Interkalaatio on molekyylin tai ryhmän palautuva sisällyttäminen muiden molekyylien tai ryhmien väliin.
On olemassa useita tapoja, joilla molekyylit (tässä yhteydessä kutsutaan ligandeiksi ) voivat olla vuorovaikutuksessa DNA :n kanssa . Ligandit voivat sitoutua kovalenttisesti tai sähköstaattisesti tai interkaloitua. Interkalaatio on mahdollista, jos ligandi on sopivan kokoinen ja kemiallinen ja mahtuu DNA-emästen väliin. Tällaisilla ligandeilla on tavallisesti polysyklinen aromaattinen rakenne ja ne ovat tasomaisia. [yksi]
DNA-interkalaattoreita käytetään kemoterapiassa estämään DNA:n replikaatiota nopeasti kasvavissa syöpäsoluissa , kuten doksorubisiinissa ( adriamysiini ) ja daunorubisiinissa (molempia käytetään Hodgkinin taudin hoitoon ) ja daktinomysiiniä (käytetään nefroblastooman , Ewingin sarkooman ja rhabdomyan hoitoon ).
RNA-polymeraasin vuorovaikutusta DNA-templaatin kanssa estää kasvainten vastainen antibiootti aktinomysiini D, joka sitoutuu vierekkäisten typpipitoisten emäsparien välisiin aukkoihin, usein GC-parien väliin (interkalaatioprosessi), mikä estää entsyymin vuorovaikutuksen polydeoksiribonukleotidiketjun kanssa.
Molekyylibiologiassa interkaloivia aineita, kuten etidiumbromidia, käytetään DNA:n leimaamiseen fluoresoivasti , kuten DNA - agaroosigeelielektroforeesi . [yksi]
| kemiallinen sidos | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Molekyyliensisäinen vuorovaikutus |
| ||||||||||||
| Molekyylien välinen vuorovaikutus | |||||||||||||