SARS-CoV-2 beeta-kanta

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 9. kesäkuuta 2022 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 2 muokkausta .

Koronaviruksen SARS-CoV-2 beetakanta [1] , joka tunnetaan myös nimellä 501.V2, 20C/501Y.V2 tai B.1.351 [ ]2 [4] ) on SARS-CoV-kanta. 2 virus , joka aiheuttaa COVID-19:n . Tämä kanta havaittiin ensimmäisen kerran Nelson Mandela Bayn alueella [5] Etelä-Afrikan itäosassa [6] , kuten Etelä-Afrikan terveysministeriö raportoi 18. joulukuuta 2020 [7] .

Siivilöi

Tutkijat ja virkamiehet raportoivat, että tämän kannan esiintyvyys oli suurempi nuorten keskuudessa, joilla ei ollut perussairauksia, ja muihin kantoihin verrattuna se todennäköisemmin johtaa vakavaan sairauteen tällaisissa tapauksissa. Etelä-Afrikan terveysministeriö on myös ilmoittanut, että tämä kanta saattaa aiheuttaa COVID-19-pandemian toista aaltoa maassa, koska kanta leviää nopeammin kuin muut aikaisemmat viruskannat.

Tutkijat huomauttivat, että tämä kanta sisältää useita mutaatioita, jotka mahdollistavat sen kiinnittymisen helpommin ihmissoluihin johtuen kolmesta mutaatiosta viruksen piikkiglykoproteiinin reseptoria sitovassa domeenissa (RBD): N501Y (aminohappo asparagiini (N) on korvattu) aminohappotyrosiini (Y) asemassa 501), K417N ja E484K. Kaksi näistä mutaatioista (E484K ja N501Y) on reseptoria sitovan domeenin (RBD) reseptoria sitovassa motiivissa (RBM).

N501Y-mutaatio löydettiin myös 202012/01-kannasta , joka on laajalle levinnyt Isossa-Britanniassa. Kaksi muuta 501.V2:sta löydettyä mutaatiota, E484K ja K417N, puuttuvat brittiläisestä kannasta. Lisäksi 501.V2:lla ei ole toisesta kannasta löydettyä 69-70del-mutaatiota.

Discovery

Uusi kanta löydettiin koko genomin sekvensoinnilla. Useita genomisia sekvenssejä tästä linjasta on lähetetty GISAID-geenisekvenssitietokantaan, esimerkiksi sekvenssi EPI_ISL_678597.

Kansainvälinen jakelu

Matt Hancock ilmoitti 23. joulukuuta, että kaksi Etelä-Afrikasta Isoon-Britanniaan matkustanutta ihmistä oli saanut 501.V2-tartunnan. Joulukuun 28. päivänä tämä kanta löydettiin kahdelta henkilöltä Sveitsissä ja yhdeltä henkilöltä Suomessa. Joulukuun 29. päivänä kanta havaittiin Etelä-Afrikasta Japaniin matkustaneelta ja kansainväliseltä matkustajalta Queenslandissa, Australiassa. 30. joulukuuta kanta havaittiin Sambiassa. Joulukuun 31. päivänä se löydettiin myös Ranskasta Etelä-Afrikasta palanneelta matkustajalta. 2. tammikuuta 2021 Etelä-Koreassa havaittiin ensimmäinen tämän kannan aiheuttama infektiotapaus. Itävalta ilmoitti ensimmäisestä tartuntatapauksestaan ​​tämän kannan kanssa sekä neljästä brittikannan tartunnan tapauksesta 4. tammikuuta. Irlanti ilmoitti 8. tammikuuta 2021 löytäneensä kolme tämän kannan tapausta, jotka kaikki liittyivät matkustamiseen Etelä-Afrikasta.

Venäjällä tämä kanta tunnistettiin ensimmäisen kerran maaliskuussa 2021 [8] .

Rokoteherkkyys

The Telegraph raportoi 4. tammikuuta 2021, että oxfordin immunologi Sir John Bell uskoo, että uusi eteläafrikkalainen kanta herättää "ison kysymyksen", koska se voisi olla vastustuskykyinen rokotteille, mikä tuhoaa toiveet ja korvaa ne pelolla [9] . Samana päivänä rokotusprofessori Shabir Madhi kertoi CBS Newsille, ettei ole varmuutta siitä, että uusi 501.V2-kanta pystyy "ohittamaan" rokotteen suojan, mutta hän uskoo, että se "voi olla vähemmän tehokas" [10 ] . Readingin yliopiston solumikrobiologian apulaisprofessori Simon Clarke mainitsi lisämutaatiot piikkiproteiinissa 501.V2-kannassa, koska ne "voivat tehdä viruksesta vähemmän herkkiä rokotteen aiheuttamalle immuunivasteelle". Lawrence Young, Warwickin yliopiston virologi, totesi myös, että tämän kannan useat piikkimutaatiot "voivat johtaa johonkin pakoon immuunipuolustukselta" [11] .

Jotkut tutkimukset osoittavat tämän kannan karkaavan SARS-CoV-2-piikkiproteiiniin kohdistuvasta neutraloivasta multiklonaalisesta vasta-aineesta [12] [13] .

BioNTechin toimitusjohtaja Ugur Sahin totesi, että lisätutkimuksia tarvitaan varmistaakseen, että yhtiön nykyinen rokote toimii 501.V2-kantaa vastaan, mutta jos rokotetta on säädettävä, yritys voi tehdä sen noin 6 viikossa [ 14] .

The Guardian raportoi 8. tammikuuta, että Pfizerin ja BioNTechin COVID-19-rokote on osoittanut 20 verikoetta sisältävissä testeissä, että se pystyy tarjoamaan suojan 501.V2-kantaa vastaan. Lisätutkimusta tarvitaan tarkan suojaustason määrittämiseksi [15] .

Moderna aikoo testata uutta versiota rokotteestaan , joka on erityisesti muunnettu suojaamaan 501.V2-kantaa vastaan ​​[16] , Novavax ryhtyy vastaaviin toimenpiteisiin [17] . Johnson & Johnsonin Ad26.COV2.S- rokotteen kliinisen tutkimuksen mukaan sen tehokkuus Etelä-Afrikassa on 15 % alhaisempi kuin Yhdysvalloissa (57 % ja 72 %). ero liittyy luultavasti 501.V2-kannan esiintyvyyteen Etelä-Afrikassa [18] . Toinen rokotetutkimus ( Novavaxin NVX- CoV2373) osoitti [17] [19] 60 prosentin tehokkuuden (HIV-negatiivisilla osallistujilla) Etelä-Afrikassa verrattuna 90 prosentin tehoon Yhdistyneessä kuningaskunnassa. Reutersin mukaan Pfizer-rokote on vain hieman vähemmän tehokas 501.V2:ta vastaan ​​[20] . AstraZeneca aikoo mukauttaa rokotteensa tähän kantaan, ja uuden rokotteen pitäisi olla valmis syksyyn 2021 mennessä [21] .

Moderna ilmoitti 24. helmikuuta 2021 aloittavansa rokotteensa uuden version kliiniset tutkimukset. Uusi versio on suunniteltu erityisesti torjumaan 501.V2 [22] [23] .

Mutaatio E484K

Muutoksen E484K-aminohapossa, reseptoria sitovan domeenin (RBD) mutaatiossa, on raportoitu "liittyvän neutraloivien vasta-aineiden karkaamiseen", mikä voi vaikuttaa haitallisesti piikkiproteiiniin kohdistuvien COVID-rokotteiden tehokkuuteen [24] [25 ] ] . Piikkimutaatio E484K on yhdistetty tapaukseen, jossa 501.V2 SARS-CoV-2 -kanta on tartuttu uudelleen Brasiliassa, mikä oli tutkijoiden mukaan ensimmäinen tapaus, jossa tämän mutaation sisältävän kannan uusi tartuntatapaus [26] .

Tilastot

Tapaukset maittain (9.1.2021 alkaen)
Maa Vahvistetut tapaukset päivämäärä Lähteet
Iso-Britannia 2 23. joulukuuta 2020 [27]
Sveitsi 2 28. joulukuuta 2020 [28]
Suomi yksi 28. joulukuuta 2020 [29]
Japani yksi 29. joulukuuta 2020 [kolmekymmentä]
Australia yksi 29. joulukuuta 2020 [31]
Sambia yksi 30. joulukuuta 2020 [32]
Ranska yksi 31. joulukuuta 2020 [33]
Etelä-Korea yksi 2. tammikuuta 2021 [34]
Itävalta yksi 4. tammikuuta 2021 [35]
Irlanti 3 8. tammikuuta 2021 [36]
Kanada yksi 8. tammikuuta 2021 [37]
Maailmanlaajuisesti (11 muuta maata) viisitoista

Katso myös

Muistiinpanot

  1. ↑ WHO päätti nimetä koronaviruskannat kreikkalaisten aakkosten kirjaimilla . "Koronaviruksen COVID-19 variantit merkitään kreikkalaisten aakkosten kirjaimilla, jotta ei tehdä eroa niiden maiden välillä, joissa nämä kannat löydettiin ensimmäisen kerran, ja ääntämisen helpottamiseksi ei-tieteellisessä keskustelussa, Maailman terveysjärjestö (WHO) Kuka sanoi. Uuden järjestelmän mukaan koronaviruksen B.1.1.7 "brittiläinen" kanta tulee nimeksi "Alpha", ensimmäisen kerran Etelä-Afrikasta löydetystä variantista B.1.351 tulee "Beta" ja brasilialainen P.1 - " Gamma". Koronaviruksen "intialaisen" kannan kahta alalajia - B.1.617.2 ja B.1.617.1 - kutsutaan "Delta" ja "Kappa". Haettu 28. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 28. kesäkuuta 2021.
  2. ↑ CDC. Koronavirustauti 2019 (COVID-19  )  ? . Tautien torjunta- ja ehkäisykeskukset (11. helmikuuta 2020). Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 15. toukokuuta 2021.
  3. ↑ Afrikkalainen koronaviruskanta kyseenalaisti rokotteiden tehokkuuden . www.mk.ru _ Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 11. tammikuuta 2021.
  4. ↑ Uusi 'eteläafrikkalainen' koronaviruksen kanta saapuu Ranskaan . lenta.ru . Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 4. tammikuuta 2021.
  5. ↑ SA saavuttaa miljoonan Covid-19-tapauksen  synkän virstanpylvään . www.iol.co.za. _ Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 26. toukokuuta 2021.
  6. ↑ Covid: Etelä-Afrikassa on yli miljoona tartuntaa tapausten lisääntyessä , BBC News  (28.12.2020). Arkistoitu alkuperäisestä 11. helmikuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  7. ↑ Fink, Sheri . Etelä-Afrikka julkistaa uuden koronaviruksen muunnelman. , The New York Times  (18. joulukuuta 2020). Arkistoitu alkuperäisestä 21. joulukuuta 2020. Haettu 9.1.2021.
  8. ↑ Venäjällä tunnistettu koronaviruksen COVID-19 kannat - RIA Novosti, 21.10.2021
  9. ↑ Knapton, Sarah . Eteläafrikkalainen variantti saattaa välttää rokotteet ja testaukset, varoittaa tutkijat , The Telegraph  (4. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 15. joulukuuta 2021. Haettu 5.1.2021.
  10. ↑ COVID-rokotteet "eivät ehkä" toimi yhtä hyvin Etelä-Afrikan kannassa, tutkijat   varoittavat ? . www.cbsnews.com . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 3. joulukuuta 2021.
  11. ↑ Yhdistyneen kuningaskunnan tutkijat pelkäävät, että rokotteet eivät ehkä suojaa Etelä-Afrikasta löydetyltä koronaviruksen variantilta | CBC News , CBC . Arkistoitu alkuperäisestä 5. tammikuuta 2021. Haettu 5.1.2021.
  12. ↑ Yiska Weisblum, Fabian Schmidt, Fengwen Zhang, Justin DaSilva, Daniel Poston. Paeta neutraloivia vasta-aineita SARS-CoV-2-  piikkiproteiinimuunnoksilla // eLife. - T. 9 . — ISSN 2050-084X . - doi : 10.7554/eLife.61312 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. tammikuuta 2021.
  13. ↑ Lyhyt raportti: SARS-CoV-2:n uusi varianttikanta tunnistettu Brasiliasta tulevilta matkustajilta . Haettu 24. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 15. tammikuuta 2021.
  14. ↑ BioNTech-rokote uudelle COVID-19-variantille voi olla valmis kuudessa  viikossa . euronews (22.12.2020). Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 8. tammikuuta 2021.
  15. ↑ Geddes, Linda . The Guardian  (8. tammikuuta 2021) tutkimuksen mukaan Pfizer-rokote suojaa uusia Covid-variantteja vastaan . Arkistoitu alkuperäisestä 8. tammikuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  16. ↑ Grady, Denise . Moderna sanoo, että rokote suojaa edelleen virusvariantteja vastaan , The New York Times  (25. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 25. tammikuuta 2021. Haettu 25.1.2021.
  17. ↑ 1 2 Novavax COVID-19 -rokote osoittaa 89,3 %:n tehokkuuden Ison-Britannian vaiheen 3 kokeessa | Novavax Inc. - IR-sivusto  (englanniksi) . www.novavax.com . Haettu 30. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 6. kesäkuuta 2021.
  18. ↑ Johnson & Johnson raportoi COVID-19-rokotteensa tehokkuudesta . RBC . Haettu 29. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 29. tammikuuta 2021.
  19. ↑ Novavax kohoaa Covid-rokotekokeen positiivisten tulosten jälkeen , Bloomberg.com  (28. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 29. tammikuuta 2021. Haettu 29.1.2021.
  20. ↑ Geddes, Linda . The Guardian  (8. tammikuuta 2021) tutkimuksen mukaan Pfizer-rokote suojaa uusia Covid-variantteja vastaan . Arkistoitu alkuperäisestä 8. tammikuuta 2021. Haettu 1. helmikuuta 2021.
  21. ↑ AstraZeneca mukauttaa rokotteen taistelemaan Etelä-Afrikan COVID-19-kantaa vastaan . RBC . Haettu 12. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 13. helmikuuta 2021.
  22. ↑ Moderna ilmoitti kehittävänsä rokotteen eteläafrikkalaista COVID-19-kantaa vastaan ​​- Interfax . Haettu 26. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 27. helmikuuta 2021.
  23. ↑ Berkeley Lovelace Jr. Moderna aloittaa kliiniset tutkimukset Covid-tehosterokotuksista Etelä-Afrikan variantille, lähettää NIH:lle tutkimuksia varten  . CNBC (24. helmikuuta 2021). Haettu 26. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 25. helmikuuta 2021.
  24. ↑ Uusi virusmutaatio herättää rokotteita koskevia  kysymyksiä . Ranska 24 (13. tammikuuta 2021). Haettu 24. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 31. elokuuta 2021.
  25. ↑ Ewen Callaway. Voivatko uudet COVID-muunnelmat heikentää rokotteita? Labs yrittää selvittää   // Luonto . – 07.01.2021. — Voi. 589 , iss. 7841 . — s. 177–178 . - doi : 10.1038/d41586-021-00031-0 . Arkistoitu alkuperäisestä 20. joulukuuta 2021.
  26. ↑ Brito, Ricardo . Eteläafrikkalainen koronaviruksen variantti havaittu uudelleentartuntatapauksessa Brasiliassa , Reuters  (9.1.2021). Arkistoitu alkuperäisestä 28. tammikuuta 2021. Haettu 24.1.2021.
  27. ↑ Vahvistetut COVID-19-variantin tapaukset Etelä-Afrikasta, jotka on tunnistettu Isossa-Britanniassa . Yhdistyneen kuningaskunnan hallitus . Haettu 23. joulukuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 23. joulukuuta 2020.
  28. ↑ Eteläafrikkalainen Covid-variantti löydetty Sveitsistä . liiketoiminnan sisäpiiriläinen . Haettu 29. joulukuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 19. marraskuuta 2021.
  29. ↑ Päivitys: Suomessa havaittu uusia Iso-Britannian, Etelä-Afrikan variantteja Covid-kantoja . Ylen uutiset . Haettu 29. joulukuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 31. lokakuuta 2021.
  30. ↑ Etelä-Afrikan koronaviruksen variantti löydetty   Japanista ? . Uutiset24 . Haettu 29. joulukuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 19. marraskuuta 2021.
  31. ↑ Ensimmäinen "tarttuvampi" koronaviruskannan tapaus havaittu Australiassa . 9 Uutiset (29.12.2020). Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 19. marraskuuta 2021.
  32. ↑ Sambia kokee Covid-19:n toisen aallon varianttina, joka liittyy uuteen kantaan Etelä-Afrikassa eristettynä  , Luksaka Times (  30.12.2020). Arkistoitu alkuperäisestä 7. tammikuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  33. ↑ Ranskassa on havaittu ensimmäinen koronaviruksen eteläafrikkalaisen muunnelman tapaus, terveysministeriö ilmoitti torstaina , France 24  (31.12.2020). Arkistoitu 19. marraskuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  34. ↑ 남아공 '변이 코로나' 첫 국내 확인…영국발 변이도 4건 추가  (korea) , Donga Ilbo 20.21. Arkistoitu 19. marraskuuta 2021. Haettu 13. kesäkuuta 2021.
  35. ↑ Ellyatt, Holly . Etelä-Afrikasta löydetty Covid-variantti huolestuttaa asiantuntijoita: Tässä on mitä tiedämme toistaiseksi , CNBC  (6. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 7. tammikuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  36. ↑ Kansallisen kansanterveyden hätätyöryhmän lausunto - perjantai 8. tammikuuta . Irlannin hallitus . Terveysministeriö (8. tammikuuta 2021). Haettu 8. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 7. joulukuuta 2021.
  37. ↑ Alberta raportoi Kanadan ensimmäisen Etelä-Afrikasta löydetyn koronaviruksen variantin tapauksen . CBC News (8. tammikuuta 2021). Haettu 9. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 9. tammikuuta 2021.

Linkit