IKZF1

Sinkkisormi 1 (Ikaros) IKAROS-perheestä
Tunnisteet
SymboliIKZF1  ; Hs.54452; IK1; IKAROS; LYF1; LyF-1; PPP1R92; PRO0758; ZNFN1A1
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  603023 MGI :  1342540 Homologeeni :  55948 GeneCards : IKZF1 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez1032022778
YhtyeENSG00000185811ENSMUSG00000018654
UniProtQ13422Q03267
RefSeq (mRNA)NM_001220765NM_001025597
RefSeq (proteiini)NP_001207694NP_001020768
Locus (UCSC)Chr 7:
50,34 – 50,47 Mb		Chr 11:
11,69 – 11,77 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

DNA:ta sitova proteiini Ikaros , joka tunnetaan myös nimellä Ikaros- perheen sinkkisormiproteiini 1 ( eng.  DNA-binding protein Ikaros, Ikaros family zinc finger protein 1, IKZF1 ), on proteiini , jota ihmisissä koodaa IKZF1 -geeni [1] [2 ] [3] .

Toiminnot

Ikaros suorittaa tärkeitä tehtäviä hematopoieettisessa järjestelmässä, ja sen toimintojen menettäminen liittyy lymfoidisen leukemian kehittymiseen [4] . Erityisesti viime vuosina on osoitettu, että Ikaros on yksi tärkeimmistä kasvainsuppressoreista , jotka osallistuvat B-solujen akuutin lymfoblastisen leukemian kehittymiseen ihmisillä [4] . IKZF1:n säätely lisääntyy granulosyyteissä , B-soluissa, T-soluissa , joissa on CD4- ja CD8 -reseptoreita , ja NK-soluissa , ja sen säätely vähenee erytroblasteissa , megakaryosyyteissä ja monosyyteissä [5] . IKZF1 - poistogeenisissä hiirissä T-soluja , mutta ei B-soluja, muodostuu edelleen myöhäisessä kehityksessä läheisen sukulaisen -geenin (IKZF3) myöhäisen kompensoivan ilmentymisen vuoksi 6] . Ikaros johtaa mutanttihiirten sikiökuolemaan anemian vuoksi ; niillä on vakavia puutteita erytrosyyttien ja granulosyyttien terminaalisessa erilaistumisessa ja liiallisessa makrofagien tuotannossa [7] .

Kliininen merkitys

Ihmisillä IKZF1-geenin 3'-alueen lähellä sijaitsevat SNP :t on yhdistetty alttiuteen lapsuuden akuuttiin lymfoblastiseen leukemiaan (ALL) [8] sekä tyypin 1 diabetekseen [9] . Nämä kaksi vaikutusta näyttävät olevan vastakkaisiin suuntiin, eli ALL-herkkyydestä vastaava alleeli tarjoaa suojan tyypin 1 diabetes mellitukselta ja päinvastoin [9] .

Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa

IKZF1:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa: IKZF2 [10] , IKZF3 [11] [12] [13] , IKZF4 [14] [15] , histonideasetylaasi 5 [16] , HDAC1 [ 17] [16] , HDAC7A [16] , SIN3B [12] [16] , SIN3A [12] [16] [18] ja CTBP1 [19] .

Muistiinpanot

  1. ↑ Georgopoulos K., Moore DD, Derfler B. Ikaros, varhainen lymfoidispesifinen transkriptiotekijä ja oletettu välittäjä T-  solusitoutumiseen //  Science : Journal. - 1992. - joulukuu ( nide 258 , nro 5083 ). - s. 808-812 . - doi : 10.1126/tiede.1439790 . — PMID 1439790 .
  2. ↑ Hahm K., Ernst P., Lo K., Kim GS, Turck C., Smale ST Lymfoidin transkriptiotekijää LyF-1 koodaavat spesifiset, vaihtoehtoisesti silmukoidut mRNA:t, jotka ovat peräisin Ikaros-geenistä   // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1994. - marraskuu ( osa 14 , nro 11 ). - P. 7111-7123 . — PMID 7935426 .
  3. ↑ Entrez-geeni: IKZF1 IKAROS-perheen sinkkisormi 1 (Ikaros) .
  4. ↑ 1 2 Kastner P., Chan S. Ikaroksen rooli T-solujen akuutissa lymfoblastisessa leukemiassa  (englanniksi)  // World J Biol Chem : Journal. - 2011. - Kesäkuu ( osa 2 , nro 6 ). - s. 108-114 . - doi : 10.4331/wjbc.v2.i6.108 . — PMID 21765975 .
  5. ↑ Watkins NA, Gusnanto A., de Bono B., De S., Miranda-Saavedra D., Hardie DL, Angenent WG, Attwood AP, Ellis PD, Erber W., Foad NS, Garner SF, Isacke CM, Jolley J ., Koch K., Macaulay IC, Morley SL, Rendon A., Rice KM, Taylor N., Thijssen-Timmer DC, Tijssen MR, van der Schoot CE, Wernisch L., Winzer T., Dudbridge F., Buckley CD , Langford CF, Teichmann S., Göttgens B., Ouwehand WH; Bloodomics-konsortio. A HaemAtlas: geeniekspression karakterisointi erilaistuneissa ihmisen   verisoluissa // Blood : päiväkirja. - American Society of Hematology, 2009. – Toukokuu ( osa 113 , nro 19 ). - P. e1-9 . - doi : 10.1182/blood-2008-06-162958 . — PMID 19228925 .
  6. ↑ Georgopoulos K., Winandy S., Avitahl N. Ikaros-geenin rooli lymfosyyttien kehityksessä ja homeostaasissa. (englanniksi)  // Ann Rev Immunol. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 15 . - s. 155-176 . - doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.155 . — PMID 9143685 .
  7. ↑ Papathanasiou P., Perkins AC, Cobb BS, Ferrini R., Sridharan R., Hoyne GF, Nelms KA, Smale ST, Goodnow CC. Hematolymfoidin erilaistumisen laajalle levinnyt epäonnistuminen, jonka aiheuttaa Ikaros-transkriptiotekijän resessiivinen markkinarako täyttävä alleeli  //  Immunity : Journal. - 2003. - Heinäkuu ( osa 19 , nro 1 ) - s. 131-144 . - doi : 10.1016/s1074-7613(03)00168-7 .
  8. ↑ Papaemmanuil E., Hosking FJ, Vijayakrishnan J., Price A., Olver B., Sheridan E., Kinsey SE, Lightfoot T., Roman E., Irving JA, Allan JM, Tomlinson IP, Taylor M., Greaves M. ., Holston RS. Kohteiden 7p12.2, 10q21.2 ja 14q11.2 lokukset liittyvät lapsuuden akuutin lymfoblastisen leukemian riskiin. (englanniksi)  // Ann Rev Immunol. : päiväkirja. - 2009. - syyskuu ( osa 41 , nro 9 ). - s. 1006-1010 . - doi : 10.1038/ng.430 . — PMID 19684604 .
  9. ↑ 1 2 Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C., Smyth DJ, Schuilenburg H., Maisuria-Armer M., Mistry T., Lenardo MJ, Todd JA. IKZF1-alleeli (Ikaros), joka antaa alttiuden lapsuuden akuutille lymfoblastiselle leukemialle, suojaa tyypin 1 diabetekselta. (englanniksi)  // Diabetes: päiväkirja. - 2011. - Helmikuu ( osa 60 , nro 3 ). - s. 1041-1044 . doi : 10.2337 /db10-0446 . — PMID 21270240 .
  10. ↑ Kelley CM, Ikeda T., Koipally J., Avitahl N., Wu L., Georgopoulos K., Morgan BA. Helios, Ikaroksen uusi dimerisaatiokumppani, joka ilmentyy varhaisemmissa hematopoieettisissa progenitoreissa  // Current Biology  : Journal  . - Cell Press , 1998. - huhtikuu ( osa 8 , nro 9 ). - s. 508-915 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70202-7 . — PMID 9560339 .
  11. ↑ Morgan B., Sun L., Avitahl N., Andrikopoulos K., Ikeda T., Gonzales E., Wu P., Neben S., Georgopoulos K. Aiolos, lymfoidirajoitettu transkriptiotekijä, joka on vuorovaikutuksessa Ikaroksen kanssa lymfosyyttien säätelemiseksi erilaistuminen. (englanniksi)  // EMBO: päiväkirja. - 1997. - huhtikuu ( osa 16 , nro 8 ) . - s. 2004-2013 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.2004 . — PMID 9155026 .
  12. ↑ 1 2 3 Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Ikaroksen ja Aiolosin repressio välittyy histonideasetylaasikompleksien kautta. (englanniksi)  // EMBO: päiväkirja. - 1999. - Kesäkuu ( osa 18 , nro 11 ). - s. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  13. ↑ Kim J., Sif S., Jones B., Jackson A., Koipally J., Heller E., Winandy S., Viel A., Sawyer A., ​​​​Ikeda T., Kingston R., Georgopoulos K. Ikaros DNA:ta sitovat proteiinit ohjaavat kromatiinin uudelleenmuotoilukompleksien muodostumista lymfosyyteissä. (englanniksi)  // Immunity : Journal. - 1999. - maaliskuu ( osa 10 , nro 3 ) . - s. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
  14. ↑ Honma, Y; Kiyosawa H., Mori T., Oguri A., Nikaido T., Kanazawa K., Tojo M., Takeda J., Tanno Y., Yokoya S., Kawabata I., Ikeda H., Wanaka A. Eos: a Ikaros-geeniperheen uusi jäsen, joka ilmentyy pääasiassa kehittyvässä hermostossa  //  FEBS Letters : päiväkirja. - ALANKOMAAT, 1999. - maaliskuu ( nide 447 , nro 1 ). - s. 76-80 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00265-3 . — PMID 10218586 .
  15. ↑ Perdomo, J; Holmes M; Chong B; Crossley M. Eos ja pegasus, kaksi Ikaros-proteiiniperheen jäsentä, joilla on erottuva DNA-sitoutumisaktiivisuus  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - YHDYSVALLAT, 2000. - Joulukuu ( nide 275 , no. 49 ). - P. 38347-38354 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M005457200 . — PMID 10978333 .
  16. ↑ 1 2 3 4 5 Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. Ikaroksen tukahdutuspiirin molekyylidissektio  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - Yhdysvallat, 2002. - elokuu ( osa 277 , no. 31 ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  17. ↑ Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Ikaroksen ja Aiolosin repressio välittyy histonideasetylaasikompleksien kautta  (englanniksi)  // The EMBO Journal : päiväkirja. - ENGLANTI, 1999. - Kesäkuu ( osa 18 , nro 11 ). - s. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  18. ↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. Ikaros-CtIP-vuorovaikutukset eivät vaadi C-terminaalista sitoutumisproteiinia ja osallistuvat deasetylaasiriippumattomaan tukahduttamismuotoon  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - Yhdysvallat, 2002. - kesäkuu ( osa 277 , no. 26 ). - P. 23143-23149 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  19. ↑ Koipally, J; Georgopoulos K. Ikarosin vuorovaikutus CtBP:n kanssa paljastaa repressiomekanismin, joka on riippumaton histonideasetylaasiaktiivisuudesta  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - YHDYSVALLAT, 2000. - Kesäkuu ( osa 275 , nro 26 ). - P. 19594-19602 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .

Kirjallisuus