Kystatiinit ovat seriiniproteaasi-inhibiittoriproteiinien perhe , jotka ovat rakenteellisesti homologisia kanan kystatiinin kanssa. Tyypillinen kystatiini sisältää noin 115 aminohappoa , siinä on 4 evoluutionaalisesti konservoitunutta kysteiinitähdettä , jotka muodostavat kaksi disulfidisidosta . Kystatiinit voivat käydä läpi glykosylaatiota ja/tai fosforylaatiota .