Haplogroup DE

Haplogroup DE  on ihmisen Y-kromosomin haploryhmä . Se määritetään yhden nukleotidin polymorfismimutaatioilla M1 (YAP), M145 (P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183 [5] .

Se tunnetaan sen määrittelevän ainutlaatuisen tapahtumapolymorfismin , YAP -  lisäyksen , ansiosta . Tämä mutaatio tapahtui, kun Alu :n DNA:n kopio lisäsi kopion Y-kromosomiin. Siten Y-kromosomeja, jotka sisältävät YAP-mutaation, kutsutaan YAP+:ksi ja jotka eivät sisällä - YAP-.

Ulkonäkö

Se on peräisin CT -haploryhmän mutaatiosta, joka tapahtui miehellä , joka eli noin 68,5 tuhatta vuotta sitten (päivämäärän määrittää YFull [6] SNP:t ).

Erään version mukaan haploryhmä DE ja YAP+ ilmestyi Afrikassa [7] . Tämän vahvistaa se tosiasia, että:

1. Afrikassa YAP:lla on suurin jakautuminen (yli 80 %).
2. DE sisältää kaksi alaryhmää, jotka eivät ole päällekkäisiä filogeneettisesti tai maantieteellisesti.
3. Haploryhmä C ilmestyi suunnilleen samaan aikaan kuin DE jossain Aasiassa, eikä ole todisteita, mukaan lukien arkeologiset todisteet, kansojen muuttamisesta Aasiasta Afrikkaan tuona aikana.

Toisen version mukaan YAP+ tulee Aasiasta. Tätä tukevat seuraavat väitteet:

1. Kun otetaan huomioon YAP:n esiintyminen haploryhmän D kantajissa Koillis - Intiassa ja Andamaanien saarilla , voidaan olettaa, että Etelä-Aasiassa jotkin M168-kromosomeista johtivat YAP:n ja M174-mutaation lisäämiseen [4] .
2. Haploryhmä CT , josta DE on peräisin, on ei-afrikkalaista alkuperää [8] .
3. On todisteita jonkin verran myöhemmistä kromosomien liikkeistä Aasiasta Afrikkaan.

Vuonna 2016 Poznick ja Underhill osoittivat, että Y-kromosomin haploryhmä E on peräisin Afrikan ulkopuolelta ja kaikkien ei-afrikkalaisten sukujen (TMRCA), mukaan lukien haploryhmät DE ja CF , yhteinen esi-isä eli ~76 tuhatta vuotta sitten [9] . Haploryhmän DE jako alakladeiksi D ja E tapahtui 69,0 ± 14,7 tuhatta vuotta sitten. n., haploryhmän E kantajien saapuminen Afrikkaan tapahtui 65,5 ± 8,5 tuhatta vuotta sitten [10] .

Chris Tyler-Smith ja kollegat uskovat, että DE- ja CF -linjat erosivat 77 tuhatta litraa. n. (perustuu mutaationopeudelle 0,76 × 10-9 nukleotidiparia kohti vuodessa) [11] .

Etnomaantieteellinen jakautuminen

Toistaiseksi ei ole löydetty yhtäkään elävää edustajaa DE -pararyhmästä . Nigerialaisista löydetyt 5 näytettä osoittautuivat itse asiassa haploryhmän D2 (A5580.2) harvinaiseksi alaklaadiksi [12] . Sama koskee näytettä Guinea -Bissaun Nalu -kansasta [13] . Kaksi edustajaa Tiibetissä [14] osoittautui itse asiassa alaryhmäksi D-M174, samoin kuin yksi näyte Altain tasavallasta Beshpeltiristä [15] .

Puu

Fylogeneettinen puu YCC 2008 [16] .

• DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183)
  • DE*
  • D (M174, (021355))
  • E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)

Muistiinpanot

1. ↑ Karafet et ai. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree Arkistoitu 7. kesäkuuta 2008 at the Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
2. ↑ Yläpaleoliittisen Siperian genomi paljastaa alkuperäiskansojen kaksoissyntyperän , Nature 505, 87–91 (2. tammikuuta 2014)
3. ↑ Underhill. Ihmisen Y-kromosomin YAP-insertin afrikkalainen eikä aasialainen alkuperä // Genetic, Linguistic and Archaeological Perspectives on Human Diversity in Kaakkois-Aasia  (englanti) . - 2001. - ISBN 9810247842 .
4. ↑ 1 2 Chandrasekar et al. (2007), YAP-lisäysallekirjoitus Etelä-Aasiassa Arkistoitu 7. marraskuuta 2017 Wayback Machinessa , 1: Ann Hum Biol. 2007 syys-lokakuu;34(5):582-6.
5. ↑ ISOGG-viitesivu. . Haettu 7. heinäkuuta 2009. Arkistoitu alkuperäisestä 20. toukokuuta 2011. (määrätön)
6. ↑ D.E. YTree . Haettu 23. heinäkuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 18. elokuuta 2016. (määrätön)
7. ↑ Kivi, Linda. Matkat, esihistorialliset ihmisen laajennukset // Geenit, kulttuuri ja ihmisen evoluutio  (uuspr.) . – 2007.
8. ↑ Chuan-Chao Wang , Li Hui . Y-kromosomaalisen sukulinjan vertailu käyttäen joko evoluutio- tai genealogisia Y-STR-mutaatiomääriä , bioRxiv, julkaistu verkossa 3. toukokuuta 2014
9. ↑ Posnik GD et ai. (2016) Pistepurskeet ihmisen miehen demografiassa pääteltynä 1 244 maailmanlaajuisesta Y-kromosomisekvenssistä . Arkistoitu 28. toukokuuta 2017 osoitteessa Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 .
10. ↑ Vicente M Cabrera et ai. Mitokondriaalisen DNA:n makrohaploryhmän L3 peruslinjan kantajat muuttivat takaisin Afrikkaan Aasiasta noin 70 000 vuotta sitten Arkistoitu 14. tammikuuta 2018 Wayback Machinessa , 13. joulukuuta 2017
11. ↑ Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. Harvinainen syvälle juurtunut D0-afrikkalainen Y-kromosomaalinen haploryhmä ja sen vaikutukset nykyihmisen laajentumiseen Afrikasta  //  Genetics : Journal. - 2019 - 13. kesäkuuta. - P. genetics.302368.2019 . — ISSN 0016-6731 . - doi : 10.1534/genetics.119.302368 . — PMID 31196864 .
12. ↑ Weale et ai. (2003), Harvinaiset syvälle juurtuvat Y-kromosomilinjat ihmisissä: Lessons for Phylogeography Arkistoitu 5. toukokuuta 2009, Wayback Machine , Genetics, Voi. 165, 229-234
13. ↑ Rosa et ai. (2007), Y-kromosomien monimuotoisuus Guinea-Bissaun populaatiossa: monietninen näkökulma , BMC Evolutionary Biology osa 7: 124, doi : 10.1186/1471-2148-7-124 , < http://www.biomedcentral. com/content/pdf/1471-2148-7-124.pdf > Arkistoitu 30. toukokuuta 2009 Wayback Machinessa 
14. ↑ Shi et ai. (2008) Y-kromosomi todisteita varhaisimmasta nykyaikaisesta ihmisasunnosta Itä-Aasiassa ja useista tiibetiläisten ja japanilaisten populaatioiden alkuperästä Arkistoitu 31. maaliskuuta 2010 at the Wayback Machine , BMC Biology
15. ↑ Kharkov et ai. (2007)
16. ↑ Karafet et ai. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree Arkistoitu 7. kesäkuuta 2008 at the Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008