Koronavirukset (alaperhe)
| Koronavirukset | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Vaikea akuuttiin hengitystieoireyhtymään liittyvä koronavirus (SARSCoV) | ||||||
| tieteellinen luokittelu | ||||||
| Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:PisuviricotaLuokka:PisoniviricetesTilaus:NidoviralesAlajärjestys:CornidovirineaePerhe:KoronaviruksetAlaperhe:Koronavirukset | ||||||
| Kansainvälinen tieteellinen nimi | ||||||
| Orthocoronavirinae | ||||||
| Synonyymit | ||||||
|
||||||
| Baltimore Group | ||||||
| IV: (+)ssRNA-virukset | ||||||
| ||||||
Koronavirukset [2] ( lat. Orthocoronavirinae ) ovat Coronaviridae [3] -heimon virusten alaheimo , joka yhdistää vaipallisia RNA:ta sisältäviä pleomorfisia [ K 1] -viruksia, jotka aiheuttavat monenlaisia eri vaikeusasteisia sairauksia eläimillä, myös ihmisillä . ] . Useimmissa tapauksissa koronavirusinfektiot ovat lieviä, mutta 2000-luvulla on esiintynyt vakavia sairauksia, jotka ovat aiheuttaneet beetakoronavirukset MERS-CoV ja SARS-CoV [4] sekä SARS-CoV-2 . Nämä ovat viruksia, joissa on (+) yksijuosteinen RNA-geeni ja kierteinen nukleokapsidi. Koronavirusten genomin koko vaihtelee noin 27-34 kiloemäksestä, joka on suurin tunnettu RNA-virus.
Genomi
Koronavirukset sisältävät yksijuosteisen sense- RNA -genomin . Niiden genomikoko vaihtelee 27 - 34 kiloemäksestä ja on yksi suurimmista RNA-viruksista. Genomissa on 5'-metyloitu korkki ja 3'-polyadenyloitu häntä. Koronaviruksen genominen organisaatio: 5'-UTR-johtosekvenssi - replikaasi / transkriptaasi - piikki (S) - kuori (E) - nukleokapsidi (N) - 3'UTR - poly(A) häntä. Avoimet lukukehykset 1a ja 1b, jotka valtaavat kaksi ensimmäistä kolmasosaa genomista, koodaavat replikaasi/transkriptaasipolyproteiinia. Replikaasi/transkriptaasipolyproteiini pilkkoutuu itsestään muodostaen ei-rakenneproteiineja (nsps). Seuraavaksi tulevat lukukehykset, jotka koodaavat neljää päärakenneproteiinia: piikki, vaippa, kalvo ja nukleokapsidi. Näiden kehysten välissä ovat lisäproteiinien lukukehykset. Apuproteiinien määrä ja toiminta ovat erilaisia eri koronaviruksilla.
Elinkaari
Alkuperä
Infektio alkaa, kun viruksen piikki (S) glykoproteiini kiinnittyy komplementaariseen isäntäsolureseptoriinsa. Kiinnittymisen jälkeen isäntäsolun proteaasi pilkkoo ja aktivoi reseptoriin kiinnittyneen piikkiproteiinin. Riippuen isäntäsolun käytettävissä olevasta proteaasista, pilkkominen ja aktivaatio mahdollistavat solun pääsyn sisälle endosytoosin tai viruksen vaipan suoran fuusion kautta isäntäkalvon kanssa. Tunkeutuessaan isäntäsoluun viruspartikkelilla ei ole päällystettä ja sen genomi pääsee solun sytoplasmaan. Koronaviruksen RNA-genomissa on 5'-metyloitu kansi ja 3'-polyadenyloitu häntä, mikä mahdollistaa RNA:n kiinnittymisen isäntäsolun ribosomiin translaatiota varten. Isäntäribosomi kääntää viruksen genomin alkuperäisen päällekkäisen avoimen lukukehyksen ja muodostaa pitkän polyproteiinin. Polyproteiinilla on omat proteaasinsa, jotka pilkkovat polyproteiinin moniksi ei-rakenneproteiineiksi.
Luokitus
Vuoteen 2009 asti alaheimon edustajat yhdistettiin Coronavirus -sukuun [5] , mutta vuonna 2009 koronavirusten taksonomiaa uudistettiin: Coronavirus jaettiin 3 sukuun ( Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Gammacoronavirus ), jotka yhdistyivät alaheimoon Coronavirinae [6] .
Kansainvälinen virustaksonomiakomitea (ICTV) tunnistaa huhtikuussa 2020 4 sukua alaheimosta [7] :
- Alphacoronavirus -suku (14 alasukua ja 19 lajia)
- Suku Betacoronavirus (5 alasukua ja 14 lajia)
- Gammacoronavirus -suku (3 alasukua ja 5 lajia)
- Suku Deltacoronavirus (3 alasukua ja 7 lajia)
Muistiinpanot
Kommentit- ↑ Pleomorfiset virukset ovat viruksia, jotka vaihtelevat muodoltaan ja kooltaan.
- ↑ Virusten taksonomia Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
- ↑ Koronavirukset / Gorbalenya A.E. // Kongo - Kaste. - M .: Great Russian Encyclopedia, 2010. - S. 352. - ( Great Russian Encyclopedia : [35 osassa] / päätoimittaja Yu. S. Osipov ; 2004-2017, v. 15). - ISBN 978-5-85270-346-0 .
- ↑ Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Koronavirusten (Nidovirales: Coronaviridae) tutkimushistoria ja nykyaikainen luokittelu // Infektio ja immuniteetti : tieteellinen artikkeli. - 2020. - T. 10 , nro 2 . - S. 221-246 . Arkistoitu alkuperäisestä 25.6.2020.
- ↑ 1 2 Zumla A., Chan JFW, Azhar EI, Hui DSC, Yuen K.-Y. Koronavirukset - lääkkeiden löytäminen ja hoitovaihtoehdot (englanniksi) // Nature Reviews Drug Discovery . - 2016. - Vol. 15 . - s. 327-347 . - doi : 10.1038/nrd.2015.37 .
- ↑ ICTV Taxonomy History for Coronavirus Arkistoitu 9. elokuuta 2016 Wayback Machinessa ICTV:n verkkosivustolla ( Käytetty 19. heinäkuuta 2019) .
- ↑ Coronaviridae-heimon versio : [ fin. ] // ICTV. — Annettu koodi(t): 2008.085-126V. - 2008. - s. 3-6. – klo 37
- ↑ Virusten taksonomia Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla . (Käytetty: 25. toukokuuta 2020) .