Haploryhmä A (mtDNA)

Haploryhmä A  on ihmisen mitokondrion DNA:n haploryhmä.

I. A. Zakharov-Gezekhus ja kollegat ehdottivat nimen Anai (Apau) antamista haploryhmälle A [1] .

Alkuperä

Haploryhmän A uskotaan syntyneen Aasiasta noin 50 tuhatta vuotta sitten. Hänen esi-isänsä oli haploryhmä N.

Paleogenetiikka

• Subklade A2 tunnistettiin 14 290–12 750 vuotta sitten ikäisistä koproliitinäytteistä Paisley Cavesista Oregonissa ( USA) [2]
• Näytteitä Brasilian Lapa do Santosta, ikääntyneitä n. 9,5 tuhatta litraa n. ja Laranjal, n. 6,8 tuhatta litraa n. Subklade A2 määritelty [3]
• A + 152 + 16362 määritettiin näytteessä DA357 (5981-5725 eKr., Glazkovon hautausmaa , Irkutskin alue ) [4]
• Haploryhmä A tunnistettiin näytteestä brn001 (5474-5312 eKr., KuengaRiver_N) Izvestkovaya-1-paikalta Izvestkovajan laaksossa ( Kuenga -joen laakso , Trans-Baikal-alue ) [5] .
• Haploryhmä A löydettiin kolmesta vauvasta Elunin- kulttuurin Berezovaja Lukan asutuksesta Altai-alueen Aleiskin alueella (2. vuosituhannen ensimmäinen puolisko eKr.) [6] [7]
• Alakladit A10* ja A10a löydettiin Länsi-Siperian pronssikauden kulttuurien edustajilta: Ust-Tartas, Odinovskaja, Krotovskaja, myöhäinen Krotovskaja, Andronovskaja (Fedorovskaja) ja Pakhomovskaja [8]
• A8a1 tunnistettiin Okunev-kulttuurin RISE664 (4409–4156 vuotta sitten, Okunevo_EMBA) edustajasta [9] , näytteestä RISE674 (4300–3850 vuotta sitten, Okunevo_EMBA) mitokondrioiden haploryhmä A-a1b3 tunnistettiin [10 ] 4]
• A12a tunnistettiin myöhäisneoliittisen näytteen N4a1 (4782–4424 vuotta sitten) Kerdugen 2 -paikalta Jakutiasta [11]
• A12a2a2 tunnistettiin N4b2-näytteestä (4348–4091 vuotta sitten) Jakutiasta [12] [11]
• A5b1b tunnistettiin näytteestä BandaKD15 (1517-1353 vuotta ennen nykypäivää ) Kiinasta (Guangxi Zhuangin autonominen alue) [13]
• Haploryhmä A tunnistettiin Sargat-kulttuurin edustajassa [14]
• Alakladit A8, A10 ja A11 tunnistettiin Staro- Aley-kulttuurin edustajien joukosta hautausmaalta Firsovo-XIV (VII-IV vuosisatoja eKr.) [15]
• A2a määritettiin Tšukotkan autonomisen piirikunnan näytteestä NEO248 (2064 vuotta sitten) [16]
• A12 tunnistettiin naarasnäytteestä R-Kich-Malka (TU10, 7. vuosisadan loppu - 800-luvun ensimmäinen puolisko) Alanian katakombihautausmaalta Kichmalkassa (Kabardino-Balkaria) [17]
• A+152+16362 määritettiin MOT01-näytteestä Tankeevkasta Tatarstanin Spasskyn alueella ( Myöhäinen Kushnarenkovo/Karayakupovo, varhainen Volga-Kama Bulghar -kausi, 10.–11. vuosisadat) [18]
• A2a määritettiin näytteestä I1524 (1180–830 vuotta sitten) Uelenista (Chukotka) [19]
• A2 löydettiin Chinchorro-kulttuurin edustajasta (muumio "Juanita" ( en: Mummy Juanita ), löydetty jäätiköstä Perun ylängöiltä), joka eli 550 vuotta sitten [20] näytteistä Huaca Pucllanasta, Pasamayosta ja Lauricocha [21] [22]
• A2a tunnistettiin näytteestä I1123 (520–140 vuotta sitten) Aleutien saarilta (Kagamilin saari, lämmin luola) [19]
• A2b1 ja A2a löytyvät Alaskan Nuvukin (Barrow) hautausmaalta peräisin olevista näytteistä, joiden kalibroidut päivämäärät ovat vuosien 981 ja 1885 välillä [23]
• A2 löydettiin keskiaikaisesta näytteestä (X-XIV vuosisatoja) Puolasta Kaldus (gmina Chełmno ) [24]

Jakelu

Alaryhmä A1 on yleinen Pohjois- ja Keski-Aasiassa, kun taas alaryhmä A2 on Siperiassa, ja se on myös yksi Amerikan alkuperäiskansojen viidestä mitokondriohaploryhmästä , kuten B , C , D ja X.

Haploryhmä A on yleisin kansojen, kuten tšuktsien , eskimoiden , na-denien ja Keski-Amerikan intiaanien keskuudessa. Siihen kuuluu myös 7,5 % japanilaisista (pääasiassa alaryhmät A4 ja A5) [25] .

Haploryhmässä A8a puolalaiset ja burjatilaiset haplotyypit on ryhmitelty alaryhmään A8a1. A8a1:n esiintyminen puolalaisissa tukee hypoteesia, että A8a-sukulinjan ilmaantuminen Keski-Eurooppaan saattaa heijastaa todennäköistä keskiaikaista nomadiheimojen muuttoa Siperiasta [26] .

Alaryhmät

Haploryhmä koostuu 5 pääalaluokasta, jotka on myös jaettu pienempiin alaryhmiin. A5-kompleksi löytyy vain Koreasta ja Japanista.

• A3- 2857, 8962, 9711, 13140, 13737, 15286, 16519
• A4-16362
  • A4a- 1442, 9713, 16249
    • A4a1-4928
  • A4b- 12720, 14290, 16189
  • A4c-200
  • A4d-151
  • A2- 146, 152, 153, 8027, 12007, 16111
  • A2a-3330, 16192
  • A2b-11365
  • A2c-64, 12468 14364
  • A2d-64, 6308
    • A2d1-8281-8289d, 11314
      • A2d1a-8548, 16274 (ehdotus)
    • A2d2-5081
  • A2e- 153, 7112, 13708, 16189, 16336, 16519
  • A2f-153, 3316
  • A2g-7724T, 16391
  • A2h- 1598, 1888, 12811, 16335, 16526
  • A2i- 960.1C, 3308A, 3309.1A, 6620, 14280, 14470, 16325
  • A2j- 10595, 11548
    • A2j1-11314
  • A2k-3202
    • A2k1-15924
  • A6-654, 3687, 4257, 13287
• A5-8563, 11536
  • A5a-152, 2156.1A, 4655, 11647, 16187
    • A5a1-14944
      • A5a1a-10801
        • A5a1a1-5773, 12880
        • A5a1a2-6956, 8628
      • A5a1b-16160
    • A5a1b-16160
    • A5a2-13461
  • A5b-961, 1709, 16126, 16235
  • A5c-523-524d, 16129, 16213
• A7-8413, 15379, 16051, 16129, 16189
• A8-16242
• A9-152, 6950, 7228, 8340, 10700, 15874 (ehdotus)

Katso myös

Muistiinpanot

1. ↑ Zakharov I. A. Ensimmäisen amerikkalaisen esi-isien keski-aasialainen alkuperä. Arkistokopio päivätty 17. lokakuuta 2018 Wayback Machinessa // First Americans. 2003. Nro 11. S. 139-144.
2. ↑ Arkeologin johtamat tutkijat, Find Pre-Clovis Human DNA Arkistoitu 21. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa , 2. huhtikuuta 2008
3. ↑ Cosimo Posth et ai. Keski- ja Etelä-Amerikan syvän väestöhistorian rekonstruoiminen Arkistoitu 22. joulukuuta 2021 Wayback Machinessa , 2018
4. ↑ 1 2 Peter de Barros Damgaard et ai. Ensimmäiset hevospaimenet ja varhaisen pronssikauden steppe-laajennusten vaikutus Aasiaan Arkistoitu 23. maaliskuuta 2021 Wayback Machinessa , 29. kesäkuuta 2018
5. ↑ Gülşah Merve Kılınç et al. Ihmispopulaatiodynamiikka ja Yersinia pestis muinaisessa Koillis-Aasiassa Arkistoitu 17. kesäkuuta 2021 Wayback Machinessa // Science Advances, 6. tammikuuta 2021
6. ↑ Kulikov E.E. Muinaisten ihmisten ja eläinten DNA:n molekyyliominaisuudet keräysmateriaalista ja arkeologisista löydöistä. M., 2004.
7. ↑ Kozintsev A. G. "Arosta autiomaahan: Itä-Turkestanin varhaiset kaukasialaiset" Arkistoitu kopio 13. tammikuuta 2017 Wayback Machinessa
8. ↑ Pilipenko et ai. MtDNA Haplogroup A10 -linjat pronssikauden näytteissä viittaavat siihen, että muinaiset autoktoniset ihmisryhmät vaikuttivat Länsi-Siperian alkuperäiskansojen spesifisyyteen. Arkistoitu 8. marraskuuta 2020 Wayback Machinessa , 2015
9. ↑ A8a1 MTree . Haettu 23. maaliskuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 19. lokakuuta 2021. (määrätön)
10. ↑ A-a1b3 MTree . Haettu 23. maaliskuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 12. kesäkuuta 2021. (määrätön)
11. ↑ 1 2 Gülşah Merve Kılınç et al. Ihmispopulaatiodynamiikka ja Yersinia pestis muinaisessa Koillis-Aasiassa Arkistoitu 17. kesäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 6. tammikuuta 2021
12. ↑ A12a2a2 MTree . Haettu 9. lokakuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 9. lokakuuta 2021. (määrätön)
13. ↑ Tianyi Wang et ai. Ihmisen väestöhistoria Itä- ja Kaakkois-Aasian risteyksessä 11 000 vuotta sitten // Cell, 24. kesäkuuta 2021
14. ↑ Bennett CC, Kaestle FA Investigation of Ancient DNA from Western Siperia and the Sargat Culture, Human Biology, voi. 82, nro. 2 (huhtikuu 2010), s. 143-156.
15. ↑ Pilipenko A. S. ym. TUTKIMUS VANHAAN ALEIC-KULTTUURIN KANTAJIEN GENEETISEN KOOSTUMUKSEEN: ONGELMAN LAUSUNTO JA mtDNA:N MUUTTUVUUSANALYYSI ENSIMMÄISET TULOKSET Arkistokopio päivätty tammikuun 21. päivänä 21. tammikuuta / Waume / 21. 4 (2020)
16. ↑ Martin Sikora et al. Koillis-Siperian väestöhistoria pleistoseenista lähtien Arkistoitu 5. heinäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 05. kesäkuuta 2019 ( bioRxiv, 2018 arkistoitu 24. lokakuuta 2018 Wayback Machinessa )
17. ↑ Saskia Pfrengle et ai. Mycobacterium lepraen monimuotoisuus ja populaatiodynamiikka keskiaikaisessa Euroopassa uusien muinaisten genomitunnusten, arkeologisten näytteiden nimien arkeologisten päivämäärien, näytteen kuvauksen, kuoliniän, mitokondrioiden haploryhmien sekä kaikkien analyysien arkeologisen ja molekyylisen sukupuolen perusteella. Arkistoitu 6. lokakuuta 2021 Wayback Machinessa
18. ↑ Bea Szeifert et ai. Muinaisten unkarilaisten geneettisten yhteyksien jäljittäminen Volgan ja Uralin alueen 6-1300-luvun populaatioihin Arkistoitu 12. helmikuuta 2022 Wayback Machinessa , 8. helmikuuta 2022
19. ↑ 1 2 Pavel Flegontov et al. (2019) Paleo-eskimojen geneettinen esi-isä ja Chukotkan ja Pohjois-Amerikan kansa Arkistoitu 16. helmikuuta 2021 Wayback Machinessa , ( bioRxiv arkistoitu 23. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa , 2017; lisätiedot arkistoitu 5. tammikuuta 20 koneeseen )
20. ↑ Genomia todisteita pleistoseenista ja alkuperäiskansojen viimeaikaisesta väestöhistoriasta, 2015 . Haettu 7. marraskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 7. marraskuuta 2015. (määrätön)
21. ↑ Andrei Konkov . Muinaisen DNA:n salaus kertoi Etelä-Amerikan intiaanien alkuperästä. Arkistokopio 26. joulukuuta 2017 Wayback Machinessa
22. ↑ Bastien Llamas et ai. Muinainen mitokondriaalinen DNA tarjoaa korkearesoluutioisen aikaskaalan Amerikan asukkaille, 2016 // Supplementary Materials. Taulukko S2. Luettelo vanhoista näytteistä, niihin liittyvistä metatiedoista ja sekvensointituloksista (erillinen Excel-dokumentti Arkistoitu 8. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa
23. ↑ Justin Tackney et ai. Muinaisen Thule-populaation molekyylianalyysi Nuvukissa, Point Barrow'ssa, Alaskassa , 9. tammikuuta 2019
24. ↑ Płoszaj T. et ai. Analyysi keskiaikaiselle hautausmaalle Kałdusissa, Keski-Puolassa , 15. tammikuuta 2020 sijoitettujen kammiohautojen yksilöiden äidin sukulinjasta
25. ↑ Japan Reference : The Origins of Japanese people Arkistoitu 30. elokuuta 2008 Wayback Machinessa
26. ↑ Marta Mielnik-Sikorska, Patrycja Daca, Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Katarzyna Skonieczna, Maria Perkova, Tadeusz Dobosz ja Tomasz Grzybowski, Luísa Maria Sousa Mesquita Pereira . Täydellisistä mitokondriaalisen genomin sekvensseistä päätelty slaavien historia arkistoitu 17. toukokuuta 2022 Wayback Machinessa // PLoS One. 2013; 8(1). Julkaistu verkossa 2013 14. tammikuuta.

Linkit

Yleistä tietoa

• Ian Loganin mitokondriaalinen DNA-sivusto
• PhyloTree.org – mtDNA-puu Rakenne 17 (18. helmikuuta 2016): alipuu A

Haplogroup A

• • Beringian pysähtyminen ja intiaanien perustajien leviäminen (PLoS)
  • Haplogroup A :n leviäminen National Geographicista
  • Aiyana