Yleiset transkriptiotekijät [1] ( eng. yleiset transkriptiotekijät, GTF:t, basaaliset transkriptiotekijät ) - luokka proteiinien transkriptiotekijöitä, jotka auttavat eukaryoottisen RNA-polymeraasi II :n sijoittamisessa oikein promoottoriin ja edistävät myös kahden DNA-juosteen erottamista sallia transkription alkaa tästä kohdasta ja edistää RNA-polymeraasin vapautumista promoottorista siirtymisen aikana transkription aloituksesta transkription elongaatioon. Nimi "yleinen" johtuu siitä, että niitä tarvitaan lähes kaikkien RNA-polymeraasi II:n käyttämien promoottorien toimintaan. Lisäksi GTF:t ovat vuorovaikutuksessa -välittäjän kanssa , joka on yksi transkriptiolaitteiston avainelementeistä, joka tarvitaan aktivaattoriproteiinien ja GTF:ien oikeaan vuorovaikutukseen RNA-polymeraasi II:n kanssa [2] . Yleisiä transkriptiotekijöitä kutsutaan nimellä TFII (englanniksi - transkriptiotekijä RNA polymeraasi II) [1] . GTF:itä ovat TFIIA , TFIIB , TFIID , TFIIE , TFIIG , TFIIH [3] [4] .
Eukaryoottiset GTF:t suorittavat samanlaisia toimintoja kuin bakteerien σ-tekijä , lisäksi TFIIH:n osilla on sama kolmiulotteinen rakenne kuin vastaavilla σ-tekijän osilla [5] .
Yleiset tekijät kootaan RNA-polymeraasi II -promoottoriin preiniitiaatiokompleksiksi ( transkription aloituskompleksi ) seuraavasti . RNA-polymeraasi II -promoottorilla on yleensä erityinen sekvenssi, nimeltään TATA-laatikko , joka sijaitsee 25 nukleotidin päässä transkription aloituskohdasta. TFIID-tekijä tunnistaa ja sitoo TATA-laatikon TBP -alayksikkönsä kautta , minkä jälkeen TFIIB sitoutuu sen vieressä olevaan DNA:han. TFIID vääristää voimakkaasti DNA:n kolmiulotteista rakennetta TATA-laatikkoalueella, ja tämä vääristymä todennäköisesti toimii mekaanisena referenssinä aktiivisen promoottorin sijainnin määrittämisessä. Sen jälkeen jäljellä olevat yhteiset transkriptiotekijät ja itse RNA-polymeraasi II kiinnittyvät promoottoriin muodostaen täysimittaisen transkription aloituskompleksin. Seuraavaksi TFIIH katkaisee ATP:tä käyttäen kaksi DNA-juostetta transkription aloituspisteessä paljastaen samalla templaattijuosteen ulkopuolelle. Se sisältää myös proteiinikinaasiaktiivisuutta omaavan alayksikön, joka fosforyloi RNA-polymeraasi II:ta, jolloin sen konformaatio muuttuu niin, että se vapautuu GTF:istä ja etenee elongaatioon. RNA-polymeraasi II:n fosforylaatio suoritetaan C-terminaalisessa domeenissa, joka koostuu 52 tandem 7 - aminohappotoistosta ; 5. seriinitähde fosforyloituu jokaisessa toistossa. Kun RNA-polymeraasi II on erotettu DNA:sta, myös transkriptiotekijät erotetaan DNA:sta [6] .
Yllä oleva sitoutumissekvenssi havaitaan in vitro -olosuhteissa ; in vivo , yleisten transkriptiotekijöiden kokoamisjärjestys promoottorissa voi vaihdella geenistä toiseen [6] .
Alla olevassa taulukossa on lueteltu yleisten transkriptiotekijöiden toiminnot.
Nimi | Alayksiköiden lukumäärä |
Toiminnot [7] |
---|---|---|
TFIID TBP-alayksikkö TAF-alayksikkö |
1 ~ 11 |
Tunnistaa TATA-laatikon Tunnistaa muut DNA-sekvenssit transkription aloituskohdan ympärillä, säätelee DNA:n sitoutumista TBP:llä |
TFIIA | 2 [8] [9] | On vuorovaikutuksessa TBP TFIID -alayksikön kanssa ja osallistuu TBP:n sitoutumiseen TATA-laatikkoon [10] |
TFIIB | yksi | Tunnistaa BRE -elementin promoottorissa, suuntaa tarkasti RNA-polymeraasi II:n transkription aloituspisteessä |
TFIIF | 3 | Stabiloi RNA-polymeraasin vuorovaikutusta TBP:n ja TFIIB:n kanssa, edistää sitoutumista TFIIE:hen ja TFIIH:hen |
TFIIE | 2 | Rekrytoi ja säätelee TFIIH:tä |
TFIIH | 9 | Purkaa DNA:ta transkription aloituskohdasta, fosforyloi RNA-polymeraasi II:n ja vapauttaa sen promoottorista |