5,8S rRNA

Ribosomaalinen RNA 5.8S (5.8S rRNA) on eukaryoottisen ribosomin suuren alayksikön ei-koodaava RNA-komponentti , jolla on tärkeä rooli proteiinien translaatiossa . RNA-polymeraasi I transkriptoi sen osana 45S-prekursoria, joka sisältää myös 18S- ja 28S- rRNA :ta . Uskotaan, että sen tehtävänä on siirtää ribosomeja [1] . Sen tiedetään myös muodostavan kovalenttisen sidoksen p53 - kasvainsuppressoriproteiinin kanssa [2] . 5,8S-rRNA:ta voidaan käyttää vertailugeeninä miRNA -detektiossa [3] . Ribosomaalista RNA:ta 5,8S:ää käytetään ymmärtämään paremmin muita rRNA-prosesseja ja -reittejä solussa [4] .

5,8S-rRNA on homologinen ei-eukaryoottisen rRNA:n suuren alayksikön 5'-pään kanssa . Eukaryooteissa ITS2-insertti hajottaa suuren alayksikön rRNA:n 5.8S- ja 28S-rRNA :ksi [5] . Joissakin kärpäsissä 5.8 rRNA jakautuu edelleen kahteen osaan [6] .

Koostumus

L567.5-rRNA-rakenne on noin 150 nukleotidin kokoinen ja koostuu useista laskostuneista juosteista, joista joidenkin katsotaan olevan yksijuosteisia [7] . Tämä ribosomin RNA yhdessä 28S- ja 5S-rRNA:n ja 46 ribosomaalisen proteiinin kanssa muodostaa ribosomin suuren alayksikön . 5,8S-rRNA transkriptoidaan aluksi yhdessä 18S- ja 28S-rRNA:n kanssa 45S-preribosomaalisessa RNA:ssa sekä ITS 1:n ja ITS 2:n ( sisäinen transkriptoitu välikappale ) ja 5'- ja 3'-ETS:n ( ulompi transkriptoitu välikappale ) [8] . 5,8S-rRNA sijaitsee kahden ITS-alueen välissä, jolloin ITS1 erottaa sen 18S-rRNA :sta 5'-suunnassa, kun taas ITS2 erottaa sen 28S-rRNA :sta 3'-suunnassa. ITS ja ETS irrotetaan rRNA:n kypsymisen aikana. Tämä saavutetaan jatkuvalla pilkkoutumisreitillä, jonka suorittavat sekä endonukleaasi että eksonukleaasi , leikkaamalla välikappaleet tietyistä kohdista.

Muistiinpanot

  1. "5.8S rRNA:n rooli ribosomin translokaatiossa". Nukleiinihappotutkimus . 25 (9): 1788-1794. toukokuuta 1997. DOI : 10.1093/nar/25.9.1788 . PMID  9108162 .
  2. "Sytoplasminen p53-polypeptidi liittyy ribosomeihin" . Molekyyli- ja solubiologia . 17 (6): 3146-3154. kesäkuuta 1997. DOI : 10.1128/MCB.17.6.3146 . PMID  9154813 .
  3. "Helppo keino mikroRNA:n ilmentymisen kvantifiointiin reaaliaikaisella PCR:llä". Biotekniikat . 39 (4): 519-525. lokakuuta 2005. DOI : 10.2144/000112010 . PMID  16235564 .
  4. "Ribasomaalinen 5.8S-RNA: eukaryoottinen adaptaatio vai prosessointivariantti?". Canadian Journal of Biochemistry and Cell Biology . 62 (6): 311-320. kesäkuuta 1984. DOI : 10.1139/o84-044 . PMID  6380683 .
  5. Lafontaine, DLJ (2001). "Ribosomien toiminta ja synteesi". Nature Reviews Molecular Cell Biology . 2 (7): 514-520. DOI : 10.1038/35080045 . PMID  11433365 .
  6. Shimada, T. (elokuu 1992). "Hajautetun 5.8S ribosomaalisen RNA:n jakautuminen kaksoisherneissä." Hyönteisten molekyylibiologia . 1 (1): 45-48. DOI : 10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x . PMID  1343775 .
  7. "5.8S ribosomaalinen RNA". solu . 33 (2): 320-322. kesäkuuta 1983. DOI : 10.1016/0092-8674(83)90413-0 . PMID  6861202 .
  8. "Yleiskatsaus esiribosomaaliseen RNA:n prosessointiin eukaryooteissa". Wiley monitieteiset arvostelut: RNA . 6 (2): 225-242. 27. lokakuuta 2014. DOI : 10.1002/wrna.1269 . PMID  25346433 .

Ulkoiset linkit