SIN3A

SIN3-transkription säädinperheen jäsen A

ATE perustuu 1g1e:hen.
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliSIN3A  ; DKFZp434K2235; FLJ90319; KIAA0700
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  607776 MGI :  107157 Homologeeni :  32124 GeneCards : SIN3A-geeni
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez2594220466
YhtyeENSG00000169375ENSMUSG00000042557
UniProtQ96ST3Q60520
RefSeq (mRNA)NM_001145357NM_001110350
RefSeq (proteiini)NP_001138829NP_001103820
Locus (UCSC)Chr 15:
75,66 – 75,75 Mb		Chr 9:
57,07 – 57,13 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

SIN3A ( paired amphipathic helix protein Sin3a ) on  proteiini , jota SIN3A -geeni koodaa ihmisissä [1] [2] .

Toiminto

Tämän geenin koodaama proteiini on transkription  säätelijä . Se sisältää parillisia amfipaattisia helix- domeeneja (PAH) , jotka ovat tärkeitä proteiini-proteiini-vuorovaikutuksille ja voivat välittää Mad-Max-kompleksin aiheuttamaa repressiota [3] .

Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa

SIN3A:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

Muistiinpanot

  1. ↑ Yu F., Thiesen J., Stratling W. H. Histonideasetylaasista riippumaton transkription repressio metyyli-CpG:tä sitovalla proteiinilla 2  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2000. - Kesäkuu ( osa 28 , nro 10 ). - P. 2201-2206 . - doi : 10.1093/nar/28.10.2201 . — PMID 10773092 .
  2. ↑ Halleck MS, Pownall S., Harder KW, Duncan AM, Jirik FR, Schlegel RA Laajalle levinnyt oletettu nisäkkään transkription säätelijä, joka sisältää useita parillisia amfipaattisia heliksejä, samankaltainen kuin hiivan SIN3  // Genomics  :  Journal. - Academic Press , 1995. - Elokuu ( nide 26 , nro 2 ). - s. 403-406 . - doi : 10.1016/0888-7543(95)80229-F . — PMID 7601471 .
  3. ↑ Entrez-geeni: SIN3A SIN3-homologi A, transkription säätelijä (hiiva) .
  4. ↑ Youn HD, Liu JO Cabin1 tukahduttaa MEF2-riippuvaisen Nur77:n ilmentymisen ja T-soluapoptoosin säätelemällä histonideasetylaasien ja asetylaasien assosiaatiota MEF2  :n kanssa //  Immunity : Journal. - Cell Press , 2000. - Voi. 13 , ei. 1 . - s. 85-94 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)00010-8 . — PMID 10933397 .
  5. ↑ 1 2 Swanson KA, Knoepfler PS, Huang K., Kang RS, Cowley SM, Laherty CD, Eisenman RN, Radhakrishnan I. HBP1- ja Mad1-repressorit sitovat Sin3-ydinpressorin PAH2-domeenin vastakkaisilla helikaalisilla orientaatioilla  (englanniksi)  // Nat. Rakenne. Mol. Biol.  : päiväkirja. - 2004. - Voi. 11 , ei. 8 . - s. 738-746 . doi : 10.1038 / nsmb798 . — PMID 15235594 .
  6. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Luteinisoivan hormonin reseptorigeenin transkription kaksoismekanismit tuman orporeseptoreiden ja histonideasetylaasikompleksien säätelyssä  (englanniksi)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 85 , no. 2-5 . - s. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  7. ↑ Yao YL, Yang WM Metastaasiin liittyvät proteiinit 1 ja 2 muodostavat erilliset proteiinikompleksit histonideasetylaasiaktiivisuuden kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2003. - Voi. 278 , nro. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  8. ↑ 1 2 3 4 5 Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Kolmen uuden mSin3A-corepressorikompleksin komponentin tunnistaminen ja karakterisointi   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 23 , ei. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  9. ↑ 1 2 Yang L., Mei Q., ​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA ERG (ets-liittyvä geeni) -assosioitunut histonimetyylitransferaasi on vuorovaikutuksessa histonideasetylaasien 1/2 ja transkription rinnakkaisrepressorien kanssa mSin3A/B   // Biochem . J. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 369 , no. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  10. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL. Kolme proteiinia määrittelee luokan ihmisen histonideasetylaasit, jotka liittyvät hiivan Hda1p:hen  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . - 1999. - Voi. 96 , no. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  11. ↑ Zhang J., Kalkum M., Chait BT, Roeder RG N-CoR-HDAC3-ydinreseptoricorepressorikompleksi estää JNK-reitin integraalisen alayksikön GPS2 kautta   // Mol . solu : päiväkirja. - 2002. - Voi. 9 , ei. 3 . - s. 611-623 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . — PMID 11931768 .
  12. ↑ Sinä A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL. CoREST on olennainen osa CoREST-ihmisen histonideasetylaasikompleksia  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . - 2001. - Voi. 98 , ei. 4 . - s. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  13. ↑ 1 2 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. NuRD-alayksiköiden analyysi paljastaa histonideasetylaasiydinkompleksin ja yhteyden  DNA :n metylaatioon  // Gene Dev.  : päiväkirja. - 1999. - Voi. 13 , ei. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  14. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Ihmisen luteinisoivan hormonin reseptorigeenin transkription vaimentaminen histonideasetylaasi-mSin3A-kompleksilla  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2002. - Voi. 277 , no. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  15. ↑ 1 2 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL . Kromatiinin deasetylaatio ATP-riippuvaisella nukleosomien uudelleenmuotoilukompleksilla  //  Nature : Journal. - 1998. - Voi. 395 , no. 6705 . - s. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  16. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Histonideasetylaasiaktiivisuuden rooli HDAC1-välitteisessä transkription repressiossa  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : päiväkirja. - 1998. - Voi. 95 , ei. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  17. ↑ Yasui D., Miyano M., Cai S., Varga-Weisz P., Kohwi-Shigematsu T. SATB1 kohdistuu kromatiinin uudelleenmuodostukseen säätelemään geenejä pitkien etäisyyksien päässä  //  Nature : Journal. - 2002. - Voi. 419 , no. 6907 . - s. 641-645 . - doi : 10.1038/luonto01084 . — PMID 12374985 .
  18. ↑ 1 2 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Ydinreseptorikorepressorit kumppanina luokan II histonideasetylaasien kanssa Sin3-riippumattomassa tukahduttamisreitissä  (eng.)  // Genes Dev.  : päiväkirja. - 2000. - Voi. 14 , ei. 1 . - s. 45-54 . — PMID 10640275 .
  19. ↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Sin3-histoni-deasetylaasikompleksin rooli tuumorisuppressoriehdokkaiden p33(ING1) kasvun säätelyssä  ( engl. .. )  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 22 , ei. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  20. ↑ 1 2 Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros-CtIP-vuorovaikutukset eivät vaadi C-terminaalista sitoutumisproteiinia ja ne osallistuvat deasetylaasiriippumattomaan repressiotapaan  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2002. - Voi. 277 , no. 26 . - P. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  21. ↑ Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. Histoni deasetylaasi 9 -geeni koodaa useita proteiini-isoformeja  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2003. - Voi. 278 , nro. 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
  22. ↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Ehdokas X-kytketty henkinen kehitysvammaisuusgeeni on komponentti uudessa histonideasetylaasipitoisten kompleksien perheessä  (englanniksi)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2003. - Voi. 278 , nro. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  23. ↑ Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN mSin3-corepressoriin liittyvät histonideasetylaasit välittävät hullua transkription repressiota  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1997. - Voi. 89 , ei. 3 . - s. 349-356 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  24. ↑ Yokoyama A., Wang Z., Wysocka J., Sanyal M., Aufiero DJ, Kitabayashi I., Herr W., Cleary ML Leukemian proto-onkoproteiini MLL muodostaa SET1:n kaltaisen histonimetyylitransferaasikompleksin meniinin kanssa estääkseen Hox-geenin ilmentymisen  (englanniksi)  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 24 , ei. 13 . - P. 5639-5649 . - doi : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004 . — PMID 15199122 .
  25. ↑ Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Ihmisen Sin3-deasetylaasi ja tritoraksiin liittyvä Set1/Ash2-histoni H3-K4-metyylitransferaasi kytketään yhteen selektiivisesti solujen lisääntymistekijän HCF-   1 // Genes Dev.  : päiväkirja. - 2003. - Voi. 17 , ei. 7 . - s. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  26. ↑ Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Ikaroksen ja Aiolosin repressio välittyy histonideasetylaasikompleksien kautta  // EMBO  J. : päiväkirja. - 1999. - Voi. 18 , ei. 11 . - s. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  27. ↑ Koipally J., Georgopoulos K. Ikaroksen repressiopiirin molekyylidissektio  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2002. - Voi. 277 , no. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  28. ↑ Zhang JS, Moncrieffe MC, Kaczynski J., Ellenrieder V., Prendergast FG, Urrutia R. Konservoitunut alfakierteinen motiivi välittää Sp1:n kaltaisten transkription repressorien vuorovaikutusta corepressorin mSin3A kanssa   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 21 , ei. 15 . - P. 5041-5049 . - doi : 10.1128/MCB.21.15.5041-5049.2001 . — PMID 11438660 .
  29. ↑ Ellenrieder V., Zhang JS, Kaczynski J., Urrutia R. Signalointi häiritsee mSin3A:n sitoutumista TIEG2:n, Sp1:n kaltaisen repressorin, Mad1:n kaltaiseen Sin3-vuorovaikutukseen liittyvään domeeniin  // EMBO  J. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 21 , ei. 10 . - P. 2451-2460 . - doi : 10.1093/emboj/21.10.2451 . — PMID 12006497 .
  30. ↑ Meroni G., Reymond A., Alcalay M., Borsani G., Tanigami A., Tonlorenzi R., Lo Nigro C., Messali S., Zollo M., Ledbetter DH, Brent R., Ballabio A., Carrozzo R. Rox, uusi lepotilassa olevissa soluissa ilmentyvä bHLHZip-proteiini, joka heterodimeroituu Maxin kanssa, sitoo ei-kanonisen E-laatikon ja toimii transkription repressorina  // EMBO  J. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 16 , ei. 10 . - P. 2892-2906 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2892 . — PMID 9184233 .
  31. ↑ Brubaker K., Cowley SM, Huang K., Loo L., Yochum GS, Ayer DE, Eisenman RN, Radhakrishnan I. Mad-Sin3-kompleksin vuorovaikutteisten domeenien ratkaisurakenne: vaikutukset kromatiinia modifioivan kompleksin värväämiseen  (englanniksi)  // Solu  : päiväkirja. - Cell Press , 2000. - Voi. 103 , no. 4 . - s. 655-665 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)00168-9 . — PMID 11106735 .
  32. ↑ Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN Mad-Max-transkription repressiota välittää ternäärinen kompleksin muodostuminen hiivarepressorin Sin3 nisäkäshomologien kanssa  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1995. - Voi. 80 , ei. 5 . - s. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
  33. ↑ Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. MBD2b :n minimaalinen repressiodomeeni on päällekkäinen metyyli-CpG:tä sitovan domeenin kanssa ja sitoutuu suoraan Sin3A:han  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2000. - Voi. 275 , nro. 45 . - P. 34963-34967 . - doi : 10.1074/jbc.M005929200 . — PMID 10950960 .
  34. ↑ Li J., Wang J., Wang J., Nawaz Z., Liu JM, Qin J., Wong J. Molemmat ydinpressoriproteiinit SMRT ja N-CoR esiintyvät suurissa proteiinikomplekseissa, jotka sisältävät HDAC3:a  //  EMBO J. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 19 , ei. 16 . - P. 4342-4350 . - doi : 10.1093/emboj/19.16.4342 . — PMID 10944117 .
  35. ↑ Yang X., Zhang F., Kudlow JE O-GlcNAc-transferaasin rekrytointi promoottoriin mSin3A-corepressorilla: proteiinin O-GlcNAcylation kytkeminen transkription repressioon  // Solu  :  Journal. - Cell Press , 2002. - Voi. 110 , ei. 1 . - s. 69-80 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)00810-3 . — PMID 12150998 .
  36. ↑ 1 2 Yochum GS, Ayer DE Pf1, uusi PHD sinkkisormiproteiini, joka yhdistää TLE-korepressorin mSin3A-histonideasetylaasikompleksiin   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 21 , ei. 13 . - P. 4110-4118 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
  37. ↑ Khan MM, Nomura T., Kim H., Kaul SC, Wadhwa R., Shinagawa T., Ichikawa-Iwata E., Zhong S., Pandolfi PP, Ishii S. PML:n ja PML-RARalfan rooli hullun välittämässä transkriptionaalinen repressio  (englanniksi)  // Mol. solu : päiväkirja. - 2001. - Voi. 7 , ei. 6 . - s. 1233-1243 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00257-X . — PMID 11430826 .
  38. ↑ Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Histonin deasetylaasiaktiivisuutta tarvitaan täydelliseen transkription repressioon mSin3A  :lla // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1997. - Voi. 89 , ei. 3 . - s. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  39. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, uusi proteiini, joka säilyy ihmisen ja hiivan välillä, on histonideasetylaasin komponentti kompleksi  (englanniksi)  // Mol. solu : päiväkirja. - 1998. - Voi. 1 , ei. 7 . - s. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  40. ↑ Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN SAP30, osa mSin3-corepressorikompleksia N-CoR-välitteinen repressio spesifisillä transkriptiotekijöillä   // Mol . solu : päiväkirja. - 1998. - Voi. 2 , ei. 1 . - s. 33-42 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
  41. ↑ 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE MSin3A:ta sisältävien Brg1- ja hBrm-kromatiiniremodeling-kompleksien puhdistus ja karakterisointi  // Genes Dev  .  : päiväkirja. - 2001. - Voi. 15 , ei. 5 . - s. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
  42. ↑ Alland L., David G., Shen-Li H., Potes J., Muhle R., Lee HC, Hou H., Chen K., DePinho RA Nisäkkään Sds3:n tunnistaminen Sin3/histoni-deasetylaasin kiinteänä komponenttina corepressor complex  (englanniksi)  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 22 , ei. 8 . - P. 2743-2750 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
  43. ↑ Huang S., Brandt SJ mSin3A säätelee hiiren erytroleukemiasolujen erilaistumista yhdistymällä TAL1- (tai SCL) transkriptiotekijään  //  Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 20 , ei. 6 . - P. 2248-2259 . - doi : 10.1128/MCB.20.6.2248-2259.2000 . — PMID 10688671 .
  44. ↑ David G., Alland L., Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. mSin3A:han liittyvä histonideasetylaasi välittää akuutin promyelosyyttisen leukemiaan liittyvän PLZF-  proteiinin repressiota //  Onkogeeni : päiväkirja. - 1998. - Voi. 16 , ei. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
  45. ↑ Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP Akuutti promyelosyyttiseen leukemiaan liittyvä proteiini, promyelosyyttileukemia sinkkisormi, säätelee 1,25-dihydroksi-D(3)-indusoitua monosyyttisen erilaistumisen kautta U937-soluja fyysinen vuorovaikutus D(3)-vitamiinireseptorin  kanssa  // Veri : päiväkirja. - American Society of Hematology, 2001. - Voi. 98 , ei. 12 . - P. 3290-3300 . - doi : 10.1182/veri.V98.12.3290 . — PMID 11719366 .
  46. ↑ Wong CW, Privalsky ML SMRT-corepressorikompleksin komponenteilla on erottuva vuorovaikutus POZ-alueen onkoproteiinien PLZF, PLZF-RARalpha ja BCL-6 kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 1998. - Voi. 273 , nro. 42 . - P. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .

Kirjallisuus