Loka-4

loka-4
Tunnisteet
Symbolit POU luokka 5 homeobox 1 transkriptiovariantti OCT4B2POU5F1 oktameeria sitova proteiini 3Oct-4POU luokka 5 homeobox 1 transkriptiovariantti OCT4B3POU-tyyppinen homeodomainin sisältävä DNA:ta sitova proteiini POU luokka 5 homeobox 1 transkriptivariantti OCT4B2POU5F1 oktameeriä sitova muunnos OCT4B2POU5F1 oktameeria sitova luokka 5 POUOc6OTF-3POUOc6OTF-3POUOc6OTF-3 luokka 5 homeobox 1 transkriptiovariantti OCT4B1POU luokka 5 homeobox 1 transkriptivariantti OCT4B5POU luokka 5 homeobox 1 transkriptiovariantti OCT4B4POU-alueen transkriptiotekijä OCT4 oktameeria sitova transkriptiotekijä 3 oktameeria sitova proteiini 4
Ulkoiset tunnukset GeneCards:
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
Erilaisia Ihmisen Hiiri
Entrez
Yhtye
UniProt
RefSeq (mRNA)

n/a

n/a

RefSeq (proteiini)

n/a

n/a

Locus (UCSC) n/a n/a
PubMed- haku n/a
Muokkaa (ihminen)

Oct-4 (lyhenne englannin  sanasta Octamer-4 ) on homeoboxia sisältävä transkriptiotekijä POU - perheestä . Tämä proteiini osallistuu erilaistumattomien alkion kantasolujen itsensä uusiutumiseen. [1] Käytetään laajasti erilaistumattomien solujen markkerina. Oct-4:n ilmentyminen on erittäin hienosäädeltyä, koska lisääntyminen tai väheneminen voi johtaa solujen erilaistumiseen. [2]

Lauseke ja funktiot

Transkriptiotekijä Oct-4 on jo aktiivinen munasolussa ja pysyy aktiivisena implantaatiohetkeen asti. Oct-4:n ilmentyminen liittyy erilaistumattomaan solufenotyyppiin ja kasvaimiin. [3] Oct-4-geenin tuhoutuminen indusoi erilaistumista ja todistaa tämän tekijän roolin ihmisen alkion kantasolujen itsensä uusiutumisessa. [4] Oct-4 muodostaa heterodimeerin Sox2 -proteiinin kanssa , nämä kaksi proteiinia sitoutuvat yhteen DNA:han. [5]

Hiiren alkioissa, joista puuttuu Oct-4-geeni, on alhainen Oct-4-proteiinitaso, eivätkä ne pysty muodostamaan sisäistä solumassaa , menettävät pluripotenssinsa ja erilaistuvat trofektodermiksi . Siten Oct-4:n ilmentymistaso hiirissä on välttämätön pluripotenssin ja varhaisen solujen erilaistumisen säätelyyn, ja sen päätehtävänä on pitää alkio erilaistumasta.

NCBI- tiedot

Erilaisia "Genetiikka" asema
Musiikki lihas GeneID: 18999 , proteiinin viite: NP_038661.1 , mRNA:n viite: NM_013633.1 Sijainti genomissa: NC_000083.4, 35114104..35118822 (plus-ketjua pitkin). Kromosomi: 17,17 B1; 17 klo 19.23
Homo sapiens GeneID: 5460 , proteiinin viite: NP_002692.2 , mRNA:n viite: NM_002701.3 . Ihmisillä on kaksi OCT4-isoformia, joista toinen näyttää ensimmäisen N-terminaaliselta osalta. [1] . Sijainti genomissa: NC_000006.10, 31246432-31240107 (negatiivinen juoste). Kromosomi: 6, 6p21.31
Rattus norvegicus GeneID: 294562 , proteiinin viitenumero: NP_001009178 , mRNA:n viitenumero: NM_001009178 Sijainti genomissa: NW_001084776, 650467-655015 (miinus ketju). Kromosomi: 20.
Danio Rerio GeeniID: 303333 , proteiinin viite: NP_571187 , mRNA-sekvenssi: NM_131112 Sijainti genomissa: NC_007127.1, 27995548-28000317 (negatiivinen juoste). Kromosomi: 21.

Rakennetiedot

konservatiivinen toimialue
konservatiivinen toimialue POU [6] homeomain [7]
Pituus, aminohappotähteet 75 59
Kuvaus Löytyy Pit-Oct-Unc transkriptiotekijöistä DNA:ta sitovat domeenit osallistuvat eukaryoottien tärkeiden kehitysprosessien transkription säätelyyn; voi sitoa DNA:ta monomeereinä, dimeereinä tai heterodimeereinä sekvenssispesifisellä tavalla.

Sairaudet

Oct-4 on osallisena kantasolukasvainten kehittymiseen aikuisilla. Epäluonnollinen tekijän ilmentyminen aikuisilla hiirillä voi johtaa ihon ja suoliston dysplasiaan . Suoliston dysplasia on seurausta β-kateniinin lisääntyneestä transkriptiosta ja solujen erilaistumisen estymisestä. [kahdeksan]

Eläinmalleja

Vuonna 2000 Niwa et ai. määrittelivät tavanomaista geeniekspressiota ja repressiota hiiren alkion kantasoluissa (ES) soluissa loka-4. [2] Vaikka transkription uskotaan yleensä säädeltävän kyllä/ei-binäärisesti, Oct-4-tasojen on osoitettu hallitsevan kolmea erilaista ES-solukehitysreittiä. Alle kaksinkertainen ilmentymistaso indusoi erilaistumisen primaariseksi endodermiksi ja mesodermiksi. Oct-4:n tukahduttaminen johtaa pluripotenssin menettämiseen ja erilaistumiseen trofektodermiksi. Itseuudistumisen ylläpitämiseen tarvitaan tiukasti määritelty määrä 4. lokakuuta, ja tason muutos aiheuttaa erilaistumista eri reiteillä. Niwa ym. uskovat, että Oct-4 on pääasiallinen pluripotenssin säätelijä.

Transkriptiotekijät Oct-4, Sox2 ja Nanog voivat indusoida toistensa ilmentymistä ja niitä tarvitaan blastokystan sisäisen solumassan erilaistumattomien solujen sekä alkion kantasolujen (jotka muodostuvat sisäisestä solumassasta ) itsestään uusiutumiseen. ). [5]

Oct-4 on transkriptiotekijä, jota on käytetty synnyttämään indusoituja kantasoluja yhdessä Sox2 :n , Klf4 :n ja usein c - Myc :n kanssa hiirillä [9] [10] [11] , mikä osoittaa kyvyn luoda soluja, joilla on kantaominaisuuksia. Myöhemmin osoitettiin, että vain kaksi näistä neljästä tekijästä Oct4 ja Klf4 vaadittiin aikuisen hiiren hermoston kantasolujen uudelleenohjelmointiin [12]. Lopulta osoitettiin, että ainoa tekijä Oct-4 vaadittiin tähän transformaatioon. [13]

Useat tutkimukset ovat osoittaneet Oct-4:n roolin somaattisten kantasolujen (suoliston epiteeli, luuydin, verkkokalvo, aivot, maksa) itsensä uusiutumisen ylläpitäjänä. Rudolf Jenischin ryhmä lokakuussa 2007 ei osoittanut 4. lokakuuta vaikuttaneen hiirten somaattisten kantasolujen uusiutumiseen. [neljätoista]

Katso myös

Muistiinpanot

  1. Young Lab- Core Transkription säätelypiiri ihmisen alkion kantasoluissa Arkistoitu 28. kesäkuuta 2009. MIT: ssä
  2. 1 2 Niwa H., Miyazaki J., Smith AG Kvantitatiivinen ilmentyminen 3. lokakuuta 4 määrittelee ES-solujen erilaistumisen, erilaistumisen tai itsensä uusiutumisen   // Nat . Genet.  : päiväkirja. - 2000. - huhtikuu ( osa 24 , nro 4 ) . - s. 372-376 . - doi : 10.1038/74199 . — PMID 10742100 .
  3. Looijenga LH, Stoop H., de Leeuw HP, et ai . POU5F1 (OCT3/4) tunnistaa solut, joilla on pluripotentti potentiaali ihmisen sukusolukasvaimissa   // Cancer Research : päiväkirja. — American Association for Cancer Research, 2003. - Voi. 63 , no. 9 . - P. 2244-2250 . — PMID 12727846 .
  4. Zaehres H., Lensch MW, Daheron L., Stewart SA, Itskovitz-Eldor J., Daley GQ Tehokas RNA-häiriö ihmisen alkion kantasoluissa  //  Stem Cells : Journal. - 2005. - Voi. 23 , ei. 3 . - s. 299-305 . - doi : 10.1634/kantasolut.2004-0252 . — PMID 15749924 .
  5. 1 2 Rodda DJ, Chew JL, Lim LH ym . Nanogin transkription säätely OCT4:llä ja SOX2:lla  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. - 2005. - heinäkuu ( nide 280 , nro 26 ). - P. 24731-24737 . - doi : 10.1074/jbc.M502573200 . — PMID 15860457 .
  6. NCBI CDD smart00352 . Haettu: 20. kesäkuuta 2007.
  7. NCBI CDD cd00086 . Haettu: 20. kesäkuuta 2007.
  8. Hochedlinger K., Yamada Y., Beard C., Jaenisch R. Oct-4:n ektooppinen ilmentyminen estää progenitorisolujen erilaistumisen ja aiheuttaa dysplasiaa epiteelikudoksissa  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2005. - Voi. 121 , nro. 3 . - s. 465-477 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.02.018 . — PMID 15882627 .
  9. Okita K. , Ichisaka T. , Yamanaka S. Generation of germline-competent induced pluripotent stem cells.  (englanniksi)  // Luonto. - 2007. - Voi. 448, nro 7151 . - s. 313-317. - doi : 10.1038/luonto05934 . — PMID 17554338 .
  10. Wernig M. , Meissner A. , ​​Foreman R. , Brambrink T. , Ku M. , Hochedlinger K. , Bernstein BE , Jaenisch R. Fibroblastien in vitro uudelleenohjelmointi pluripotenttiin ES-solun kaltaiseen tilaan.  (englanniksi)  // Luonto. - 2007. - Voi. 448, nro 7151 . - s. 318-324. - doi : 10.1038/luonto05944 . — PMID 17554336 .
  11. Maherali N. , Sridharan R. , Xie W. , Utikal J. , Eminli S. , Arnold K. , Stadtfeld M. , Yachechko R. , Tchieu J. , Jaenisch R. , Plath K. , Hochedlinger K. Ohjelmoitu suoraan uudelleen fibroblastit osoittavat globaalia epigeneettistä uudelleenmuodostumista ja laajaa kudososuutta.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2007. - Voi. 1, ei. 1 . - s. 55-70. - doi : 10.1016/j.stem.2007.05.014 . — PMID 18371336 .
  12. Kim JB, Zaehres H., Wu G., Gentile L., Ko K., Sebastiano V., Araúzo-Bravo MJ, Ruau D., Han DW, Zenke M., Schöler HR Pluripotent stem cell induced from adult hermo stem solut ohjelmoimalla uudelleen kahdella tekijällä  //  Nature : Journal. - 2008. - Heinäkuu ( nide 454 , nro 7204 ). - s. 646-650 . - doi : 10.1038/luonto07061 . — PMID 18594515 .
  13. Kim JB, Sebastiano V., Wu G., Araúzo-Bravo MJ, Sasse P., Gentile L., Ko K., Ruau D., Ehrich M., van den Boom D., Meyer J., Hübner K. , Bernemann C., Ortmeier C., Zenke M., Fleischmann BK, Zaehres M., Schöler HR Oct4 -Induced Pluripotency in Adult Neural Stem Cells  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2009. - Helmikuu ( nide 136 , nro 3 ). - s. 411-419 . - doi : 10.1016/j.cell.2009.01.023 .
  14. Lengner CJ, Camargo FD, Hochedlinger K., et ai . Oct4-ilmentymistä ei vaadita hiiren somaattisten kantasolujen itsensä uusiutumiseen  // Cell  Stem Cell : päiväkirja. - 2007. - lokakuu ( osa 1 , nro 4 ). - s. 403-415 . - doi : 10.1016/j.stem.2007.07.020 . — PMID 18159219 .

Artikkelit lisälukemista varten

Linkit