Sinkkisormi ja BTB-domeeni, joka sisältää proteiinia 16

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 17.11.2021 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 2 muokkausta .
Sinkkisormi ja BTB-domeeni, jotka sisältävät 16

ATE :tä edustaa esimerkki 1buo.
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliZBTB16  ; P.L.Z.; ZNF145
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  176797 MGI :  103222 Homologeeni :  21214 GeneCards : ZBTB16 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez7704235320
YhtyeENSG00000109906ENSMUSG00000066687
UniProtQ05516A3KMN0
RefSeq (mRNA)NM_001018011NM_001033324
RefSeq (proteiini)NP_001018011NP_001028496
Locus (UCSC)Chr 11:
113,93 – 114,12 Mb
Chr 9:
48,65 – 48,84 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Proteiini 16, joka sisältää sinkkisormen ja BTB-domeenin  , on proteiini , jota ZBTB16 -geeni koodaa ihmisissä .

Toiminto

Tämä geeni on C2H2 sinkkisormen kruppel -proteiiniperheen jäsen ja koodaa sinkkisormen transkriptiotekijää , joka sisältää yhdeksän sinkkisormen kruppel ( saksa:  Krueppel ) domeenia C-päässä. Tämä proteiini löytyy tumasta, osallistuu solusyklin etenemiseen ja on vuorovaikutuksessa histonideasetylaasin kanssa . Erityisiä tapauksia poikkeavista geenien uudelleenjärjestelyistä tässä lokuksessa on liitetty akuuttiin promyelosyyttiseen leukemiaan [1] ja fysiologiset toiminnot on tunnistettu hiirillä luonnollisiksi tappaja-T-soluiksi [2] [3] ja gamma-delta-T-soluiksi. [4] On olemassa vaihtoehtoisia transkription silmukointivariantteja , joita on karakterisoitu ihmisillä. [5] [6]

Vuorovaikutuksia

Proteiinin 16, joka sisältää sinkkisormen ja BTB-domeenin, on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien rakenteiden kanssa:

Muistiinpanot

  1. Chen Z., Brand NJ, Chen A., Chen SJ, Tong JH, Wang ZY, Waxman S., Zelent A. Uuden Krüppel-kaltaisen sinkkisormigeenin ja retinoiinihapporeseptori-alfa-lokuksen välinen fuusio muunnelman vuoksi t(11;17) translokaatio, joka liittyy akuuttiin promyelosyyttiseen leukemiaan  (englanniksi)  // The EMBO Journal : päiväkirja. - 1993. - Voi. 12 , ei. 3 . - s. 1161-1167 . — PMID 8384553 .
  2. Kovalovsky D., Uche OU, Eladad S., Hobbs RM, Yi W., Alonzo E., Chua K., Eidson M., Kim HJ, Im JS, Pandolfi PP, Sant'Angelo DB The BTB-sinc finger transkription säätelijä, PLZF, ohjaa iNKT-solujen efektoritoimintojen kehitystä  (englanniksi)  // Nature Immunology  : Journal. - 2008. - Voi. 9 , ei. 9 . - s. 1055-1064 . - doi : 10.1038/ni.1641 . — PMID 18660811 .
  3. Savage AK, Constantinides MG, Han J., Picard D., Martin E., Li B., Lantz O., Bendelac A. Transkriptiotekijä PLZF (Zbtb16) ohjaa NKT-solulinjan efektoriohjelmaa  //  Immunity: päiväkirja. - Cell Press , 2008. - Voi. 29 , ei. 3 . - s. 391-403 . - doi : 10.1016/j.immuni.2008.07.011 . — PMID 18703361 .
  4. Kreslavsky T., Savage AK, Hobbs R., Gounari F., Bronson R., Pereira P., Pandolfi PP, Bendelac A., von Boehmer H. TCR-indusoituva PLZF-transkriptiotekijä, joka tarvitaan γδ:n osajoukon synnynnäiseen fenotyyppiin T-solut, joilla on rajoitettu TCR-monimuotoisuus  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 2009. - Vol. 106 , nro. 30 . - P. 12453-12458 . - doi : 10.1073/pnas.0903895106 . — PMID 19617548 .
  5. Zhang T., Xiong H., Kan LX, Zhang CK, Jiao XF, Fu G., Zhang QH, Lu L., Tong JH, Gu BW, Yu M., Liu JX, Licht J., Waxman S., Zelent A., Chen E., Chen SJ Promyelosyyttisen leukemian sinkkisormigeenin genominen sekvenssi, rakenneorganisaatio, molekyylievoluutio ja poikkeava uudelleenjärjestely  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . - 1999. - Voi. 96 , no. 20 . - P. 11422-11427 . - doi : 10.1073/pnas.96.20.11422 . — PMID 10500192 .
  6. ZBTB16 sinkkisormi ja BTB-domeeni, joka sisältää 16 . Entrez (4. lokakuuta 2009). Haettu: 10. lokakuuta 2009.
  7. Senbonmatsu T., Saito T., Landon EJ, Watanabe O., Price E., Roberts RL, Imboden H., Fitzgerald TG, Gaffney FA, ​​​​Inagami T. Uusi angiotensiini II tyypin 2 reseptorin signalointireitti: mahdollinen rooli sydämen hypertrofiassa  (englanniksi)  // EMBO J. : päiväkirja. — Voi. 22 , ei. 24 . - P. 6471-6482 . - doi : 10.1093/emboj/cdg637 . — PMID 14657020 .
  8. Dhordain P., Albagli O., Honore N., Guidez F., Lantoine D., Schmid M., The HD, Zelent A., Koken MH Kolokalisaatio ja heteromerointi kahden ihmisen onkogeenin POZ/sinkkisormiproteiinin, LAZ3, välillä ( BCL6 ) ja PLZF   // Onkogeeni : päiväkirja. — Voi. 19 , ei. 54 . - P. 6240-6250 . - doi : 10.1038/sj.onc.1203976 . — PMID 11175338 .
  9. Barna M., Merghoub T., Costoya JA, Ruggero D., Branford M., Bergia A., Samori B., Pandolfi PP Plzf välittää HoxD-geenin ilmentymisen transkriptionaalista repressiota kromatiinin uudelleenmuodostuksen kautta  (Eng.)  // Dev. solu : päiväkirja. — Voi. 3 , ei. 4 . - s. 499-510 . - doi : 10.1016/s1534-5807(02)00289-7 . — PMID 12408802 .
  10. 1 2 Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP kanssa  // Blood : päiväkirja. - American Society of Hematology. — Voi. 98 , ei. 12 . - P. 3290-3300 . - doi : 10.1182/blood.v98.12.3290 . — PMID 11719366 .
  11. Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C., Ruthardt M. AML:ään liittyvä translokaatio tuotteet estävät D(3)-vitamiinin aiheuttaman erilaistumisen eristämällä D(3)-vitamiinireseptorin  //  Cancer Research : päiväkirja. — American Association for Cancer Research. — Voi. 62 , nro. 23 . - P. 7050-7058 . — PMID 12460926 .
  12. McLoughlin P., Ehler E., Carlile G., Licht JD, Schäfer BW Ainoastaan ​​LIM-proteiini DRAL/FHL2 on vuorovaikutuksessa promyelosyyttisen leukemian sinkkisormiproteiinin kanssa ja on sen ydinpressori  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 40 . - P. 37045-37053 . - doi : 10.1074/jbc.M203336200 . — PMID 12145280 .
  13. Labbaye C., Quaranta MT, Pagliuca A., Militi S., Licht JD, Testa U., Peschle C. PLZF indusoi megakaryosyyttien kehitystä, aktivoi Tpo-reseptorin ilmentymistä ja on vuorovaikutuksessa GATA1-  proteiinin kanssa //  Onkogeeni : päiväkirja. — Voi. 21 , ei. 43 . - P. 6669-6679 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205884 . — PMID 12242665 .
  14. Tsuzuki S., Enver T. GATA-2:n vuorovaikutukset promyelosyyttisen leukemian sinkkisormen (PLZF) proteiinin, sen homologin FAZF:n ja t(11;17)-generoidun PLZF-retinoiinihapporeseptorin alfa-   onkoproteiinin kanssa / Veri : päiväkirja. - American Society of Hematology. — Voi. 99 , ei. 9 . - P. 3404-3410 . - doi : 10.1182/blood.v99.9.3404 . — PMID 11964310 .
  15. 1 2 3 4 Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 välittää akuutin promyelosyyttisen leukemiaan liittyvän proteiinin transkription repressiota PLZF   // Onkogeeni _ : päiväkirja. — Voi. 23 , ei. 54 . - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .
  16. 1 2 3 David G., Alland L., Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. mSin3A:han liittyvä histonideasetylaasi välittää akuutin promyelosyyttisen leukemiaan liittyvän PLZF-  proteiinin repressiota //  Onkogeeni : päiväkirja. — Voi. 16 , ei. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
  17. 1 2 3 Wong CW, Privalsky ML SMRT-corepressorikompleksin komponenteilla on erottuva vuorovaikutus POZ-alueen onkoproteiinien PLZF, PLZF-RARalpha ja BCL-6 kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 273 , nro. 42 . - P. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .
  18. 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Luokan II histonideasetylaasit värväävät suoraan BCL6-transkription repressori  (englanti)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
  19. Nanba D., Mammoto A., Hashimoto K., Higashiyama S. ProHB-EGF:n karboksiterminaalisen fragmentin proteolyyttinen vapautuminen aiheuttaa PLZF:n ydinvientiä  //  J. Cell Biol. : päiväkirja. — Voi. 163 , no. 3 . - s. 489-502 . - doi : 10.1083/jcb.200303017 . — PMID 14597771 .
  20. Nanba D., Toki F., Higashiyama S. Varautuneiden aminohappotähteiden roolit proHB-EGF:n sytoplasmisessa domeenissa   // Biochem . Biophys. Res. commun. : päiväkirja. — Voi. 320 , no. 2 . - s. 376-382 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.05.176 . — PMID 15219838 .
  21. Takahashi S., McConnell MJ, Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick AM, Licht JD The Flt3 sisäinen tandem-kaksoismutantti estää transkription repressorien toimintaa estämällä vuorovaikutuksia   SMRT :n kanssa // Blood : päiväkirja. - American Society of Hematology. — Voi. 103 , no. 12 . - P. 4650-4658 . - doi : 10.1182/blood-2003-08-2759 . — PMID 14982881 .
  22. Hong SH, David G., Wong CW, Dejean A., Privalsky ML SMRT -korepressori on vuorovaikutuksessa PLZF:n ja akuuttiin promyelosyyttiseen leukemiaan liittyvien  PML-retinoiinihapporeseptorin alfa (RARalpha) ja  PLZF -RARalpha onkoproteiinien kanssa // National Proceedings of the National Proceedings Amerikan yhdysvaltojen tiedeakatemia  : aikakauslehti. — Voi. 94 , no. 17 . - P. 9028-9033 . - doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 . — PMID 9256429 .
  23. Koken MH, Reid A., Quignon F., Chelbi-Alix MK, Davies JM, Kabarowski JH, Zhu J., Dong S., Chen S., Chen Z., Tan CC, Licht J., Waxman S., de Thé H., Zelent A. Leukemiaan liittyvät retinoiinihapporeseptorin alfafuusiopartnerit, PML ja PLZF, heterodimeroituvat ja  kolokalisoituvat ydinkappaleisiin // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . — Voi. 94 , no. 19 . - P. 10255-10260 . - doi : 10.1073/pnas.94.19.10255 . — PMID 9294197 .
  24. Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A., ​​​​Carlile GW, Arai S., Ball HJ, Lutterbach B., Hiebert SW, Licht JD T(8;21)-assosioituneessa akuutissa myelooisessa leukemiassa häiriintynyt ETO-proteiini on corepressor promyelosyyttisen leukemian sinkkisormiproteiinille  (englanniksi)  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 20 , ei. 6 . - s. 2075-2086 . - doi : 10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000 . — PMID 10688654 .
  25. Melnick A., Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A., ​​​​Hiebert SW, Licht JD AML-1  / ETO -fuusioproteiini on hallitseva negatiivinen promyelosyyttisen leukemian sinkkisormiproteiinin transkription repression estäjä  // Blood : päiväkirja. - American Society of Hematology. — Voi. 96 , no. 12 . - s. 3939-3947 . — PMID 11090081 .
  26. Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P., Lefebvre P. PLZF on retinoiinihapporeseptorin transkriptioaktiivisuuden negatiivinen säätelijä   // Nucl . Resepti. : päiväkirja. — Voi. 1 , ei. 1 . - s. 6 . - doi : 10.1186/1478-1336-1-6 . — PMID 14521715 .
  27. Hoatlin ME, Zhi Y., Ball H., Silvey K., Melnick A., Stone S., Arai S., Hawe N., Owen G., Zelent A., Licht JD Uusi BTB/POZ-transkription repressoriproteiini on vuorovaikutuksessa Fanconin anemiaryhmän C proteiinin ja   PLZF:n kanssa // Blood : päiväkirja. - American Society of Hematology. — Voi. 94 , no. 11 . - P. 3737-3747 . — PMID 10572087 .

Kirjallisuus