Sytokromi f

Sytokromi f
Spinacia oleraceasta (alhaalla) peräisin oleva sytokromi f vähentää plastosyaniinia (ylhäällä). Näytetään sinisellä keskellä kaksi alfaheliksia, oikealla on beta-sandwich. Vaalea kirsikka näyttää kupariatomin . Sytokromi f:n transmembraanidomeenia ei ole esitetty.
Tunnisteet
Symboli	Apocytochr_F_C
Pfam	PF01333
Pfam- klaani	CL0105
InterPro	IPR002325
PROSITE	PDOC00169
SCOP	1 ctm
SUPERPERHE	1 ctm
TCDB	3.D.3
OPM superperhe	345
OPM proteiini	3h1j
Saatavilla olevat proteiinirakenteet
Pfam	rakenteet
ATE	RCSB ATE ; PDBe ; ATEj
ATE-summa	3D malli

Sytokromi f on sytokromi b 6 /f -kompleksin ( plastokinoni-plastosyaniinireduktaasi ) suurin alayksikkö, CF-koodi 1.10.99.1 . Rakenteeltaan ja toiminnaltaan sytokromi b 6 /f -kompleksi on samanlainen kuin mitokondrioiden ja purppurabakteerien sytokromi b / c 1 -kompleksi . Sytokromi f:llä on samanlainen rooli kuin sytokromi c 1 huolimatta niiden sekundaarirakenteen eroista [1] .

Ensimmäistä kertaa sytokromi f:n tertiäärinen rakenne määritettiin sen eristyksen jälkeen Brassica rapasta [2] . Sytokromi f:n luminaalinen osa koostuu kahdesta rakenteellisesta alueesta: pienestä ja suuresta. Pieni sijaitsee suuren päällä, joka puolestaan on kiinnitetty kalvoankkuriin, joka koostuu pitkästä α-kierteestä. Suuri domeeni koostuu antirinnakkaisesta beeta-sandwichista ja lyhyestä hemiä sitovasta peptidistä, joka muodostaa kolmikerroksisen rakenteen. Pieni domeeni sijaitsee suuren domeenin F- ja G -beetaketjujen välissä ja koostuu kokonaan beetarakenteista. Suuri hemiä sitova domeeni on tertiaarirakenteeltaan samanlainen kuin eläinproteiinin fibronektiinin domeeni III . Hemi on ankkuroitu kahden lyhyen alfaheliksin väliin sytokromi f:n N-päässä. Epätavallisesti sytokromin N-pää toimii ligandina hemiraudalle [3] . Toisessa alfaketjussa on sytokromi c :lle tyypillinen rakennemotiivi CxxCH (tähteet 21-25), joka on kovalenttisesti kytketty heemiin tioeetterisidoksella Cys - 21:n ja Cys -24:n kautta . Hemipyrrolirenkaiden neljän typen lisäksi rautaa stabiloi His -25 ja vapaa alfa-aminoryhmä Tyr - 1 ensimmäisestä alfaketjusta [ 2] . Sytokromi f:n sisällä on huomattava määrä vesimolekyylejä , jotka voivat toimia protonin johtavana järjestelmänä [2] . Vesimolekyylien ketju näyttää olevan konservatiivinen ominaisuus kaikille sytokromeille f.

Galleria

Muistiinpanot

↑ Prince RC, George GN Cytochrome f paljastettiin // Trends Biochem . sci. : päiväkirja. - 1995. - Kesäkuu ( osa 20 , nro 6 ) . - s. 217-218 . - doi : 10.1016/S0968-0004(00)89018-0 . — PMID 7631417 .
↑ 1 2 3 Martinez SE, Huang D., Ponomarev M., Cramer WA, Smith JL . Kloroplastin sytokromi f:n hemi-pelkistyskeskus on kytketty haudattuun viiden veden ketjuun // Protein Sci . : päiväkirja. - 1996. - Kesäkuu ( osa 5 , nro 6 ). - s. 1081-1092 . - doi : 10.1002/pro.5560050610 . — PMID 8762139 .
↑ Sergio E Martinez, Deru Huang, Andrzej Szczepaniak, William A Cramer, Janet L Smith. Kloroplastin sytokromin kiderakenne paljastaa uuden sytokromilaskoksen ja odottamattoman hemiligaation (englanniksi) : Journal. - 1994. - Helmikuu ( osa 2 , nro 2 ) . - s. 95-105 . - doi : 10.1016/S0969-2126(00)00012-5 .

Lue lisää

Bendall , DS Keskeneräinen tarina sytokromista f // Drugs. - Adis International , 2004. - Voi. 80 , ei. 1-3 . - s. 265-276 . - doi : 10.1023/B:PRES.0000030454.23940.f9 . — PMID 16328825 .
Cramer, WA, Martinez, SE, Huang, D., Tae, GS, Everly, RM, Heymann, JB, Cheng, RH, Baker, TS ja Smith, JL . Sytokromi b 6 f -kompleksin rakenteelliset näkökohdat ; sytokromi f :n luumen-puolen domeenin rakenne (englanniksi) // J. Bioenerg. Biomembr. : päiväkirja. - 1994. - Voi. 26 , nro. 1 . - s. 31-47 . - doi : 10.1007/BF00763218 . — PMID 8027021 .

Linkit

MeSH Sytochrome+f

Tässä artikkelissa käytetään Pfamin ja InterPro IPR002325 :n julkista tekstiä