Haploryhmä T (mtDNA)

Haploryhmä T  - populaatiogenetiikassa - ihmisen mitokondrion DNA:n haploryhmä.

Alkuperä

Haploryhmä T on johdettu haploryhmästä JT , josta myös haploryhmä J on johdettu .

Paleogenetiikka

Haploryhmän T oletetaan syntyneen noin 33 tuhatta vuotta sitten Lähi-idässä ( Mesopotamiassa tai hedelmällisen puolikuun alueella ), minkä jälkeen se levisi Eurooppaan ja itään noin 15 tuhatta vuotta sitten nykyaikaiseen Pakistaniin ja Intiaan asti [1] .

Haploryhmä T on ollut Euroopassa alle 12 000 vuotta, joten se on nuorin eurooppalaisista mitokondriohaploryhmistä. Genographic Project -sivustolla todetaan, että haploryhmän T varhaiset kantajat olivat ilmeisesti ensimmäisiä maataloussadon kantajia ja muodostivat ryhmän, joka toi maatalouden Eurooppaan aiheuttaen " neoliittisen vallankumouksen " [2] .

• T2-haaralla on melko korkea esiintymistiheys (20-33%) Keski-Euroopan neoliittisten kulttuurien mitokondrioiden haploryhmissä ( lineaarinen keramiikka ja Sakalhat - jälkimmäinen oli LLK-elementtien ja Vinca-kulttuurin hybridi ) [3] . Suunnilleen samalla taajuudella T2:ta (alakladi T2b) löytyy Trypillia- viljelmän kantajista Verteba- luolasta [4] .
• Alakladit T1a ja T2b löydettiin Starchev- kulttuurin edustajilta , jotka asuivat n. 5700 vuotta sitten [5] . T2b-alakladi löydettiin Cardiac Ware -viljelmän jäsenestä [6] . T2- ja T1-alakladit löytyvät Yamnaya-kulttuurin jäsenistä .
• T1a2, T2, T2g1a on tunnistettu eneoliittisen (4500-3900/3800 eKr.) näytteistä israelilaisesta Peqi'in-luolasta [7] .
• T2a1b määritettiin eneoliittisen näytteen VJ1001 (6242 vuotta ennen nykypäivää ) Vonyuchka-1 -paikalta (Vonyuchka 1) Stavropolin alueella [8] .
• T2a1a tunnistettiin katakombin kulttuurihistoriallisen yhteisön RISE552 (2849–2146 eKr.) edustajasta Ulan IV:n paikkakunnalta Rostovin alueella [9] .
• T1a ja T2c1d1 tunnistettiin myöhäisen trypillin näytteissä Pocrovca ​​3 ja Pocrovca ​​2 (3500–3100 eKr.) Moldaviasta [10] , T4 [11] ja T2b [4]  Trypilliansissa Verteban luolasta (Ternopilin alue Ukrainassa) .
• T2b, T2b4 tunnistettiin zlota -kulttuurin edustajilla (2900-2500 eKr.) Puolasta [12] .
• T2c1a2 tunnistettiin pronssikauden Afanasjevin kulttuurin edustajasta [9] .
• Haploryhmä T määritettiin näytteestä BMAC:sta ( Bactria-Margiana Archaeological Complex ) [13] .
• T1a, T1a2, T1a5, T1a7, T1a8a, T2, T2c1, T2c1c ja T2e on tunnistettu Abusirista peräisin olevista muumioista [ 14] .
• T1 tunnistettiin rautakauden skyttien pazyryk-kulttuurin edustajasta [15] .
• T2c1a tunnistettiin Tarton yliopiston taidemuseon muinaisesta egyptiläisestä muumiosta OM S1, joka on päivätty 1. vuosituhannen toiselle puoliskolle eKr . [16] .
• T2 tunnistettiin yhdestä viikingistä pakanahautauksesta Galgedil (Galgedil) Tanskan Funenin saarella (700-1100 jKr.) [17] .
• T1, T1a1j, T2 ja T2f1 tunnistettiin Sigtunan asukkaiden joukosta , jotka asuivat noin 10-1100-luvuilla [18] .
• T2b21b määritettiin näytteestä Sk6990 (XVI vuosisata) hopeakaivoksesta Ruotsista [19] .
• T2b tunnistettiin naissoturista Björkö -saaren kammiohautauksesta Bj.581 , joka haudattiin 1000-luvulla hautaan taistelukirvesen, veitsen, keihään, panssarin lävistysnuolien, kahden kilpen, orin kanssa. ja tamma [20] .
• T1 tunnistettiin roomalaisessa (ERS3189333, QED-2) Qornet ed-Deir -vuorelta Pohjois-Libanonissa, joka eli noin 244-400 [21] .
• T2 löydettiin Sidonista kotoisin olevasta ristiretkeläisestä (ERS3189343, SI-53), joka eli noin 1025-1154 [21] .
• T2d1 tunnisti näytteen Zhenzishanin hautausmaalta Shangdusta, Kiinasta (XIII vuosisata) [22] .
• T2b1 tunnistettiin noin 700 vuotta vanhoista jäännöksistä, joiden katsottiin olevan Cro- Magnon Cro-Magnon 1 [23] .

Moderni jakelu

Tällä hetkellä korkea haploryhmän T pitoisuus on löydetty Itämeren itärannikolta . Oxford Ancestorsin mukaan haploryhmä T muodostaa vain alle 10 % Euroopan nykyajan väestöstä. Sen lukuisat alahaarat ovat laajalle levinneitä Etelä- ja Länsi-Euroopassa, ja ne ovat erityisen suuria Irlannissa ja Länsi- Britanniassa . Genographic Project -sivuston mukaan "Haplogroup T:llä on erittäin laaja levinneisyys, ja se on tällä hetkellä jaettu Intian ja Pakistanin Indus-laaksoon ja Arabian niemimaalle asti. Se on edustettuna myös Itä- ja Pohjois-Euroopassa" [2] . Haploryhmä T on venäläisten esiintyvyyden suhteen 2-4 sijalla H:n jälkeen, samoin haploryhmät U ja J, - noin. 12 % [25] .

Merkittäviä edustajia

Viimeisen Venäjän tsaari Nikolai II :n ja hänen sukulaistensa jäänteiden geneettinen analyysi osoitti hänen kuuluneen haploryhmään T2 [26] [27] [28] . Jos eurooppalaisten hallitsijoiden tunnetuissa sukuluetteloissa ei ole virhettä, tämä haploryhmä voidaan jäljittää Barbara Zilliin (1390-1451), Pyhän Rooman keisarin Sigismundin vaimoon . Suuri joukko eurooppalaisia ​​aatelisia kuuluu samaan linjaan, mukaan lukien: George I (Iso-Britannia) ja Frederick William I ( Sofian Hannoverin kautta ), Kaarle I (Englannin kuningas) , Yrjö III (Ison-Britannian kuningas) ja George V. (Ison-Britannian kuningas) Kaarle X Kustaa (Ruotsi), Kustaa II Adolf (Ruotsi), Moritz Nassaulainen , Olaf V (Norja) ja George I (Kreikan kuningas) .

Lääketiede

Yhden tutkimuksen, jonka tuloksia asiantuntijat kritisoivat, mukaan mitokondrioiden haploryhmä T liittyy miehillä vähentyneeseen siittiöiden liikkuvuuteen [29] .

Zaragozan yliopiston biokemian ja molekyylisolubiologian laitoksen julkaisun mukaan haploryhmä T edustaa heikkoa geneettistä taipumusta asthenozoospermialle [30] .

Joidenkin tutkimusten mukaan haploryhmän T esiintyminen liittyy lisääntyneeseen sepelvaltimotaudin riskiin [31] . Toisen tutkimuksen mukaan T-kantajat ovat vähemmän alttiita diabetekselle [32] .

Useat lääketieteelliset pilottitutkimukset ovat osoittaneet, että haploryhmän T esiintyminen liittyy alentuneeseen Parkinsonin ja Alzheimerin tautien riskiin [33] .

Katso myös

Muistiinpanot

1. ↑ Mitä genomi kertoi minulle - 23andMe-tulokset ammattigeneetikon silmin Arkistoitu 20. elokuuta 2017 Wayback Machinessa 6. helmikuuta 2014
2. ↑ 1 2 Atlas of the Human Journey - Genografinen projekti Arkistoitu 26. heinäkuuta 2011 Wayback Machinessa
3. ↑ Muinaiset DNA-todisteet homogeenisestä äidin geenivarannosta kuudennen vuosituhannen ajan Unkarissa ja Keski-Euroopan LBK:ssa . Käyttöpäivä: 26. helmikuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 25. helmikuuta 2020. (määrätön)
4. ↑ 1 2 Alexey G. Nikitin, Inna Potekhina, Nadin Rohland, Swapan Mallick, David Reich, Malcolm Lillie. Ukrainasta peräisin olevien eneoliittisten trypillien mitokondriaalinen DNA-analyysi paljastaa neoliittisen viljelyn geneettiset juuret  (englanniksi)  // PLoS ONE. - 2017. - 24. helmikuuta ( nro 12(2) ). - doi : 10.1371/journal.pone.0172952 .
5. ↑ Szécsényi-Nagy et ai. (2015), Euroopan ensimmäisten maanviljelijöiden geneettisen alkuperän jäljittäminen paljastaa oivalluksia heidän sosiaalisesta organisaatiostaan, Proceedings of the Royal Society B, voi. 282, nro 1805, 20150339. (Julkaistu aiemmin verkossa 2014 muualla ennen tulostusta) . Haettu 2. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 1. huhtikuuta 2016. (määrätön)
6. ↑ Yhteinen geneettinen alkuperä varhaisille viljelijöille Välimeren Cardial- ja Keski-Euroopan LBK-viljelmistä . Haettu 5. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 5. syyskuuta 2015. (määrätön)
7. ↑ Éadaoin Harney et ai. Muinainen DNA kalkoliittisesta Israelista paljastaa populaatioseoksen roolin kulttuurinmuutoksessa Arkistoitu 20. elokuuta 2018 Wayback Machinessa , 2018
8. ↑ Chuan-Chao Wang et ai. Muinaisen ihmisen genomin kattavat tiedot 3000 vuoden ajalta Kaukasiassa vastaavat ekologisia maantieteellisiä alueita . Arkistoitu 15. heinäkuuta 2021 Wayback Machineen 4. helmikuuta 2019 (lisätiedot 1)
9. ↑ 1 2 Morten E. Allentoft et ai. "Population genomics of Bronze Age Eurasia" Arkistoitu 30. huhtikuuta 2016 Wayback Machinessa , 2015
10. ↑ Alexander Immel et ai. Geenivirtaus aro-yksilöistä Cucuteni-Trypilliaan liittyviin populaatioihin osoittaa pitkäaikaisia ​​kontakteja ja asteittaista sekoittumista Arkistoitu 8. joulukuuta 2019 Wayback Machinessa , 2019
11. ↑ Nikitin A.G. et ai. Kattava sivuston kronologia ja muinainen mitokondrioiden DNA-analyysi Verteba-luolasta – eneoliittisen Ukrainan trypillikulttuuripaikasta  (englanniksi)  // Interdisciplinaria Archaeologica – Natural Sciences in Archaeology. - 2010. - Vol. I , iss. 1-2 . - s. 9-18 . - doi : 10.24916/ians.2010.1-2.1 .
12. ↑ Anna Juras et ai. Myöhäisen ja lopullisen neoliittisen ihmispopulaatioiden äidin geneettinen alkuperä nykyisestä Puolasta Arkistoitu 27. heinäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 26. heinäkuuta 2021
13. ↑ Etelä- ja Keski-Aasian genominen muodostuminen arkistoitu 1. huhtikuuta 2018 Wayback Machinessa , 31. maaliskuuta 2018
14. ↑ Verena J. Schuenemann et ai. Muinaisen Egyptin muumiogenomit viittaavat Saharan eteläpuolisen Afrikan esi-isien lisääntymiseen roomalaisen jälkeisenä aikana . Arkistoitu 30. syyskuuta 2019 Wayback Machinessa , 30. toukokuuta 2017
15. ↑ Mitokondrioiden ja Y-kromosomien haploryhmät, jotka on uutettu historiallisista ja esihistoriallisista ihmisjäännöksistä Euroopassa ja niihin liittyvistä jäännöksistä Aasiassa, kronologisesti järjestettyinä . Haettu 7. helmikuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 28. syyskuuta 2021. (määrätön)
16. ↑ Ester Oras et ai. Monitieteinen tutkimus kahdesta egyptiläisestä lapsimuumiosta, kuratoitu Tarton yliopiston taidemuseossa Virossa (myöhäis/kreikkalais-roomalaiset kaudet) , 2020
17. ↑ Linea Melchior, Toomas Kivisild , Niels Lynnerup, Jørgen Dissing . Todisteet aidosta DNA:sta tanskalaisista viikinkiaikaisista luurangoista, joita ihmiset eivät koskettaneet 1 000 vuotta Arkistoitu 10. huhtikuuta 2022 Wayback Machinessa , 28. toukokuuta 2008
18. ↑ Maja Krzewińska et al. Genominen ja strontium-isotoopin vaihtelut paljastavat maahanmuuttokuvioita viikinkiaikaisessa kaupungissa Arkistoitu 23. huhtikuuta 2020 Wayback Machinessa , 2018
19. ↑ Maja Krzewińskaa et al. Selvitetään lähihistoriaa jäljittämällä kolmen 1500-luvun ruotsalaisen kaivosmiehen geneettinen affiniteetti , 2018
20. ↑ Charlotte Hedenstierna-Jonson et ai. Genomiikan vahvistama naispuolinen viikingisoturi Arkistoitu 13. huhtikuuta 2019 Wayback Machinessa , 8. syyskuuta 2017
21. ↑ 1 2 Marc Haber et al. Ohimenevä geneettisen sekoittumisen pulssi Lähi-idän ristiretkeläisistä, tunnistettu muinaisista genomisekvensseistä , arkistoitu 31. toukokuuta 2019 Wayback Machinessa , 2019
22. ↑ Jiawei Li et ai. Muinaiset genomit paljastavat kansainvälisen metropolin monimutkaisen geneettisen historian Kublai Khanin yläpääkaupungissa (Xanadu) , 14. kesäkuuta 2022
23. ↑ Qiaomei Fu et ai. Muinaisiin mitokondriogenomeihin perustuva ihmisen evoluution tarkistettu aikaskaala, arkistoitu 5. syyskuuta 2020 Wayback Machinessa , 2013
24. ↑ http://www.oxfordancestors.com/content/view/35/55/ Arkistoitu 15. heinäkuuta 2017 Wayback Machinessa Oxford Ancestors Maternal Ancestry
25. ↑ Claudio Ottoni et ai. Bysantin väestön mitokondrioanalyysi paljastaa useiden historiallisten tapahtumien erilaisen vaikutuksen Etelä-Anatoliassa, 2011. . Haettu 3. lokakuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 26. maaliskuuta 2017. (määrätön)
26. ↑ Rogaev, (2009), Genominen tunnistus Nikolai II:n kuninkaallisen perheen historiallisessa tapauksessa, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America, voi. 106, nro 13 (maaliskuu 2009), s. 5258?5263. . Haettu 3. lokakuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 28. tammikuuta 2022. (määrätön)
27. ↑ Coble M.D. et ai. (2009), Mystery Solved: Kahden kadonneen Romanovin lapsen tunnistaminen DNA-analyysin avulla, PLoS ONE, voi. 4, ei. 3: e4838. . Haettu 3. lokakuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 28. tammikuuta 2022. (määrätön)
28. ↑ http://isogg.org/famousdna.htm Arkistoitu 13. kesäkuuta 2006 Wayback Machinessa ISOGG:n kuuluisassa DNA:ssa
29. ↑ Luonnonvalinta muokkasi alueellista mtDNA-variaatiota ihmisillä . Haettu 25. tammikuuta 2022. Arkistoitu alkuperäisestä 25. tammikuuta 2022. (määrätön)
30. ↑ Ruiz-Pesini E., Lapeña AC, Díez-Sánchez C., et ai. Ihmisen mtDNA-haploryhmät, jotka liittyvät siittiöiden korkeaan tai vähentyneeseen liikkuvuuteen  (englanniksi)  // Am. J. Hum. Genet. : päiväkirja. - 2000. - syyskuu ( osa 67 , nro 3 ) . - s. 682-696 . - doi : 10.1086/303040 . — PMID 10936107 .
31. ↑ ScienceDirect-Mitochondrion: 30 mitokondrioiden haploryhmä T liittyy sepelvaltimotautiin . Haettu 31. toukokuuta 2009. Arkistoitu alkuperäisestä 31. elokuuta 2010. (määrätön)
32. ↑ Mitokondrioiden DNA:n haplotyypin 'T' kantajat ovat vähemmän alttiita diabetekselle "Mathilda's Anthropology Blog" . Haettu 31. toukokuuta 2009. Arkistoitu alkuperäisestä 30. maaliskuuta 2009. (määrätön)
33. ↑ "Mualla on raportoitu, että haploryhmään T kuuluminen voi tarjota jonkin verran suojaa Alzheimerin taudilta (Chagnon ym. 1999; Herrnstadt ym. 2002) ja myös Parkinsonin taudilta (Pyle ym. 2005), mutta Pereiran varoittavat sanat et ai. viittaavat siihen, että lisätutkimukset saattavat olla tarpeen ennen kuin päädytään päätelmiin." . Haettu 31. toukokuuta 2009. Arkistoitu alkuperäisestä 31. toukokuuta 2008. (määrätön)

Linkit

• T YFull MTree 1.02.00 (rakenteilla)
• Ian Loganin mitokondriaalinen DNA-sivusto
• Keskustelulista Roots Webissä
• Haplogroup T :n leviäminen National Geographicista
• Geneettinen sukututkimus: henkilökohtainen näkemys Tarasta, Karjalaisista ja Kentistä, Englannista
• Tanskan Demesin alueellinen DNA-projekti: mtDNA Haplogroup T
• Haploryhmän T-sekvenssin analyysi (T5/T2)
• Fylogeneettiset verkot ihmisen mtDNA-haploryhmälle T
• Fylogeneettiset verkot ihmisen mtDNA-haploryhmälle T
• Genografinen hanke julkisen osallistumisen mitokondrioiden DNA-tietokanta
• Mitokondrioiden haploryhmän T-sekvenssien molekyylin epävakaus nukleotidiasemissa 16292 ja 16296  (linkki ei saatavilla)
• Babalini C., Martinez-Labarga C., Tolk HV, et ai. Molisen (Etelä-Italia) kroatialaisen kielivähemmistön väestöhistoria: äidin näkemys  (englanniksi)  // Eur. J. Hum. Genet. : päiväkirja. - 2005. - elokuu ( osa 13 , nro 8 ). - s. 902-912 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5201439 . — PMID 15886710 .
• Abu-Amero KK, Larruga JM, Cabrera VM, González AM Mitokondrioiden DNA-rakenne Arabian niemimaalla  //  BioMed Central : päiväkirja. - 2008. - Voi. 8 . - s. 45 . - doi : 10.1186/1471-2148-8-45 . — PMID 18269758 .
• Thomas MG, Barnes I., Weale ME, et ai. Uusi geneettinen näyttö tukee eristäytymistä ja ajautumista Etelä-Tirolin Alppien ladinyhteisöissä, mutta ei muinaista alkuperää Lähi-idässä   // Eur . J. Hum. Genet. : päiväkirja. - 2008. - tammikuu ( osa 16 , nro 1 ) - s. 124-134 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5201906 . — PMID 17712356 .
• Mitokondrioiden haploryhmä T liittyy sepelvaltimotautiin
• Mitokondrioiden DNA-haplotyypin "T" kantajat ovat vähemmän alttiita diabetekselle