SARS-CoV-2 -kannat

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 5.6.2022 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 3 muokkausta .

SARS-CoV-2-kannat  ovat SARS-CoV-2- koronaviruksen lajikkeita, joita pidetään erityisen tärkeinä [1] . WIV04/2019 geneettinen sekvenssi on todennäköisesti alkuperäinen kanta , joka tartuttaa ihmisiä, ja joka tunnetaan nimellä "geneettinen sekvenssi nolla" [2] .

Ne on merkitty kreikkalaisten aakkosten kirjaimilla .

Nimeämisjärjestelmä

Maailman terveysjärjestö , joka yritti olla käyttämättä georeferenssiä uuden koronaviruksen kantojen nimissä [3] , päätti toukokuussa 2021 nimetä ne kreikkalaisten aakkosten kirjaimilla. Tämä ei sisällä nimiä "British", "Brasilia" jne., jotka liittyvät niiden maiden nimiin, joissa vastaavat kannat löydettiin ensimmäisen kerran [4] . Erityisesti uusi SARS-CoV-2-kanta, joka löydettiin marraskuussa 2021, nimettiin "omicroniksi" [5] .

Samaan aikaan kirjainten " nu " ja " xi " käytöstä luovuttiin [6] : ensimmäinen muistuttaa englanninkielistä sanaa new (uusi) ja toinen - kiinalaista sukunimeä Xi, joka on erityisesti Xi . Jinping [7] [8] .

Pivot-taulukko

Riski:   hyvin pitkä   korkea   keskiverto   lyhyt

Nimi Ensimmäinen löytö Merkittäviä mutaatioita Kliiniset muutokset
WHO pangoliini Paikka päivämäärä Siirrettävyys Kuolleisuus
Beeta B.1.351
Etelä-Afrikka 		toukokuu 2020 N501Y, K417N, E484K +25 % (20–30 %) [9] Mahdollisesti lisääntymässä
Epsilon B.1.427,
B.1.429
USA 		Heinäkuu 2020 +20 % (19-24 %)
lambda C.37
Peru 		Elokuu 2020
Alpha B.1.1.7
Iso-Britannia 		20. syyskuuta 2020 [10] N501Y, 69-70del, P681H +29 % (24–33 %) [9] +59 % (44-74 %)
Delta B.1.617.2
Intia 		Lokakuu 2020 L452R, T478K, P681R +97 % (76–117 %) [9] [11] +137 % (50–230 %) [12]
Gamma B.1.1.28
(P.1)
Brasilia 		Marraskuu 2020 K417T, E484K, N501Y +38 % (29–48 %) [9] +50 % (20-90 %)
Zeta B.1.1.28
(P.2)
Brasilia 		Marraskuu 2020
Iota B.1.526
USA 		Marraskuu 2020
Tämä B.1.525
UK Nigeria

Joulukuu 2020
Kappa B.1.617.1
Intia 		Joulukuu 2020
Mu B.1.621
Kolumbia 		Tammikuu 2021
Theta B.1.1.28
(P.3)
Filippiinit 		Helmikuu 2021
Omicron B.1.1.529
Etelä-Afrikka Botswana

8. marraskuuta 2021 [13] Kasvanut [14] [15] −75 % [16] [Comm. yksi]

Hoards

Vastaavuustaulukko SARS-CoV-2-lajikkeiden eri nimille
Linjat Rambaut ja muiden mukaan. Huomautuksia Rambautista et ai. Nextstrain clades [ GISAID klades [ Merkittävät kannat tai mutaatiot
A.1-A.6 19B S
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13 – B.16 19A L
O
B.2 V
B.1 B.1.5–B.1.72 20A G Rambaut et ai.:n linja B.1 sisältää kannat, joissa on mutaatio D614G
B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37 GH
B.1.3–B.1.66 20C Sisältää kannan 501.V2
B.1.1 20B GR Sisältää kannat 202012/01 , kannat B.1.1.207 ja B.1.1.284
B.1.177 20A.EU1 [17] GV

Luonnossa on useita tuhansia SARS-CoV-2-viruksen kantoja. Ne on yleensä ryhmitelty suuriin ryhmiin, joita kutsutaan kladeiksi . SARS-CoV-2:lle on ehdotettu useita erilaisia ​​kladinimikkeitä.

Merkittävät viruskannat

Strains of Concern (VOC)

Alla on WHO:n huolenaiheiksi luetteloimat kannat (Variants of Concern) [18] .

Alfa (rivi B.1.1.7)

Kanta 202012/01 (VOC-202012/01), joka tunnettiin aiemmin ensimmäisenä tarkastelun kohteena olevana kannana joulukuussa 2020 (VUI - 202012/01) ja myös linjana B.1.1.7 tai 20B/501Y.V1, havaittiin ensimmäisen kerran lokakuuta 2020 Britannian COVID-19-pandemian aikana edellisessä kuussa otetusta näytteestä. Sen jälkeen sen mahdollisuudet olla hallitsevassa asemassa ovat kaksinkertaistuneet 6,5 päivän välein (arvioitu sukupolviväli). Tämä korreloi COVID-19:n ilmaantuvuuden merkittävän lisääntymisen kanssa Isossa-Britanniassa. Tämän kasvun uskotaan johtuvan ainakin osittain muutoksesta N501Y:ssä piikkiglykoproteiinin reseptoria sitovassa domeenissa, jota tarvitaan ACE2 :een sitoutumiseen ihmissoluissa.

On olemassa todisteita siitä, että tällä variantilla on 30–70 % lisääntynyt tarttuvuus, ja alustavat tutkimukset viittaavat lisääntyneeseen kuolleisuuteen [19] .

Britannian viranomaiset ilmoittivat 2. helmikuuta 2021, että tämän kannan 214 000 geneettisesti sekvensoidusta näytteestä 11:ssä oli myös E484K-mutaatio [20] [21] . Yksi mutaatioista (N501Y) on myös beeta- ja gamma-kannoissa.

Maailman terveysjärjestö WHO ilmoitti 31. toukokuuta 2021, että julkisessa viestinnässä brittiläistä kantaa kutsutaan "alfaksi" [22] [23] .

Beta (rivi B.1.351)

501.V2-kanta, joka tunnetaan myös nimellä 501.V2, 20C/501Y.V2 tai B.1.351, tunnistettiin ensimmäisen kerran Etelä-Afrikassa, kuten Etelä-Afrikan terveysministeriö ilmoitti 18. joulukuuta 2020. Tutkijat ja viranomaiset ilmoittivat, että tämän kannan esiintyvyys oli suurempi nuorten aikuisten keskuudessa, joilla ei ole perussairautta, ja muihin kantoihin verrattuna se todennäköisemmin aiheuttaa vakavia sairauksia näissä tapauksissa. Etelä-Afrikan terveysministeriö on myös ilmoittanut, että tämä kanta saattaa aiheuttaa COVID-19-pandemian toista aaltoa maassa, koska kanta leviää nopeammin kuin muut, aikaisemmat viruskannat.

Tutkijat huomauttivat, että tämä kanta sisältää useita mutaatioita, jotka mahdollistavat sen helpomman kiinnittymisen ihmissoluihin. Nämä ovat kolme mutaatiota reseptoria sitovassa domeenissa (RBD) viruksen piikkiglykoproteiinissa: N501Y [24] [25] (aminohapon asparagiini (N) sijaan aminohappo tyrosiini (Y) [26] asemassa 501), K417N ja E484K [27 ] [28] . Kaksi näistä mutaatioista (E484K ja N501Y) on reseptoria sitovan domeenin (RBD) reseptoria sitovassa motiivissa (RBM) [29] .

Uusi kanta löydettiin genomin sekvensoinnilla . Useita genomisia sekvenssejä tästä linjasta on lähetetty GISAID- ( Global I nitiative on Sharing A vian I influenza D ata ) [ en ] -sekvenssitietokantaan , sekvenssi EPI_ISL_678597 [30] .

The Telegraph raportoi 4. tammikuuta 2021, että Oxfordin immunologi Sir John Bell uskoo, että uusi eteläafrikkalainen kanta herättää "ison kysymyksen", koska se voisi olla vastustuskykyinen rokotteille, mikä tuhoaa toiveet ja korvaa ne pelolla [31] . Samana päivänä rokotusprofessori Shabir Madhi kertoi CBS Newsille, ettei ole varmaa, että uusi 501.V2-kanta pystyy "ohittamaan" rokotteen suojan, mutta hän uskoo, että se "voi olla vähemmän tehokas" [32 ] . Readingin yliopiston solumikrobiologian apulaisprofessori Simon Clarke mainitsi lisämutaatiot piikkiproteiinissa 501.V2-kannassa, koska ne "voivat tehdä viruksesta vähemmän herkkiä rokotteen aiheuttamalle immuunivasteelle". Lawrence Young, Warwickin yliopiston virologi, totesi myös, että useat piikkimutaatiot tässä kannassa "voivat johtaa johonkin pakoon immuunipuolustukselta" [33] .

BioNTechin toimitusjohtaja Ugur Sahin totesi, että lisätutkimuksia tarvitaan varmistaakseen, että yhtiön nykyinen rokote toimii 501.V2-kantaa vastaan, mutta jos rokotetta on säädettävä, yritys voi tehdä sen noin 6 viikossa [ 34] . The Guardian raportoi 8. tammikuuta 2021, että Pfizerin ja BioNTechin COVID-19-rokote on osoittanut 20 verikoetta sisältävissä testeissä, että se pystyy tarjoamaan suojan 501.V2-kantaa vastaan. Lisätutkimusta tarvitaan tarkan suojaustason määrittämiseksi [35] .

Gamma (rivi B.1.1.248)

National Institute of Infectious Diseases (NIID) löysi B.1.1.248-linjan Tokiosta 6. tammikuuta 2021. Uusi kanta löydettiin neljältä ihmiseltä, jotka saapuivat Tokioon Amazonasista 2. tammikuuta 2021. Brasilian valtion säätiö Oswaldo Cruz vahvisti oletuksensa, että tämä kanta oli yleinen Amazonin sademetsissä. Tässä SARS-CoV-2-kannassa on 12 mutaatiota piikkiproteiinissa, mukaan lukien N501Y ja E484K.

Caroline M. Volochin ym.:n esipainettu paperi identifioi SARS-CoV-2:n uuden sukulinjan "B.1.1.248", jota levitetään Brasiliassa ja joka on peräisin kannasta B.1.1.28. Siinä kuvataan, että uusi kanta ilmestyi ensimmäisen kerran heinäkuussa ja havaittiin ensimmäisen kerran lokakuussa, mutta julkaisuhetkellä (joulukuu 2020), vaikka sen esiintymistiheys on lisääntynyt merkittävästi, sen levinneisyys rajoittui edelleen pääosin osavaltion pääkaupunkiin Rio de Janeiroon.

Tämä kanta aiheutti epidemian Manauksen kaupungissa huolimatta siitä, että kaupunki oli jo kokenut massiivisen infektion toukokuussa [36] ja tutkimus osoitti [37] SARS-CoV-2-vasta-aineserotyyppien suuren esiintyvyyden [38] .

Brasilian terveysministeriön johtaja Eduardo Pazuello ilmoitti 11. helmikuuta 2021, että tämä kanta on kolme kertaa tarttuvampi kuin "alkuperäinen" SARS-CoV-2 [39] .

Delta (rivi B.1.617.2)

Lokakuussa 2020 B.1.617.2-linja havaittiin ensimmäisen kerran Intiassa [40] [41] [42] . Huhtikuun 2021 toisella puoliskolla Intian Delta-kanta saapui Venäjälle [43] .

14. kesäkuuta 2021 Intiasta löydettiin mutatoitunut variantti B.1.617.2, joka tunnetaan nimellä AY.1 tai delta plus -variantti [44] . "Delta plus" erottuu siitä, että piikkiproteiinissa on K417N-mutaatio, joka voi vähentää vasta-aineiden aktiivisuutta toipuneilla ja rokotetuilla ihmisillä [45] . Intian terveysministeriö on nimennyt kolme "delta plus":n tunnusmerkkiä: lisääntynyt tarttuvuus, lisääntynyt kyky sitoutua keuhkosolureseptoreihin ja mahdollinen vastustuskyky monoklonaaliselle vasta- ainehoidolle [46] .

Lokakuussa 2021 brittiläiset virologit havaitsivat delta-kannan kehitystä seuratessaan uuden kannan, AY.4.2, joka on tarttuvampi kuin aiemmat kannat. AY.4.2 on 10-15 % tarttuvampi kuin delta-kanta. Yhdistyneessä kuningaskunnassa se on yksi kymmenestä koronavirustartuntatapauksesta maassa [47] [48] .

Omicron (rivi B.1.1.529)

Marraskuussa 2021 B.1.1.529-linja havaittiin ensimmäistä kertaa Botswanassa ja Etelä-Afrikassa. Poikkeaa suuresta määrästä mutaatioita tuhkamittareissa [49] . Yhdistyneen kuningaskunnan terveysturvallisuusviranomaisen mukaan tässä variantissa on piikkiproteiini, joka eroaa merkittävästi alkuperäisen koronaviruksen (muunnelma, johon rokotteet perustuvat) proteiinista, mikä herättää huolta olemassa olevien rokotteiden tehokkuudesta. Uuden kannan löytäminen aiheutti maailmanlaajuisen paniikin 26. marraskuuta 2021. Monet maat ovat keskeyttäneet matkustamisen Etelä-Afrikasta, ja osakemarkkinat Atlantin molemmin puolin ovat kokeneet pahimman laskunsa yli vuoteen [50] . Britannian pääministeri Boris Johnson ilmoitti, että maa ottaa käyttöön pakollisen PCR-testin kaikille maahan saapuville ja itsensä eristäytymisen, kunnes saadaan negatiivinen tulos. Pakollinen kymmenen päivän eristys otetaan käyttöön myös niille, joiden epäillään saaneen omicron-kannan tartunnan [51] .

Strains of Interest (VOI)

Alla on WHO:n kiinnostaviksi vaihtoehtoiksi luetteloimat kannat [18] .

Lambda (rivi C.37)

Elokuussa 2020 C.37 -sukulinja havaittiin ensimmäisen kerran Perussa [52] . Kesäkuussa 2021 Perussa lambda-kannan osuus oli 81 prosenttia kaikista maassa ilmoitetuista tapauksista. Argentiinassa ja Chilessä "lambdan" osuus on noin kolmannes [53] .

Muut

Tämä (rivi B.1.525)

Linja B.1.525, joka tunnetaan myös nimellä VUI-202102/03 tai UK1188, on osittain samanlainen kuin kanta 501.V2, mutta eroaa sekä E484K-mutaation että uuden F888L-mutaation (leusiinin fenyylialaniinin (F) korvaaminen L) domeenin S2 piikkiproteiinissa). Helmikuun 16. päivään mennessä kantaa on havaittu 15 maassa, mukaan lukien Iso-Britannia, Tanska, Suomi, Alankomaat, Belgia, Ranska, Espanja, Nigeria, Ghana, Jordania, Japani, Singapore, Australia, Kanada ja Yhdysvallat. Ensimmäiset tapaukset tunnistettiin joulukuussa 2020 Isossa-Britanniassa ja Nigeriassa, ja helmikuun 15. päivänä tämä on Nigerian yleisimmin eristetty kanta. Helmikuun 15. päivään mennessä Yhdistyneessä kuningaskunnassa on tunnistettu 38 tartuntatapausta. Tanskassa tunnistettiin 14. tammikuuta - 9. helmikuuta välisenä aikana 55 tartuntatapausta tällä kannalla, joista seitsemän liittyi suoraan ulkomaan matkustamiseen.

Brittiasiantuntijat tutkivat tähän kantaan liittyviä riskejä. Sitä pidetään tällä hetkellä "tutkittavana kannana", mutta kun enemmän tietoa tulee saataville, siitä voi tulla "huolenaihe". Professori Ravi Gupta Cambridgen yliopistosta kertoi BBC:lle, että B.1.525:ssä näyttää olevan "merkittäviä mutaatioita", joita on jo havaittu joissakin muissa uusissa kannoissa, mikä on jokseenkin rohkaisevaa, koska niiden todennäköinen vaikutus on jossain määrin ennakoitavampi.

Tämän kannan mutaatioita ovat E484K, deleetio kohdissa 69-70, uudet mutaatiot Q677H (glutamiini histidiiniksi asemassa 677) ja F888L (fenyylialaniini leusiiniksi asemassa 888) [54] .

Ryhmä 5

Klusteri 5, jota Danish Serum State Institute (SSI) kutsuu myös ΔFVI-piikiksi , löydettiin Pohjois-Jyllannista , Tanskasta . Sen uskotaan siirtyneen minkeistä minkkitilojen ihmisille. 4.11.2020 ilmoitettiin, että minkkipopulaatio Tanskassa lopetetaan tämän mutaation mahdollisen leviämisen estämiseksi ja uusien mutaatioiden esiintymisen vähentämiseksi. Pohjois-Jyllannin seitsemässä kunnassa on otettu käyttöön lukituksia ja matkustusrajoituksia, jotta estetään mutaation leviäminen, joka voisi vaarantaa kansallisten tai kansainvälisten toimien tehokkuuden COVID-19-pandemiaan.

Maailman terveysjärjestö (WHO) on todennut, että klusterin 5 "herkkyys neutraloiville vasta-aineille on vähentynyt kohtalaisesti". SSI varoitti, että mutaatio voi vähentää kehitteillä olevien COVID-19-rokotteiden vaikutusta, vaikka se ei todennäköisesti tee niistä hyödyttömiä.

Karanteenin ja massatestauksen jälkeen SSI ilmoitti 19. marraskuuta 2020, että klusteri 5 on mitä todennäköisimmin kuollut sukupuuttoon [55] .

Merkittäviä mutaatioita

D614G

D614G on mutaatio, joka vaikuttaa SARS-CoV-2-piikkiproteiiniin. Kanta G ( glysiini asemassa 614) lisääntyi pandemian aikana, luultavasti sen jälkeen, kun se oli alun perin peräisin Kiinasta ja sitten levinnyt Italiaan tammikuussa ja sieltä maailmanlaajuisesti. G on korvannut D:n ( asparagiinihapon ) monissa maissa, erityisesti Euroopassa, ja hieman hitaammin Kiinassa ja muualla Itä-Aasiassa, mikä tukee hypoteesia, että G lisää tartuntanopeutta, mikä on johdonmukaista korkeampien virustiitterien ja in vitro -tarttuvuuden kanssa. 56] .

Heinäkuussa 2020 SARS-CoV-2:n tarttuvammasta D614G-kannasta ilmoitettiin tullut pandemian hallitseva muoto [57] [58] [59] .

D614G:n maailmanlaajuinen esiintyvyys korreloi hajuhäviön (anosmian ) esiintyvyyden kanssa COVID-19:n oireena, mikä mahdollisesti johtuu tämän kannan vahvemmasta sitoutumisesta ACE2-reseptoriin tai vastaavan proteiinin korkeammasta stabiilisuudesta ja siten suuremmasta hajuaistin tarttuvuudesta. epiteeli [60] .

GISAID pitää viruksia, jotka sisältävät G-mutaation, osana G-kladia [56] ja sen avulla[ selventää ] PANGOLIN ( N amed G lobal O eages -epidemian filogeneettinen A - lähetys )  — kuuluu kladiin B1 [61] .

E484K

E484K:n on raportoitu olevan mutaatio, joka antaa resistenssin vähintään yhdelle monoklonaalisten SARS-CoV-2-vasta-aineiden muodolle, mikä viittaa "mahdolliseen muutokseen antigeenisyydessä". Kannat B.1.1.248 (Brasilia/Japani) ja 501.V2 (Etelä-Afrikka) sisältävät tämän mutaation. Mutaation nimi E484K tarkoittaa glutamiinihapon (E) korvaamista lysiinillä (K) aminohappoasemassa 484. Monoklonaalisten ja seerumin vasta-aineiden on raportoitu olevan 10-60 kertaa vähemmän tehokkaita neutraloimaan E484K-mutaation kantavaa virusta. [62] [63] .

N501Y

N501Y edustaa muutosta asparagiinista (N) tyrosiiniin (Y) aminohappoasemassa 501. Englannin kansanterveyslaitos katsoo, että tämä muutos lisää reseptoriin sitoutumisaffiniteettia, koska se sijaitsee piikkiglykoproteiinin reseptoria sitovassa domeenissa, joka sitoutuu piikkiglykoproteiiniin. ACE2-reseptori ihmissoluissa; tiedot tukevat myös hypoteesia lisääntyneestä sitoutumisaffiniteetista tämän muutoksen seurauksena. N501Y-kantoja ovat B.1.1.248 (Brasilia/Japani), "huolenaiheellinen kanta" 202012/01 (Yhdistynyt kuningaskunta), 501.V2 (Etelä-Afrikka) ja Columbus, Ohio -kanta, josta tuli hallitseva viruksen muoto Columbuksessa joulukuun 2020 lopussa ja tammikuussa. Jälkimmäinen nimettiin COH.20G/501Y ja näyttää kehittyneen muista kannoista riippumatta.

New Strain Evaluation Platform

Britannian hallitus ilmoitti 26. tammikuuta 2021 jakavansa genomin sekvensointikykynsä muiden maiden kanssa sekvensointinopeuden lisäämiseksi ja uusien kantojen jäljittämiseksi [64] . Tammikuussa 2021 yli puolet kaikesta COVID-19-genomisekvensoinnista tehtiin Isossa-Britanniassa [65] .

Rokotteen tehokkuus

Pfizer, Inc:n alustava tutkimus osoitti, että heidän mRNA-rokotteensa tehokkuus uusia SARS-CoV-2-kantoja vastaan ​​heikkeni vain hieman [66] . US Centers for Disease Control -sivustolla 28. tammikuuta 2021 julkaistun artikkelin mukaan immuunivasteen täysin kiertävien mutanttikantojen syntymistä pidetään epätodennäköisenä viruksen luonteen vuoksi [67] .

Mahdollisesti T-soluimmuniteetti voi olla ratkaisu ongelmaan, joka liittyy rokotteiden tehon heikkenemiseen uusia kantoja vastaan. Biotekniikkayritys Gritstone Oncology Emeryvillestä, Kaliforniasta, USA:sta kehittää rokotetta, joka on erityisesti suunniteltu indusoimaan T-soluimmuniteettia [68] . Saksalaisen Tübingenin yliopiston kehittämä peptidirokote yrittää indusoida T-soluimmuniteettia vasta-aineiden sijaan [69] .

29. tammikuuta 2021 Moskovan kaupungin duuman edustaja Daria Besedina kääntyi Venäjän federaation terveysministerin puoleen ja pyysi rahoittamaan uusien kantojen tutkimusta ja tekemään tutkimuksia venäläisten rokotteiden tehokkuudesta näitä kantoja vastaan ​​[70][ tosiasian merkitys? ] . Euroopan lääkevirasto esitti 10. helmikuuta 2021 samanlaisen vetoomuksen rokotevalmistajille [71] . Venäjän presidentti Vladimir Putin kehotti 15. helmikuuta hallitusta ottamaan käyttöön venäläisten SARS-CoV-2-kantojen genomin sekvensoinnin kuukauden kuluessa, osoittamaan varoja näihin tutkimuksiin ja myös tarkistamaan, ovatko venäläiset rokotteet uusia kantoja vastaan ​​tehokkaita [72] .

Pfizer ilmoitti 19. helmikuuta 2021, että sen rokote tuottaa noin 66 % vähemmän vasta-aineita, jotka ovat aktiivisia eteläafrikkalaista 501.V2 -kantaa vastaan ​​"klassiseen" kantaan verrattuna, kun taas immuunijärjestelmä pystyy edelleen onnistuneesti neutraloimaan viruksen [73] .

Israelin terveysministeriön heinäkuun 2021 tiedot osoittavat amerikkalaisen Pfizer-rokotteen tehokkuuden laskeneen 39 prosenttiin kuukauden aikana koronaviruksen delta-kannan aiheuttaman infektion estämisessä, mutta rokote suojaa edelleen 88 prosenttia rokotteelta. sairaalahoitoa ja 91,4 % vakavista tautitapauksista. [74]

Kommentit

  1. ↑ Kansallisen tartuntatautien instituutin ja Pretorian yliopiston tiedot, jotka on saatu seuraamalla potilaita Tswanen kaupunkialueella ( Gautengin maakunta , Etelä-Afrikka) sijaitsevassa sairaalassa . Katso: Eteläafrikkalaiset tutkijat paljastavat tietoja omicron-kannan kuolleisuudesta. Arkistokopio , joka on päivätty 2. tammikuuta 2022 Wayback Machinessa // RBC , 30.12.2021.

Muistiinpanot

  1. ↑ WHO | SARS-CoV-2-versiot (linkki ei saatavilla) . WHO . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 5. tammikuuta 2021. 
  2. ↑ Anna Zhukova, Luc Blassel, Frederic Lemoine, Marie Morel, Jakub Voznica. SARS-CoV-2:n alkuperä, kehitys ja maailmanlaajuinen leviäminen  // Comptes Rendus. Biologiat. - 0. - T. 0 , ei. 0 . - doi : 10.5802/crbiol.29 . Arkistoitu alkuperäisestä 21. helmikuuta 2021.
  3. ↑ Lausunto Kansainvälisten terveyssäännösten komitean kuudennen kokouksen työstä (2005) pandeemisen ‎koronavirusinfektion ( COVID- 4. joulukuuta 2021 Wayback Machinessa // Artikkeli päivätty 15.1.2021 // Maailman terveysjärjestö, virallinen verkkosivusto, 15.1.2021.
  4. ↑ Koronaviruskannat saavat kreikkalaiset kirjaimet _ _ _
  5. ↑ Uusi koronaviruskanta nimeltä "Omicron" Arkistokopio 27. helmikuuta 2022 Wayback Machinessa // Yhdistyneet kansakunnat, virallinen verkkosivusto, 26.11.2021
  6. ↑ "Nu" putosi, "Xi" katosi . Arkistokopio päivätty 1. joulukuuta 2021 Wayback Machinessa // " Moscow 24 ", 29.11.2021.
  7. ↑ WHO selitti kannan " omicron " nimen ja aakkosten kahden kirjaimen pois jättämisen
  8. ↑ Puuttuvat kirjaimet: miksi WHO antoi uuden kannan nimeksi " omicron "
  9. ↑ 1 2 3 4 Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et ai. (kesäkuu 2021). "Huolta aiheuttavien SARS-CoV-2-varianttien lisääntynyt tarttuvuus ja leviäminen maailmanlaajuisesti kesäkuussa 2021". Eurovalvonta . 26 (24): 2100509. DOI : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  10. ↑ Alustava genominen karakterisointi esiin nousevasta SARS-CoV-2-linjasta Yhdistyneessä kuningaskunnassa, joka on määritelty uusilla piikkimutaatioilla . Virologinen (18.12.2020). Haettu 14. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 21. joulukuuta 2020.
  11. ↑ Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Huolenaiheiden SARS-CoV-2-varianttien lisääntynyt tarttuvuus ja maailmanlaajuinen leviäminen kesäkuussa 2021  // Eurosurveillance. – 17.6.2021. - T. 26 , no. 24 . — ISSN 1025-496X . - doi : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  12. ↑ David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Uusien SARS-CoV-2-varianttien virulenssin progressiivinen kasvu Ontariossa, Kanadassa   // medRxiv . - 04-08-2021 — P. 2021.07.05.21260050 . - doi : 10.1101/2021.07.05.21260050 . Arkistoitu alkuperäisestä 2.9.2021.
  13. ↑ Omicronista tulee hallitseva variantti Etelä-Afrikassa  (2. joulukuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 2. joulukuuta 2021. Haettu 21.12.2021.
  14. ↑ "Omicron" tunnistettu 110 maassa ympäri maailmaa . " Kommersant " (24. joulukuuta 2021). Haettu 24. joulukuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 24. joulukuuta 2021.
  15. ↑ Murashko puhui venäläisten asiantuntijoiden Etelä-Afrikan matkan tuloksista. Arkistokopio 29.12.2021 Wayback Machinessa // TASS , 25.12.2021.
  16. ↑ Eteläafrikkalaiset tutkijat julkaisivat tietoja omicron-kannan kuolleisuudesta. Arkistokopio on päivätty 2. tammikuuta 2022 Wayback Machinessa // RBC , 30.12.2021.
  17. ↑ COG-UK-päivitys erityisen kiinnostavista SARS-CoV-2-piikkimutaatioista: Raportti 1, COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), 20. joulukuuta 2020, s. 2 , < https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2 -Mutations_final_updated2.pdf > . Haettu 18. tammikuuta 2021. . 
  18. ↑ 1 2 SARS-CoV-2-varianttien seuranta . Haettu 29. marraskuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 6. kesäkuuta 2021.
  19. ↑ Koronavirus: Iso-Britannian variantti "voi olla tappavampi" , BBC News  (22.1.2021). Arkistoitu 23. toukokuuta 2021. Haettu 3. helmikuuta 2021.
  20. ↑ Rachael Rettner-Senior Writer 2. helmikuuta 2021. Yhdistyneen kuningaskunnan koronaviruksen variantti kehittää rokotetta kiertävää mutaatiota  . livescience.com . Haettu 3. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 2. helmikuuta 2021.
  21. ↑ Achenbach, Joel . Huolestuttava koronaviruksen mutaatio nähty Iso-Britannian muunnelmassa ja joissakin Yhdysvaltojen näytteissä , Washington Post . Arkistoitu alkuperäisestä 2. helmikuuta 2021. Haettu 3. helmikuuta 2021.
  22. ↑ Selitetty: Miksi WHO nimesi ensin Intiassa löydetyt Covid-19-muunnelmat "Kappa" ja "Delta" | Intian uutiset - Times of India  (englanniksi) . The Times of India . Haettu 2. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 25. marraskuuta 2021.
  23. ↑ WHO julkistaa yksinkertaiset, helposti sanottavat tarrat kiinnostaville ja  huolestuneille SARS-CoV-2-varianteille . www.who.int . Haettu 6. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 6. joulukuuta 2021.
  24. ↑ Fink, Sheri . Etelä-Afrikka julkistaa uuden koronaviruksen muunnelman. , The New York Times  (18. joulukuuta 2020). Arkistoitu alkuperäisestä 21. joulukuuta 2020. Haettu 5.1.2021.
  25. ↑ SSAK:n koko esitys - 18. joulukuuta | virus | Mutaatio . Scribd . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 6. tammikuuta 2021.
  26. ↑ 3AA-1 ja 3AA-2 . web.archive.org (9. lokakuuta 2008). Haettu: 5.1.2021.
  27. ↑ WHO:n COVID-19-eläinmalleja käsittelevän työryhmän (WHO-COM) lausunto Yhdistyneen kuningaskunnan ja Etelä-Afrikan SARS-CoV-2:n uusista varianteista (PDF), Maailman terveysjärjestö . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 7. lokakuuta 2021.
  28. ↑ Derek Lowe 22.  joulukuuta 2020. Uudet mutaatiot  ? . In the Pipeline (22.12.2020). Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 29. tammikuuta 2021.
  29. ↑ Asiantuntijan reaktio SARS-CoV-2:n eteläafrikkalaiseen varianttiin, kuten Matt Hancock mainitsi Downing Streetin lehdistötilaisuudessa | Tiedemediakeskus  ?  _ . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 8. lokakuuta 2021.
  30. ↑ "COVID-19 GISAID Acknowledgement Threat Assessment UK variant" (PDF) . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 28. lokakuuta 2021.
  31. ↑ Knapton, Sarah . Eteläafrikkalainen variantti saattaa välttää rokotteet ja testaukset, varoittaa tutkijat , The Telegraph  (4. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 15. joulukuuta 2021. Haettu 5.1.2021.
  32. ↑ COVID-rokotteet "eivät ehkä" toimi yhtä hyvin Etelä-Afrikan kannassa, tutkijat   varoittavat ? . www.cbsnews.com . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 3. joulukuuta 2021.
  33. ↑ Yhdistyneen kuningaskunnan tutkijat pelkäävät, että rokotteet eivät ehkä suojaa Etelä-Afrikasta löydetyltä koronaviruksen variantilta | CBC News , CBC . Arkistoitu alkuperäisestä 5. tammikuuta 2021. Haettu 5.1.2021.
  34. ↑ BioNTech-rokote uudelle COVID-19-variantille voi olla valmis kuudessa  viikossa . euronews (22.12.2020). Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 8. tammikuuta 2021.
  35. ↑ Geddes, Linda . The Guardian  (8. tammikuuta 2021) tutkimuksen mukaan Pfizer-rokote suojaa uusia Covid-variantteja vastaan . Arkistoitu alkuperäisestä 8. tammikuuta 2021. Haettu 9.1.2021.
  36. ↑ Matt Rivers CNN. Onko uusi koronaviruksen muunnelma syyllinen tämän brasilialaisen kaupungin romahtamiseen? . CNN . Haettu 2. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 6. marraskuuta 2021.
  37. ↑ Lewis F. Buss, Carlos A. Prete, Claudia MM Abrahim, Alfredo Mendrone, Tassila Salomon. Kolme neljäsosaa SARS-CoV-2:n hyökkäysasteesta Brasilian Amazonissa suurelta osin lieventämättömän epidemian aikana   // Tiede . – 15.1.2021. — Voi. 371 , iss. 6526 . — s. 288–292 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.abe9728 . Arkistoitu alkuperäisestä 2. helmikuuta 2021.
  38. ↑ Ester C. Sabino, Lewis F. Buss, Maria PS Carvalho, Carlos A. Prete, Myuki AE Crispim. COVID-19:n uudelleen puhkeaminen Manausissa, Brasiliassa, huolimatta korkeasta seroprevalenssista  //  The Lancet. – 27.1.2021. - T. 0 , ei. 0 . — ISSN 1474-547X 0140-6736, 1474-547X . - doi : 10.1016/S0140-6736(21)00183-5 .
  39. ↑ "Brasilialainen" koronaviruksen kanta on kolme kertaa tarttuvampi kuin COVID-19:n ensimmäinen versio – maan terveysministeriö . nv.ua. _ Käyttöönottopäivä: 12.2.2021.
  40. ↑ PANGO-sukulinjat . cov-lineages.org . Haettu 18. huhtikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.
  41. ↑ Koronavirus | Intialainen "kaksoismutantti" -kanta nimeltä B.1.617 (en-IN), The Hindu  (8. huhtikuuta 2021). Arkistoitu 26. toukokuuta 2021. Haettu 18. kesäkuuta 2021.
  42. ↑ Intian muunnelmien käyttämä toinen aalto osui samaan aikaan tartunnan saaneiden lentojen piikkien kanssa Kanadassa , Toronto Sunissa (10. huhtikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 2. kesäkuuta 2021. Haettu 18. kesäkuuta 2021.
  43. ↑ Sputnik V:n luoja puhui muunnetusta intialaisesta kannasta Moskovassa. COVID-19:n kolmatta aaltoa selitetään heille . Arkistoitu 16. kesäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 16.6.2021
  44. ↑ Sharma, Milano SARS-CoV-2:n uusi Delta Plus -variantti tunnistettu;  tässä on se, mitä tiedämme toistaiseksi . Intia tänään . Haettu 16. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 17. kesäkuuta 2021.
  45. ↑ Uusi delta plus koronaviruskanta on tunnistettu Intiassa . Arkistoitu 23. kesäkuuta 2021 Wayback Machinessa , 21. kesäkuuta 2021
  46. ↑ Uusi supertarttuva Covid-kanta löydettiin Intiasta Wayback Machinen arkistokopio 25. kesäkuuta 2021
  47. ↑ Uusi Deltan jälkeläinen voi olla tarttuvampi kuin esi-isänsä . Haettu 23. lokakuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 23. lokakuuta 2021.
  48. ↑ Iso- Britannia paljastaa tietoja uudesta koronaviruskannasta Arkistoitu 23. lokakuuta 2021 Wayback Machinessa , 20. lokakuuta 2021
  49. ↑ [Uusi Botswana-variantti, jossa on 32 "hirvittävää" mutaatiota, on kaikkien aikojen kehittynein Covid-kanta ja voisi olla "pahempi kuin Delta" – kuten asiantuntija sanoo, että se on saattanut ilmaantua HIV-potilaassa], 25. marraskuuta 2021
  50. ↑ Uusi COVID-versio Omicron aiheuttaa maailmanlaajuista paniikkia Arkistoitu 28. marraskuuta 2021 Wayback Machinessa , 28.11.2021
  51. ↑ Britanniassa otetaan käyttöön karanteeni niille, jotka ovat kosketuksissa omicron-kannan kantajiin. Arkistokopio päivätty 28.11.2021 Wayback Machinessa // RIA Novosti, 27.11.2021
  52. ↑ SARS-CoV-2-  varianttien seuranta . Maailman terveysjärjestö . Haettu 17. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 9. kesäkuuta 2021.
  53. ↑ Latinalaisessa Amerikassa raivoaa uusi vaarallinen koronaviruskanta - "lambda" . Haettu 24. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 24. kesäkuuta 2021.
  54. ↑ Yksi mutantti lisää: uusi, mahdollisesti vaarallinen Covid-19-kanta on alkanut levitä maailmaan . Sisäpiiri . Haettu 17. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 16. helmikuuta 2021.
  55. ↑ De fleste restriktioner lempes i Nordjylland . Sundheds- og Ældreministeriet (19.11.2020). — “Sekventeringen af ​​​​depositiivinen prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden den den 15. syyskuu, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er. ("Korkealla luultavasti [...] kuoli pois")". Haettu 16. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 20. tammikuuta 2021.
  56. ↑ 1 2 SARS-CoV-2:n alkuperä, kehitys ja maailmanlaajuinen leviäminen (pääsemätön linkki) . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 21. helmikuuta 2021. 
  57. ↑ Koronavirus: Tekevätkö mutaatiot siitä tarttuvampaa? , BBC News  (18. heinäkuuta 2020). Arkistoitu alkuperäisestä 30.12.2020. Haettu 5.1.2021.
  58. ↑ Uusi, tarttuvampi COVID-19-kanta hallitsee nyt maailmanlaajuisia virustapauksia:  tutkimus . medicalxpress.com . Haettu 5. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 17. marraskuuta 2020.
  59. ↑ Bette Korber, Will M. Fischer, Sandrasegaram Gnanakaran, Hyejin Yoon, James Theiler. SARS-CoV-2-piikkien muutosten seuranta: todisteita siitä, että D614G lisää COVID-19-viruksen tarttuvuutta  // Solu. – 20.08.2020. - T. 182 , no. 4 . — s. 812–827.e19 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . Arkistoitu 1. marraskuuta 2020.
  60. ↑ Rafal Butowt, Katarzyna Bilinska, Christopher S. Von Bartheld. [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7581292/ Kemosensorinen toimintahäiriö COVID-19:ssä: geneettisten ja epidemiologisten tietopisteiden integrointi D614G-piikkiproteiinivarianttiin vaikuttavana tekijänä] // ACS Chemical Neuroscience . – 30.09.2020. - T. 11 , no. 20 . — S. 3180–3184 . — ISSN 1948-7193 . - doi : 10.1021/acchemneuro.0c00596 . Arkistoitu alkuperäisestä 12. tammikuuta 2021.
  61. ↑ cov-linjat/pangoliini . - 2021-01-05. Arkistoitu alkuperäisestä 15. helmikuuta 2021.
  62. ↑ Allison J. Greaney, Andrea N. Loes, Katharine H. D. Crawford, Tyler N. Starr, Keara D. Malone. Mutaatioiden kattava kartoitus SARS-CoV-2-reseptoria sitovaan domeeniin, jotka vaikuttavat ihmisen polyklonaalisten seerumin vasta-aineiden tunnistamiseen   // bioRxiv . - 01-04-2021. — P. 2020.12.31.425021 . - doi : 10.1101/2020.12.31.425021 . Arkistoitu alkuperäisestä 26. tammikuuta 2021.
  63. ↑ Kai Kupferschmidt. Uudet mutaatiot herättävät "immuunipakosta"   // Tiede . – 22.1.2021. — Voi. 371 , iss. 6527 . — s. 329–330 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/tiede.371.6527.329 . Arkistoitu 13. toukokuuta 2021.
  64. ↑ Smout, Alistair . Britannia auttaa muita maita jäljittämään koronaviruksen muunnelmia , Reuters  (26.1.2021). Arkistoitu alkuperäisestä 26. tammikuuta 2021. Haettu 29.1.2021.
  65. ↑ Donnelly, Laura . Iso-Britannia auttaa sekvensoimaan Covidin mutaatioita ympäri maailmaa löytääkseen vaarallisia uusia variantteja , The Telegraph  (26. tammikuuta 2021). Arkistoitu alkuperäisestä 27. tammikuuta 2021. Haettu 29.1.2021.
  66. ↑ Collier DA, Meng B, Ferreira, Gupta RK (2021). "Piikin 69/70-deleetion, E484K:n ja N501Y SARS-CoV-2:n neutralointi BNT162b2-rokotteella aikaansaaduilla seerumeilla" . Haettu 29. tammikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 26. tammikuuta 2021.
  67. ↑ Uudet SARS-CoV-2-variantit - CDC . Haettu 4. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 15. toukokuuta 2021.
  68. ↑ Kuinka "tappaja" T-solut voisivat vahvistaa COVID-immuniteettia uusien muunnelmien edessä. Arkistoitu 15. helmikuuta 2021 Wayback Machinessa , 12. helmikuuta 2021
  69. ↑ Biotech selittää, mikä EpiVacCoronassa on vialla: "Se on nukke. Lentokone, jossa on mukava matkustamo, halpa ja helppo rakentaa. Mutta hän ei lennä! . Nykyinen (23.6.2021). Haettu 24. kesäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 24. kesäkuuta 2021.
  70. ↑ Apulaisjohtaja Besedinan kirjeenvaihtolehti . besedina.moskova . Haettu 19. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 17. helmikuuta 2021.
  71. ↑ EMA valmistelee ohjeita COVID-19-muunnelmien torjumiseksi . Haettu 19. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 15. helmikuuta 2021.
  72. ↑ Ohjeluettelo hallituksen jäsenten tapaamisen jälkeen • Venäjän presidentti . Venäjän presidentti . Haettu 19. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 17. helmikuuta 2021.
  73. ↑ Eteläafrikkalainen SARS-CoV-2-kanta, jonka epäillään vähentävän immuunivastetta Pfizer-rokotteelle . TASS . Haettu 24. helmikuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 18. helmikuuta 2021.
  74. ↑ Pfizerin arvioidaan olevan 39 % tehokas delta-infektiota vastaan ​​Israelissa . TASS . Haettu 25. heinäkuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 25. heinäkuuta 2021.