SAP30

Sin3A:han liittyvä proteiini, 30 kDa
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliSAP30
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  603378 MGI :  1929129 Homologeeni :  2869 GeneCards : SAP30 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez881960406
YhtyeENSG00000164105ENSMUSG00000031609
UniProtO75446O88574
RefSeq (mRNA)NM_003864NM_021788
RefSeq (proteiini)NP_003855NP_068560
Locus (UCSC)Chr 4:
174,29 - 174,3 Mb		Chr 8:
57,48 – 57,49 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

30 kDa:n Sin3A:han liittyvä proteiini , joka tunnetaan myös nimellä SAP30 , on proteiini , jota SAP30 -geeni koodaa ihmisissä [1] .

Toiminto

Histoniasetylaatiolla on keskeinen rooli eukaryoottisten geenien ilmentymisen säätelyssä . Histonien asetylaatiota ja deasetylaatiota katalysoivat monialayksikkökompleksit. Tämän geenin koodaama proteiini on komponentti histonideasetylaasikompleksissa , joka sisältää SIN3A :n , SAP18 :n , HDAC1 :n , HDAC2 :n , RbAp46 :n , RbAp48 :n ja muita polypeptidejä. Tämä kompleksi osallistuu aktiivisesti pääoktameerihistonien deasetylaatioon, mutta on inaktiivinen nukleosomaalisten histonien deasetylaatiossa. Tämän geenin pseudogeeni sijaitsee kromosomissa 3 [1] .

Nisäkkäillä on yksi SAP30-paralogi, nimeltään SAP30-like (SAP30L), jonka saatavilla olevat sekvenssit ovat 70-prosenttisesti identtisiä SAP30:n kanssa [2] . SAP30 ja SAP30L muodostavat yhdessä hyvin säilyneen SAP30- proteiiniperheen . SAP30L on myös vuorovaikutuksessa useiden Sin3A-kompleksin ydinpressorikomponenttien kanssa ja indusoi transkription repressiota Sin3A:n ja histonideasetylaasien värväämisen kautta [3] .

SAP30-perheen proteiineilla on signaalin toiminnallinen tumalokalisaatio ja ne voivat välittää Sin3A-signaalin ytimeen [3] . SAP30-proteiineilla on itsenäinen sekvenssikontakti DNA :n kanssa , niiden N-terminaalinen sinkistä riippuvainen moduuli ja niiden hapan ydinalue myötävaikuttavat histoni-nukleosomivuorovaikutuksiin. SAP30-proteiinien DNA-sitoutumista säätelee lipidituman signalointi, fosfoinositidit (PI) [4] . SAP30-proteiinit ovat ensimmäinen esimerkki, jossa DNA ja PI näyttävät olevan keskenään antagonistisessa suhteessa niiden vuorovaikutuksen suhteen sinkkisormiproteiinien kanssa ja havainnollistavat siten molekyylimekanismia, kuinka nämä lipidit voivat osallistua geenisäätelyyn [4] [5] .

Vuorovaikutuksia

SAP30:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa HDAC1 :n [6] [7] [8] [9] [10] [11] , histonideasetylaasi 2 :n [7] [8] [11] , SIN3A:n [7] [8] [10] kanssa. [11] [12] [13] , RBBP7 [7] [8] [11] , ydinreseptorin ydinpressori 1 [13] [14] , RBBP4 [7] [8] [11] , ING1 [11] ja YY1 [ 6] .

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 Entrez-geeni: SAP30 Sin3A-assosioitunut proteiini, 30 kDa .
  2. ↑ Lindfors K., Viiri KM, Niittynen M., Heinonen TY, Mäki M., Kainulainen H. TGF-beta indusoi SAP30L:n ilmentymistä, uutta ydinproteiinia  //  BMC Genomics : päiväkirja. - 2003. - joulukuu ( osa 4 ). - s. 53 . - doi : 10.1186/1471-2164-4-53 . — PMID 14680513 .
  3. ↑ 1 2 Viiri KM, Korkeamäki H., Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K., Peterson P., Mäki M., Kainulainen H., Lohi O. SAP30L on vuorovaikutuksessa Sin3A-korepressorikompleksin jäsenten kanssa ja kohdistaa Sin3A:n ytimeen  (eng.)  // Nucleic Acids Research : päiväkirja. - 2006. - Voi. 34 , nro. 11 . - P. 3288-3298 . - doi : 10.1093/nar/gkl401 . — PMID 16820529 .
  4. ↑ 1 2 Viiri KM, Jänis J., Siggers T., Heinonen TY, Valjakka J., Bulyk ML, Mäki M., Lohi O. SAP30L:n ja SAP30:n DNA:ta sitovia ja taivutustoimintoja välittää sinkistä riippuvainen moduuli ja monofosfoinositidit  //  Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2009. - tammikuu ( osa 29 , nro 2 ) - s. 342-356 . - doi : 10.1128/MCB.01213-08 . — PMID 19015240 .
  5. ↑ TamPub (downlink) . Haettu 20. huhtikuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 25. toukokuuta 2011. 
  6. ↑ 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y. YY1-toiminnan modulaatio SAP30:llä  //  Biokemiallisen ja biofysikaalisen tutkimuksen viestintä : päiväkirja. - Yhdysvallat, 2003. - Kesäkuu ( nide 306 , no. 1 ). - s. 267-275 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . — PMID 12788099 .
  7. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; SunZW; Iratni R; Erdjument Bromage H; TempstP; Hampsey M; Reinberg D. SAP30, uusi proteiini, joka on konservoitunut ihmisen ja hiivan välillä, on histonideasetylaasikompleksin komponentti  //  Molecular Cell : päiväkirja. - YHDYSVALLAT, 1998. - Kesäkuu ( osa 1 , nro 7 ). - s. 1021-1031 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  8. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; lintu A; Reinberg D. NuRD-alayksiköiden analyysi paljastaa histonideasetylaasiydinkompleksin ja yhteyden DNA:n metylaatioon  // Genes & Development  : Journal  . - YHDYSVALLAT, 1999. - elokuu ( osa 13 , nro 15 ). - P. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  9. ↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar. HBP1- ja Mad1-repressorit sitovat Sin3-corepressorin PAH2-domeenin vastakkaisilla kierukkasuunnilla  (englanniksi)  // Nature Structural & Molecular Biology  : Journal. - Yhdysvallat, 2004. - elokuu ( osa 11 , no. 8 ). - s. 738-746 . — ISSN 1545-9993 . doi : 10.1038 / nsmb798 . — PMID 15235594 .
  10. ↑ 12 Yochum , G.S.; Ayer D E. Pf1, uusi PHD sinkkisormiproteiini, joka yhdistää TLE-koressorin mSin3A-histonideasetylaasikompleksiin  //  Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - Yhdysvallat, 2001. - heinäkuu ( osa 21 , no. 13 ). - P. 4110-4118 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
  11. ↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. Sin3-histoni-deasetylaasikompleksin rooli ehdokaskasvainsuppressorin p33(ING1  ) kasvun säätelyssä  // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - Yhdysvallat, 2002. - Helmikuu ( osa 22 , no. 3 ). - s. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  12. ↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. mSin3A-corepressorikompleksin kolmen uuden komponentin tunnistaminen ja karakterisointi   // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - Yhdysvallat, 2003. - toukokuu ( osa 23 , no. 10 ). - P. 3456-3467 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  13. ↑ 12 Laherty , CD; Billin A. N., Lavinsky R M., Yochum G S., Bush A C., Sun J M., Mullen T M., Davie J R., Rose D W., Glass C K., Rosenfeld M G., Ayer D E., Eisenman RN. SAP30, mSin3-corepressorikompleksin komponentti, joka osallistuu spesifisten transkriptiotekijöiden aiheuttamaan N-CoR-välitteiseen repressioon  //  Molecular Cell : päiväkirja. - YHDYSVALLAT, 1998. - Heinäkuu ( osa 2 , nro 1 ). - s. 33-42 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
  14. ↑ Underhill, C; Qutob MS; Yee SP; Torchia J. Uusi ydinreseptoricorepressorikompleksi, N-CoR, sisältää komponentteja nisäkkään SWI/SNF-kompleksista ja ydinpressorista KAP-1  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - YHDYSVALLAT, 2000. - Joulukuu ( osa 275 , nro 51 ). - P. 40463-40470 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M007864200 . — PMID 11013263 .

Kirjallisuus