Tertiäärinen rakenne (tai kolmiulotteinen rakenne [1] ) on koko proteiinimolekyylin tai muun yhdestä ketjusta koostuvan makromolekyylin avaruudellinen rakenne (mukaan lukien konformaatio ) [2] [3] .
Proteiinin tertiäärinen rakenne on tapa, jolla polypeptidiketju laskostuu avaruudessa. Tertiäärisen rakenteen muodon mukaan proteiinit jaetaan pääasiassa pallomaisiin ja säikeisiin. Globulaarisilla proteiineilla on useimmiten elliptinen muoto, ja fibrillaariset (säikeiset) proteiinit ovat pitkänomaisia (sauvan, karan muoto).
Proteiinien tertiaarisen rakenteen konfiguraatio ei kuitenkaan vielä anna aihetta olettaa, että fibrillaarisilla proteiineilla on vain β-rakenne ja globulaarisilla α-kierteisillä. On fibrillaarisia proteiineja, joilla on kierteinen eikä kerroksittain laskostunut sekundaarinen rakenne. Esimerkiksi α-keratiini ja paramyosiini (nilviäisten sulkulihaksen proteiini), tropomyosiinit (luurankolihasproteiinit) ovat säikeisiä proteiineja (on sauvan muotoinen muoto) ja niiden toissijainen rakenne on a-heliksi; päinvastoin, pallomaiset proteiinit voivat sisältää suuren määrän β-rakenteita.
Lineaarisen polypeptidiketjun spiralisointi pienentää sen kokoa noin 4 kertaa; ja pakkaaminen tertiääriseen rakenteeseen tekee siitä kymmeniä kertoja kompaktimman kuin alkuperäinen ketju.
Kolmannen tason rakenne määräytyy suurelta osin primäärirakenteen mukaan . Pyrkimys ennustaa proteiinin tertiääristä rakennetta sen primäärirakenteen perusteella tunnetaan proteiinirakenteen ennustusongelmana . Ympäristö, jossa proteiini laskostuu, vaikuttaa merkittävästi sen lopulliseen muotoon, mutta sitä ei yleensä oteta suoraan huomioon nykyisissä ennustemenetelmissä. Useimmat näistä menetelmistä perustuvat vertailuihin jo tunnettuihin rakenteisiin ja ottavat siten ympäristön vaikutuksen epäsuorasti huomioon.
Proteiinin tertiaarisen rakenteen stabilointiin osallistuvat:
Monilla nukleiinihappomolekyylillä on myös tertiäärinen rakenne ; erityisesti tRNA - molekyyleillä on universaali tertiäärinen rakenne [4] .