DNMT3L

DNA (sytosiini-5)-metyylitransferaasi 3:n kaltainen entsyymi

Otettu käyttöön ATE 2PV0 : n perusteella .

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
2PV0 , 2PVC , 2QRV

Tunnisteet

Symboli

DNMT3L ; MGC1090

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 606588 MGI : 1859287 Homologeeni : 8362 GeneCards : DNMT3L Gene

Geeniontologia
Toiminto	• proteiineihin sitoutuminen • entsyymiaktivaattoriaktiivisuus • entsyymin sitoutuminen • metalli-ionien sitominen
solukomponentti	• kondensoitunut ydinkromosomi • ydin • ydinheterokromatiini • sytosoli
biologinen prosessi	• kohdun alkion kehityksessä • istukan kehitys • DNA:n metylaatio • geeniekspression säätely geneettisellä imprintingillä • spermatogeneesi • katalyyttisen aktiivisuuden positiivinen säätely • transkription negatiivinen säätely, DNA-templaatti • korionitrofoblastisolujen erilaistuminen
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 21:
45,67 – 45,68 Mb

Chr 10:
78,04 – 78,06 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

DNA (sytosiini-5)-metyylitransferaasi 3:n kaltainen entsyymi englanti. DNA (sytosiini-5)-metyylitransferaasi 3:n kaltainen, DNMT3L on entsyymi , jota DNMT3L -geeni koodaa ihmisissä [1] [2] .

Toiminnot

CpG - metylaatio on epigeneettinen modifikaatio, joka on tärkeä alkion kehitykselle, painamiselle ja X-kromosomin inaktivaatiolle . Hiirillä tehdyt tutkimukset ovat osoittaneet, että DNA:n metylaatiota tarvitaan nisäkkäiden kehittymiseen . DNMT3L - geeni koodaa tumaproteiinia , joka on samanlainen kuin DNA-metyylitransferaasi. Tämä proteiini ei toimi DNA-metyylitransferaasina , koska se ei sisällä metyylitransferaasiaktiivisuuden edellyttämiä aminohappotähteitä . Tämä proteiini kuitenkin stimuloi de novo DNA:n sytosiinimetyylitransferaasin 3-α metylaatiota, ja sen uskotaan tarvittavan äidin genomijäljen muodostumiseen . Tämä proteiini välittää myös transkription repressiota olemalla vuorovaikutuksessa histonideasetylaasi 1 :n (HDAC1) kanssa. Vaihtoehtoinen silmukointi tuottaa kaksi muunnelmaa transkripteistä. Toinen silmukointivariantti on kuvattu, mutta sen biologista vaikutusta ei ole määritetty [2] .

Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa

DNMT3L:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa HDAC1 :n kanssa [3] [4] .

Muistiinpanot

↑ Aapola U., Kawasaki K., Scott HS, Ollila J., Vihinen M., Heino M., Shintani A., Kawasaki K., Minoshima S., Krohn K., Antonarakis SE, Shimizu N., Kudoh J. , Peterson P. Sytosiini-5-metyylitransferaasi 3 -geeniperheeseen liittyvän uuden sinkkisormigeenin, DNMT3L:n, eristäminen ja alkuperäinen karakterisointi 21q22.3:ssa // Genomics : Journal. - Academic Press , 2000. - Elokuu ( nide 65 , nro 3 ). - s. 293-298 . - doi : 10.1006/geno.2000.6168 . — PMID 10857753 .
↑ 1 2 Entrez-geeni: DNMT3L DNA (sytosiini-5-)-metyylitransferaasi 3:n kaltainen . Arkistoitu alkuperäisestä 11. toukokuuta 2009. (määrätön)
↑ Aapola U., Liiv I., Peterson P. Imprinting regulator DNMT3L on transkription repressori, joka liittyy histonideasetylaasiaktiivisuuteen // Nucleic Acids Res . : päiväkirja. - 2002. - Voi. 30 , ei. 16 . - P. 3602-3608 . - doi : 10.1093/nar/gkf474 . — PMID 12177302 .
↑ Deplus R., Brenner C., Burgers WA, Putmans P., Kouzarides T., de Launoit Y., Fuks F. Dnmt3L on transkription repressori, joka värvää histonideasetylaasi // Nucleic Acids Res . : päiväkirja. - 2002. - syyskuu ( osa 30 , nro 17 ). - P. 3831-3838 . - doi : 10.1093/nar/gkf509 . — PMID 12202768 .

Kirjallisuus

Hattori M; Fujiyama A; Taylor TD; Taylor, T.D.; Watanabe, H.; Yada, T.; Park, H.-S.; Toyoda, A.; Ishii, K. Ihmisen kromosomin 21 DNA-sekvenssi // Nature . - 2000. - Voi. 405 , no. 6784 . - s. 311-319 . - doi : 10.1038/35012518 . — PMID 10830953 .
Hata K., Okano M., Lei H., Li E. Dnmt3L tekee yhteistyötä de novo DNA -metyylitransferaasien Dnmt3-perheen kanssa luodakseen emon jälkiä hiirissä (englanniksi) // Development : Journal. - 2002. - Voi. 129 , no. 8 . - P. 1983-1993 . — PMID 11934864 .
Burgers WA, Fuks F., Kouzarides T. DNA-metyylitransferaasit kytkeytyvät kromatiiniin // Trends Genet . : päiväkirja. - 2002. - Voi. 18 , ei. 6 . - s. 275-277 . - doi : 10.1016/S0168-9525(02)02667-7 . — PMID 12044346 .
Aapola U., Liiv I., Peterson P. Imprinting regulator DNMT3L on transkription repressori, joka liittyy histonideasetylaasiaktiivisuuteen // Nucleic Acids Res . : päiväkirja. - 2002. - Voi. 30 , ei. 16 . - P. 3602-3608 . - doi : 10.1093/nar/gkf474 . — PMID 12177302 .
Deplus R; Brenner C; Burgers W.A.; Putmans, P; Kouzarides, T; De Launoit, Y; Fuks, F. Dnmt3L on transkription repressori, joka värvää histonideasetylaasi // Nucleic Acids Res . : päiväkirja. - 2002. - Voi. 30 , ei. 17 . - P. 3831-3838 . - doi : 10.1093/nar/gkf509 . — PMID 12202768 .
Kierszenbaum AL Genominen imprinting ja epigeneettinen uudelleenohjelmointi: haarautuvien polkujen puutarhan kaivaa esiin // Mol . jäljentäminen. kehittäjä : päiväkirja. - 2003. - Voi. 63 , nro. 3 . - s. 269-272 . - doi : 10.1002/mrd.90011 . — PMID 12237941 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C. M.; Schuler, GD Yli 15 000 täyspitkän ihmisen ja hiiren cDNA-sekvenssin luominen ja alkuanalyysi // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2003. - Voi. 99 , ei. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Chedin F., Lieber MR, Hsieh CL DNA-metyylitransferaasin kaltainen proteiini DNMT3L stimuloi de novo metylaatiota Dnmt3a : lla // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2003. - Voi. 99 , ei. 26 . - P. 16916-16921 . - doi : 10.1073/pnas.262443999 . — PMID 12481029 .
Huntris J; Hinkins M; Oliver B; Harris, SE; Beazley, JC; Rutherford, AJ; Gosden, R.G.; Lanzendorf, SE; Picton, HM DNA-metyylitransferaasien ja metyyli-CpG:tä sitovien proteiinien mRNA:iden ekspressio ihmisen naisen sukusolussa, preimplantaatioalkioissa ja alkion kantasoluissa // Mol . jäljentäminen. kehittäjä : päiväkirja. - 2004. - Voi. 67 , no. 3 . - s. 323-336 . - doi : 10.1002/mrd.20030 . — PMID 14735494 .
Suetake I; Shinozaki F; Miyagawa J; Takeshima, H; Tajima, S. DNMT3L stimuloi Dnmt3a:n ja Dnmt3b:n DNA-metylaatioaktiivisuutta suoran vuorovaikutuksen kautta // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 279 , nro. 26 . - P. 27816-27823 . - doi : 10.1074/jbc.M400181200 . — PMID 15105426 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C. M.; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Vanha, S; Rasooly, R. NIH:n täyspitkän cDNA-projektin tila, laatu ja laajennus: Nisäkkäiden geenikokoelma (MGC ) // Genome Res. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 14 , ei. 10B . - s. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amelie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Kohti ihmisen proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkoston proteomimittakaavaista karttaa (englanniksi) // Nature : Journal. - 2005. - Voi. 437 , no. 7062 . - s. 1173-1178 . - doi : 10.1038/luonto04209 . — PMID 16189514 .
Hata K; Kusumi M; Yokomine T; Li, En; Sasaki, Hiroyuki. Meioottiset ja epigeneettiset poikkeavuudet Dnmt3L-puutteellisissa miessukusoluissa (englanniksi) // Mol. jäljentäminen. kehittäjä : päiväkirja. - 2006. - Voi. 73 , no. 1 . - s. 116-122 . - doi : 10.1002/mrd.20387 . — PMID 16211598 .
XieZH; Huang YN; ChenZX; Riggs, AD; Ding, JP; Gowher, H; Jeltsch, A; Sasaki, H; Hata, K. Mutations in DNA methyltransferase DNMT3B in ICF oireyhtymä vaikuttaa sen säätelyyn DNMT3L:llä // Human Molecular Genetics : päiväkirja. - Oxford University Press , 2006. - Voi. 15 , ei. 9 . - s. 1375-1385 . doi : 10.1093 / hmg/ddl059 . — PMID 16543361 .
Yokomine T., Hata K., Tsudzuki M., Sasaki H. Selkärankaisten DNMT3-geeniperheen evoluutio: mahdollinen yhteys DNMT3L:n olemassaolon ja genomisen painamisen välillä // Cytogenet . Genome Res. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 113 , nro. 1-4 . - s. 75-80 . - doi : 10.1159/000090817 . — PMID 16575165 .
HuYH; Warnatz HJ; Vanhecke D; Wagner, Florian; Fiebitz, Andrea; Thamm, Sabine; Kahlem, Pascal; Lehrach, Hans; Yaspo, Marie-Laure. Solujoukkopohjainen solunsisäinen lokalisointiseulonta paljastaa ihmisen kromosomin 21 proteiinien uusia toiminnallisia ominaisuuksia // BMC Genomics : päiväkirja. - 2006. - Voi. 7 . - s. 155 . - doi : 10.1186/1471-2164-7-155 . — PMID 16780588 .
Kareta MS; Botello ZM; Ennis JJ; Chou, C; Chédin, F. Ihmisen DNMT3L:n de novo -metylaation stimuloinnin palauttaminen ja mekanismi // J. Biol. Chem. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 281 , nro. 36 . - P. 25893-25902 . - doi : 10.1074/jbc.M603140200 . — PMID 16829525 .
Ooi SK; Qiu C; Bernstein E; Li, Keqin; Jia, Da; Yang, Zhe; Erdjument-Bromage, Hediye; Tempst, Paul; Lin, Shau Ping. DNMT3L yhdistää histoni H3:n metyloitumattoman lysiinin 4 DNA:n de novo -metylaatioon // Nature : Journal. - 2007. - Voi. 448 , no. 7154 . - s. 714-717 . - doi : 10.1038/luonto05987 . — PMID 17687327 .
Jia D; Jurkowska RZ; Zhang X; Jeltsch, Albert; Cheng, Xiaodong. Dnmt3L:ään sitoutuneen Dnmt3a:n rakenne ehdottaa mallia DNA:n de novo metylaatiolle // Nature : Journal. - 2007. - Voi. 449 , no. 7159 . - s. 248-251 . - doi : 10.1038/luonto06146 . — PMID 17713477 .