiin kuin monimuotoisimpiin afrikkalaisiin L1- ja L2 -klustereihin " [20] L3 on haploryhmä, josta kaikki nykyihmiset Afrikan ulkopuolella ovat polveutuvat [21] .

Euroopassa makrohaploryhmän L mtDNA:n osuus on < 1 %, kun taas ~65 % eurooppalaisista L-sukupolvista saapui historiallisessa ajassa (mukaan lukien L3d1b1a), ja loput 35 % L mtDNA:sta muodostavat eurooppalaisia ​​subklaadeja, jotka saapuivat Eurooppaan Saharan eteläpuolisesta Afrikasta. 000 vuotta sitten (L1b1, L2a1k) [22] .

Haploryhmän L3 alaluokat (jälkeläiset)

Fylogeneettinen puu

Alla oleva fylogeneettinen puu perustuu Van Ovenin (2008) julkaisuun ja myöhemmin julkaistuihin tutkimuksiin.

Muistiinpanot

  1. ↑ Tishkoff et ai., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007
  2. ↑ Salas et ai. (2002), The Making of the African mtDNA Landscape Arkistoitu 9. toukokuuta 2006 Wayback Machinessa , Am J Hum Genet. marraskuuta 2002; 71(5): 1082–1111
  3. ↑ van Oven M, Kayser M. 2009. Päivitetty kattava fylogeneettinen puu globaalista ihmisen mitokondrion DNA-variaatiosta. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org Arkistoitu 17. kesäkuuta 2016 the Wayback Machine , mtDNA tree Build 2 (14. lokakuuta 2008)
  4. ↑ Derenko M.V. Pohjois-Aasian alkuperäiskansojen molekyylifylogeografia mitokondriaalisen DNA:n vaihtelun mukaan Arkistokopio päivätty 13. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa
  5. ↑ Vicente M Cabrera, Julia Patricia Marrero Rodriguez, Khaled K Abu-Amero, Jose M Larruga . Mitokondriaalisen DNA:n makrohaploryhmän L3 peruslinjan kantajat muuttivat takaisin Afrikkaan Aasiasta noin 70 000 vuotta sitten Arkistoitu 22. helmikuuta 2021 Wayback Machinessa , 2018 19. kesäkuuta
  6. ↑ Vicente M Cabrera, Julia Patricia Marrero Rodriguez, Khaled K Abu-Amero, Jose M Larruga . Mitokondriaalisen DNA:n makrohaploryhmän L3 peruslinjan kantajat muuttivat takaisin Afrikkaan Aasiasta noin 70 000 vuotta sitten Arkistoitu 14. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa , 13. joulukuuta 2017
  7. ↑ Veronica Gomes et ai. Mosaiikki äidin esi-isät Itä-Afrikan Suurten järvien alueella Arkistoitu 29. syyskuuta 2017 Wayback Machinessa , Human Genetics, syyskuu 2015, osa 134, numero 9, s . 1013–1027
  8. ↑ Soares P., Alshamali F., Pereira JB, Fernandes V., Silva NM, Afonso C., Costa MD, Musilová E., Macaulay V., Richards MB, Cerny V., Pereira L. The Expansion of mtDNA Haplogroup L3 Afrikassa ja Afrikan ulkopuolella Arkistoitu 17. helmikuuta 2018 Wayback Machinessa // Mol Biol Evol. 2012 maaliskuu;29(3):915-27. doi: 10.1093/molbev/msr245. Epub 2011 16. marraskuuta.
  9. ↑ Fernandez, 2014 .
  10. ↑ Taulukko 1. Tässä tutkimuksessa raportoidut muinaiset yksilöt kalibroidun radiohiilen aikajakson alun mukaan // Mary E. Prendergast et al. Muinainen DNA paljastaa ensimmäisten paimenten monivaiheisen leviämisen Saharan eteläpuoliseen Afrikkaan. Tiede. 2019 5. heinäkuuta
  11. ↑ Anna Linderholm ym. Corded Ware -kulttuurinen monimutkaisuus paljastettiin genomi- ja isotooppianalyysillä Kaakkois-Puolasta Arkistoitu 12. toukokuuta 2020 Wayback Machinessa , 2020 14. huhtikuuta
  12. ↑ Verena J. Schuenemann et ai. Muinaisen Egyptin muumiogenomit viittaavat Saharan eteläpuolisen Afrikan esi-isien lisääntymiseen roomalaisen jälkeisenä aikana . Arkistoitu 30. syyskuuta 2019 Wayback Machinessa , 30. toukokuuta 2017
  13. ↑ Muinaisen Etiopian genomi paljastaa laajan Euraasian sekoittumisen koko Afrikan mantereella . Haettu 10. lokakuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 10. lokakuuta 2015.
  14. ↑ E. B. Yatsisina, E. S. Bulygina, S. V. Vasiliev, R. M. Galeev, N. V. Slobodova, S. V. Tsygankova, F. S. Sharko . Muinaisten muumioiden paleogeneettinen tutkimus Kurchatov-instituutissa , 2020
  15. ↑ EB Yatsisina, ES Bulygina, SV Vasilyev, RM Galeev, NV Slobodova, SV Tsygankova, FS Sharko . Muinaisten muumioiden paleogeneettinen tutkimus Kurchatov-instituutissa Arkistoitu 3. elokuuta 2021 Wayback Machinessa , 22. maaliskuuta 2021
  16. ↑ Rodrigo Barquera et ai. Early Colonial Meksikon ensimmäisen sukupolven afrikkalaisten alkuperä ja terveydentila Arkistoitu 10. toukokuuta 2020 Wayback Machinessa , 30. huhtikuuta 2020
  17. ↑ Peyroteo Stjerna et ai. Monitieteinen tutkimus paljastaa länsiafrikkalaista alkuperää olevan yksilön, joka on haudattu neljä vuosisataa sitten portugalilaiseen mesoliittiseen kuoreen , Midden .
  18. ↑ Wallace DC et ai. (2000), Haploryhmän M alkuperä Etiopiassa, Am J Hum Genet 67 (Suppl): 217
  19. ↑ Wallace et ai., Mitochondrial DNA variation in human evolution and sairaus, Gene, 1999 Sep 30;238(1):211-30
  20. ↑ Maca-Meyer et ai. (2001), Tärkeimmät genomiset mitokondriolinjat kuvaavat varhaisia ​​ihmisen laajennuksia . Arkistoitu 17. lokakuuta 2015, the Wayback Machine , BMC Genetics 2001, 2:13
  21. ↑ Cambridge DNA Services arkistoitu 8. heinäkuuta 2011 Wayback Machinessa
  22. ↑ Maria Cerezo et ai. "Muinaisten mitokondrioiden DNA-yhteyksien rekonstruoiminen Afrikan ja Euroopan välillä" , 2012
  23. ↑ Kivisild ym. marraskuuta 2004 "Etiopian mitokondrioiden DNA-perintö: geenivirran seuranta kyyneleiden portin yli ja ympäri" American Journal of Human Genetics 75(5): 759
  24. ↑ Černý et al., (2009). Tšadinkielisten paimenten muuttoliike Afrikassa Tšadin altaan väestörakenteen ja mitokondrioiden L3f-haploryhmän fylogeografian perusteella Arkistoitu 8. maaliskuuta 2011 Wayback Machinessa . BMC Evolutionary Biology, 9:63, 2.

Julkaisut

2014

Katso myös

Ihmisen mtDNA:n haploryhmäpuu

Mitokondrioiden Eeva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G K R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 ennen JT:tä P Iso-Britannia minä N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Vanhat IWX- klusterit


Linkit

Yleistä tietoa

Haplogroup L3