Pohjois-Borneon asemakiista on Filippiinien ja Malesian välinen aluekiista siitä, kenen pitäisi omistaa Malesian Sabahin osavaltion koillisosa , joka tunnettiin aiemmin nimellä North Borneo .
Muinaisina aikoina Sulun sulttaanikunta sai Kalimantanin koillisrannikon lahjana Brunein hallitsijoilta heidän avustaan vihollisia vastaan. Vuonna 1865 Yhdysvaltain konsuli Bruneissa Claude Lee Moses osti Pohjois-Borneon alueen Brunein sulttaanilta kymmenen vuoden vuokrasopimuksella . Yhdysvallat, joka oli juuri päättänyt sisällissodan , ei osoittanut kiinnostusta Aasian siirtokuntien hankkimiseen, joten Mooseksen oli myytävä toimilupa Hongkongin yksityiselle amerikkalaiselle Borneon kauppayhtiölle , joka perusti sinne pienen Ellenan ( Ellenan ) siirtokunnan. nyt Kimanis ( Kimanis ).
Taloudellisten vaikeuksien vuoksi ATC puolestaan myi oikeudet Pohjois-Borneoon tammikuussa 1875 Itävalta-Unkarin konsulille Hongkongissa , Baron Gustav von Overbeckille ( saksaksi Gustavus Baron Von Overbeck ). 22. tammikuuta 1878 sulttaani Muedzul Lail Tan Kiram allekirjoitti sopimuksen konsuli von Overbeckin ja hänen brittiläisen kumppaninsa Alfred Dentin kanssa Kalimantanin Sulun rannikon vuokraamisesta niin kauan kuin he tarvitsevat. Vastineeksi von Overbeck toimitti sulttaanille tuliaseita puolustaakseen espanjalaisia vastaan ja lupasi maksaa sulttaanille tai hänen perillisilleen 5 000 dollaria vuodessa.
Huhtikuun 22. päivänä 1903 sulttaani Jamalul Kiram allekirjoitti vahvistuksen erillisten saarten siirrosta, jonka mukaan brittiläinen North Borneo Company vuokrasi lisää saaria Kalimantanin rannikolta - Banggin saarelta Sibuku-lahdelle; vastineeksi vuotuiset maksut Sulun sulttaaneille nostettiin 5 000 dollarista 5 300 dollariin.
Pian Sulun sulttaani joutui Espanjan hallintaan, ja sulttaani joutui allekirjoittamaan asiakirjan, jonka mukaan kaikki hänen Palawanissa ja Sulussa (mutta ei Pohjois-Borneolla) sijaitseva omaisuutensa siirrettiin Espanjalle. Vuonna 1885 Espanja allekirjoitti Madridin pöytäkirjan, jonka mukaan se luopui kaikista vaatimuksistaan Kalimantania kohtaan Iso-Britannian hyväksi.
Voiton jälkeen Espanjan ja Yhdysvaltojen välisessä sodassa vuonna 1898 Filippiinien hallinta siirtyi Espanjalta Yhdysvaltoihin. Vuosina 1906 ja 1923 Yhdysvallat muistutti Iso-Britanniaa siitä, että Pohjois-Borneo ei kuulunut Britannian kruunun maihin ja kuului Sulun sulttaanikuntaan. Filippiinien perustuslaki vuodelta 1941 julisti, että Filippiinien alue on muun muassa "kaikki Filippiineille historiallisten oikeuksien tai laillisten vaatimusten perusteella kuuluvat maat". Kuitenkin vuonna 1946 Britannia teki Brittiläisestä Pohjois-Borneosta kruununsiirtomaa.
Malesian vuonna 1963 muodostumisen jälkeen Sabah sisällytettiin sen kokoonpanoon, ja Filippiinit katkaisivat diplomaattisuhteet Malesian kanssa. Manilassa pidetyssä kokouksessa Indonesian, Malesian ja Filippiinien edustajat allekirjoittivat Manilan sopimuksen , jossa määrättiin Sabahin itsemääräämisoikeuden ehdot, mutta kaikki allekirjoittajat jättivät sen myöhemmin huomiotta. Diplomaattiset suhteet Filippiinien ja Malesian välillä palautettiin vuonna 1989, mutta kiista Pohjois-Borneon asemasta on edelleen ratkaisematta.