Hammerhead ribotsyymi

Hammerhead ribotsyymit  ovat pieniä itsestään leikkaavia RNA:ita , joilla on konservoitunut sekvenssi ja joita löytyy joistakin viroideista ja jotka liittyvät joidenkin kasvivirusten satelliitti-RNA: ihin . [2]

Hammerhead- ribotsyymit löydettiin ensin kasviviroideista ; tällaiset ribotsyymit katalysoivat sekvenssispesifistä fosfodiesterisidosten katkaisua RNA-molekyyleissä niiden spesifisen tertiaarisen rakenteensa vuoksi . [3] [4] Toissijainen rakenne muistuttaa vasaran päätä .  vasarapää .

Itsekopiointi

Tämä ribotsyymi pystyy replikoitumaan itsestään. Replikointi tapahtuu kuin vierivä pyörä [5] . RNA on lovettu vierivän renkaan alkupisteeseen. Vapaat deoksinukleotidit alkavat kiinnittyä tämän ketjun vapautuneeseen 3'-päähän. Kun tytär-RNA-juoste pitenee, 5'-pää siirtyy pois emorenkaasta. Kun 3'- ja 5'-päät kohtaavat samassa kohdassa, RNA-synteesi pysähtyy ja tytärrengas erottuu emorenkaasta.

Linkit

• Hammerheadin ribotsyymin toissijainen rakenne . Virtuaalilaboratorio Wiki . - (Kuvat). Haettu: 15.10.2009. Arkistoitu alkuperäisestä 19. maaliskuuta 2012. (Venäjän kieli)

• Energian arvioinnin merkityksettömyydestä RNA-mallinnuksessa - Wikiversityn tutkimus tertiaarisen rakenteen mallintamisesta vasaranpään ribotsyymin avulla esimerkkinä

• Chrysanthemum kloroottisen mottle viroidiorganismin viroidiribotsyymin tertiäärinen rakenne , ennustettu käyttämällä YouTuben RNAInSpace - ohjelmistoa Borisov, S.S. Jakovlev. Peliteorian soveltaminen ribonukleiinihapon taittumisen ongelmaan . (Venäjän kieli)

• Organismin Chrysanthemum chlorotic mottle viroidin viroidiribotsyymin laskostumisen mallirata, ennustettu käyttämällä YouTuben RNAInSpace - ohjelmistoa Borisov, S.S. Jakovlev. Peliteorian soveltaminen ribonukleiinihapon taittumisen ongelmaan . (Venäjän kieli)

Katso myös

• Ribotsyymi, joka sisältää hiusneulan
• Replikoinnin aloituspiste
• Jatkoliitos

Muistiinpanot

1. ↑ Martick M., Scott WG Tertiaariset kontaktit, jotka ovat kaukana aktiivisesta kohdasta, muodostavat ribotsyymin katalyysiä varten  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2006. - Voi. 126 , nro. 2 . - s. 309-320 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.06.036 . — PMID 16859740 .
2. ↑ Forster AC, Symons RH Virusoidin plus- ja miinus-RNA:iden itsekatkaisu ja aktiivisten kohtien rakennemalli  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1987. - Voi. 49 , ei. 2 . - s. 211-220 .
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G. Dimeric Plant Virus Satellite RNA  :n autolytic Processing //  Science : Journal. - 1986. - Voi. 231 , nro. 4745 . - s. 1577-1580 . - doi : 10.1126/tiede.231.4745.1577 .
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH Avocado sunblotch -viroidin plus- ja miinus-RNA-transkriptien itsekatkaisu  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. - 1986. - Voi. 14 , ei. 9 . - P. 3627-3640 .
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroidit vasarapääribotsyymeillä: joitakin ainutlaatuisia rakenteellisia ja toiminnallisia näkökohtia suhteessa muihin ryhmän jäseniin  // Biol. Chem.. - 1999. - T. 380 , nro 7-8 . - S. 849-854 .