Histonideasetylaasi 9

Tunnisteet

HDAC9 ; HD7; HD7b; HD9; HDAC; HDAC7; HDAC7B; HDAC9B; HDAC9FL; HDRP; MITR

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 606543 MGI : 1931221 Homologeeni : 128578 IUPHAR : ChEMBL : 4145 GeneCards : HDAC9 Gene

3.5.1.98

Geeniontologia
Toiminto	• transkriptiocorepressoriaktiivisuus • histonideasetylaasiaktiivisuus • proteiinikinaasi C:n sitoutuminen • proteiineihin sitoutuminen • transkriptiotekijän sitoutuminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3-K14-spesifinen) • proteiinideasetylaasiaktiivisuus • histonideasetylaasin sitoutuminen • metalli-ionien sitoutuminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3) -K9-spesifinen) • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H4-K16-spesifinen) • transkriptiotekijän sitoutumisen estäminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3-K18-spesifinen)
solukomponentti	• histonideasetylaasikompleksi • tuma • nukleoplasma • transkriptiotekijäkompleksi • sytoplasma • histonimetyylitransferaasikompleksi
biologinen prosessi	• RNA-polymeraasi II -promoottorin transkription negatiivinen säätely • transkriptio, DNA-templaatti • tulehdusvaste • Notch-signalointireitti • sydämen kehitys • histonin deasetylaatio • B-solujen erilaistuminen • soluvaste insuliiniärsykkeelle • peptidyylilysiinin deasetylaatio • B-soluaktivaatio • transkription negatiivinen säätely , DNA-templaatti • luustolihaskuitujen kehitys • poikkijuovaisten lihassolujen erilaistumisen säätely • histoni H3 deasetylaatio • histoni H4 deasetylaatio • itämisen angiogeneesiin osallistuvan solumigroituksen positiivinen säätely
Lähteet: Amigo / QuickGO

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 7:
18,13 – 19,04 Mb

Chr 12:
34,37 – 34,53 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

Histonideasetylaasi 9 ( Histonideasetylaasi 9 ) on HDAC9 -geenin [1] [2] [3] koodaama entsyymi ihmisissä .

Toiminto

Histoneilla on kriittinen rooli transkription , solusyklin ja kehitysprosessien säätelyssä. Histonien asetylaatio/deasetylaatio muuttaa kromosomien rakennetta ja vaikuttaa transkriptiotekijöiden pääsyyn DNA :han . Tämän geenin koodaamalla proteiinilla on sekvenssihomologiaa histonideasetylaasiperheen jäsenten kanssa . Tämä geeni on ortologinen hiiren Xenopus- ja MITR-geenien kanssa. MITR-proteiinista puuttuu histonideasetylaasikatalyyttinen domeeni. Se tukahduttaa MEF2-aktiivisuutta rekrytoimalla monikomponenttisia ydinpressorikomplekseja, joihin kuuluvat CtBP ja HDAC. Tällä koodatulla proteiinilla voi olla rooli hematopoieesissa. Tälle geenille on kuvattu useita vaihtoehtoisia silmukointivariantteja , mutta joitain niistä ei ole täysin määritelty [3] .

Vuorovaikutuksia

HDAC9:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

CBX5 [4] ,
HDAC3 [5] [6] ,
MEF2A [7] [8] ,
NCOR1 [5] ,
SIN3A [9] [5] ja
SUV39H1 [4] .

Katso myös

Histonideasetylaasit

Muistiinpanot

↑ Wang AH, Bertos NR, Vezmar M., Pelletier N., Crosato M., Heng HH, Th'ng J., Han J., Yang XJ HDAC4, ihmisen histonideasetylaasi, joka liittyy hiivaan HDA1, on transkriptionaalinen korepressori ( englanti) // Mol Cell Biol : päiväkirja. - 1999. - marraskuu ( osa 19 , nro 11 ). - P. 7816-7827 . — PMID 10523670 .
↑ Sparrow DB, Miska EA, Langley E., Reynaud-Deonauth S., Kotecha S., Towers N., Spohr G., Kouzarides T., Mohun TJ MEF-2 toimintoa modifioi uusi rinnakkaisrepressori, MITR ( englanti) // EMBO J : päiväkirja. - 1999. - marraskuu ( osa 18 , nro 18 ). - P. 5085-5098 . doi : 10.1093 / emboj/18.18.5085 . — PMID 10487760 .
↑ 1 2 Entrez-geeni: HDAC9-histonideasetylaasi 9 . (määrätön)
↑ 1 2 Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Luokan II histonideasetylaasien yhdistäminen heterokromatiiniproteiinin 1 kanssa: histonien metylaation mahdollinen rooli lihasten erilaistumisen säätelyssä // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - 2002. - lokakuu ( osa 22 , nro 20 ). - P. 7302-7312 . - doi : 10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
↑ 1 2 3 Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. Histoni deasetylaasi 9 -geeni koodaa useita proteiini-isoformeja // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2003. - Toukokuu ( nide 278 , nro 18 ). - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
↑ Zhou X., Richon VM, Rifkind RA, Marks PA Histonideasetylaasien 4 ja 5 ei-katalyyttiseen domeeniin liittyvän transkription repressorin tunnistaminen // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2000. - Helmikuu ( osa 97 , nro 3 ) . - s. 1056-1061 . - doi : 10.1073/pnas.97.3.1056 . — PMID 10655483 .
↑ Miska EA, Karlsson C., Langley E., Nielsen SJ, Pines J., Kouzarides T. HDAC4-deasetylaasi liittyy MEF2-transkriptiotekijään ja repressoi sitä // EMBO J. : päiväkirja. - 1999. - syyskuu ( osa 18 , nro 18 ). - P. 5099-5107 . - doi : 10.1093/emboj/18.18.5099 . — PMID 10487761 .
↑ Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard MP, Khochbin S. mHDA1/HDAC5 histonideasetylaasi on vuorovaikutuksessa MEF2A:n transkriptionaalisen aktiivisuuden kanssa ja tukahduttaa // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2000. - Toukokuu ( osa 275 , nro 20 ). - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros-CtIP-vuorovaikutukset eivät vaadi C-terminaalista sitoutumisproteiinia ja osallistuvat deasetylaasiriippumattomaan tukahduttamismuotoon // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2002. - Kesäkuu ( nide 277 , nro 26 ). - P. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .

Kirjallisuus

Marks PA, Richon VM, Rifkind RA Histonideasetylaasi- inhibiittorit: transformoituneiden solujen erilaistumisen tai apoptoosin indusoijat. (englanniksi) // J. Natl. Cancer Inst. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 92 , no. 15 . - s. 1210-1216 . doi : 10.1093 / jnci/92.15.1210 . — PMID 10922406 .
Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Class II histonideasetylaasit: monipuoliset säätelijät. (englanti) // Trends Genet. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 19 , ei. 5 . - s. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Kohti ihmisen täydellistä genomisekvenssiä. (englanniksi) // Genome Res. : päiväkirja. - 1999. - Voi. 8 , ei. 11 . - s. 1097-1108 . - doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . — PMID 9847074 .
Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Tuntemattomien ihmisen geenien koodaavien sekvenssien ennustaminen. XI. 100 uuden cDNA-kloonin täydelliset sekvenssit aivoista, jotka koodaavat suuria proteiineja in vitro. (englanniksi) // DNA Res. : päiväkirja. - 1999. - Voi. 5 , ei. 5 . - s. 277-286 . - doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . — PMID 9872452 .
Miska EA, Karlsson C., Langley E., Nielsen SJ, Pines J., Kouzarides T. HDAC4-deasetylaasi liittyy MEF2-transkriptiotekijään ja repressoi sitä. (englanniksi) // EMBO J. : päiväkirja. - 1999. - Voi. 18 , ei. 18 . - P. 5099-5107 . - doi : 10.1093/emboj/18.18.5099 . — PMID 10487761 .
Zhou X., Richon VM, Rifkind RA, Marks PA Histonideasetylaasien 4 ja 5 ei-katalyyttiseen domeeniin liittyvän transkription repressorin tunnistaminen. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2000. - Voi. 97 , no. 3 . - s. 1056-1061 . - doi : 10.1073/pnas.97.3.1056 . — PMID 10655483 .
Youn HD, Grozinger CM, Liu JO Kalsium säätelee myosyyttitehostajatekijän 2 transkriptionaalista repressiota histonideasetylaasi 4:n vaikutuksesta. // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 275 , nro. 29 . - P. 22563-22567 . - doi : 10.1074/jbc.C000304200 . — PMID 10825153 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) ja MEF2-interacting transkriptiorepressori (MITR) myötävaikuttavat MEF2-transkriptiotekijän transkription repressioon. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 276 , nro. 1 . - s. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Ihmisen HDAC7-histonideasetylaasiaktiivisuus liittyy HDAC3:een in vivo. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 276 , nro. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
Zhou X., Marks PA, Rifkind RA, Richon VM Histonideasetylaasi, HDAC9, kloonaus ja karakterisointi. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2001. - Voi. 98 , ei. 19 . - P. 10572-10577 . - doi : 10.1073/pnas.191375098 . — PMID 11535832 .
Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros-CtIP-vuorovaikutukset eivät vaadi C-terminaalista sitoutumisproteiinia ja osallistuvat deasetylaasiriippumattomaan tukahduttamismuotoon. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 277 , no. 26 . - P. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. SUMO E3 ligaasi RanBP2 edistää HDAC4-deasetylaasin modifikaatiota. (englanniksi) // EMBO J. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 21 , ei. 11 . - P. 2682-2691 . - doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . — PMID 12032081 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Will J., Cicek N., Hoelzer D. Ihmisen histonideasetylaasi 9 -geenin (HDAC9) kromosomaalinen organisaatio ja lokalisaatio. (englanti) // Biochem. Biophys. Res. commun. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 293 , nro. 1 . - s. 182-191 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00193-6 . — PMID 12054582 .
Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Luokan II histonideasetylaasien yhdistäminen heterokromatiiniproteiinin 1 kanssa: histonin metylaation mahdollinen rooli lihasten erilaistumisen hallinnassa. (englanniksi) // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - 2002. - Voi. 22 , ei. 20 . - P. 7302-7312 . - doi : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
Hoogeveen AT, Rossetti S., Stoyanova V., Schonkeren J., Fenaroli A., Schiaffonati L., van Unen L., Sacchi N. Transkriptionaalinen korepressori MTG16a sisältää uuden nukleolaarisen kohdistussekvenssin, joka on poikkeavaa kohdassa t (16; 21)- positiiviset myeloidiset pahanlaatuiset kasvaimet. (englanniksi) // Onkogeeni : päiväkirja. - 2002. - Voi. 21 , ei. 43 . - P. 6703-6712 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205882 . — PMID 12242670 .
Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. Histonideasetylaasi 9 -geeni koodaa useita proteiini-isoformeja. (englanniksi) // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 278 , nro. 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .

Linkit

MeSH HDAC9+proteiini,+ihminen