| jmol | |
|---|---|
| Jmol - Java-ohjelma 3D-molekyylirakenteiden visualisointiin | |
| Tyyppi | bioinformatiikka |
| Tekijä | Dan Geselter [d] [1] |
| Kehittäjä | jmol kehitystiimi |
| Sisään kirjoitettu | Java |
| Käyttöjärjestelmä | Poikkitaso |
| Käyttöliittymäkielet | katalaani , kiina , tšekki , saksa , englanti , ranska , hollanti , unkari , italia , korea , portugali , espanja , turkki , venäjä |
| Laitteistoalusta | Java-virtuaalikone |
| uusin versio | 14.31.18 ( 19.11.2020 ) |
| Luettavat tiedostomuodot | Protein Data Bank , CIF , MDL Molfile [d] , CML , SMILES ja XYZ-tiedostomuoto [d] |
| Lisenssi | LGPL |
| Verkkosivusto | jmol.org |
| Mediatiedostot Wikimedia Commonsissa | |
Jmol on ohjelma, jolla tarkastellaan molekyylien rakennetta kolmessa ulottuvuudessa.
Jmolia käytetään sekä koulutustarkoituksiin [2] että tieteelliseen tutkimukseen molekyylibiologian , kemian ja biokemian alalla . Ohjelma on ilmainen ja avoimen lähdekoodin . Se on kirjoitettu Java -kielellä ja on siksi monialustainen . Siellä on sekä erillinen ohjelma että työkalut integrointiin toiseen Java-sovellukseen. Useimmiten ohjelmaa käytetään web-sivulle upotettuna sovelmana . Ohjelman avulla voit rakentaa kuvia molekyyleistä useilla tavoilla. Jmol tukee useita tiedostomuotoja, mukaan lukien:
Pyrococcus furiosuksen arkkibakteerin H/ACA RNP -laatikon kristallirakenne .
Kahden suolasillan valaistus hemoglobiinitetrameerissä (hemoryhmä on kuvattu sauvoilla oikeassa alakulmassa).
Fragmentti transkriptiotekijästä TFIIIA, joka muodostaa kolme peräkkäistä sinkkisormea kiinnittyneenä DNA-sekvenssiin .
Thermus thermophilus -bakteerin ribosomin 70S-alayksikkö .