Methylococcus capsulatus

Methylococcus capsulatus

Methylococcus capsulatus , TEM.
tieteellinen luokittelu
Verkkotunnus:bakteeritTyyppi:ProteobakteeritLuokka:Gamma proteobakteeritTilaus:MetylokokkiPerhe:MethylococcaceaeSuku:MethylococcusNäytä:Methylococcus capsulatus
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Methylococcus capsulatus
Foster ja Davis 1966

Methylococcus capsulatus   (lat.) on Methylococcus - suvun pakollinen metanotrofinen gramnegatiivinen kokki , joka käyttää metaania ainoana hiilenlähteenä , ammoniumionien läsnäolo estää metaanin käytön [1] .

Tämän lajin bakteerit pystyvät myös käyttämään metanolia , formaldehydiä [2] [3] ja muurahaishappoa . He osallistuvat hiilen kiertoon planeetalla ja käyttävät metaanikaasua elämäänsä. Ainutlaatuinen entsyymi , joka suorittaa metaanin hapettumisen ensimmäisen vaiheen, on metaanimono-oksygenaasi , jota on Methylococcus capsulatus -soluissa kahdessa muodossa: liukoisena [4] ja kalvoon sitoutuneena, joka on kuparia sisältävä kolmen alayksikön entsyymi [5] [ 6] [7] [8] . Pystyy kiinnittämään ilmakehän typpeä [9] , kykenee nitrifikaatioon (käyttäen liukoista ja kalvoon sitoutunutta metaanimono-oksigenaasia, jolla ei ole tiukkaa spesifistä substraatille [10] [11] ) ja denitrifikaatioon . Ne ovat aerobeja ja syntetisoivat sytokromeja [12] [13] . Pystyy syntetisoimaan steroleja [14] [15] .

Genomi

Methylococcus capsulatuksen genomia edustaa pyöreä kaksijuosteinen DNA -molekyyli, jonka koko on 3304561 bp ja sisältää 3052 geeniä , joista 2956 koodaa proteiineja , G+C-parien prosentuaalinen osuus on 63% [16] . Genomi on erikoistunut metanotrofiaan ja sisältää geneettisen tiedon, joka on vastuussa redundanteista aineenvaihduntareiteistä, oletettavasti avainasemassa metanotrofiaan, ja toistuvista metaanimono-oksygenaasigeeneistä [17] . On myös havaittu, että metaanimono-oksigenaasin ilmentymistä säätelevät kupari-ionit [18] .

Sovellus

Methylococcus capsulatuksen käyttö bioremediatiossa on lupaavaa, koska se pystyy käyttämään metaania ainoana hiilen lähteenä sekä hapettamaan ksenobiotteja , kuten trikloorietyleeniä , ja mikro-organismia voidaan käyttää myös tiettyjen kemikaalien mikrobiologisessa synteesissä ja biotransformaatiossa. [19] .

Ruoka

Bakteeria käytetään jo rehun valmistukseen. Polttoaine- ja energiayhtiö Statoil (nykyisin Equinor ) avasi vuonna 1999 maakaasusta valmistetun bioproteiinin rehutehtaan , jonka vuosituotanto on ~10 000 tonnia. [20] [21] Tehdas suljettiin kuitenkin vuonna 2006 alhaisten rehuhintojen ja korkeampien kaasuhintojen vuoksi. [22] [23]

Amerikkalainen bioteknologiayritys Calysta avasi vuonna 2016 Englannissa kalaruokatehtaan, jonka tuotantokapasiteetti on noin 100 tonnia vuodessa. [22] [24] . Toinen bioteknologiayritys Unibio avasi myös lemmikkieläinten ruokatehtaan Tanskaan vuonna 2016, jonka kapasiteetti on ~80 tonnia vuodessa [25] [26] .

Katso myös

Muistiinpanot

  1. ↑ SpringerLink - Lehtiartikkeli  (linkkiä ei ole saatavilla)
  2. ↑ Methylococcus capsulatuksen (Bath) formaldehydidehydrogenaasivalmisteet sisältävät metanolidehydrogenaasia ja metyleenitetrahydrometanopteriinidehydrogenaasia - Adeosun et a... (linkki ei saatavilla) . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 7. lokakuuta 2008. 
  3. ↑ Methylococcus capsulatus (Bath) -bakteerin pienimolekyylinen proteiini vastaa formaldehydidehydrogenaasiaktiivisuuden säätelystä in vitro - Tate ja Dalton 145 (1): ... (ei käytettävissä oleva linkki) . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 5. syyskuuta 2008. 
  4. ↑ InfoWeb.netissä toimiva hakukone . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 27. kesäkuuta 2013.
  5. ↑ Methylococcus capsulatus (Bath) -hiukkasmetaanimono-oksigenaasi on uusi kuparia sisältävä kolmen alayksikön entsyymi - JBC (linkki ei saatavilla) . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 22. syyskuuta 2008. 
  6. ↑ Methylococcus capsulatuksen (Bath) metaanimono-oksigenaasin kalvoon liittyvä muoto on kupari/rautaproteiini Arkistoitu 2008-09-3 .
  7. ↑ Methylococcus capsulatuksen (Bath) puhdistettu hiukkasmainen metaanimono-oksigenaasi on dimeeri, jossa on sekä yksitumaista kuparia että kuparia sisältävää klusteria - PNAS . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 24. syyskuuta 2015.
  8. ↑ Kalvoon liittyvä metaanimono-oksigenaasi Methylococcus capsulatusista (Bath) - Zahn ja DiSpirito 178 (4): 1018 - The Journal of Bacteriology . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 16. toukokuuta 2008.
  9. ↑ Murrell JC, Dalton H. Typen kiinnitys obligaateissa metanotrofeissa // J Gen Microbiol, 1983 No. 129 P. 3481-3486.
  10. ↑ Methylococcun liukoinen metaanimono-oksigenaasi… [Biochem J. 1977] - PubMed-tulos . Haettu 3. lokakuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 12. kesäkuuta 2015.
  11. ↑ SpringerLink - Lehtiartikkeli  (linkkiä ei ole saatavilla)
  12. ↑ Sytokromi c -peroksidaasi Methylococcus capsulatus Bathista (pääsemätön linkki) . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 10. kesäkuuta 2015. 
  13. ↑ Sytokromi P460 -geenit Methanotroph Methylococcus capsulatus Bathista - Bergmann et al. 180 (24): 6440 - The Journal of Bacteriology . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 25. heinäkuuta 2008.
  14. ↑ Lanosterolin biosynteesi prokaryootissa Methylococcus Capsulatus: Katsaus sterolin biosynteesin kehitykseen - Lamb et al. 24(8): 1714 - Molecular Biology and Evolution . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 7. lokakuuta 2008.
  15. ↑ Steroidit ja skvaleeni Methylococcus capsulatusissa, jotka on kasvatettu metaanilla . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 30. syyskuuta 2008.
  16. ↑ uid=507 genomitulos
  17. ↑ Genominen oivalluksia metanotrofiasta: täydellinen ... [PLoS Biol. 2004] - PubMed-tulos
  18. ↑ http://www.sci.u-szeged.hu/ABS/2002/Acta%20HPa/4631.pdf
  19. ↑ Methylococcus_capsulatus | 2can tukiportaali | EBI . Haettu 30. elokuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 27. kesäkuuta 2013.
  20. ↑ Natures Value Chain.. Biomassatuotanto (linkki ei saatavilla) . norferm. Haettu 30. heinäkuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 2. elokuuta 2019. 
  21. ↑ Bioproteiini alkaa . Statoil (17. helmikuuta 1999). Haettu 12. joulukuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 20. joulukuuta 2016.
  22. ↑ 12 Le Page, Michael . Maakaasusta valmistettu ruoka ruokkii pian kotieläimiä – ja meitä  (eng.)  (19.11.2016). Arkistoitu alkuperäisestä 12. kesäkuuta 2018. Haettu 30.7.2019.
  23. ↑ Fletcher, Rob Aterian valmistus metaanista . Kalanviljelyn asiantuntija . Norsk Fiskeoppdrett AS (10. heinäkuuta 2015). Haettu 12. joulukuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 20. joulukuuta 2016.
  24. ↑ Lane, Jim menossa Gracelandiin: Cargill, Calysta valitse Tennessee metaani-syöttöprojektia varten . Biofuels Digest (4. joulukuuta 2016). Käyttöpäivä: 13. joulukuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 5. joulukuuta 2016.
  25. ↑ Nandy, Subir Kumar . Kohti vihreää tulevaisuutta: rehuksi käytetty bakteeribiomassa , Euro Biomass 2016 Conference, Birmingham, UK , OMICS International (8. elokuuta 2016). Arkistoitu alkuperäisestä 31. tammikuuta 2018. Haettu 30.7.2019.
  26. ↑ Unibio saa päätökseen kaupallisen tehtaan Tanskassa ja siirtyy kaupalliseen vaiheeseen . BusinessWire (31. lokakuuta 2016). Haettu 12. joulukuuta 2016. Arkistoitu alkuperäisestä 20. joulukuuta 2016.

Linkit