Integraalinen kalvoproteiini

Integraalikalvoproteiini ( IMP , IMP tai yksinkertaisesti integraaliproteiini ) on yksi kalvoproteiinityypeistä, jotka liittyvät vahvasti sytoplasmiseen kalvoon (integroitu). Ne muodostavat merkittävän osan minkä tahansa organismin genomissa koodatuista proteiineista [1] . Integraalit proteiinit voidaan upottaa kokonaan kalvoon ja joskus jopa tunkeutua sen läpi [2] . Tässä mielessä kaikki transmembraaniproteiinit ovat integraaliproteiineja, mutta kaikki integraaliset proteiinit eivät ole transmembraanisia. Integraalisten proteiinien yhteys kalvolipideihin on erittäin vahva ja sen määrää pääasiassahydrofobiset vuorovaikutukset .

Rakenne

Integraalisten proteiinien ominaisuus on, että niiden polypeptidiketjussa on melko pitkiä osia, joissa on hallitseva pitoisuus ei-polaarisia aminohappoja. Pääsääntöisesti näillä kohdilla on α-heliksikonformaatio, jonka ulkopuolella on aminohappotähteiden lateraalisia hiilivetyfragmentteja, minkä seurauksena koko heliksi kokonaisuudessaan saa hydrofobisen luonteen. α-kierteisten alueiden osuus kalvoproteiineissa on melko suuri (30-50 %), loppu polypeptidiketjusta on pääosin kierukkamaista. Yleensä β-rakenteen omaavia kohtia on vähän, mutta jos ne ovat, niin tällaisella proteiinilla on pääsääntöisesti beeta-tynnyrin muoto.

Integraalit proteiinit voidaan jakaa kahteen ryhmään:

Rakennetutkimukset

Yksi tärkeimmistä esteistä biologisten kalvojen integraalisten proteiinien rakennetutkimuksessa on niiden alhainen liukoisuus. Kalvoproteiinit ovat käytännössä liukenemattomia vesipitoisiin puskurijärjestelmiin, mikä käytännössä eliminoi proteolyyttisten entsyymien käytön perinteisessä muodossa. Sama ongelma estää niiden tarkkojen atomirakenteiden saamisen röntgendiffraktioanalyysillä : kalvoproteiinit tuskin muodostavat kiteitä. Tästä syystä homologisten proteiinien spatiaaliseen rakenteeseen perustuvaa mallintamista käytetään usein niiden tertiääristen ja kvaternaaristen rakenteiden selvittämiseen.

Toiminnot

Integraalisia kalvoproteiineja ovat kuljettajaproteiinit, linkkerit, ionikanavat, reseptorit , entsyymit , kalvoankkureiden rakenteelliset domeenit, proteiinit, jotka osallistuvat energian keräämiseen ja siirtoon, sekä proteiinit, jotka vastaavat solujen tarttumisesta [3] .

Esimerkkejä integraalisista proteiineista

Muistiinpanot

  1. ↑ Wallin E., von Heijne G. Eubakteeri-, arkea- ja eukaryoottiorganismien integraalisten kalvoproteiinien genominlaajuinen analyysi  //  Protein Science : päiväkirja. - 1998. - Voi. 7 , ei. 4 . - s. 1029-1038 . - doi : 10.1002/pro.5560070420 . — PMID 9568909 .
  2. ↑ Gusev M.V., Mineeva L.A. Mikrobiologia. - M .: Mosk.un-ta, 1985. - 376 s.
  3. ↑ Saier MH, Yen MR, Noto K., Tamang DG, Elkan C. Kuljettajan luokitustietokanta: viimeaikaiset edistysaskeleet  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. - 2009. - tammikuu ( osa 37 , nro Tietokantanumero ). - P.D274-8 . doi : 10.1093 / nar/gkn862 . — PMID 19022853 .
  Siirry Wikidata-kohteeseen  Sanakirjat ja tietosanakirjat