Välikappale (biologia)

Välikkeet ( englanniksi  spacer  - "separator") ovat ei-koodaavan DNA :n osia, jotka sijaitsevat tandemly toistuvien geenien välissä , esimerkiksi ribosomaalisten RNA -geenien [1] välissä eukaryooteissa . Niiden toiminta todennäköisimmin tarjoaa korkean tason transkription tarkkuuden sukulaisissa geeneissä.

Bakteereissa DNA :n välikappaleet koostuvat vain muutamasta nukleotidistä . Eukaryooteissa ne voivat olla paljon suurempia ja sisältää toistuvia DNA-sekvenssejä , mikä sulkee sisäänsä suurimman osan genomisesta DNA:sta.

Ribosomaalisessa DNA:ssa välikappaleita on sekä geeniklustereissa että niiden välillä, ja niitä kutsutaan vastaavasti sisäisiksi välikkeiksi (ITS) ja ulkoisiksi välikkeiksi (ETS). Eläimillä mitokondrioiden DNA-geeneillä on yleensä hyvin lyhyet välikappaleet. Sienissä mitokondrioiden DNA-välikappaleet ovat pituudeltaan vaihtelevia ja voivat olla liikkuvia [2] . Koska välikappaleiden nukleotidisekvenssit muuttuvat evoluution aikana paljon nopeammin kuin geenisekvenssit, uskotaan, että välikkeen toiminta ei riipu sen mononukleotidien sekvenssistä [3] .

Suppeammassa merkityksessä termiä "spacer" käytetään viittaamaan DNA:n jakamiseen rRNA-geenien tandemkopioiden välillä.

Muistiinpanot

1. ↑ Lackie, JM, toim. (2007), The Dictionary of Cell & Molecular Biology (4. painos), Burlington, MA: Academic Press, s. 394
2. ↑ Rédei, G. P. (2008), Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics (3. painos), Springer, s. 1848
3. ↑ Sudbery, P. (2002), Human Molecular Genetics (2. painos), Pearson Education, pp. 35-36