DDX5

Box helicase DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) 5
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliDDX5  ; G17P1; HLR1; HUMP68; p68
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  180630 MGI :  105037 Homologeeni :  6797 GeneCards : DDX5 Gene
EY-numero3.6.4.13
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez165513207
YhtyeENSG00000108654ENSMUSG00000020719
UniProtP17844Q61656
RefSeq (mRNA)NM_004396NM_007840
RefSeq (proteiini)NP_004387NP_031866
Locus (UCSC)Chr 17:
62,5 – 62,5 Mb		Chr 11:
106,78 – 106,79 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Oletettu ATP-riippuvainen DDX5-RNA-helikaasi , joka tunnetaan myös nimellä DEAD 5 -laatikkoproteiini tai p68-RNA-helikaasi,  on entsyymi , jota ihmisissä koodaa DDX5 - geeni [1] .

Toiminto

Box DEAD -proteiinit , joille on tunnusomaista konservoitunut Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) -motiivi, ovat oletettavasti RNA - helikaaseja . Ne osallistuvat moniin soluprosesseihin, kuten RNA:n sekundaarirakenteen muutoksiin, translaation alkamiseen, ydin- ja mitokondrioiden silmukoitumiseen , ribosomien ja silmukoimien kokoonpanoon . Jakautumiskuvioidensa perusteella joidenkin tämän perheen jäsenten uskotaan osallistuvan alkion muodostumiseen , spermatogeneesiin sekä solujen kasvuun ja jakautumiseen. Tämä geeni koodaa DEAD-laatikkoproteiinia, joka on RNA-riippuvainen ATPaasi , sekä proliferaatioon liittyvää tuma-antigeeniä, joka on spesifisesti herkkä apinaviruksen tuumoriantigeenille 40. Tämä geeni koostuu 13 eksonista , ja siellä on useita intronisekvenssejä sisältäviä silmukointivariantteja . , mutta näitä transkriptioita ei havaittu [1] .

Vuorovaikutuksia

DDX5:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 Entrez-geeni: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) -laatikkopolypeptidi 5 .
  2. ↑ Akileswaran L., Taraska JW, Sayer JA, Gettemy JM, Coghlan VM A-kinaasiin ankkuroiva proteiini AKAP95 on kohdistettu tumamatriisiin ja liittyy p68 ​​RNA-helikaasiin  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2001. - toukokuu ( nide 276 , nro 20 ). - P. 17448-17454 . - doi : 10.1074/jbc.M101171200 . — PMID 11279182 .
  3. ↑ Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV Hyvin samankaltaiset DEAD box RNA -helikaasit p68 ja p72 esiintyvät heterodimeereinä soluissa  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. - 2003. - maaliskuu ( osa 31 , nro 5 ). - s. 1470-1480 . - doi : 10.1093/nar/gkg236 . — PMID 12595555 .
  4. ↑ Wilson BJ, Giguère V. P68- ja p72-RNA-helikaasien uusien reittikumppaneiden tunnistaminen Oncomine-meta-analyysin avulla  //  BMC Genomics : päiväkirja. - 2007. - Voi. 8 . - s. 419 . - doi : 10.1186/1471-2164-8-419 . — PMID 18005418 .
  5. ↑ Endoh H., Maruyama K., Masuhiro Y., Kobayashi Y., Goto M., Tai H., Yanagisawa J., Metzger D., Hashimoto S., Kato S. Purification and Identification of p68 RNA helicase Acting as a Ihmisen estrogeenireseptorin α:n aktivointifunktiolle 1 spesifinen transkription koaktivaattori  (englanniksi)  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 1999. - elokuu ( osa 19 , nro 8 ). - P. 5363-5372 . — PMID 10409727 .
  6. ↑ Rossow KL, Janknecht R. Synergismi p68 RNA-helikaasin ja transkription koaktivaattorien CBP ja  p300 välillä //  Onkogeeni : päiväkirja. - 2003. - tammikuu ( osa 22 , nro 1 ) . - s. 151-156 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206067 . — PMID 12527917 .
  7. ↑ Nicol SM, Causevic M., Prescott AR, Fuller-Pace FV Tuman DEAD box RNA helikaasi p68 on vuorovaikutuksessa nukleolaarisen fibrillariinin proteiinin kanssa ja kolokalisoituu spesifisesti syntymässä olevissa nukleoleissa telofaasin aikana   // Exp . Cell Res. : päiväkirja. - 2000. - Kesäkuu ( nide 257 , nro 2 ). - s. 272-280 . - doi : 10.1006/excr.2000.4886 . — PMID 10837141 .
  8. ↑ Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV p68 ja p72 DEAD box RNA helikaasit ovat vuorovaikutuksessa HDAC1:n kanssa ja estävät transkription promoottorispesifisellä tavalla  //  BMC Mol. Biol. : päiväkirja. - 2004. - elokuu ( osa 5 ). — s. 11 . - doi : 10.1186/1471-2199-5-11 . — PMID 15298701 .
  9. ↑ 1 2 3 Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. RNA:ta sitovien DEAD-box - proteiinien alaryhmä toimii estrogeenireseptorin a-koaktivaattorina N-terminaalisen aktivaatiodomeenin (AF-1) kautta RNA-koaktivaattorin, SRA:n, kanssa  // EMBO  J. : päiväkirja. - 2001. - maaliskuu ( osa 20 , nro 6 ). - s. 1341-1352 . - doi : 10.1093/emboj/20.6.1341 . — PMID 11250900 .
  10. ↑ Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J., Gregory DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV The DEAD box -proteiini p68: uusi transkription koaktivaattori p53-kasvainsuppressorille  .)  // EMBO J. : päiväkirja. - 2005. - Helmikuu ( osa 24 , nro 3 ). - s. 543-553 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600550 . — PMID 15660129 .
  11. ↑ Yao H., Brick K., Evrard Y., Xiao T., Camerini-Otero RD, Felsenfeld G. CTCF-transkription eristyksen välittäminen DEAD-box-RNA:ta sitovalla proteiinilla p68 ja steroidireseptorin RNA-aktivaattorilla   SRA // Genes Dev  : päiväkirja. - 2010. - Vol. 24 , ei. 22 . - P. 2543-2555 . - doi : 10.1101/gad.1967810 . — PMID 20966046 .

Kirjallisuus