Haploryhmä K(xLT) (Y-DNA)

Haploryhmä K(xLT) - MNOPS
Haploryhmän K(xLT) alkuperä - MNOPS
Tyyppi Y-DNA-makroryhmä
Esiintymisaika 55-47 tuhatta vuotta sitten
Spawn Sijainti Etelä- tai Keski- Aasiassa
Esi-isän ryhmä makroryhmä K
sisarryhmät makroryhmä LT ( L: n ja T :n esi-isä )
Alaryhmät K1, K2, K3, M ja S , NO ja P makroryhmät
Merkkimutaatiot M526/PF5979 (alkuperäinen rs2033003)

Populaatiogenetiikassa ja ihmisen genogeografiassa Y-kromosomaalisia haploryhmiä tutkivassa K2 tai K-M526 (aiemmin K(xLT) ja MNOPS) on patrilineaalinen perinnöllisyys , jolle on tunnusomaista Y-kromosomin DNA-mutaatio M526/PF5979 [1] . Koska monet muut haploryhmät tulevat siitä, se on makroryhmä . YFull-yhtiön mukaan K2 -haploryhmä syntyi K-M9-makroryhmästä 47 200 vuotta sitten [2] . Tamara Karafet ja kollegat päättelivät vuoden 2014 artikkelissa, että K2-M526:n nopea monipuolistuminen tapahtui todennäköisesti Kaakkois-Aasiassa [3] .

Puun varhaisissa versioissa Y-DNA puuttui ( K -makroryhmässä pienten alaklaadien ohella L-, M-, NO- ja P-haarat erotettiin suoraan; vuonna 2008 niihin lisättiin S ja T). Myöhemmin NO- ja P-ryhmistä löydettiin yhteinen mutaatio rs2033003, ja vuonna 2009 näitä haploryhmiä alettiin pitää NOP -makroryhmän haaroina . Kuitenkin jo vuonna 2010 kävi ilmi, että sama etiketti (nimeltään M526) on läsnä myös M- ja S-ryhmissä, joten MNOPS -makroryhmä muodostui . Lisäksi vuonna 2011 havaittiin mutaatioita, että toisiinsa liittyvät haploryhmät L ja T sekä M526 löytyivät myös pienistä alaklaadeista K1, K2, K3 ja K4, joten LT-ryhmä ilmestyi haploryhmäpuuhun ja MNOPS-ryhmä nimettiin uudelleen K ( xLT) . koska nyt makroryhmän K alle on jäänyt vain kaksi haaraa: "LT" ja "ei-LT".

Tämä IHC :n ( eng.  Y Chromosome Consortium (YCC) ) "vallankumouksellinen" päätös aiheutti useita kiistoja, koska ensinnäkin syntyi sekaannusta: ryhmät K1, K2, K3, K4 eivät alkaneet liittyä suoraan K:hen, mutta sen sijaan sen alaluokkaan K(xLT), ja toiseksi sanamuoto kuten "K(xLT)" on perinteisesti tarkoittanut "kaikki K:hen liittyvää paitsi LT:tä koskevaa" (tai lyhyesti sanottuna "K LT:n ulkopuolella"), ja nyt siellä on ei ole selvää tapaa erottaa vanha ja uusi käyttö. Niiden merkitysero tässä tapauksessa ei ole suuri, mutta varsin selvä, nimittäin: "K(xLT)" perinteisessä merkityksessä sisältäisi myös pararyhmän K* ja mahdollisesti tulevaisuudessa K:n avoimet haarat, joilla ei ole etiketti M526, mutta eivät kuulu LT:lle.

Perinteinen ratkaisu tässä tilanteessa olisi:

  1. nimeä haploryhmät K1, K2, K3 ja K4 uudelleen U:ksi, V:ksi, W:ksi ja X:ksi ja makroryhmä MNOPS muotoon MNOPSUVWX;
  2. nimeä K1, K2, K3 ja K4 uudelleen muotoiksi K(xLT)1, K(xLT)2, K(xLT)3 ja K(xLT)4;
  3. nimeä LT uudelleen K1:ksi, MNOPS K2:ksi ja K1, K2, K3 ja K4 K2a:ksi, K2b:ksi, K2c:ksi ja K2d:ksi, jolloin M, NO, P ja S ovat haaran K2 osajoukkoja;

Konsortio ei kuitenkaan pitänyt näitä vaihtoehtoja tyydyttävinä ja päätti poikkeuksellisesti sallia hierarkkisen epäjohdonmukaisuuden K- ja K(xLT)-haarojen nimeämisessä.

Vuonna 2012 puusta poistettiin K1-alahaara, koska sen ei todettu olevan tarpeeksi vanha, ja K2, K3 ja K4 nimettiin uudelleen K1:ksi, K2:ksi ja K3:ksi.

Paleogeografia

Puu

Yleinen rakenne on seuraava:

Makroryhmän K(xLT) nimettyjen alaklaadien puu ja ne määrittävät mutaatiot vuoden 2013 alussa ovat seuraavat [10] (haploryhmien laskevat haarat jätetään pois):

K(xLT) (M526/PF5979)


Ihmisen Y-kromosomin haploryhmienevoluutiopuu
Y-kromosomaalinen Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
minä J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) K R  


Muistiinpanot

  1. ↑ Jacques Chiaroni, Peter A. Underhill ja Luca L. Cavalli-Sforza, "Y-kromosomien monimuotoisuus, ihmisen laajeneminen, ajautuminen ja kulttuurinen evoluutio", PNAS julkaistiin verkossa ennen painoa 17. marraskuuta 2009, doi: 10.1073/pnas.3101680
  2. ↑ KYTree . Käyttöpäivä: 30. heinäkuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 20. toukokuuta 2016.
  3. ↑ Karafet, Tatiana; Mendez, Fernando; Sudoyo, Herawati. Y-kromosomin haploryhmän K-M526 parantunut fylogeneettinen erottelukyky ja nopea monipuolistaminen Kaakkois-Aasiassa  (englanniksi)  // Nature : Journal. - 2014. - Vol. 23 . - s. 369-373 . - doi : 10.1038/ejhg.2014.106 . — PMID 24896152 .
  4. ↑ Lisätiedot 9. Ust'Ishim Y-kromosomin filogeneettinen rekonstruktio . Haettu 6. joulukuuta 2014. Arkistoitu alkuperäisestä 24. maaliskuuta 2016.
  5. ↑ paleoliittista DNA:ta Eurasiasta Arkistoitu 3. lokakuuta 2016 Wayback Machinessa
  6. ↑ Posnik GD et ai. (2016) Punktuated purskeet ihmisen miehen demografiassa pääteltynä 1 244 maailmanlaajuisesta Y-kromosomisekvenssistä . Arkistoitu 28. toukokuuta 2017 osoitteessa Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. kuva 15).
  7. ↑ Ladattavat genotyypit nykyisestä ja muinaisesta DNA-datasta (koottu julkaistuista julkaisuista) | David Reich Lab (linkki ei saatavilla) . reich.hms.harvard.edu . Haettu 11. syyskuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 2. marraskuuta 2019. 
  8. ↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven ym. , "Austronesian laajentumisen vaikutus: todisteita mtDNA:n ja Y-kromosomien monimuotoisuudesta Melasian Admiraliteettisaarilla", Molecular Biology and Evolution (2008)
  9. ↑ Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox et ai. MBE Advance Access julkaistiin 5. maaliskuuta 2010.
  10. ↑ Y-DNA:n haploryhmä K ja sen alaryhmät -  2013 . International Society of Genetic Genealogy (viimeksi päivitetty: 4. tammikuuta 2013). Käyttöpäivä: 7. tammikuuta 2013. Arkistoitu alkuperäisestä 11. tammikuuta 2013.

Linkit