Haploryhmä D (Y-DNA)

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 25.10.2020 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 19 muokkausta .
Haploryhmä D
Tyyppi Y-DNA
Esiintymisaika 64,7-83 tuhatta vuotta sitten [1]
Spawn Sijainti Afrikka , Aasia [1]
Esi-isän ryhmä DE
sisarryhmät E
Alaryhmät D1, D2
Merkkimutaatiot CTS3946, CTS4030/Z1605

Haploryhmä D (CTS3946) on Y-kromosomin DNA:n haploryhmä . Sekä haploryhmä D että E sisältävät yhden nukleotidin polymorfismin M168 , joka löytyy kaikista haploryhmistä paitsi A ja B (katso ryhmä CT ), sekä YAP ainutlaatuisen tapahtumapolymorfismin , joka on ainutlaatuinen haploryhmälle DE  , joka on D:n ja E:n yhteinen esi-isä.

Alkuperä

Haploryhmä D tulee Y-kromosomin haploryhmän DE mutaatiosta , joka tapahtui miehellä, jonka oletettiin eläneen 65,2 tuhatta vuotta sitten. Kaikkien Y-kromosomin haploryhmän D elävien kantajien yhteisen esi-isän elinikä on 46,5 tuhatta vuotta sitten (päivämäärät ovat YFull-yhtiön määrittämiä SNP:t [2] ).

Chris Tyler-Smith ja kollegat uskovat, että haploryhmä D muodostui Afrikassa noin 73 tuhatta vuotta sitten. n., ja noin 71 tuhatta vuotta sitten Länsi-Afrikan linja D0 erottui [1] . Sekä haploryhmä D että haploryhmä E sisältävät ainutlaatuisen YAP-tapahtumapolymorfismin ominaisuuden , mutta niillä on yhteinen alkuperä. Haploryhmän D1-M174 alakladi syntyi suurella todennäköisyydellä Aasiassa noin 60 tuhatta vuotta sitten. Haploryhmän D1-M174 alakladia ei löydy Aasian ulkopuolelta. Haploryhmää D2 löydettiin merkityksettömästi Afrikassa ja Vähässä- Aasiassa [3] .

T. Karafetin mukaan haploryhmä D syntyi Aasiasta noin 60 tuhatta vuotta sitten [4] [5] .

Paleogenetiikka

Yleiskatsaus

Tällä hetkellä sitä tavataan usein Tiibetin , Japanin saariston [10] ja Andamaanien väestön keskuudessa , mutta tuntemattomien olosuhteiden vuoksi sitä ei ole vielä löydetty Hindustanin niemimaalta . Ainuilla Japanissa sekä Jarawa- ja Onge -kansoilla Andamaanien saarilla on lähes yksinomaan tämä haploryhmä, vaikka ainuilla on D1a2-haploryhmän (81,3 % [11] ) lisäksi myös Y-kromosomin haploryhmä C3 . noin 15 %:n taajuudella .

Y-kromosomaalista haploryhmää D löydettiin myös alhaisella tai kohtalaisella esiintymistiheydellä Keski-Aasian ja Pohjois-Itä-Aasian kansojen keskuudessa sekä Kiinan han-kiinalaisten ja miao-yao-kansojen sekä joidenkin kiinalaisten kansallisten vähemmistöjen keskuudessa. Sichuanin ja Yunnanin maakunnat , jotka puhuvat tiibeti-burman kieliä ja asuvat tiibetiläisten lähellä. Yi-kansan väestöstä tunnistettu alaryhmä D1a1a-M15 ( Liangshan Yin autonominen prefektuuri ) oli haarautuma tiibetiläisten ryhmien laajenemisesta lännestä itään tasangolla [12] .

Toisin kuin Haploryhmä C , Haploryhmä D ei siirtynyt Aasiasta Beringian kautta uuteen maailmaan .

Haploryhmä D on myös huomionarvoinen poikkeuksellisesta maantieteellisestä erilaistumisestaan, kun haploryhmän tietty alaluokka on selvästi paikantunut mihin tahansa populaatioon, jossa suurella osalla yksilöistä on haploryhmä D:

Tämä ilmeisesti muinainen haploryhmän D monipuolistaminen viittaa siihen, että sitä pitäisi pikemminkin luonnehtia "superhaploryhmäksi", "makrohaploryhmäksi".

Erityisen tyypillisiä ovat esimerkit haploryhmästä D Japanin saarten väestöstä, koska ne sisältävät vähintään viiden erillisen haploryhmälle D ominaisen mutaation kompleksin, mikä erottaa ne selvästi Tiibetin ja Andamaanien asukkaiden haploryhmästä D. . Tämä tosiasia on todiste siitä, että haploryhmä D1a2 oli Japanin saarten esihistoriallisen Jomon -kulttuurin modaalinen haploryhmä.

Alaluokat

Fylogeneettinen puu

ISOGG (versio: 14.151) [13] .

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 3 4 Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. Harvinainen syvälle juurtunut D0-afrikkalainen Y-kromosomaalinen haploryhmä ja sen vaikutukset nykyihmisen laajentumiseen Afrikasta  //  Genetics : Journal. - 2019 - 13. kesäkuuta. - P. genetics.302368.2019 . — ISSN 0016-6731 . - doi : 10.1534/genetics.119.302368 . — PMID 31196864 .
  2. ↑ DYTree . Haettu 30. maaliskuuta 2018. Arkistoitu alkuperäisestä 31. elokuuta 2019.
  3. ↑ 1 2 Estes, Roberta Jännittäviä uusia Y DNA:n haploryhmän D löytöjä!  (englanniksi) . DNAeXplained - Genetic Genealogy (21. kesäkuuta 2019). Haettu 8. heinäkuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 6. heinäkuuta 2019.
  4. ↑ Shi et ai. (2008) Y-kromosomi todisteita varhaisimmasta nykyaikaisesta ihmisasunnosta Itä-Aasiassa ja useista tiibetiläisten ja japanilaisten populaatioiden alkuperästä Arkistoitu 31. maaliskuuta 2010 at the Wayback Machine , BMC Biology
  5. ↑ Tatiana M. Karafet et ai. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Reshape of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. ↑ Hugh McColl et ai. Muinainen genomiikka paljastaa neljä esihistoriallista muuttoaaltoa Kaakkois-Aasiaan , 2018
  7. ↑ POB-162 Neoliittisten japanilaisten metsästäjä-keräilijöiden, jomon-ihmisten fenotyyppi ja fysiologia, perustuu koko ydingenomisekvenssiin // SMBE 2018 Arkistoitu 7. heinäkuuta 2018 Wayback Machinessa
  8. ↑ 1 2 Chuan-Chao Wang et al. Genomic Insights to the Formation of Human Populations in Itä-Aasia Arkistoitu 31. heinäkuuta 2021 Wayback Machinessa (lisätaulukot // Taulukko 1. Äskettäin raportoidut muinaiset yksilöt), 2021
  9. ↑ Eugenia Boulygina et ai. Pohjois-Kaukasuksen esihistoriallisen Koban-kulttuurin mitokondrioiden ja Y-kromosomien monimuotoisuus , 2020
  10. ↑ Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking ja Satoshi Horai, "Japanin kaksois alkuperä: metsästäjä-keräilijän ja maanviljelijän Y-kromosomien yhteinen perusta", Journal of Human Genetics Volume 51, numero 1 / tammikuu 2006.
  11. ↑ Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Koko Y-kromosomisekvenssien analyysi paljastaa Japanin väestöhistorian Jomon-kaudella . Arkistoitu 30. syyskuuta 2019 Wayback Machinessa , 2019
  12. ↑ Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou . Geneettinen rekonstruktio ja fylogeneettinen analyysi 193 Y-SNP:n ja 27 Y-STR:n avulla kiinalaisessa yi-etnisessä ryhmässä Arkistoitu 16. heinäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 28. huhtikuuta 2021
  13. ↑ Y-DNA:n haploryhmä D ja sen alaryhmät - 2019 . Haettu 6. syyskuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 11. lokakuuta 2019.
  14. ↑ 1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Japanilaisten kaksoisperä: metsästäjä-keräilijän ja maanviljelijän Y-kromosomien yhteinen perusta". J. Hum. Genet. 51(1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082 .
  15. ↑ DYTree . www.yfull.com _ Haettu 3. syyskuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 31. elokuuta 2019.
  16. ↑ Y-DNA:n haploryhmä D ja sen alaryhmät - 2014 . Haettu 11. syyskuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 28. toukokuuta 2017.

Kirjallisuus

Katso myös

Ihmisen Y-kromosomin haploryhmienevoluutiopuu
Y-kromosomaalinen Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
minä J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) K R  

Linkit