Rossmanin tyyli

Rossmann-laskos  on rakenteellinen motiivi proteiinin tertiäärisessä rakenteessa , joka sitoo nukleotideja (erityisesti NAD - kofaktori ). [1] Rakenne, joka koostuu kahdesta identtisestä osasta, sisältää kuusi lähes yhdensuuntaista β-levyä , jotka on yhdistetty kahdella α-heliksiparilla järjestyksen β-α-β-α-β mukaan. Koska jokainen Rossmann-laskos voi sitoa yhden nukleotidin, dinukleotidien, kuten NAD, sitoutumisdomeeni koostuu kahdesta rinnakkaisesta Rossmann-laskostuksesta. Yksi Rossmann-laskos voi sitoa mononukleotidin, kuten FMN -kofaktorin .

Motiivi on nimetty Michael Rossmanin mukaan, joka ensimmäisenä löysi ja kuvasi tämän rakenteen esiintyvän usein nukleotideja sitovissa proteiineissa, kuten dehydrogenaaseissa [2] .

Vuonna 1989 Israel Hanukoglu Weizmann Institute of Sciencesta havaitsi, että joidenkin proteiinien NADP:tä sitovien rakenteiden nukleotidisekvenssi eroaa NAD:ta sitovista motiiveista [3] . Tätä löytöä on käytetty entsyymien kofaktoriselektiivisyyden kääntämiseen [4] .

Muistiinpanot

  1. Hanukoglu I. Proteopedia: Rossmann-laskos: Beeta-alfa-beeta-laskos dinukleotidin sitoutumiskohdissa  //  Biochem Mol Biol Educ : Journal. - 2015. - Vol. 43 , nro. 3 . - s. 206-209 . - doi : 10.1002/bmb.20849 . — PMID 25704928 .
  2. Rao S., Rossmann M. Proteiinien supersekundaaristen rakenteiden vertailu  // J Mol  Biol : päiväkirja. - 1973. - Voi. 76 , nro. 2 . - s. 241-256 . - doi : 10.1016/0022-2836(73)90388-4 . — PMID 4737475 .
  3. Hanukoglu I. , Gutfinger T. Adrenodoksiinireduktaasin cDNA-sekvenssi. Oksidoreduktaasien NADP:tä sitovien kohtien tunnistaminen.  (englanniksi)  // European Journal of Biochemistry / FEBS. - 1989. - Voi. 180, ei. 2 . - s. 479-484. — PMID 2924777 .
  4. Scrutton NS, Berry A., Perham RN Dehydrogenaasin koentsyymispesifisyyden uudelleensuunnittelu proteiinitekniikalla. (englanti)  // Luonto: päiväkirja. - 1990. - tammikuu ( osa 343 , nro 6253 ). - s. 38-43 . - doi : 10.1038/343038a0 . — PMID 2296288 .