POLR2A

Polypeptidi A RNA-polymeraasi II (ohjattu DNA)

Otettu käyttöön ATE : n 2GHQ perusteella .
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliPOLR2A  ; POLR2; POLRA; RPB1; RPBh1; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  180660 MGI :  98086 Homologeeni :  721 ChEMBL : 1641353 GeneCards : POLR2A-geeni
EY-numero2.7.7.48, 2.7.7.6
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez543020020
YhtyeENSG00000181222ENSMUSG00000005198
UniProtP24928P08775
RefSeq (mRNA)NM_000937NM_001291068
RefSeq (proteiini)NP_000928NP_001277997
Locus (UCSC)Chr 17:
7,39 – 7,42 Mb
Chr 11:
69,73 – 69,76 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

DNA-ohjatun RNA-polymeraasi II:n RPB1-alayksikkö , joka tunnetaan myös nimellä RPB1 , on POLR2A -geenin koodaama entsyymi ihmisissä .

Toiminto

Tämä geeni koodaa RNA-polymeraasi II :n suurta alayksikköä, polymeraasia, joka vastaa RNA -synteesistä eukaryooteissa . Tämän geenin tuote sisältää karboksyyliterminaalisen domeenin , joka koostuu polymeraasiaktiivisuuteen tarvittavista heptapeptiditoistoista . Nämä toistot sisältävät seriini- ja treoniinitähteitä, jotka ollessaan aktiivisia fosforyloivat RNA-polymeraasin transkription . Lisäksi tämä alayksikkö yhdessä joidenkin muiden polymeraasialayksiköiden kanssa muodostaa polymeraasi-DNA:ta sitovan domeenin, jossa lähetti-DNA transkriptoituu RNA:ksi. [yksi]

Vuorovaikutuksia

POLR2A:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa :

Muistiinpanot

  1. Entrez-geeni: POLR2A-polymeraasi (RNA) II (DNA-ohjattu) polypeptidi A, 220 kDa .
  2. Krum SA, Miranda GA, Lin C., Lane TF BRCA1 liittyy prosessiiviseen RNA-polymeraasi II  : een //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 2003. - joulukuu ( nide 278 , nro 52 ). - P. 52012-52020 . - doi : 10.1074/jbc.M308418200 . — PMID 14506230 .
  3. 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R., Anderson SF, Chao DM, Wei W., Ye L., Young RA, Livingston DM, Parvin JD BRCA1 on RNA-polymeraasi II   -holoentsyymin komponentti // Proceedings of the the Yhdysvaltain kansallinen tiedeakatemia  : aikakauslehti. - 1997. - toukokuu ( osa 94 , nro 11 ). - P. 5605-5610 . - doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . — PMID 9159119 .
  4. Chiba N., Parvin JD BRCA1:n uudelleenjakautuminen neljän eri proteiinikompleksin kesken replikaation eston jälkeen  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 2001. - lokakuu ( nide 276 , nro 42 ). - P. 38549-38554 . - doi : 10.1074/jbc.M105227200 . — PMID 11504724 .
  5. Krum SA, Womack JE, Lane TF Bovine BRCA1 osoittaa klassisia vasteita genotoksiseen stressiin, mutta alhainen in vitro transkription  aktivaatioaktiivisuus //  Onkogeeni : päiväkirja. - 2003. - syyskuu ( osa 22 , nro 38 ). - P. 6032-6044 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . — PMID 12955082 .
  6. 1 2 3 4 5 6 7 Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang XJ, Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. Ihmisen RNA-polymeraasi II -kompleksi, joka sisältää tekijöitä, jotka muokkaavat kromatiinin rakennetta  (englanti)  // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1998. - syyskuu ( osa 18 , nro 9 ). - P. 5355-5363 . — PMID 9710619 .
  7. Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA CA150, RNA-polymeraasi II -holoentsyymiin liittyvä ydinproteiini, osallistuu Tat-aktivoituun ihmisen immuunikatoviruksen tyypin 1  transkriptioon.)  // Molekyyli- ja solubiologia : päiväkirja. - 1997. - lokakuu ( osa 17 , nro 10 ). - P. 6029-6039 . — PMID 9315662 .
  8. Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely TJ, Florens L., Zybailov B., Swanson SK, Banks CA, Jin J., Cai Y., Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC Joukko konsensusnisäkäsvälittäjä alayksiköt, jotka tunnistetaan moniulotteisella proteiinintunnistustekniikalla  //  Molecular Cell : päiväkirja. - 2004. - Kesäkuu ( osa 14 , nro 5 ). - s. 685-691 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . — PMID 15175163 .
  9. 1 2 3 4 Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1997. - Heinäkuu ( nide 272 , nro 27 ). - P. 16815-16821 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
  10. Humbert S., Saudou F. Kohti soluspesifisyyttä SCA1  : ssä //  Neuron. - Cell Press , 2002. - Toukokuu ( nide 34 , nro 5 ). - s. 669-670 . - doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . — PMID 12062012 .
  11. 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE mSin3A:ta sisältävien Brg1- ja hBrm-kromatiiniremodeling-kompleksien puhdistus ja karakterisointi   // Genes & Development  : Journal. - 2001. - maaliskuu ( osa 15 , nro 5 ). - s. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
  12. 1 2 3 Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C., Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M., Workman JL, Crabtree GR Purification and biochemical heterogeneity of nisäkkään SWI-SNF-kompleksi  //  The EMBO Journal : päiväkirja. - 1996. - lokakuu ( osa 15 , nro 19 ). - P. 5370-5382 . — PMID 8895581 .
  13. Zhao K., Wang W., Rando OJ, Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree GR SWI/SNF:n kaltaisen BAF-kompleksin nopea ja fosfoinositoliriippuvainen sitoutuminen kromatiiniin T-lymfosyyttireseptorisignaloinnin jälkeen  .)  // Solu  : päiväkirja. - Cell Press , 1998. - marraskuu ( osa 95 , nro 5 ). - s. 625-636 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . — PMID 9845365 .
  14. Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva FP, Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 koodaa histonimetyylitransferaasia, joka osallistuu syöpäsolujen lisääntymiseen  (eng.)  // Nature Cell Biology  : lehti. - 2004. - elokuu ( osa 6 , nro 8 ). - s. 731-740 . - doi : 10.1038/ncb1151 . — PMID 15235609 .
  15. Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase  II )  // EMBO-lehti : päiväkirja. - 2002. - syyskuu ( osa 21 , nro 18 ). - P. 4950-4958 . - doi : 10.1093/emboj/cdf463 . — PMID 12234934 .
  16. Kim JB, Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp PA Tat-SF1-proteiini liittyy RAP30- ja ihmisen SPT5-proteiineihin   // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1999. - syyskuu ( osa 19 , nro 9 ). - P. 5960-5968 . — PMID 10454543 .
  17. Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog GA, Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a uusi transkription elongaatiotekijä, joka säätelee RNA-polymeraasi II:n prosessikykyä, koostuu ihmisen  Spt4- ja Spt5-homologeista  // Genes & Development  : Journal. - 1998. - Helmikuu ( osa 12 , nro 3 ) . - s. 343-356 . - doi : 10.1101/gad.12.3.343 . — PMID 9450929 .
  18. Conaway RC, Kong SE, Conaway JW TFIIS ja GreB: kaksi samanhenkistä transkription elongaatiotekijää tahmeilla sormilla  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - Elokuu ( osa 114 , nro 3 ). - s. 272-274 . — PMID 12914690 .
  19. Archambault J., Pan G., Dahmus GK, Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus ME, Greenblatt J. FCP1, ihmisen proteiinifosfataasin RAP74:n kanssa vuorovaikuttava alayksikkö, joka defosforyloi karboksyyliterminaalisen domeenin RNA-polymeraasi IIO  (englanti)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1998. - lokakuu ( nide 273 , nro 42 ). - P. 27593-27601 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27593 . — PMID 9765293 .
  20. Pan G., Aso T., Greenblatt J. Pidentymistekijöiden TFIIS ja elongiini A vuorovaikutus ihmisen RNA-polymeraasi II -holoentsyymin kanssa, joka kykenee käynnistymään promoottorispesifisesti ja reagoimaan transkription aktivaattoreihin  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1997. - syyskuu ( nide 272 , nro 39 ). - P. 24563-24571 . doi : 10.1074 / jbc.272.39.24563 . — PMID 9305922 .
  21. Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C., Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL Proteiinin vuorovaikutusmoduulit, jotka järjestävät ydintoiminnan:  CA150 :n FF-domeenit sitovat RNA-polymeraasi II:n fosfoCTD:tä  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerikan osavaltiot  : lehti. - 2000. - elokuu ( osa 97 , nro 16 ). - P. 9015-9020 . - doi : 10.1073/pnas.160266597 . — PMID 10908677 .
  22. Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. KRAB  / Cys2-His2 sinkkisormiproteiinin ZNF74 suora vuorovaikutus RNA-polymeraasi II:n suurimman alayksikön hyperfosforyloidun muodon kanssa  // Journal of Biological Chemistry  : päiväkirja. - 1997. - lokakuu ( nide 272 , nro 44 ). - P. 27877-27885 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.27877 . — PMID 9346935 .

Kirjallisuus

Linkit