TCF4
TCF4
|
---|
|
|
|
Symbolit
| TCF4 , E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transkriptiotekijä 4, CDG2T |
---|
Ulkoiset tunnukset |
OMIM: 602272 MGI: 98506 Homologi: 2407 GeneCards: 6925
|
---|
|
Sairauden nimi |
Linkit |
---|
sairaalloisen lihavuuden |
|
skitsofrenia |
|
haavainen paksusuolitulehdus |
|
sklerosoiva kolangiitti |
|
Sarveiskalvon endoteelin dystrofia |
|
Pitt-Hopkinsin oireyhtymä |
|
Toiminnot |
• proteiinien dimerisaatioaktiivisuus • proteiinin homodimeroituminen • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA:ta sitovan transkriptiotekijän aktiivisuus • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001212, GO:0001, DNA2012013, GO20101, -sitoutuva transkriptioaktivaattoriaktiivisuus, RNA-polymeraasi II -spesifinen • bHLH-transkriptiotekijän sitoutuminen • E-boxin sitoutuminen • proteiinin C-pään sitoutuminen • GO:0001948, GO:0016582 sitoutuminen plasman proteiineihin • samanlainen proteiinisitoutuminen • TFIIB-luokan transkriptiotekijän sitoutuminen • proteiinien heterodimerointiaktiivisuus • DNA:ta sitova • GO:0000980 RNA-polymeraasi II:n cis-säätelyalueen sekvenssispesifinen DNA-sitoutuminen • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA:ta sitova transkriptiotekijäaktiivisuus, RNA-polymeraasi II-spesifinen
|
---|
solukomponentti |
• transkription säätelijäkompleksi • solun ydin • beeta-kateniini-TCF-kompleksi • beeta-kateniini-TCF7L2-kompleksi
|
---|
biologinen prosessi |
• Solujen erilaistuminen • GO:0009373 DNA-riippuvainen transkription säätely • proteiini-DNA-kompleksin kokoonpano • transkriptio, DNA-riippuvainen • hermoston kehitys • GO:0060469, GO:0009371 DNA-riippuvainen transkription positiivinen säätely • DNA-templaatti transkriptio, aloitus • transkription aloitus RNA-polymeraasi II -promoottorista • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 transkription positiivinen säätely RNA-polymeraasi II -promoottorilla • hermosolujen erilaisuuden positiivinen säätely
|
---|
Lähteet: Amigo / QuickGO | |
Erilaisia |
Ihmisen |
Hiiri |
---|
Entrez |
|
|
---|
Yhtye |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (proteiini) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 18: 55,22 – 55,66 Mb
| Chr 18: 69,34 – 69,69 Mb
|
---|
PubMed- haku |
[9]
| [kymmenen] |
---|
Muokkaa (ihminen) | Muokkaa (hiiri) |
TCF-4 ( englanniksi Transkriptiotekijä 4 ) tai Transkriptiotekijä 4 , joka tunnetaan myös nimellä immunoglobuliinin transkriptiotekijä 2 ( ITF-2 ), on proteiini, jota ihmisissä koodaa kromosomissa 18q21.2 sijaitseva TCF4-geeni [1] .
Toiminto
TCF4-proteiini toimii transkriptiotekijänä, joka sitoutuu mu-E5/kappa-E2-immunoglobuliinin tehostaja-motiiviin. TCF4 aktivoi transkription sitoutumalla E-boxiin (5'-CANNTG-3'), joka löytyy yleisesti SSTR2 -INR: stä tai somatostatiinireseptorin 2 aloituselementistä . TCF4 osallistuu ensisijaisesti sikiön neurologiseen kehitykseen raskauden aikana käynnistämällä hermoston erilaistumisen sitoutumalla DNA:han. Sitä esiintyy keskushermostossa, somiiteissa ja progenitorisukurauhasissa varhaisessa kehityksessä. Myöhemmissä kehitysvaiheissa sitä löytyy kilpirauhasesta, kateenkorvasta ja munuaisista, kun taas aikuisiässä TCF4:ää löytyy lymfosyyteistä, lihaksista, kypsistä hermosoluista ja ruoansulatuskanavasta [2] [3] [4] .
Kliininen merkitys
TCF4:n mutaatiot aiheuttavat Pitt-Hopkinsin oireyhtymän (PTHS). Nämä mutaatiot aiheuttavat sen, että TCF4-proteiinit eivät sitoudu kunnolla DNA:han ja hallitse hermoston erilaistumista. Useimmissa tutkituissa tapauksissa mutaatiot olivat de novo, eli kyseessä oli uusi mutaatio, jota ei löytynyt muilta potilaan perheenjäseniltä. Pitt-Hopkinsin oireyhtymän yleisiä oireita ovat leveä suu, maha-suolikanavan ongelmat, hidastunut hienomotorinen kehitys, puhe- ja hengitysongelmat, epilepsia ja muut aivovauriot [5] [6] .
Muistiinpanot
- ↑ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (helmikuu 1990). ITF-2:ta, positiivisesti toimivaa transkriptiotekijää koodaavan cDNA:n sekvenssi . Nukleiinihappotutkimus . 18 (3): 678. doi : 10.1093/nar/ 18.3.678 . PMC 333500 . PMID2308860 . _
- ↑ de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et ai. (huhtikuu 2009). "TCF4-geenin mutaatio-, toiminnalliset ja ilmentymistutkimukset Pitt-Hopkinsin oireyhtymässä." Ihmisen Mutaatio . 30 (4): 669-76. DOI : 10.1002/humu.20935 . PMID 19235238 .
- ↑ Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (joulukuu 1996). "Heliksi-silmukka-heliksi-transkriptiotekijä SEF-2 säätelee uuden aloituselementin aktiivisuutta ihmisen somatostatiinireseptori II -geenin promoottorissa. " EMBO-lehti . 15 (23): 6680-90. DOI : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x . PMC 452492 . PMID 8978694 .
- ↑ D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammed; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (12.4.2016). Tyypin I bHLH-proteiinit Daughterless- ja Tcf4-proteiinit rajoittavat neuriittien haarautumista ja synapsien muodostumista estämällä neureksiinia postmitoottisissa neuroneissa . Soluraportit . 15 (2): 386-397. DOI : 10.1016/j.celrep.2016.03.034 . ISSN 2211-1247 . PMC 4946342 . PMID27050508 _ _
- ↑ Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et ai. (toukokuu 2007). "TCF4:n mutaatiot, jotka koodaavat luokan I perushelix-loop-helix-transkriptiotekijää, ovat vastuussa Pitt-Hopkinsin oireyhtymästä, vakavasta epileptisesta enkefalopatiasta, joka liittyy autonomiseen toimintahäiriöön . " American Journal of Human Genetics . 80 (5): 988-93. DOI : 10.1086/515582 . PMC 1852736 . PMID 17436254 .
- ↑ Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J et ai. (toukokuu 2007). "TCF4:n haploinsufektiivisuus aiheuttaa syndromaalista kehitysvammaisuutta ja ajoittaista hyperventilaatiota (Pitt-Hopkinsin oireyhtymä)" . American Journal of Human Genetics . 80 (5): 994-1001. DOI : 10.1086/515583 . PMC 1852727 . PMID 17436255 .