Proteiinidomeeni on osa proteiinin tertiaarista rakennetta , joka on melko vakaa ja itsenäinen proteiinin alarakenne, jonka laskostuminen tapahtuu muista osista riippumatta. Verkkotunnus sisältää yleensä useita toissijaisen rakenteen elementtejä . Rakenteeltaan samanlaisia domeeneja ei löydy vain sukulaisista proteiineista (esimerkiksi eri eläinten hemoglobiineista ), vaan myös täysin erilaisista proteiineista.
Melko usein domeeneille annetaan erilliset nimet, koska niiden läsnäolo vaikuttaa suoraan proteiinin suorittamiin biologisiin toimintoihin - esimerkiksi Calmodulin Ca 2+ -sitoutumisdomeeni , homeodomeeni , joka vastaa DNA :han sitoutumisesta erilaisissa transkriptiotekijöissä jne.
Koska domeenit ovat melko "autonomisia" rakenteensa muodostamisessa ja tehtävänsä suorittamisessa, voidaan geenitekniikan avulla "ommella" johonkin proteiiniin toiselle kuuluva domeeni (jolla saadaan aikaan kimeerinen proteiini ). Tällainen kimeera yhdistää onnella molempien proteiinien toiminnot. Esimerkiksi fuusioimalla Cas9:n DNA:ta sitova domeeni erilaisten säätelydomeenien kanssa oli mahdollista saada keinotekoisia transkriptiotekijöitä (crisprTF), jotka ohjataan selektiivisesti halutuille genomin alueille käyttämällä räätälöityjä "RNA-ohjaimia" [1] [2] [3] . Cas9 - domeenia voidaan käyttää myös keinotekoisten restriktioendonukleaasien , repressorien ja epigenomia modifioivien entsyymien , kuten DNA-metylaasien ja demetylaasien, rakentamiseen.