Haploryhmä J (Y-DNA)

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 19. kesäkuuta 2022 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 3 muokkausta .
Haploryhmä J
Tyyppi Y-DNA
Esiintymisaika 30 tuhatta vuotta sitten
Spawn Sijainti Lähi-Itä
Esi-isän ryhmä IJ
sisarryhmät minä
Alaryhmät J1 , J2
Merkkimutaatiot M304/Page16/PF4609, 12f2.1

Haploryhmä J (J-P209)  - Y-DNA:n haploryhmä , jaettu pääasiassa Lähi-idässä , Pohjois-Afrikassa , Kaukasuksella ja Etelä - Euroopassa , vaikka sitä löytyy myös muilta planeettamme alueilta. Se koostuu kahdesta suuresta haarasta (kladit, alaryhmät):

Haploryhmä J on peräisin haploryhmän IJ mutaatiosta, joka tapahtui miehellä, joka eli c. 42 900 vuotta sitten. Haploryhmän J nykyaikaisten kantajien viimeinen yhteinen esi-isä eli 31 600 vuotta sitten (päivämäärät on määritetty YFullin [1] snipsistä ).

Jakauma nykyajan populaatioissa

Ihmisen genomitutkimuksen mukaan 2000-luvulla jKr haploryhmä J on yleisin Arabian niemimaan lounaisosassa . Sen ulkopuolella sitä esiintyy Kaukasuksella , Etelä-Euroopassa (erityisesti Etelä-Italiassa , Maltalla , Kreikassa ja Albaniassa ), Pohjois-Afrikassa ja Etelä-Aasiassa . Haploryhmä J löytyy Pohjois-Afrikasta , pääasiassa alakladin J1 muodossa . Sen toinen lajike, J2a , tavataan pääasiassa Kreikassa , Anatoliassa ja Etelä-Italiassa .

Tilastot

Maa/alue Ryhmä N J-M267, J1 J-M172, J2 Yhteensä J Opiskelu
Algeria Oran 102 22.5 4.9 27.4 Robino, 2008
Kaukasus Tšetšenia 330 29.9 56.7 86.6 Balanovsky, 2011
Kaukasus Ingušia 143 2.8 88.8 91.6 Balanovsky, 2011
Kypros 164 9.6 12.9 22.5 El Sibai, 2009 [2]
Egypti 124 19.8 7.6 27.4 El Sibai, 2009
Kreikka Kreeta / Heraklion 104 1.9 44.2 46.1 Martinez, 2007
Kreikka Kreeta 143 3.5 35 38.5 El Sibai, 2009
Kreikka 154 1.9 18.1 kaksikymmentä El Sibai, 2009
Iran 92 3.2 25 28.2 El Sibai, 2009
Irak 117 33.1 25.1 58.2 El Sibai, 2009
Israel Akko 101 39.2 18.6 57.8 El Sibai, 2009
Italia 699 2 kaksikymmentä 22 Capelli, 2007
Italia Marche 59 5.1 35.6 40.7 Capelli, 2007
Italia Calabria 57 3.5 35.1 38.6 Capelli, 2007
Italia Sisilia 212 5.2 22.6 27.8 El Sibai, 2009
Italia Sardinia 81 4.9 9.9 14.8 El Sibai, 2009
Kypros 164 9.6 12.9 22.5 El Sibai, 2009
Jordania 273 35.5 14.6 50.1 El Sibai, 2009
Kuwait 42 33.3 9.5 42.8 El Sibai, 2009
Libanon 951 17 29.4 46.4 El Sibai, 2009
Malta 90 7.8 21.1 28.9 El Sibai, 2009
Marokko 316 yksi 0.2 1.2 El Sibai, 2009
Portugali 303 4.3 6.9 11.2 El Sibai, 2009
Qatar 72 58.3 8.3 66.6 El Sibai, 2009
Espanja Cadiz 28 3.6 14.3 17.9 El Sibai, 2009
Espanja Kantabria 70 2.9 2.9 5.8 El Sibai, 2009
Espanja Kastilia 21 0 9.5 9.5 El Sibai, 2009
Espanja Cordova 27 0 14.7 14.7 El Sibai, 2009
Espanja Galicia 19 5.3 0 5.3 El Sibai, 2009
Espanja Huelva 22 0 13.7 13.7 El Sibai, 2009
Espanja Ibiza 54 0 3.7 3.7 El Sibai, 2009
Espanja Leon 60 1.7 5 6.7 El Sibai, 2009
Espanja Malaga 26 0 15.4 15.4 El Sibai, 2009
Espanja Mallorca 62 1.6 kahdeksan 9.7 El Sibai, 2009
Espanja Sevilla 155 3.2 7.8 yksitoista El Sibai, 2009
Espanja Valencia 31 2.7 5.5 8.2 El Sibai, 2009
Syyria 554 33.6 20.8 54.4 El Sibai, 2009
Tunisia 148 32.4 3.4 35.8 Arredi, 2004
Turkki 523 9.1 24.2 33.3 El Sibai, 2009
Arabiemiirikunnat 164 34.7 10.3 45 El Sibai, 2009
Jemen 62 72.5 9.6 82.1 El Sibai, 2009

Muunnelmia

Paragroup J-P209*

Pararyhmä J-P209* [Fylogenetics 1] on kaikki J :n muunnelmat paitsi J1 ja J2 . J-P209* on hyvin yleinen Socotran saarella , missä sen taajuus on 71,4 %. [3] J-P209* on löydetty pienempinä osuuksina myös Jemenissä ( Giacomo 2004 ), Ashkenazi-juutalaisten keskuudessa , [4] Saudi - Arabiassa ( Abu-Amero 2009 ).

J1-M267

Mahdolliset nimitykset [Phylogenetics 2]

J2-M172

Mahdolliset nimitykset [Phylogenetics 3]

Paleogenetiikka

Haploryhmä J löydettiin georgialaisen Satsurbliyan luolan paleoliittisesta asukkaasta , joka eli n. 13,2 tuhatta vuotta sitten. Subklade J2a löydettiin mesoliittisen metsästäjän kotias Klden karstiluolasta Länsi -Georgiasta , joka eli 9529-9895 tuhatta vuotta sitten [5] .

J2a tunnistettiin Onega-järven eteläisen Olenyn saaren mesoliittisesta asukkaasta , joka eli 7500 vuotta sitten [6] , iranilaisen Khotun luolan ( en: Huto and Kamarband Caves ) mesoliittisesta asukkaasta [7] .

J2a2 ja J2a1a tunnistettiin Cardiac Ware -kulttuurin edustajilla Ripabianca di Monteradosta (Italia) [8] .

J1 tunnistettiin Kura-Araxes-kulttuurin edustajasta [9] .

J ja J2a tunnistettiin Maikop-kulttuurin edustajilta [9] .

J2a-M410 tunnistettiin tummaihoisesta ja ruskeasilmäisestä asukkaasta (Kou01) Kreikan Koufonisia -saarella varhaispronssikaudelta (varhaiskykladit, 2464–2349 eKr.) [10] .

J2a tunnistettiin henkilöstä, joka eli noin 1110-1270 eaa. e. myöhäisen pronssikauden kyjatice-kulttuurin edustaja Unkarin paikkakunnalta Ludas-Varjú-dűlő [11] .

Merkittäviä haploryhmän J jäseniä

Muistiinpanot

  1. JYTree . Haettu 2. heinäkuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 25. helmikuuta 2017.
  2. El-Sibai, 2009 raportoi tuloksia useista tutkimuksista: Di Giacomo, 2003 , Al-Zahery, 2003 , Flores, 2004 , Cinnioglu, 2004 , Capelli, 2005 , Goncalves, 2005 , Ca2008,2, Zallou .
  3. Cerny, 2008 : J-12f2(xM267,M172)(45/63)
  4. Shen, 2004 : Haploryhmä J-M304(xM267,M172) 1/20 ashkenazi-juutalaisessa.
  5. Jones, ER et ai. Yläpaleoliittiset genomit paljastavat nykyaikaisten euraasialaisten syvät juuret Arkistoitu 21. elokuuta 2016 Wayback Machinessa , 2015
  6. Iain Mathieson et ai. Kahdeksantuhatta vuotta luonnonvalintaa Euroopassa Arkistoitu 3. maaliskuuta 2016 Wayback Machinessa , 2015
  7. Iosif Lazaridis et ai. Maailman ensimmäisten maanviljelijöiden geneettinen rakenne, 2016. . Haettu 18. kesäkuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 16. heinäkuuta 2018.
  8. Margaret L. Antonio et ai. Muinainen Rooma: Geneettinen Euroopan ja Välimeren risteys Arkistoitu 10. marraskuuta 2019 Wayback Machinessa , 2019
  9. 1 2 Chuan-Chao et ai. Suur-Kaukasuksen geneettinen esihistoria arkistoitu 18. toukokuuta 2018 Wayback Machinessa , 2018
  10. Florian Clemente et ai. Egeanmeren palatsisivilisaatioiden genomihistoria Arkistoitu 29. huhtikuuta 2021 Wayback Machinessa , 29. huhtikuuta 2021
  11. Genomivirta ja pysähtyneisyys Euroopan esihistorian viiden vuosituhannen transektissa Arkistoitu 29. huhtikuuta 2015 Wayback Machinessa , 2014
  12. Yu. M. Idrisov. Uusia tietoja Kumykin genogeografiaan // Kumyk-arkisto: kokoelma artikkeleita ja materiaaleja. Ongelma. 1. Toim. yhteistyökumppanit: Yu. M. Idrisov (tieteellinen toimittaja), R. P. Garunov (vastaava toimittaja), A. B. Ibragimov, Kh. A. Alkhanadžiev, S. A. Khamurzaev, I. M. Makhtibekov. - Makhachkala: Abusupiyan Publishing House, 2018.

Käytetyt tutkimukset

Aikakauslehdet

  • Y-kromosomikonsortio "YCC". Nimikkeistöjärjestelmä ihmisen Y-kromosomaalisten binaaristen haploryhmien  puulle  // Genomitutkimus : päiväkirja. - 2002. - Voi. 12 , ei. 2 . - s. 339-348 . - doi : 10.1101/gr.217602 . — PMID 11827954 .
  • Abu-Amero, Khaled K; Hellani, Ali; Gonzalez, Ana M; Larruga, Jose M; Cabrera, Vicente M; Underhill, Peter A. Saudi-Arabian Y-kromosomien monimuotoisuus ja sen suhde lähialueisiin  (englanniksi)  // BMC Genetics : Journal. - 2009. - Vol. 10 . - s. 59 . - doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . — PMID 19772609 .
  • Alshamali, Farida; Pereira, Luísa; Budowle, Bruce; Poloni, Estella S.; Currat, Mathias. Y-STR:n monimuotoisuus paljastaa Arabian niemimaan paikallisen väestörakenteen  // Ihmisen  perinnöllisyys : päiväkirja. - 2009. - Vol. 68 , no. 1 . - s. 45-54 . - doi : 10.1159/000210448 . — PMID 19339785 .
  • Chiaroni, Jacques; King, Roy J; Myres, Natalie M; Henn, Brenna M; Ducourneau, Axel; Mitchell, Michael J; Boetsch, Gilles; Sheikha, Issa; Lin, Alice A. Y-kromosomin haploryhmän J1e ilmaantuminen arabiankielisissä populaatioissa  // European  Journal of Human Genetics : päiväkirja. - 2009. - Vol. 18 , ei. 3 . - s. 348-353 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . — PMID 19826455 .
  • Chiaroni, Jacques; King, Roy J; Myres, Natalie M; Henn, Brenna M; Ducourneau, Axel; Mitchell, Michael J; Boetsch, Gilles; Sheikha, Issa; Lin, Alice A. Y-kromosomin haploryhmän J1e ilmaantuminen arabiankielisissä populaatioissa  // European  Journal of Human Genetics : päiväkirja. - 2010. - Vol. 18 , ei. 3 . - s. 348-353 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . — PMID 19826455 .
  • Cinnioglu, Cengiz; kuningas, Roy; Kivisild, Toomas; Kalfoglu, Ersi; Atasoy, Sevil; Cavalleri, Gianpiero L.; Lilly, Anita S.; Roseman, Charles C.; Lin, Alice A. Y-kromosomin haplotyyppikerrostumien kaivaminen Anatoliassa  (englanniksi)  // Human Genetics: Journal. - 2004. - Voi. 114 , nro. 2 . - s. 127-148 . - doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 . — PMID 14586639 .
  • Di Giacomo, F.; Luca, F.; Anagnou, N.; Ciavarella, G.; Corbo, R.M.; Cresta, M.; Cucci, F.; Di Stasi, L.; Agostiano, V. Ihmisen Y-kromosomaalisen monimuotoisuuden kliinisiä malleja Manner-Italiassa ja Kreikassa hallitsevat ajautuminen ja perustajavaikutukset  // Molecular Phylogenetics and Evolution  : Journal  . - Academic Press , 2003. - Voi. 28 , ei. 3 . - s. 387-395 . - doi : 10.1016/S1055-7903(03)00016-2 . — PMID 12927125 .
  • Di Giacomo, F.; Luca, F.; Popa, L.O.; Akar, N.; Anagnou, N.; Banyko, J.; Brdicka, R.; Barbujani, G.; Papola, F. Y kromosomaalisen haploryhmän J allekirjoituksena post-neoliittista kolonisaatiota Euroopassa  (englanniksi)  // Human Genetics : Journal. - 2004. - Voi. 115 , nro. 5 . - s. 357-371 . - doi : 10.1007/s00439-004-1168-9 . — PMID 15322918 .
  • Hammer, Michael F.; Behar, Doron M.; Karafet, Tatiana M.; Mendez, Fernando L.; Hallmark, Brian; Erez, Tamar; Zhivotovsky, Lev A.; Rosset, Saharon; Skorecki, Karl. Laajennetut Y-kromosomin haplotyypit ratkaisevat useita ja ainutlaatuisia juutalaisen papiston sukulinjaa  (englanniksi)  // Human Genetics : Journal. - 2009. - Vol. 126 , nro. 5 . - s. 707-717 . - doi : 10.1007/s00439-009-0727-5 . — PMID 19669163 .
  • Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris. Uusia käyttötapoja uusille haplotyypeille  //  Trends in Genetics : päiväkirja. - Cell Press , 2000. - Voi. 16 , ei. 8 . - s. 356-362 . - doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 . — PMID 10904265 .
  • Karafet, T.M.; Mendez, F. L.; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, S.L.; Hammer, MF Uudet binaariset polymorfismit muokkaavat ihmisen Y-kromosomaalista haploryhmäpuuta ja lisäävät sen  resoluutiota //  Genomitutkimus : päiväkirja. - 2008. - Voi. 18 , ei. 5 . - s. 830-838 . - doi : 10.1101/gr.7172008 . — PMID 18385274 .
  • Luca, F.; Di Giacomo, F.; Benincasa, T.; Popa, L.O.; Banyko, J.; Krachmarova, A.; Malaspina, P.; Novelletto, A.; Brdicka, R. Y-kromosomaalinen vaihtelu Tšekin tasavallassa  // American Journal of Physical Anthropology  :  Journal. - 2007. - Voi. 132 , nro. 1 . - s. 132-139 . - doi : 10.1002/ajpa.20500 . — PMID 17078035 .
  • Louis, J; Rowold, D; Regueiro, M; Caeiro, B; Cinnioglu, C; Roseman, C; Underhill, P; Cavallisforza, L; Herrera, R. Levantti vs. Afrikan sarvi: todisteita ihmisten muuttoliikkeen kaksisuuntaisista käytävistä  // The American  Journal of Human Genetics : päiväkirja. - 2004. - Voi. 74 , nro. 3 . - s. 532-544 . - doi : 10.1086/382286 . — PMID 14973781 .
  • Nasidze, I.; Ling, EYS; Quinque, D.; Dupanloup, I.; Cordaux, R.; Rychkov, S.; Naumova, O.; Zhukova, O.; Sarraf-Zadegan, N. Mitokondriaalinen DNA ja Y-kromosomivariaatio Kaukasiassa  //  Annals of Human Genetics : päiväkirja. - 2004. - Voi. 68 , no. 3 . - s. 205-221 . - doi : 10.1046/j.1529-8817.2004.00092.x . — PMID 15180701 .
  • Shen, Peidong; Lavi, Tal; Kivisild, Toomas; Chou, Vivian; Sengun, Deniz; Gefel, Dov; Spirer, Isac; Woolf, Eilon; Hillel, Jossi. Samarialaisten ja muiden israelilaisten populaatioiden patrilinjojen ja matriliinien rekonstruktio Y-kromosomien ja mitokondrioiden DNA-sekvenssin vaihteluista  // Human  Mutation : päiväkirja. - 2004. - Voi. 24 , nro. 3 . - s. 248-260 . - doi : 10.1002/humu.20077 . — PMID 15300852 .

Blogit

Postituslistat

Kirjallisuus

Merkintä

  1. Tässä taulukossa on lueteltu J-P209:n (myös J-12f2.1 tai J-M304) mahdolliset merkinnät eri lähteistä. Semino 2000:ssa Eu09 tarkoittaa alakladia Eu10:stä ja Karafet 2001:ssä 24 on alakladi luvusta 23 .
    YCC 2002/2008 (lyhyt) J-
    P209 (AKA J-12f2.1 tai J-M304)
    Jobling ja Tyler-Smith 2000 9
    Underhill 2000 VI
    Vasara 2001 Med
    Karafet 2001 23
    Semino 2000 Eu10
    Su 1999 H4
    Capelli 2001 B
    YCC 2002 (Longhand) J*
    YCC 2005 (Longhand) J
    YCC 2008 (Longhand) J
    YCC 2010r (Longhand) J
  2. Tässä taulukossa luetellaan mahdolliset nimet haploryhmälle J-M267 ja sen aiemmin tutkitulle ja kuvatulle alakladille J-M62 julkaistussa vertaisarvioidussa kirjallisuudessa.
    YCC 2002/2008 (lyhyt) J-M267 J-M62
    Jobling ja Tyler-Smith 2000 - 9
    Underhill 2000 - VI
    Vasara 2001 - Med
    Karafet 2001 - 23
    Semino 2000 - Eu10
    Su 1999 - H4
    Capelli 2001 - B
    YCC 2002 (Longhand) - J1
    YCC 2005 (Longhand) J1 J1a
    YCC 2008 (Longhand) J1 J1a
    YCC 2010r (Longhand) J1 J1a
  3. Tässä taulukossa luetellaan haploryhmän J-M172 mahdolliset nimet julkaistussa vertaisarvioidussa kirjallisuudessa. Semino 2000:ssa Eu09 on alakladi Eu10:stä ja Karafet 2001:ssä 24 on alakladi luvusta 23 .
    YCC 2002/2008 (lyhyt) J-M172
    Jobling ja Tyler-Smith 2000 9
    Underhill 2000 VI
    Vasara 2001 Med
    Karafet 2001 24
    Semino 2000 Eu9
    Su 1999 H4
    Capelli 2001 B
    YCC 2002 (Longhand) J2*
    YCC 2005 (Longhand) J2
    YCC 2008 (Longhand) J2
    YCC 2010r (Longhand) J2

Linkit

Ihmisen Y-kromosomin haploryhmienevoluutiopuu
Y-kromosomaalinen Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
minä J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) K R