ATR (biologia)
Seriini/treoniiniproteiinikinaasi ATR , joka tunnetaan myös nimellä ataksia-telangiektasia ja Rad3-sukuinen proteiini (ATR) tai FRAP-sukuinen proteiini 1 (FRP1), on ATR -geenin koodaama entsyymi ihmiskehossa . [1] [2] ATR kuuluu fosfatidyyli-inositoli-3-kinaasiin liittyvien kinaasiproteiinien perheeseen.
Toiminto
ATR on seriini / treoniini - spesifinen proteiinikinaasi, joka tarkkailee DNA-vaurioita ja aktivoi solusyklin tarkistuspisteen, jos se havaitaan . [3] ATR aktivoituu yksijuosteisen DNA :n läsnäollessa , joka on välituote nukleotidileikkauksen korjauksessa ja DNA- vaurion korjaamisessa homologisella rekombinaatiolla . Yksijuosteinen DNA ilmestyy myös, kun replikaatiohaarukka pysäytetään . ATR toimii yhdessä ATRIP-nimisen proteiinin kanssa, joka tunnistaa yksijuosteisen DNA:n, joka on päällystetty replikatiivisella proteiini A :lla. [4] Aktivoituessaan ATR fosforyloi Chk1 :n ja käynnistää transduktiosignaalien sarjan, joka johtaa solusyklin pysähtymiseen . Lisäksi ATR voi toimia myös häiriöttömän DNA :n replikaation kanssa . [5]
ATR on sukua toiselle kinaasille , ATM :lle , joka aktivoituu DNA:n kaksoisjuosteen katkeamisen tai kromatiinin hajoamisen seurauksena . [6]
Kliininen merkitys
ATR:n mutaatiot ovat syynä Seckelin oireyhtymään ( eng. Seckelin syndrooma ), joka on harvinainen perinnöllinen sairaus, joka on ilmenemismuodoiltaan samanlainen kuin toinen oireyhtymä - ataksia telangiectasia, joka johtuu ATM-geenin mutaatioista. [7]
ATR/Chk1-estäjät voivat tehostaa syövän kemoterapiassa usein käytettyjen DNA-silloittajien vaikutusta. Ensimmäiset kliiniset tutkimukset ATR-estäjillä aloitettiin vuonna 2014 kahden lääkeyhtiön toimesta: AstraZeneca (kroonisen lymfosyyttisen leukemian, prolymfosyyttisen leukemian tai B-solulymfooman hoitoon) ja Vertex Pharmaceuticals (kiinteiden kasvainten hoitoon). [kahdeksan]
Vuorovaikutuksia
ATR on vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:
Muistiinpanot
- ↑ Cimprich KA, Shin TB, Keith CT, Schreiber SL cDNA-kloonaus ja ehdokassolusyklin tarkistuspisteproteiinin geenikartoitus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 1996. - huhtikuu ( osa 93 , nro 7 ) . - P. 2850-2855 . - doi : 10.1073/pnas.93.7.2850 . — PMID 8610130 .
- ↑ Bentley NJ, Holtzman DA, Flaggs G., Keegan KS, DeMaggio A., Ford JC, Hoekstra M., Carr AM The Schizosaccharomyces pombe rad3 checkpoint gene // EMBO J. : päiväkirja. - 1996. - joulukuu ( osa 15 , nro 23 ). - P. 6641-6651 . — PMID 8978690 .
- ↑ Sancar A., Lindsey-Boltz LA, Unsal-Kaçmaz K., Linn S. Nisäkkään DNA:n korjauksen molekyylimekanismit ja DNA-vaurion tarkistuspisteet // Annu . Rev. Biochem. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 73 , no. 1 . - s. 39-85 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.73.011303.073723 . — PMID 15189136 .
- ↑ Zou L., Elledge SJ DNA-vaurion havaitseminen RPA-ssDNA-kompleksien ATRIP-tunnistuksen avulla // Science : Journal. - 2003. - Kesäkuu ( nide 300 , nro 5625 ). - s. 1542-1548 . - doi : 10.1126/tiede.1083430 . — PMID 12791985 .
- ↑ Brown EJ, Baltimore D. ATR:n olennaiset ja välttämättömät roolit solusyklin pysäyttämisessä ja genomin ylläpidossa // Genes Dev . : päiväkirja. - 2003. - maaliskuu ( osa 17 , nro 5 ). - s. 615-628 . - doi : 10.1101/gad.1067403 . — PMID 12629044 .
- ↑ Bakkenist CJ, Kastan MB DNA-vaurio aktivoi ATM:n molekyylien välisen autofosforylaation ja dimeerien dissosioitumisen kautta // Nature: Journal. - 2003. - tammikuu ( osa 421 , nro 6922 ). - s. 499-506 . - doi : 10.1038/luonto01368 . — PMID 12556884 .
- ↑ O'Driscoll M., Ruiz-Perez VL, Woods CG, Jeggo PA, Goodship JA . Silmukointimutaatio, joka vaikuttaa ataksia-telangiektasian ja Rad3:een liittyvän proteiinin (ATR) ekspressioon, johtaa Seckelin oireyhtymään // Nat . Genet. : päiväkirja. - 2003. - Huhtikuu ( osa 33 , nro 4 ). - s. 497-501 . - doi : 10.1038/ng1129 . — PMID 12640452 .
- ↑ Llona-Minguez S., Höglund A., Jacques SA, Koolmeister T., Helleday T. Kemialliset strategiat ATR-estäjien kehittämiseksi // Expert Rev Mol Med. : päiväkirja. - 2014. - toukokuu ( osa 16 , nro e10 ). - doi : 10.1017/erm.2014.10 . — PMID 24810715 .
- ↑ 1 2 3 Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB Substraattispesifisyydet ja ATM-kinaasiperheen oletettujen substraattien tunnistaminen // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 1999. - joulukuu ( nide 274 , nro 53 ). - P. 37538-37543 . doi : 10.1074 / jbc.274.53.37538 . — PMID 10608806 .
- ↑ Tibbetts RS, Cortez D., Brumbaugh KM, Scully R., Livingston D., Elledge SJ, Abraham RT Funktionaaliset vuorovaikutukset BRCA1:n ja tarkistuspistekinaasi ATR:n välillä genotoksisen stressin aikana // Genes Dev . : päiväkirja. - 2000. - Joulukuu ( osa 14 , nro 23 ). - s. 2989-3002 . - doi : 10.1101/gad.851000 . — PMID 11114888 .
- ↑ Chen J. Ataxia-telangiectasiaan liittyvä proteiini osallistuu BRCA1:n fosforylaatioon deoksiribonukleiinihappovaurion jälkeen // Cancer Res . : päiväkirja. - 2000. - syyskuu ( osa 60 , nro 18 ). - P. 5037-5039 . — PMID 11016625 .
- ↑ Gatei M., Zhou BB, Hobson K., Scott S., Young D., Khanna KK Ataxia telangiectasia mutatated (ATM) kinaasi ja ATM- ja Rad3-sukuinen kinaasi välittävät Brca1:n fosforylaatiota erillisissä ja päällekkäisissä kohdissa. In vivo -arviointi käyttämällä fosfospesifisiä vasta-aineita (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2001. - toukokuu ( nide 276 , nro 20 ). - P. 17276-17280 . - doi : 10.1074/jbc.M011681200 . — PMID 11278964 .
- ↑ 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Molekyyliassosiaatio ATR:n ja nukleosomiremodeling- ja deasetylointikompleksin kahden komponentin, HDAC2:n ja CHD4 :n välillä // Biochemistry : Journal. - 1999. - marraskuu ( osa 38 , nro 44 ). - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
- ↑ Wang Y., Qin J. MSH2 ja ATR muodostavat signalointimoduulin ja säätelevät DNA-metylaatioon kohdistuvan vauriovasteen kahta haaraa // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2003. - joulukuu ( osa 100 , nro 26 ). - P. 15387-15392 . - doi : 10.1073/pnas.2536810100 . — PMID 14657349 .
- ↑ Fabbro M., Savage K., Hobson K., Deans AJ, Powell SN, McArthur GA, Khanna KK BRCA1-BARD1 komplekseja tarvitaan p53Ser-15:n fosforylaatioon ja G1/S-pysähdykseen ionisoivan säteilyn aiheuttaman DNA- vaurion jälkeen.) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2004. - Heinäkuu ( osa 279 , nro 30 ). - P. 31251-31258 . - doi : 10.1074/jbc.M405372200 . — PMID 15159397 .
- ↑ Bao S., Tibbetts RS, Brumbaugh KM, Fang Y., Richardson DA, Ali A., Chen SM, Abraham RT, Wang XF ATR / /ATM-välitteistä ihmisen Rad17:n fosforylaatiota tarvitaan genotoksisiin stressireaktioihin - 2001. - kesäkuu ( nide 411 , nro 6840 ). - s. 969-974 . - doi : 10.1038/35082110 . — PMID 11418864 .
- ↑ Long X., Lin Y., Ortiz-Vega S., Yonezawa K., Avruch J. Rheb sitoo ja säätelee mTOR-kinaasia // Curr . Biol. : päiväkirja. - 2005. - huhtikuu ( osa 15 , nro 8 ). - s. 702-713 . - doi : 10.1016/j.cub.2005.02.053 . — PMID 15854902 .
Kirjallisuus
- Giaccia AJ, Kastan MB P53-modulaation monimutkaisuus: syntyviä malleja poikkeavista signaaleista // Genes Dev . : päiväkirja. - 1998. - Voi. 12 , ei. 19 . - P. 2973-2983 . doi : 10.1101 / gad.12.19.2973 . — PMID 9765199 .
- Shiloh Y. ATM ja ATR: solujen vasteiden verkottaminen DNA-vaurioille // Curr . Opin. Genet. kehittäjä : päiväkirja. - 2001. - Voi. 11 , ei. 1 . - s. 71-7 . - doi : 10.1016/S0959-437X(00)00159-3 . — PMID 11163154 .
- Kastan MB, Lim DS ATM:n monet substraatit ja toiminnot // Nat . Rev. Mol. Cell biol. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 1 , ei. 3 . - s. 179-186 . - doi : 10.1038/35043058 . — PMID 11252893 .
- Abraham RT ATM:ään liittyvä kinaasi, hSMG-1, yhdistää genomin ja RNA:n valvontareitit // DNA Repair (Amst. ) : päiväkirja. - 2005. - Voi. 3 , ei. 8-9 . - s. 919-925 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2004.04.003 . — PMID 15279777 .
- Li L., Li HS, Pauza CD, et ai. HIV-1:n apuproteiinien roolit viruspatogeneesissä ja isäntä-patogeenivuorovaikutuksissa // Cell Res . : päiväkirja. - 2006. - Voi. 15 , ei. 11-12 . - s. 923-934 . - doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . — PMID 16354571 .