POLR2D

Polypeptidi D RNA-polymeraasi II (ohjattu DNA)

ATE :tä edustaa esimerkki 2c35.

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
2C35

Tunnisteet

Symboli

POLR2D ; HSRBP4; HSRPB4; RBP4; RPB16

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 606017 MGI : 1916491 Homologeeni : 37968 GeneCards : POLR2D-geeni

EY-numero

2.7.7.6

Geeniontologia
Toiminto	• nukleotidien sitoutuminen • yksijuosteinen DNA-sitoutuminen • yksijuosteinen RNA-sitoutuminen • DNA-ohjattu RNA-polymeraasiaktiivisuus • translaation aloitustekijän sitoutuminen
solukomponentti	• sytoplasminen mRNA:ta prosessoiva elin • tuma • nukleoplasma • DNA-ohjattu RNA-polymeraasi II, ydinkompleksi
biologinen prosessi	• ydintranskriptoitu mRNA:n katabolinen prosessi, deadenylaatiosta riippuvainen hajoaminen • mRNA:n silmukointi silmukoinnin kautta • DNA:n korjaus • transkriptiokytkentäinen nukleotidi-leikkauskorjaus • nukleotidi-leikkauskorjaus • transkriptio RNA-polymeraasi II -promoottorista • transkription aloitus RNA-polymeraasi II-promoottorista • transkription pidentyminen RNA-polymeraasi II-promoottorista • 7-metyyliguanosiini capping • RNA:n silmukointi • geenin ilmentyminen • virusprosessi • mRNA:n vienti tumasta vasteena lämpöstressille • 3'-pään prosessointitekijöiden värvääminen RNA-polymeraasi II -holoentsyymikompleksiin • translaation aloituksen positiivinen säätely • viruksen transkription positiivinen säätely
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 2:
128,6 – 128,62 Mb

Chr 18:
31,79 – 31,8 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

DNA-riippuvaisen RNA-polymeraasi II:n RPB4-alayksikkö on entsyymi , jota ihmisissä koodaa POLR2D -geeni [1] .

Tämä geeni koodaa RNA-polymeraasi II : n neljänneksi suurinta alayksikköä , joka vastaa RNA -synteesistä eukaryooteissa . Hiivassa tämä polymeraasialayksikkö sitoutuu polymeraasiin suboptimaalisissa kasvuolosuhteissa ja sillä voi olla rooli stressisuojauksessa. Tämän geenitranskriptin transloimaton 3'-alue sisältää ribosomaalisen pseudogeenin sekvenssin [ 2 ] .

Muistiinpanot

↑ Khazak V., Estojak J., Cho H., Majors J., Sonoda G., Testa JR, Golemis EA Analyysi uuden RNA-polymeraasi II (pol II) -alayksikön hsRPB4 vuorovaikutuksesta sen kumppanin hsRPB7 ja pol II kanssa (eng.) // Mol Cell Biol : päiväkirja. - 1998. - Toukokuu ( osa 18 , nro 4 ). - P. 1935-1945 . — PMID 9528765 .
↑ Entrez-geeni: POLR2D-polymeraasi (RNA) II (DNA-ohjattu) polypeptidi D. (määrätön)

Kirjallisuus

Zhang KT Tat, Tat-assosioitunut kinaasi ja transkriptio. (englanniksi) // J. Biomed. sci. : päiväkirja. - 1998. - Voi. 5 , ei. 1 . - s. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkription ohjaus: Tat-kofaktorit ja transkription venymä. (englanniksi) // Curr. Biol. : päiväkirja. - 1998. - Voi. 8 , ei. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., et ai. Cdk9:n ja sykliini T1:n säätelytoiminnot HIV tat-transaktivaatioreitin geeniekspressiossa. (englanniksi) // J. Cell. Biochem. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 75 , no. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Useita transkription säätelytapoja HIV-1 Tat -transaktivaattorilla. (englanniksi) // IUBMB Life: Journal. - 2002. - Voi. 51 , nro. 3 . - s. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. HIV-1-transkription säätely: kemoterapeuttisten toimenpiteiden molekyylikohteet. (englanniksi) // Med Res Rev : Journal. - 2007. - Voi. 26 , nro. 5 . - s. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., et ai. Johtavatko erilaiset Tat-vuorovaikutukset uusiin antiretroviraalisiin lääkekohteisiin? (eng.) // Nykyiset lääkekohteet : Journal. - 2007. - Voi. 7 , ei. 12 . - s. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et ai. HIV-1 Tat toimii prosessointitekijänä in vitro yhdessä solujen elongaatiotekijöiden kanssa. (englanniksi) // Genes Dev. : päiväkirja. - 1992. - Voi. 6 , ei. 4 . - s. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Transkription aktivointi HIV-1 Tat-proteiinilla, joka on kytketty syntymässä olevaan RNA:han toisen proteiinin kautta. (englanti) // Luonto: päiväkirja. - 1990. - Voi. 345 , no. 6276 . - s. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB RNA-polymeraasi II:n spesifistä sitoutumista ihmisen immuunikatoviruksen transaktivoivaan alueeseen RNA:ta säätelevät solun kofaktorit ja Tat. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1995. - Voi. 92 , no. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiinit liittyvät spesifisesti soluproteiinikinaasiin, TAK, joka hyperfosforyloi RNA-polymeraasi II:n suuren alayksikön karboksyyliterminaalisen domeenin: Tat-kofaktorin ehdokas. (englanniksi) // J. Virol. : päiväkirja. - 1995. - Voi. 69 , ei. 3 . - s. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Ihmisen immuunikatovirus tyyppi 1 Tat on olennainen komponentti aktivoidussa transkriptio-pidennyskompleksissa. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1996. - Voi. 93 , ei. 6 . - P. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP . Ihmisen immuunikatoviruksen Tat-proteiinit liittyvät spesifisesti TAK:iin in vivo ja vaativat RNA-polymeraasi II:n karboksiterminaalisen domeenin toimiakseen. (englanniksi) // J. Virol. : päiväkirja. - 1996. - Voi. 70 , ei. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F. et ai. Ihmisen immuunikatoviruksen tyypin 1 Vpr-transaktivaattori: yhteistyö promoottoriin sitoutuneiden aktivaattoridomeenien kanssa ja sitoutuminen TFIIB:hen. (englanniksi) // J. Mol. Biol. : päiväkirja. - 1996. - Voi. 261 , nro. 5 . - s. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktori transkription pidentymisen stimuloimiseksi HIV-1 Tat:lla. (englanniksi) // Tiede: lehti. - 1996. - Voi. 274 , nro. 5287 . - s. 605-610 . - doi : 10.1126/tiede.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, et ai. Ihmisen immuunikatoviruksen Tat-proteiinin transaktivaatio vaatii RNA-polymeraasi II:n C-terminaalisen domeenin. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1996. - Voi. 93 , ei. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Vaatimukset RNA-polymeraasi II:n karboksyyliterminaaliselle domeenille ihmisen retrovirusten ihmisen T-solulymfotrooppisen virus I ja HIV-1:n transkriptiolle. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 1996. - Voi. 271 , nro. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG RNA-polymeraasi II:n tehostettu prosessoivuus, jonka sen karboksiterminaalisen domeenin Tat-indusoitu fosforylaatio laukaisee. (englanti) // Luonto: päiväkirja. - 1996. - Voi. 384 , no. 6607 . - s. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat puhdistetuilla HIV-1- ja HIV-2-transkription preinitiation komplekseilla. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 272 , nro. 11 . - P. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .
Cujec TP, Cho H., Maldonado E. et ai. Ihmisen immuunikatoviruksen transaktivaattori Tat on vuorovaikutuksessa RNA-polymeraasi II -holoentsyymin kanssa. (englanniksi) // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 17 , ei. 4 . - P. 1817-1823 . — PMID 9121429 .
García-Martinez LF, Mavankal G., Neveu JM, et ai. Tat-assosioituneen kinaasin puhdistaminen paljastaa TFIIH-kompleksin, joka moduloi HIV-1-transkriptiota. (englanniksi) // EMBO J. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 16 , ei. 10 . - P. 2836-2850 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2836 . — PMID 9184228 .