Alfa-galaktosidaasi
Melibiaasit (tai α-galaktosidaasit ) ( EC 3.2.1.22 ) ovat glykosyylihydrolaaseja , jotka pystyvät yleensä pilkkomaan α-D-galaktoosien terminaalisia ei-pelkistäviä tähteitä α-D- galaktosideista säilyttäen optisen konfiguraationsa . myös galakto- oligosakkarideista , galaktomannaaneista ja galaktolipideistä . Niiden yksinkertaisimmat luonnolliset substraatit ovat disakkaridi melibioosi ja trisakkaridiraffinoosi . Monissa tapauksissa transgalaktosidaasiaktiivisuutta havaittiin melibiaasissa. α-N-asetyyligalaktosidaasit ovat biokemiallisesti ja evoluutionaalisesti samanlaisia kuin α-galaktosidaasit ( EC 3.2.1.49 ).
Perheiden melibiasis
Niiden rakenteen perusteella kaikkien a-galaktosidaasien katalyyttiset domeenit on jaettu kuuteen perheeseen: GH4 , GH27 , GH36 , GH57 , GH97 ja GH110 .
- Korkeammalla hierarkkisella tasolla olevat GH27- ja GH36-perheet muodostavat GH-D-klaanin. Tämän klaanin domaineilla on kolmiulotteinen (β/α) 8 -tynnyrirakenne, joka tunnetaan myös nimellä TIM-tynnyri. Tämä kolmiulotteinen rakenne on yleisin kaikkien glykosyylihydrolaasien katalyyttisten domeenien joukossa ja myös yksi yleisimmistä kaikkien proteiinien joukossa. Kaikilla monisoluisilla organismeilla ja suurimmalla osalla tutkituista yksisoluisista eukaryooteista ja bakteereista on α-galaktosidaaseja. Arkeasta niitä löytyy vain tietyistä lajeista. Useimmat eukaryoottiset α-galaktosidaasit kuuluvat GH27-perheeseen, kun taas useimmat bakteerien α-galaktosidaasit kuuluvat GH36-perheeseen. Nämä kaksi perhettä sisältävät lähes yksinomaan α-galaktosidaaseja ja α-N-asetyyligalaktosaminidaaseja. GH36-perheen filogeneettinen analyysi osoitti sen polyfyleettisen alkuperän, mikä mahdollisti tämän perheen jakamisen kahdeksaan uuteen. Nämä kahdeksan perhettä muodostavat yhdessä GH27- ja GH31 -perheiden kanssa a-galaktosidaasi-superperheen.
- GH97-perheen katalyyttisillä domeeneilla on myös (β/a) 8 -tynnyrirakenne. Tällä hetkellä vain yhdellä tämän perheen edustajalla on osoitettu olevan α-galaktosidaasiaktiivisuutta - yhdessä Bacteroides thetaiotaomicron -bakteerin proteiineista .
- GH57-perheen katalyyttisten domeenien rakenne on samanlainen kuin TIM-tynnyrillä, (β/α) 7 - tynnyrillä. GH57-perhe sisältää sekä tähän mennessä tunnettuja arkeaalisia α-galaktosidaaseja että useita prokaryoottisia glykosyylihydrolaaseja, joilla on muita aktiivisuuksia.
- GH4-perheeseen kuuluvat bakteeriglykosidaasit, joilla on laaja substraattispesifisyys. Kolmella niistä osoitettiin olevan a-galaktosidaasiaktiivisuutta.
- GH110-perhe sisältää ainutlaatuisia α-galaktosidaaseja, jotka pystyvät katkaisemaan α-D-galaktoositähteet kääntämällä niiden optisen konfiguraation. Tällaisia entsyymejä on löydetty bakteereista Bacteroides fragilis , B. thetaiotaomicron ja Streptomyces avermitilis .
On todennäköistä, että GH27-, GH36-, GH57- ja GH97-perheiden α-galaktosidaasigeeneillä on yhteinen evoluutioperä.
Monet α-galaktosidaasigeenin mutaatiot ihmisillä johtavat Fabryn tautiin ja α - N-asetyyligalaktosaminidaasigeenissä Schindlerin tautiin , joka tunnetaan myös nimellä
tautiKanzaki
Katso myös
